PURPOSE: Glaucoma is characterized by optic nerve damage and retinal ganglion cell loss. The glycoprotein neuromedin B-associated (Gpnmb) gene is well-known to be involved in the glaucoma disease process. The purpose of this study is to identify a downstream gene through which Gpnmb affects the glaucoma phenotypes using a systems genetics approach.
METHODS: Retinal gene expression data for the BXD recombinant inbred (RI) strains (n=75) have previously been generated in our laboratory for a glaucoma study, and these data were used for genetic and bioinformatics analysis. Expression quantitativ
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Clinical application of oxaliplatin, a platinum-based chemotherapeutic agent, in cancer, especially colorectal cancer, is widely used. However, oxaliplatin-induced peripheral neurotoxicity (OIPN) has a high incidence, and to date, there have been few detailed studies on pathogenesis and treatment mechanisms. The present study was performed by using a proteomic approach to explore protein expression profiling of rats treated with oxaliplatin by multiplex isobaric tags for relative and absolute quantification labeling and two-dimensional liquid chromatography-tandem mass spectrometry. There were
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Epithelial-mesenchymal transition (EMT) of the medial edge epithelium (MEE) occurs through fusion of the palatal shelves and is a crucial step in palatogenesis. The key genes, however, and the related signaling pathway of EMT are not yet fully understood. Therefore, the aim of this study was to reveal the key genes and the related signaling pathway of EMT during palatal fusion.
MATERIALS AND METHODS: C57BL/6J mice at embryonic gestation day 14.5 (E14.5; n = 6) were used to establish the cleft palate model for mRNA-Seq (HiSeq X Ten). The Gene Ontology (GO) and the Kyoto Encyclopedi
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Genetic forms of ataxia are a heterogenous group of degenerative diseases of the cerebellum. Many causative genes have been identified. We aimed to systematically investigate these genes to better understand ataxia pathophysiology.
METHODS: A manually curated catalogue of 71 genes involved in disorders with progressive ataxias as a major clinical feature was subjected to an integrated gene ontology, protein network and brain gene expression profiling analysis.
RESULTS: We found that genes mutated in ataxias operate in networks with significantly enriched protein connectivity, dem
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Endotoxin is a significant contributing factor underlying the occurrence of fever, diarrhea, inflammation, edema, coagulation, shock and other syndromes associated with gram-negative bacterial infections. To date, there is no effective treatment for endotoxemia.
AIM: The aim of this study was to characterize differentially expressed genes in sinomenine-treated and lipopolysaccharide (LPS)-induced endothelial cells by microarray analysis and to determine the potential pharmacological activity of sinomenine.
DESIGN: The cultured cells of five treatment groups (n = 3) were collected
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Alzheimer's disease (AD) is strongly associated with microglia-induced neuroinflammation. Particularly, Aβ plaque-associated microglia take on an "activated" morphology. However, the function and phenotype of these Aβ plaque-associated microglia are not well understood. We show hyperreactivity of Aβ plaque-associated microglia upon systemic inflammation in transgenic AD mouse models (i.e., 5XFAD and APP23). Gene expression profiling of Aβ plaque-associated microglia (major histocompatibility complex II+ microglia) isolated from 5XFAD mice revealed a proinflammatory phenotype. The upregulated g
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Trisomy 21, or Down syndrome (DS), is the most frequent human autosomal chromosome aneuploidy, which leads to multiple developmental disorders, especially mental retardation in individuals. The presence of an additional human chromosome 21 (HSA21) could account for the pathological manifestations in DS. In this study, we analyzed the mRNA gene expression profile of DS-derived amniocytes compared with normal amniocytes, aiming to evaluate the relationship between candidate dysregulated HSA21 genes and DS developmental phenotypes. Differentially expressed genes (DEGs) included 1794 upregulated g
Клинический случайСтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Superwarfarins are very long-lasting rodenticides effective in warfarin-resistant rodents at extremely low doses. The consequences of chronic superwarfarin levels in tissues, due to biological half-lives on the order of 20 days, have not been examined. We now characterized the neurological effects of brodifacoum (BDF), one of the most widely used superwarfarins, in adult male Sprague Dawley rats. Dosing curves established the acute oral lethal dose for BDF as 221 ± 14 μg/kg. Measurement of tissue BDF levels showed accumulation throughout the body, including the central nervous system, with lev
СтатьяПоддержка правительства СШАПоддержка NIH: внешняя программаПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Thoracic ossification of the ligamentum flavum (TOLF) is a unique disease with ectopic ossification, and is a major cause of thoracic spinal stenosis and myelopathy. However, the underlying etiology remains largely unknown. In this study, the ligamentum flavum was systematically analyzed in TOLF patients by using comprehensive iTRAQ labeled quantitative proteomics. Among 1285 detected proteins, there were 282 proteins identified to be differentially expressed. The Gene Ontology (GO) analysis regarding functional annotation of proteins consists of the following three aspects: the biological pro
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Mutations in progranulin (PGRN) have been linked to two neurodegenerative disorders, heterozygote mutations with frontotemporal lobar degeneration (FTLD) and homozygote mutations with neuronal ceroid lipofuscinosis (NCL). Human PGRN is 593aa secreted growth factor, made up of seven and a half repeats of a highly conserved granulin motif that is cleaved to produce the granulin peptides A-G and paragranulin. While it is thought that PGRN protects against neurodegeneration through its role in inflammation and tissue repair, the role of PGRN and granulins in the nervous system is currently unclear
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Venom is a key-factor in the regulation of host physiology by parasitic Hymenoptera and a potentially rich source of novel bioactive substances for biotechnological applications. The limited study of venom from the ectoparasitoid Bracon hebetor, a tiny wasp that attacks larval pest insects of field and stored products and is thus a potential insect control agent, has not described the full complement and composition of these biomolecules. To have a comprehensive picture of genes expressed in the venom glands of B. hebetor, a venom gland transcriptome was assembled by using next generation sequ
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The aim of this study was to identify core pathways associated with juvenile idiopathic arthritis (JIA) using the attract method. Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes pathways were determined using the GSEA-ANOVA method, based on the gene expression data of JIA. Syn-expression groups within core attractor pathways were identified by hierarchical clustering. Correlated sets of genes exhibiting highly similar profiles to the syn-expression groups were identified and each correlated set was subjected to a gene ontology functional enrichment analysis to discover potentially shared biological th
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
AIMS: The aim of this study was to identify potential candidates and explore the possible mechanism in congenital cataract induced by tudor domain-containing 7 (TDRD7) deficiency.
METHODS: The gene expression profile GSE25812 generated from 18 samples was downloaded from the Gene Expression Omnibus database. Differentially expressed genes (DEGs) between disease and normal groups were identified. Then, gene ontology and pathway enrichment analysis of DEGs were performed. The protein-protein interaction (PPI) network and transcription factor (TF) regulatory network were constructed. The modules
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Diarrhea and edema disease in weaned piglets due to infection by Escherichia coli F18 is a leading cause of economic loss in the pig industry. Resistance to E. coli F18 depends on expression of receptors on intestinal epithelial cells, and individual immunity. This study was conducted in Sutai pig E. coli F18-resistant and -susceptible full sib-pair individuals, identified on the basis of resource populations and verification of adhesion assays. The molecular mechanism underlying E. coli F18 resistance was investigated through analysis of the expression of E. coli F18 receptor associated and i
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Many genes have been implicated in the pathogenesis of common respiratory and related diseases (RRDs), yet the underlying mechanisms are largely unknown. Differential gene expression patterns in diseased and healthy individuals suggest that RRDs affect or are affected by modified transcription regulation programs. It is thus crucial to characterize implicated genes in terms of transcriptional regulation. For this purpose, we conducted a promoter analysis of genes associated with 11 common RRDs including allergic rhinitis, asthma, bronchiectasis, bronchiolitis, bronchitis, chronic obstructive p
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Relapse is a major challenge in the successful treatment of childhood acute lymphoblastic leukemia (ALL). Despite intensive research efforts, the mechanisms of ALL relapse are still not fully understood. An understanding of the molecular mechanisms underlying treatment outcome, therapy response and the biology of relapse is required. In this study, we carried out a genome-wide microRNA (miRNA) microarray analysis to determine the miRNA expression profiles and relapse-associated miRNA patterns in a panel of matched diagnosis-relapse or diagnosis-complete remission (CR) childhood ALL samples. A
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVES: To compare the gene expression profile of osseointegration associated with a moderately rough and a chemically modified hydrophilic moderately rough surface in a human model.
MATERIAL AND METHODS: Eighteen solid screw-type cylindrical titanium implants, 4 mm long and 2.8 mm wide, with either a moderately rough (SLA) or a chemically modified moderately rough (SLActive) surface were surgically inserted in the retromolar area of nine human volunteers. The devices were removed using a trephine following 4, 7 and 14 days of healing. The tissue surrounding the implant was harvested, tot
Сравнительное исследованиеСтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND/AIM: Prostate cancer, a leading global malignancy, exhibits variable progression influenced by angiogenesis, the formation of new blood vessels critical for tumor growth and metastasis. We investigated the impact of genetic variants of angiogenesis-related genes on the survival outcomes of patients with prostate cancer receiving androgen deprivation therapy (ADT).
MATERIALS AND METHODS: We conducted a genetic association study of 87 single-nucleotide polymorphisms across seven angiogenic genes in 630 patients with prostate cancer undergoing ADT. Survival analysis was used to assess
Клинический случайСтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVE: To examine human blastocyst microRNA (miRNA) expression in correlation with human infertility. MicroRNAs are small, noncoding RNA molecules that regulate gene expression via mechanisms such as degradation and translational suppression of targeted messenger RNAs. Recent data has pointed to the importance of miRNAs in disease states and during mouse embryo development.
DESIGN: Descriptive study.
SETTING: Nonprofit research foundation.
PATIENT(S): Transferable quality human blastocysts donated with consent to research (n = 40).
INTERVENTION(S): Quantitative real-time PCR.
MAIN OUT
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The study of protein-protein interactions is essential to define the molecular networks that contribute to maintain homeostasis of an organism's body functions. Disruptions in protein interaction networks have been shown to result in diseases in both humans and animals. Monogenic diseases disrupting biochemical pathways such as hereditary coagulopathies (e.g. hemophilia), provided a deep insight in the biochemical pathways of acquired coagulopathies of complex diseases. Indeed, a variety of complex liver diseases can lead to decreased synthesis of the same set of coagulation factors as in hemo
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.