Metagenomic next-generation sequencing (mNGS) enables unbiased detection of human pathogens without prior assumptions. However, the direct detection of bloodstream infection pathogens is limited by host DNA interference, leading to the clinical adoption of microbial cell-free DNA mNGS (plasma cfDNA mNGS). This study developed a host cell depletion method based on immunomagnetic separation using CD45-conjugated magnetic particles (CD45-MPs, termed the IP method) to reduce host DNA interference and enhance mNGS performance for bloodstream pathogen detection. In simulated samples, known concentra
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
INTRODUCTION: Bloodstream infections are a critical challenge worldwide due to the slow turnaround time of conventional microbiological tests for detecting bacteremia in septic patients. Noscendo GmbH (Duisburg, Germany) has developed the CE/IVD pipeline DISQVER for clinical metagenomics testing based on cell-free DNA (cfDNA) from blood samples to address this issue.
METHODS: We conducted a retrospective study to evaluate the diagnostic utility of this methodological setup in improving treatment decisions since it was introduced into our clinical setting. Between January 2021 and June 2022, t
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
PURPOSE: An estimated 25% of patients with biliary tract cancer (BTC) do not undergo genotyping, representing a missed opportunity for therapeutic targeting.
METHODS: Cell-free DNA (cfDNA) and matched tumor sample from patients with BTC were analyzed using targeted next-generation sequencing (NGS) assay and compared. We sought to define the molecular profile of cancer-derived cfDNA, frequency of OncoKB level 1/2 alterations, plasma:tumor genotype concordance, the prognostic impact of cfDNA, and clonal evolution after targeted therapy progression.
RESULTS: cfDNA-based genotyping was performed
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Early detection of prostate cancer is limited by the poor specificity of prostate-specific antigen (PSA)-based screening. Cell-free DNA (cfDNA) fragmentomics offers a promising non-invasive approach to improve screening accuracy and risk stratification. In this study, we enrolled 106 prostate cancer patients and 114 high-risk non-cancer individuals to develop a cfDNA fragmentomics-based screening assay using plasma whole-genome sequencing. Two fragmentomic features-copy number variation and fragment size profile-were incorporated into machine learning models for training and evaluated in an in
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVE: Placental proteins, including placental alkaline phosphatase (PLAP), soluble fms-like tyrosine kinase-1 (sFLT-1) and placental growth factor (PlGF), are quantifiable in maternal saliva and show promise as predictive biomarkers for the development of pregnancy complications including preeclampsia. We aimed to develop a more comprehensive cell-free RNA saliva based placental biomarker panel with the addition of vascular endothelial growth factor A (VEGFA), soluble endoglin (sENG), pregnancy-associated plasma protein A (PAPPA), and sFLT-1:PlGF to predict preeclampsia prior to the onset
СтатьяНаблюдательное исследованиеПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Recognizing which premature infants are at higher risk of developing BPD/death is a challenge in neonatology. The aims of our study are to identify mitochondrial haplogroups and quantify circulating cell-free mitochondrial DNA (ccf-mtDNA) levels in very preterm infants at risk of bronchopulmonary dysplasia (BPD) or death and explore the relationship between these variables and the development of BPD/death.
METHODS: Single-center prospective cohort study including preterm infants of ≤32 weeks gestational age (GA) and birth weight ≤1500 g. Clinical variables, mitochondrial haplogrou
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
PURPOSE: Current methods for glioma response assessment are limited. This study aimed to assess the technical and clinical feasibility of molecular profiling using longitudinal intracranial cerebrospinal fluid (CSF) from patients with gliomas.
EXPERIMENTAL DESIGN: Adults with gliomas underwent longitudinal intracranial CSF collection via Ommaya reservoirs or ventriculoperitoneal shunts. Cell-free DNA (cfDNA) was extracted and analyzed using PredicineCARE for cancer variant profiling and/or PredicineSCORE for low-pass whole-genome sequencing.
RESULTS: Five patients (two females and three male
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
This study aims to assess the feasibility of detecting and diagnosing Duchenne muscular dystrophy (DMD) during prenatal screening for chromosome abnormalities using cell-free fetal DNA extracted from peripheral blood samples of pregnant women.Two pregnant women identified as high risk through noninvasive prenatal testing (NIPT) underwent amniocentesis to obtain fetal cells. Subsequent fetal chromosomal karyotyping was conducted, and genomic DNA from fetal cells was extracted for copy number variation sequencing (CNV-Seq) analysis, complemented by multiplex ligation-dependent probe amplificatio
СтатьяКлинический случайПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
A better understanding of the function of neutrophil extracellular traps (NETs) may facilitate the development of interventions for sepsis. The study aims to investigate the formation and degradation of NETs in three murine sepsis models and to analyze the production of reactive oxygen species (ROS) during NET formation. Murine sepsis was induced by midgut volvulus (720° for 15 min), cecal ligation and puncture (CLP), or the application of lipopolysaccharide (LPS) (10 mg/kg body weight i.p.). NET formation and degradation was modulated using mice that were genetically deficient for peptidyl ar
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The emergence of targeted therapies has transformed ovarian cancer treatment. However, biomarker profiling for precision medicine is limited by access to quality, tumour-enriched tissue samples. The use of cell-free DNA (cfDNA) in ascites presents a potential solution to this challenge. In this study, next-generation sequencing was performed on ascites-derived cfDNA samples (26 samples from 15 human participants with ovarian cancer), with matched DNA from ascites-derived tumour cells (n = 5) and archived formalin-fixed paraffin-embedded (FFPE) tissue (n = 5). Similar tumour purity and variant
СтатьяResearch Support, N.I.H., IntramuralПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Chromosomal numerical and structural alterations are significant causes of various developmental disorders in foetuses. Non-invasive prenatal testing (NIPT) has emerged as an effective screening tool for detecting common aneuploidies, aiding in the identification of individuals who may require further diagnostic work-up.
METHODS: This retrospective, monocentric observational study evaluates the usage patterns, test choices, turnaround times (TAT), and outcomes of NIPT between 2013 and 2023 on a sample of 2431 pregnant women at a special hospital offering outpatient services and co
СтатьяНаблюдательное исследованиеПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
IMPORTANCE: Ultrasonographic measurement of fetal nuchal translucency is used in prenatal screening for trisomies 21 and 18 and other conditions. A cutoff of 3.5 mm or greater is commonly used to offer follow-up investigations, such as prenatal cell-free DNA (cfDNA) screening or cytogenetic testing. Recent studies showed a possible association with chromosomal anomalies for levels less than 3.5 mm, but extant evidence has limitations.
OBJECTIVE: To evaluate the association between different nuchal translucency measurements and cytogenetic outcomes on a population level.
DESIGN, SETTING, AND
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Accurate individualized assessment of preeclampsia risk enables the identification of patients most likely to benefit from initiation of low-dose aspirin at 12 to 16 weeks of gestation when there is evidence for its effectiveness, and enables the guidance of appropriate pregnancy care pathways and surveillance.
OBJECTIVE: The primary objective of this study was to evaluate the performance of artificial neural network models for the prediction of preterm preeclampsia (<37 weeks' gestation) using patient characteristics available at the first antenatal visit and data from prenatal c
СтатьяНаблюдательное исследованиеМногоцентровое исследованиеПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: The diagnosis of tuberculous pleurisy (TP) presents a significant challenge due to the low bacterial load in pleural effusion (PE) samples. Cell-free Mycobacterium tuberculosis DNA (cf-TB) in PE samples is considered an optimal biomarker for diagnosing TP. This study aimed to evaluate the applicability of cf-TB testing across diverse research sites with a relatively large sample size.
METHODS: Patients suspected of TP and presenting with clinical symptoms and radiological evidence of PE were consecutively enrolled by treating physicians from 11 research sites across 6 provinces in
СтатьяМногоцентровое исследованиеПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
PURPOSE OF REVIEW: Despite the availability of Rh(D) immune globulin (RhIg) to prevent alloimmunization in Rh(D)-negative pregnant patients, anti-Rh(D) alloimmunization remains a prevalent cause of hemolytic disease of the fetus and newborn (HDFN). Recent RhIg shortages have caused clinicians and professional societies to identify methods to prioritize RhIg administration. New cell-free DNA (cfDNA) tests to predict fetal red blood cell antigen genotypes have been proposed as an option to prioritize the administration of RhIg to Rh(D)-negative pregnant people.
RECENT FINDINGS: Commercial labor
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
INTRODUCTION: To investigate whether the methylation of circulating cell-free DNA (cfDNA) differentiates active tuberculosis (TB) from latent TB infection (LTBI).
METHODS: Patients with pulmonary TB, contacts with LTBI, and healthy controls were enrolled (2018-2021). Plasma cfDNA was extracted, and using a 5-methylcytosine (5mC) DNA ELISA kit, the global methylation of cfDNA (5mC-cfDNA) was measured.
RESULTS: 59 TB, 63 LTBI, 39 healthy controls were included. The 5mC-cfDNA level was higher in TB (6.4 %) than LTBI (4.1 %) and healthy controls (4.9 %) (both p<0.05). Independent TB factors were
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
PURPOSE: The aim of this study was to assess the performance of cell-free DNA (cfDNA) screening to detect sex chromosome aneuploidies (SCAs) in an unselected obstetrical population with genetic confirmation.
METHODS: This was a planned secondary analysis of the multicenter, prospective SNP-based Microdeletion and Aneuploidy RegisTry (SMART) study. Patients receiving cfDNA results for autosomal aneuploidies and who had confirmatory genetic results for the relevant sex chromosomal aneuploidies were included. Screening performance for SCAs, including monosomy X (MX) and the sex chromosome trisom
Многоцентровое исследованиеСтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: The duration of anti-SARS-CoV-2-antibody detectability up to 12 months was examined in individuals after either single convalescence or convalescence and vaccination. Moreover, variables that might influence an anti-RBD/S1 antibody decline and the existence of a post-COVID-syndrome (PCS) were addressed.
METHODS: Forty-nine SARS-CoV-2-qRT-PCR-confirmed participants completed a 12-month examination of anti-SARS-CoV-2-antibody levels and PCS-associated long-term sequelae. Overall, 324 samples were collected. Cell-free DNA (cfDNA) was isolated and quantified from EDTA-plasma. As cfDNA
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVES: Universal screening for trisomy using cell-free DNA (cfDNA) has proven to be more effective than combined test, but it is not cost efficient currently. Contingent cfDNA screening on the results of the first-trimester combined test can improve the detection rate of the combined test and reduce the number of invasive tests at a lower cost than universal screening. In 2018, a contingent screening program was implemented in the community of Castilla y Leon (Spain). This study aims to compare the results achieved in Salamanca University Hospital during the first 3 years of contingent sc
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The last few years have seen an explosion in clinical research focusing on the use of donor-derived cell-free DNA (dd-cfDNA) in solid-organ transplants (SOT). Although most of the literature published so far focuses on kidney transplants, there are several recent as well as ongoing research studies on heart, lung, pancreas, and liver transplants. Though initially studied as a noninvasive means of identifying subclinical or acute rejection in SOT, it is rapidly becoming clear that instead of being a specific marker for allograft rejection, dd-cfDNA is more appropriately described as a marker of
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования