In situ hybridization was used to characterize the expression pattern of the T:G mismatch-specific thymidine-DNA glycosylase (TDG) gene, encoding a DNA repair enzyme which corrects G:T mismatches that result from the hydrolytic deamination of 5-methyl cytosines. TDG transcripts were uniformly and ubiquitously expressed from 7.5-13.5 days post-coitum, but were then markedly enriched in specific tissues of the developing fetus. At 14.5 gestational days, TDG was strongly expressed in the developing nervous system, thymus, lung, liver, kidney and intestine. At later stages, high levels of expressi
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: One-carbon metabolism supports methyl-donor availability for cellular methylation reactions. (6S)-5-methyltetrahydrofolate dicholine salt (5-MTHF-DCh) is a source of bioactive folate and choline, and a potential modifier of one-carbon metabolism and DNA methylation. However, despite the potential relevance of this dual folate-choline formulation to dietary supplement science, its effects on methyl-donor metabolism and downstream epigenetic endpoints remain insufficiently characterized.
STUDY DESIGN: Here, we tested whether 5-MTHF-DCh modifies one-carbon metabolism endpoints and DN…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
In rheumatoid arthritis (RA), altered DNA methylation patterns could be associated with pro-inflammatory, immune, and metabolic risk profiles. Notably, DNA methylation is dynamically regulated by the interplay of multiple factors, including diet, cardiometabolic status, and aging. Therefore, this study aimed to assess the associations between global leukocyte DNA methylation, dietary methyl-donor intake, and cardiometabolic risk in RA and control subjects (CS). A cross-sectional study was conducted with 123 female RA patients classified by the 2010 ACR-EULAR criteria, and 130 female CS. Leukoc…
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: The potential biomarkers for Parkinson's Disease (PD) in blood circulating cell-free DNA (cfDNA) have been infrequently explored. This study aims to identify specific methylation markers in blood cfDNA that could aid in the diagnosis of PD.
METHODS: A total of twenty patients with PD and nine healthy participants were recruited for this study. Cerebrospinal fluid (CSF) and/or blood samples were collected from the patients. Whole-genome bisulfite sequencing (WGBS) was conducted to analyze cfDNA methylation patterns in both CSF and blood samples. Data analysis and figure plotting we…
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Epigenetic mechanisms provide an interface between environmental factors and the genome and are influential in various diseases. These mechanisms, including DNA methylation, influence the regulation of development, differentiation, and establishment of cellular identity. Here, we performed high-throughput methylome profiling to determine whether differential patterns of DNA methylation correlate with Down syndrome (DS).
MATERIALS AND METHODS: We extracted DNA from the chorionic villi cells of five normal and five DS fetuses at the early developmental stage (12-13 weeks of gestatio…
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Analysis of global methylation in cells has revealed correlations between overall DNA methylation status and some biological states. Recent studies suggest that epigenetic regulation through DNA methylation could be responsible for neuroadaptations induced by addictive drugs. However, there is no investigation to determine global DNA methylation status following repeated exposure to addictive drugs. Using mice conditioned place preference (CPP) procedure, we measured global DNA methylation level in the nucleus accumbens (NAc) and the prefrontal cortex (PFC) associated with drug rewarding effec…
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
DNA methylation (DNAm) plays a critical role in Alzheimer's disease (AD). Previous epigenome-wide association studies using 450K arrays captured limited CpG coverage and often focused on a single neuropathological measure. Here we profiled DNAm in 1,250 postmortem prefrontal cortex samples from the Rush Alzheimer's Disease cohorts using the Infinium MethylationEPIC v2 array (~930,000 CpGs) and performed epigenome-wide association studies of multiple neuropathologic measures, including AD diagnosis, amyloid-β and tau tangles. We identified 107 differentially methylated probes associated with AD…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Alzheimer's disease (AD) is the most common cause of dementia and remains without a cure; recently introduced disease-modifying therapies provide only modest slowing in selected patients. Physical exercise is associated with better cognitive and functional outcomes, but the molecular mechanisms underlying these benefits remain incompletely understood. DNA methylation is a potential interface linking environmental stimuli to gene regulation and neural function. This narrative review examines evidence connecting exercise, DNA methylation, and AD, with emphasis on AD-related loci and on the possi…
СтатьяОбзорПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVE: To explore the associations between peripheral blood whole-genome DNA methylation and obesity in young Chinese males.
SUBJECTS AND METHODS: Four young Chinese males aged 18-25 years with obesity (body mass index [BMI] ≥ 30 kg/m2) from Liuzhou Peoples Hospital Health Management Center and 3 age-matched healthy controls with average weights were included. Methylation sequencing was conducted using whole-blood DNA extraction and an Illumina 850K methylation chip, followed by gene functional annotation, pathway enrichment analysis, and differential analysis using bioinformatics tools.
…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Aberrant DNA methylation and consequent silencing of tumor suppressor gene (TSGs) are maintained by UHRF1-mediated recruitment of DNMT1, making the UHRF1-DNMT1 axis as an attractive target for hypomethylating agents (HMAs). However, fully reversing DNA methylation abnormalities requires lowering DNMT1 below a deep threshold, posing major drug discovery challenges. Here, we demonstrated that a similarly stringent threshold applied to UHRF1 in maintaining hypermethylated TSG suppression. Genetically reducing redundancy in DNMT1 or UHRF1 markedly lowered these thresholds, sensitizing cells to the…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Noninvasive detection of bladder cancer remains challenging because many urine tests trade sensitivity for specificity. We evaluated whether a biologically grounded, complementary three-gene methylation panel measured in urine could improve diagnostic performance.
METHODS: We conducted a single-center 1:1 matched case-control study using clinically relevant urine samples. Urine DNA was subjected to bisulfite conversion and quantitative methylation analysis targeting three gene loci (TRPS1, HAND2, ZNF154). We evaluated the performance of individual genes and a combined panel, repor
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND/AIM: Accurate preoperative staging is important for predicting prognosis and determining appropriate preoperative treatment. We r … derestimated compared to the postoperative pathological diagnosis were classified as Group U. The ctDNA methylation levels of the SOX11 gene were assessed with the quantitative methylation-specific polymerase chain reaction.
RESULTS: pT3N+ patients had significant differences in recurrence-free survival (RFS) between Groups E and U (p=0.01). The Relative Methyla …
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Epigenetic dysregulation plays an essential role in autism spectrum disorder (ASD), but the parent-of-origin effects (POEs) of DNA methylation remain unknown. Here, we applied PacBio HiFi sequencing with haplotype-phased methylation profiling in 124 individuals (31 ASD quartets) to systematically dissect POE-dependent methylation. Comparative analysis of phased methylomes between probands and unaffected siblings identified 114 paternal- and 106 maternal-specific differential methylated cytosines (DMCs), 45 and 46 differential methylated regions (DMRs), and 2425 and 2693 methylation outliers (M…
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Colorectal cancer (CRC) is the second leading cause of cancer-related mortality in the United States. While the gut microbiota has been shown to influence CRC development, the specific contribution of bacteria to DNA methylation and carcinogenesis remains underexplored.
RESULTS: We colonize two groups of GF ApcMin/+ mice with two consortia, one harboring a pks+ E. coli strain with "low-pks" activity (DSMZ) and the second with a clinical isolate exhibiting "high-pks" activity (UM149). These colonized mice are exposed to DSS-induced colitis, and analyzed for tumor burden, DNA methyl…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: The prevalence of Type 2 diabetes mellitus (T2DM) is rapidly increasing in India, yet molecular markers that reflect early disease susceptibility remain limited. Epigenetic modifications such as DNA methylation may reflect early metabolic vulnerability preceding overt dysglycemia. In this study, we examined genome-wide DNA methylation patterns in a pilot subset nested within a prospective Indian cohort using Nanopore sequencing and assessed their associations with previously identified metabolite predictors from the same cohort.
RESULTS: Genome-wide DNA methylation profiling was p…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Regulation of the endothelial stress response is important for blood vessel homeostasis and angiogenesis, processes disrupted in common vasc … veal that ZONAB repression in endothelial cells leads to genome-wide changes in gene expression and DNA methylation, regulating endothelial proliferation and inflammation, as well as mitochondrial deregulation to promote cellular senescence. Hence, ZONAB supports endothelial homeostasis and may play a role in vascular health.
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Methylation of DNA is an epigenetic reversible process that regulates gene expression. Aberrant promoter methylation is associated with chronic inflammation; however, the genome-wide DNA promoter methylation signature in periodontitis remains unexplored. METHODS: The present study is an epigenome-wide association study (EWAS) aimed at investigating salivary DNA methylation patterns within gene promoter regions in individuals with Stage III/IV periodontitis compared to healthy controls. Cases (all available individuals with Stage III/IV and probing pocket depths (PPD) > 5 mm, n = 50…
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Alzheimer disease (AD) and aging have similar molecular mechanisms that are affected by genetic as well as environmental variables. Based on current research, gut microbiomes contribute to age-specific biological processes and play an essential role in maintaining host homeostasis. Several molecular processes, including the host DNA methylation mechanism, are affected by microbially derived metabolites such as short-chain fatty acids, folate, and choline. This interaction establishes a mechanistic causal relationship that further shapes gene expression, inflammatory balance, and neuronal funct…
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Lead (Pb), a ubiquitous environmental toxin, poses significant risks to central nervous system health, primarily by disrupting essential metal homeostasis in the brain. While epigenetic regulation and proteomic expression are significantly affected by Pb, its specific molecular impact on copper (Cu) redox states remains poorly understood. This study systematically investigated the molecular mechanisms underlying Pb-induced neurotoxicity in SH-SY5Y cells through integrated epigenomics and proteomics analysis. DNA methylation analysis revealed 141,357 differentially methylated regions (DMRs), pr…
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVES: To classify differentially methylated CpG sites in periodontitis based on methylation shift direction and location relative to CpG islands.
MATERIAL AND METHODS: We integrated DNA methylation data from 65 gingival samples (31 periodontitis, 34 healthy) from three GEO datasets. Preprocessing included normalization using R pipelines. Differential DNA methylation analysis was performed with the limma package. CpG sites (adjusted p < 0.05) were further evaluated using an exploratory threshold-crossing framework based on group-mean β-values (cutoff = 0.5) identifying Control low → Peri…
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования