This study identified and validated novel QTL controlling GPC, predicted the underlying candidate genes, and provides valuable insights for improving wheat nutritional quality while minimizing yield penalties. Grain protein content (GPC) is a key determinant of wheat quality, but its improvement is often limited by a negative correlation with yield. To elucidate the genetic architecture of GPC, a genome-wide association study was conducted on 224 wheat cultivars genotyped with a 120 K SNP array and phenotyped across three environments. We identified three stable quantitative trait loci (QTL) o…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Glomerulonephritis (GN) is an immune-mediated kidney disorder that causes glomerular injury, progressive renal dysfunction, and end-stage kidney disease. Traditional treatments such as corticosteroids and immunosuppressants are limited by variable efficacy and severe adverse effects, highlighting the need for novel therapeutic targets and personalized strategies. We performed a systematic multi-omics Mendelian randomization (MR) analysis applying established proteomic and transcriptomic quantitative trait loci (pQTL/eQTL) resources to genome-wide association studies (GWAS) of four GN subtypes:…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Serine β-lactamase-like protein (LACTB), a mitochondrial protease, has incompletely characterized roles in metabolic pathways. We employed Mendelian randomization to investigate LACTB's causal relationships with lipid metabolism, metabolic syndrome (MetS), and chronic kidney disease (CKD). We performed a comprehensive Mendelian randomization (MR) analysis using genome-wide association study summary statistics. Cis-expression quantitative trait loci from the eQTLGen consortium identified genetic instruments for LACTB. Two-sample MR approaches, including inverse variance weighted, MR-Egger, and …
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND AND OBJECTIVE: To investigate the relationship between inflammation and hypertension by comparing epigenetic and serum biomarkers of inflammation and their association with target organ damage (TOD).
METHODS: The epigenome-wide methylation profiles of peripheral leukocyte DNA from 176 patients with hypertension were analyzed using Illumina Infinium Methylation EPIC BeadChips. The commercially available Olink® Target 96 Inflammation panels were utilized to evaluate markers associated with inflammation. We identified CpG-protein association protein quantitative trait methylation loci
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Ongoing climate change is driving unprecedented environmental fluctuations, with extreme events predicted to increase in frequency, intensit … ins the most effective control strategy. In tomato, resistance is quantitative and mostly relies on quantitative trait loci (QTLs) bwr-6 and bwr-12. However, as in other crops, high temperature and humidity can compromise this resistance in commercial tomato cultivars. We investigated temperature-dependent quantitative disease resistance (QDR) using a panel of 189 wild t …
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Discovery of autoantibodies in steroid-sensitive nephrotic syndrome (SSNS) has transformed our understanding of SSNS as an immun … 1540 proteins on SSNS risk by Mendelian randomization (MR) using cis genetic determinants (protein quantitative trait loci, pQTL). Genetic colocalization, gene expression, and affinity binding analyses were performed to further investigate loci identified by MR.
RESULTS: Two proteins, apolipoprotein M (APOM) and Tenascin XB (TNXB), were causally linked to SSNS by MR an …
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The effect of diet on genetic regulation in humans remains largely unexplored. Here, we investigate gene-diet interactions in a unique group of healthy individuals (N = 200) who alternate between omnivory and dietary restriction of animal products for religious reasons. Using longitudinal proteomic and genotype data, we identify diet-responsive cis-pQTLs and highlight regulatory effects on LBR and MSRA, proteins involved in cholesterol and methionine metabolism respectively. LBR-associated cis-pQTL rs74148404 colocalizes with obesity exclusively under dietary restriction, suggesting diet-depen
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Cervical spondylosis (CS) is an age-related degenerative spinal disorder with increasing evidence linking its pathogenesis to immune aging. The genetic mechanisms connecting immune dysregulation to CS remain largely undefined.
METHODS: We integrated GWAS data from 484,598 individuals with single-cell eQTL profiles across 14 immune cell types, using Mendelian randomization (MR) and Bayesian colocalization to identify genes whose cell-type-specific expression causally influences CS risk. Entropy analysis quantified lineage specificity of MR effects. Functional enrichment, drug-gene
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The genetic architecture of polycystic ovary syndrome (PCOS) has not been fully elucidated. Translating genome-wide association study (GWAS) loci into functional effector genes represents a key challenge for elucidating disease mechanisms and advancing targeted therapeutic strategies. In this study, the FinnGen R12 dataset was utilized in conjunction with the Genotype-Tissue Expression Project (GTEx) v8 eQTL dataset to conduct cross-tissue transcriptome-wide association studies (TWAS). External validation was performed in two independent datasets, comprising a PCOS meta-analysis of Rotterdam-
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Celery (Apium graveolens) is a globally cultivated vegetable renowned for its health-promoting and nutraceutical benefits. Exploring its genomic and metabolic diversity can help to facilitate breeding selection. Here, by integrating genomic and metabolomic analyses of 305 globally representative accessions, we reveal pronounced east-west population structure that parallels geographical distribution and varietal differentiation, with three major variety groups showing distinct domestication trajectories. We identify key loci associated with domestication-related traits, including petiole morpho
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Rice (Oryza sativa L.) is a staple food crop globally, and identifying genes governing grain yield is critical for food security. Although heat shock proteins (HSPs) are known for their roles in stress tolerance, the molecular mechanisms by which they regulate yield formation remain unclear. In this study, we generated knockout and overexpression lines for OsHSP20 which is encoding a member of the Hsp20/alpha crystallin family, LOC_Os10g30162.1 (It is also one of the four candidate genes discovered during our fine mapping of major QTLs for photosynthetic rate in rice.), and performed integrate
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Fusarium ear rot (FER), caused by Fusarium verticillioides, results in substantial yield losses and poses a significant threat to maize production worldwide. However, the genetic basis of FER resistance remains poorly understood. Utilizing QTL-seq and association analysis, we identified a gene encoding UDP-ᴅ-glucuronate 4-epimerase 1 (ZmGAE1). A 141-base pair insertion was revealed as the natural functional variation in the promoter of ZmGAE1, which decreases its expression and enhances resistance to FER. Functional validation confirmed that ZmGAE1 acts as a negative regulator of maize resista
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Periodontal disease is a widespread inflammatory condition that compromises the supporting structures of the teeth, potentially … oups for subsequent analysis utilizing CellChat and ClusterProfilerR. MR analysis of the expression quantitative trait loci (eQTLs) for these genes was conducted to determine causal relationships with periodontal disease, leveraging data from the IEU Open GWAS project.
RESULTS: Single-cell analysis revealed distinct immune cell subtypes and indicated an increased presen …
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Metabolic dysfunction-associated steatotic liver disease (MASLD) affects > 25% of the global population, potentially leading to … SLD. Of 4302 drug-target genes, 2,664 genetic instrument variables were derived from cis-expression quantitative trait loci (cis-eQTLs). Colocalization analyses assessed shared causal variants between MASLD-associated single nucleotide polymorphisms and eQTLs. Using the drug target gene cis-eQTL of liver tissue from the genotype-tissue expression project, we performed MR …
СтатьяМетаанализПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Mounting evidence suggests that Parkinson's disease (PD) and inflammatory bowel disease (IBD) are closely associated and becoming global health burdens. However, the causal relationships and common pathogeneses between them are uncertain. Furthermore, they are uncurable. Thus, we aimed to identify the causal relationships and novel therapeutic targets shared between them based on their common pathophysiological mechanisms in gut-brain-axis (GBA).
METHODS: A meta-analysis on bidirectional Mendelian randomization (MR) utilizing various datasets was performed to estimate their causal
СтатьяМетаанализПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Most genetic variants identified through genome-wide association studies (GWASs) are suspected to be regulatory in nature, but only a small fraction colocalize with expression quantitative trait loci (eQTLs, variants associated with expression of a gene). Therefore, it is hypothesized but largely untested that integration of disease GWAS with context-specific eQTLs will reveal the underlying genes driving disease associations. We used colocalization and transcriptomic analyses to identify shared genetic variants and likely causal genes associated with critically ill COVID-19 and idiopathic pul…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
PURPOSE: The purpose of this study was to identify therapeutic targets and repurposable drugs for primary open-angle glaucoma (POAG) by investigating its immunometabolic mechanisms using druggable genomic and single-cell transcriptomic approaches.
METHODS: We integrated druggable genome-wide and single-cell Mendelian randomization (MR) using POAG genome-wide association study (GWAS) data, blood and single-cell expression quantitative trait loci (eQTL) datasets. Causal genes were identified via colocalization and MR inference (inverse-variance weighted [IVW]). Drug-gene interactions were predi…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Rosacea is a chronic inflammatory facial disorder with limited therapeutic options, severely impacting patients' quality of life. The identification of druggable genes plays a crucial role in facilitating the development of effective therapeutic strategies.
METHODS: We conducted Mendelian randomization (MR) and Summary-based Mendelian randomization (SMR) analyses by integrating data on 5883 druggable genes, cis-expressed quantitative trait loci (eQTL) from blood and skin tissue (lower leg and suprapubic), and genome-wide association study (GWAS) data on rosacea to elucidate the ca…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Tinnitus, a condition characterized by the perception of ringing in the ears, significantly impacts quality of life, yet its underlying biological mechanisms remain poorly understood. Emerging evidence suggests a role for inflammation in tinnitus pathophysiology. This study employs a bidirectional two-sample Mendelian Randomization (MR) approach to investigate the causal relationship between circulating inflammatory proteins and tinnitus. Genetic data from large-scale pQTL and GWAS datasets were analyzed to identify potential causal links. The results reveal that elevated levels of CCL19, CXCL
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The co-occurrence of alcohol use disorder (AUD) and schizophrenia is prevalent, with a rate of 33.7%. Previous research has suggested a gene … and rs145879288) that influence the pace of aging and cognitive functions (rs705935) through their quantitative trait loci effects on CpG sites within SSTR4.
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования