Nickel-containing carbon monoxide dehydrogenases (CODHs) reversibly catalyze the oxidation of carbon monoxide to carbon dioxide and are of vital importance in the global carbon cycle. The unusual catalytic CODH C-cluster has been crystallographically characterized as either a NiFe(4)S(4) or a NiFe(4)S(5) metal center, the latter containing a fifth, additional sulfide that bridges Ni and a unique Fe site. To determine whether this bridging sulfide is catalytically relevant and to further explore the mechanism of the C-cluster, we obtained crystal structures of the 310 kDa bifunctional CODH/acet
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПоддержка правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The protein phosphatase 2A (PP2A) is a serine/threonine phosphatase involved in the regulation of multiple signaling pathways including the Wnt/beta-catenin and the ERK pathways. To understand the complex signaling networking associated with PP2A, we searched proteins interacting with the catalytic subunit of protein phosphatase 2A (PP2Ac) by a pull-down analysis followed by 2-D gel electrophoresis and proteomic analyses. The probability of identification of the proteins interacting with PP2Ac was increased by searching proteins differently interacting with PP2Ac according to stimulation of Wn
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Our goal was to design, synthesize, and evaluate new cholinesterase inhibitors. Fourteen dehydroamino acids esterified to choline and to its ternary analog were synthesized by a new method that gave a yield of 84-93%. The potency of the amino acid ester derivatives was tested by measuring K(i) values for inhibition of human red cell acetylcholinesterase and human plasma butyrylcholinesterase. The most potent compound was a choline ester of dehydrophenylalanine where the amine group of the amino acid was derivatized with a benzoyl group containing a methoxy in the 2-position, CH(3)O(C(6)H(4))CO
СтатьяПоддержка правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MID1 catalyzes the ubiquitination of the protein alpha4 and the catalytic subunit of protein phosphatase 2A. Mutations within the MID1 Bbox1 domain are associated with X-linked Opitz G syndrome (XLOS). Our functional assays have shown that mutations of Ala130 to Val or Thr, Cys142 to Ser and Cys145 to Thr completely disrupt the polyubiquitination of alpha4. Using NMR spectroscopy, we characterize the effect of these mutations on the tertiary structure of the Bbox1 domain by itself and in tandem with the Bbox2 domain. The mutation of either Cys142 or Cys145, each of which is involved in coordin
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоддержка правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Two DNA methyltransferases, Dam and β-class cell cycle-regulated DNA methyltransferase (CcrM), are key mediators of bacterial epigenetics. CcrM from the bacterium Caulobacter crescentus (CcrM C. crescentus, methylates adenine at 5'-GANTC-3') displays 105-107-fold sequence discrimination against noncognate sequences. However, the underlying recognition mechanism is unclear. Here, CcrM C. crescentus activity was either improved or mildly attenuated with substrates having one to three mismatched bp within or adjacent to the recognition site, but only if the strand undergoing methylation is left u
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The p21-activated kinases (PAKs), stimulated by binding with GTP-liganded forms of Cdc42 or Rac, modulate cytoskeletal actin assembly and activate MAP-kinase pathways. The 2.3 A resolution crystal structure of a complex between the N-terminal autoregulatory fragment and the C-terminal kinase domain of PAK1 shows that GTPase binding will trigger a series of conformational changes, beginning with disruption of a PAK1 dimer and ending with rearrangement of the kinase active site into a catalytically competent state. An inhibitory switch (IS) domain, which overlaps the GTPase binding region of PAK
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоддержка службы здравоохранения СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Azo dyes are widespread in the environment, and humans ingest a range of these dyes present in food and drugs. The human gut microbiome significantly impacts the fate of ingested azo dyes primarily through the reduction of the azo bond (R-N = N-R'). Flavin-dependent azoreductases have been considered the key enzymatic drivers of this process. To challenge this paradigm, we constructed a sequence similarity network of known azoreductases and focused on AzoA of Klebsiella pneumoniae, a central representative within the gut microbiome cluster. Unexpectedly, K. pneumoniae AzoA displayed relatively
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Chalcone synthase (CHS) is the entry-point enzyme of the flavonoid biosynthetic pathway, catalyzing the first committed step toward the production of diverse bioactive metabolites with antioxidant, anti-inflammatory, and anticancer properties. Here, we conducted a comparative in silico characterization of CHS from 13 medicinal plants, with Arabidopsis thaliana included as reference species. Protein sequences retrieved from UniProtKB were aligned using ClustalW, revealing strong conservation of key motifs, particularly the catalytic triad (Cys-His-Asn), GFGPG motif, and catalytic loop. Physicoc
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
SARS-CoV-2 main protease (MPro) is a cysteine enzyme essential for viral replication and pathogenesis. It contains multiple cysteines that are susceptible to covalent modifications. Reported modifications include inhibitor-derived modifications at the catalytic Cys145, Cys145-Cys117 disulfide, an S-O-N (SON) crosslink between Cys22 and Lys61, and S-O-N-O-S (SONOS) crosslink spanning Cys22-Lys61-Cys44, Cys300 S-glutathionylation, and inhibitor-derived adducts on Cys156 and Cys300. Reanalysis of MPro crystal structures obtained from samples exposed to air identified nine structures containing th
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The RNA interference (RNAi) pathway regulates gene expression and viral defense and has been harnessed in therapeutic solutions to inhibit otherwise undruggable proteins by preventing translation. Dicer initiates RNAi by generating cleaved RNA products that bind to a target mRNA to promote gene silencing. Mutations to the Dicer catalytic domain cause DICER1 syndrome, which increases the risk of cancers, including early childhood variants. However, the catalytic mechanism remains poorly defined due to the lack of structural data for Dicer bound to a substrate (or substrate mimic) in the presenc…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Polymorphic toxins mediate interbacterial antagonism among competitors in the gut microbiome. Nuclease effectors, distantly related to the type VI-secreted Bacteroidales Tde, are enriched in human gut Bacillota. Tde mediates antagonism among Bacillota, and expression of the cognate immunity, Tdi, in recipients is protective. Crystal structures of Tde/Tdi complexes from two Bacillus spp. and Enterococcus quebecensis highlight a conserved mechanism of immunity. Tdi engages Tde with high-affinity, specific binding at an interface that features predominantly polar amino acids. A separate Tdi inter
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The bis(2-hydroxyethyl) disulfide (HEDS) steady-state assay is the most commonly used assay to measure the activity and kinetic parameters of glutaredoxins. Despite its widespread use, the HEDS assay is often misinterpreted, and the exact enzyme mechanism has remained unclear. Here we used stopped-flow kinetic measurements to show that the active-site cysteinyl residue of mono- and dithiol class I glutaredoxins from Saccharomyces cerevisiae and Plasmodium falciparum reduces HEDS with a second-order rate constant around 105 M-1s-1, regardless of the absence or presence of reduced glutathione (G
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The rapid expansion of CRISPR technologies has unveiled a diverse repertoire of RNA-guided endonucleases, among them the compact Cas12j, which has emerged as a promising genome-editing tool. Cas12j cleaves the two DNA strands sequentially; however, the molecular mechanism that regulates this cleavage remains incompletely understood. Here, we combine extensive all-atom molecular dynamics simulations with well-tempered metadynamics, totaling approximately 175 μs of cumulative sampling, to investigate how target-strand accessibility to the catalytic site is controlled. Our results are in agreemen
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Alzheimer's disease (AD) represents an escalating global neuropharmacological crisis, with prevalence in high-growth demographic regions such as India projected to exceed 14 million by 2040. This study addresses the urgent need for high-potency, dual-site acetylcholinesterase (AChE) inhibitors through an integrated computational pipeline. We address the failure of mono-target paradigms by designing scaffolds capable of simultaneously anchoring the Catalytic Active Site (CAS) and the Peripheral Anionic Site (PAS). A robust GA-MLR QSAR model was developed from 115 quinoline analogs using 11,135
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The coronaviral main protease (Mpro) has been the subject of various biochemical and structural studies and a drug target against severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 (SARS-CoV-2) infections. SARS-CoV-2 Mpro is active as a dimer, but despite apparent cooperativity in catalytic activity, how the two distal active sites communicate and modulate binding and/or catalysis is unclear. Here, we have investigated the interplay between cooperativity, dimerization, and substrate cleavage in SARS-CoV-2 Mpro through a combination of enzymatic assays, crystal structures, and protein characteriza
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Bacteriophage tailspike proteins (TSPs) degrade bacterial capsules to enable infection, yet the molecular determinants of their function and host range remain unclear. We applied deep mutational scanning (DMS) to the endosialidase TSP of Escherichia coli K1 phage K1F, generating 22,365 single-amino acid variants using an enhanced ORACLE phage engineering platform. Functional scores revealed that the TSP is structurally fragile yet harbors pockets of adaptive flexibility. Mutations within the β-propeller active site uncovered residues accommodating longer sialic acid chains than captured by str
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Hyaluronic acid in vivo serves a multitude of functions, including water retention and osmoregulation. Inhibition of hyaluronidase activity prevents the degradation of hyaluronic acid, thereby preserving its normal physiological functions. Fucoidan is a natural sulfated polysaccharide extracted from brown algae. Here, bovine testicular hyaluronidase was separated and purified as a basis for investigating the inhibitory effect of fucoidan on hyaluronidase activity. The experimental results showed that fucoidan exhibited strong competitive inhibition of hyaluronidase activity, with an IC50 value
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Protein prenylation plays a critical role in regulating the cellular localization of small GTPases and is essential for multiple myeloma (MM) pathology. Geranylgeranyl diphosphate synthase (GGPPS), producing a key prenylation moiety, exists in a dimeric or hexameric form, depending on the species. However, the functional significance of this oligomerization remains unclear. Using crystallography, mass spectrometry, and fluorescence spectroscopy, we show that the GGPPSR235C mutant-found in the widely studied MM cell line RPMI-8226-exhibits weakened inter-dimer interactions, reduced hexamer stab
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Urolithin A (UA) is a dibenzo[b,d]pyran-6-one polyhydroxy derivative produced as intestinal microbe metabolize ellagitannin and ellagic acid. Because of its superior anti-inflammatory and antioxidant effects, it can cure neuronal damage in a variety of ways and play a neuroprotective role. More and more research has revealed that UA is a potential medicine for the treatment of neurodegenerative diseases. Due to UA source limitations, it is insufficient to achieve disease treatment concentrations, and the activity of UA inhibiting PDE2 needs further enhancement. As a result, we used UA as the p
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase (Rubisco) is central to global CO2 fixation. In eukaryotic algae, its catalytic efficiency is enhanced through the pyrenoid - a protein-dense organelle within the chloroplast that concentrates CO2. Although Rubisco structure has been extensively studied in vitro, its native structure, dynamics and interactions within the pyrenoid remain elusive. Here, we present the native Rubisco structure inside the green alga Chlamydomonas reinhardtii determined by cryo-electron tomography and subtomogram averaging of cryo-focused ion beam milled cells. Multip
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования