BldD generally functions as a repressor controlling morphological development of Streptomyces. In this work, evidences that BldD also activates antibiotic production are provided. In Streptomyces roseosporus (which produces daptomycin widely used for treatment of human infections), deletion of bldD notably reduced daptomycin production, but enhanced sporulation. BldD stimulated daptomycin production by directly activating transcription of dpt structural genes and dptR3 (which encodes an indirect activator of daptomycin production), and repressed its own gene. BldD-binding sites on promoter reg
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The dinucleotide second messenger c-di-GMP has emerged as a central regulator of reversible cell attachment during bacterial biofilm formation. A prominent cell adhesion mechanism first identified in pseudomonads combines two c-di-GMP-mediated processes: transcription of a large adhesin and its cell surface display via posttranslational proteolytic control. Here, we characterize an orthologous c-di-GMP effector system and show that it is operational in Vibrio cholerae, where it regulates two distinct classes of adhesins. Through structural analyses, we reveal a conserved autoinhibition mechani
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПоддержка правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Non-typeable Haemophilus influenzae (NTHi) is an opportunistic pathogen that plays a major role in a number of respiratory tract infections, including otitis media, cystic fibrosis and chronic obstructive pulmonary disease. Biofilm formation has been implicated in both NTHi colonization and disease, and is responsible for the increased tolerance of this pathogen towards antibiotic treatment. Targeting metabolic pathways that are important in NTHi biofilm formation represents a potential strategy to combat this antibiotic recalcitrance. A previous investigation demonstrated increased expression
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Microbes produce a variety of secondary metabolites to be explored for herbicidal activities. We investigated an endophyte Pseudomonas viridiflava CDRTc14, which impacted growth of its host Lepidium draba L., to better understand the possible genetic determinants for herbicidal and host-interaction traits. Inoculation tests with a variety of target plants revealed that CDRTc14 shows plant-specific effects ranging from beneficial to negative. Its herbicidal effect appeared to be dose-dependent and resembled phenotypically the germination arrest factor of Pseudomonas fluorescens WH6. CDRTc14 sha
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Staphylococcus aureus continues to pose major public health challenges in many areas because of antibiotic resistance problems. In the Caribbean, especially Trinidad and Tobago, the challenge is not different. This study was performed to evaluate the antimicrobial resistance gene prevalence among S. aureus isolates in Trinidad and Tobago. Standard and molecular microbiological methods, including the Microscan automated system, DNA microarray and multi locus sequence typing (MLST) analysis, were performed on 309 clinical S. aureus isolates recovered from patients who were treated at three of th
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Brucella abortus is an alpha-2 proteobacteria with a type IV secretion system (T4SS) known as virB, which is necessary to gain virulence by building up a replicative vacuole associated with the endoplasmic reticulum of the host cell. A virB T4SS mutant of the B. abortus 2308 strain and its wild-type strain were grown in acid medium in order to obtain and analyze their proteomes, looking for putative proteins that may serve as T4SS substrates and those that may be subjected to T4SS regulation. A total of 47 overexpressed and 22 underexpressed proteins from the virB T4SS mutant strain were selec
Сравнительное исследованиеСтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Colony morphology variation of Burkholderia pseudomallei is a notable feature of a proportion of primary clinical cultures from patients with melioidosis. Here, we examined the hypothesis that colony morphology switching results in phenotypic changes associated with enhanced survival under adverse conditions. We generated isogenic colony morphology types II and III from B. pseudomallei strain 153 type I, and compared their protein expression profiles using 2D gel electrophoresis. Numerous proteins were differentially expressed, the most prominent of which were flagellin, arginine deiminase (AD
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Density-dependent gene expression, quorum sensing (QS), involves the synthesis and detection of low-molecular-weight molecules known as autoinducers. Inhibitors of bacterial QS systems offer potential treatment of infections with highly virulent or multidrug-resistant agents. We studied the effects on Bacillus anthracis growth and the virulence gene (pagA, lef, and cya) expression of the QS inhibitor (5Z)-4-bromo-5-(bromomethylene)-3-butyl-2(5H)-furanone, which is naturally synthesized by the marine alga Delisea pulchra, as well as a related compound and synthetic derivatives. Growth of B. ant
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПоддержка правительства СШАПоддержка службы здравоохранения СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Epstein-Barr virus-induced gene 3 (EBI3) encodes a protein that in mammals is known to be a subunit of interleukin (IL)-27 and IL-35, both which regulate cytokine production and inflammatory response. To date, no studies on fish EBI3 have been documented. In this work, we report the identification of an EBI3 homologue, CsEBI3, from tongue sole (Cynoglossus semilaevis) and analysis of its expression and biological effect. CsEBI3 is composed of 245 amino acid residues and possesses a Fibronectin type 3 (FN3) domain that is preserved in lower and higher vertebrates. Expression of CsEBI3 was detec
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
LL-D49194α1 (LLD) is a natural product with promising antitumor activity; however, its extremely low native fermentation yield has severely hindered further development. This study identified and characterized two key Streptomyces antibiotic regulatory protein-family activators (LldRg1, LldRg5) and a two-component system (LldRg3/Rg4) within its biosynthetic gene cluster. Coordinated overexpression of these three regulators dramatically increased LLD titer >100-fold to ∼400 mg/L. This engineering also led to the coupregulation of an MFS transporter and a DNA repair-related self-resistance gene,
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Global regulators (GRs) are key transcription factors that orchestrate the expression of multiple genes, playing essential roles in stress responses, virulence, secondary metabolism, and antibiotic resistance-traits that make them powerful tools for synthetic biology applications. However, conventional approaches often fail to detect remote homologs and novel GR types, limiting our understanding of their regulatory diversity and evolutionary dynamics across prokaryotes. Here, we present a large-scale, protein language model-driven framework to systematically chart the global regulatory landsca
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Beta-lactam antibiotics are widely used to treat bacterial infections, but their efficacy is compromised by resistance mechanisms such as the production of beta-lactamases. In Pseudomonas aeruginosa, the chromosomally encoded beta-lactamase AmpC is the primary mediator of beta-lactam resistance. ampC expression is regulated by the transcription factor AmpR, which responds to intracellular peptidoglycan (PG) fragments. Under normal conditions, AmpR binds the PG precursor (UDP-MurNAc-pentapeptide) and represses ampC expression. However, during beta-lactam treatment or in PG recycling-deficient m
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Stenotrophomonas maltophilia is an important opportunistic pathogen that utilizes SmeE efflux pump to extrude structurally dissimilar antibiotics. Here, we constructed smeE gene deletion (D531) and overexpression (O531) strains of S. maltophilia CYZ, and investigated changes in biological functions by analyzing the transcriptional and expression levels of differentially expressed genes and proteins, respectively. S. maltophilia D531 showed significant susceptibility to erythromycin, quinolones, and tetracycline. The organism exhibited stronger bacterial motility, which was due to the upregulat
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Mycobacterium tuberculosis maintains long-term infections characterised by the need to regulate growth and adapt to contrasting in vivo environments. Here we show that M. tuberculosis complex bacteria utilise reversible ADP-ribosylation of single-stranded DNA as a mechanism to coordinate stationary phase growth with transcriptional adaptation. The DNA modification is controlled by DarT, an ADP-ribosyltransferase, which adds ADP-ribose to thymidine, and DarG, which enzymatically removes this base modification. Using darG-knockdown M. bovis BCG, we map the first DNA ADP-ribosylome from any organ
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Pseudomonas aeruginosa is a significant opportunistic pathogen, and its complex mechanisms of antibiotic resistance pose a challenge to modern medicine. This literature review explores the advancements made from 1979 to 2024 in understanding the regulatory networks of antibiotic resistance genes in Pseudomonas aeruginosa, with a particular focus on the molecular underpinnings of these resistance mechanisms. The review highlights four main pathways involved in drug resistance: reducing outer membrane permeability, enhancing active efflux systems, producing antibiotic-inactivating enzymes, and f
СтатьяОбзорПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Toxin-antitoxin (TA) systems are genetic modules that consist of a stable protein-toxin and an unstable antitoxin that neutralizes the toxic effect. In type II TA systems, the antitoxin is a protein that inhibits the toxin by direct binding. Type II TA systems, whose roles and functions are under intensive study, are highly distributed among bacterial chromosomes. Here, we identified and characterized a novel type II TA system PrrT/A encoded in the chromosome of the clinical isolate 39016 of the opportunistic pathogen Pseudomonas aeruginosa. We have shown that the PrrT/A system exhibits classi
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Pseudouridimycin (PUM) was recently discovered from Streptomyces sp. DSM26212 as a novel bacterial nucleoside analog that competes with UTP for access to the RNA polymerase (RNAP) active site, thereby inhibiting bacterial RNAP by blocking transcription. This represents a novel antibacterial mode of action and it is known that PUM inhibits bacterial RNAP in vitro, inhibits bacterial growth in vitro, and was active in vivo in a mouse infection model of Streptococcus pyogenes peritonitis. The biosynthetic gene cluster (BGC) was previously identified and characterized by knockout experiments. Howe
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
This research was to explore antibiotic-induced drug resistance of Salmonella enteritidis and its biofilm formation mechanism. Kirby-Bauer (K-B) disk method recommended by Clinical and Laboratory Standards Institute (CLSI) was used to test drug sensitivity of Salmonella enteritidis to 16 kinds of antibiotics including ß-lactams, aminoglycosides, quinolones, sulfonamides, chloramphenicols, and tetracyclines. Polymerase chain reaction (PCR) was performed to detect carrying of drug resistance genes of 29 kinds of antibiotics including ß-lactams, aminoglycosides, quinolones, sulfonamides, chloramp
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Pseudomonas aeruginosa harbors pvcABCD operon that is responsible for the synthesis of paerucumarin. Here we report the involvement of pvcABCD operon in chloramphenicol and ciprofloxacin resistance. P. aeruginosa mutant defective in pvcB (PW4832) was more sensitive to chloramphenicol and ciprofloxacin in comparison with its parent strain (MPAO1). A mutation in pvcA gene in MPAO1 (PW4830) did not alter the sensitivity to either antibiotic. As chloramphenicol and ciprofloxacin are substrates of MexEF-OprN efflux pump, so we decided to investigate the modulation of MexEF-OprN and its transcriptio
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
PsaA, the subunit of the fimbria originally referred to as the "pH 6 antigen," is required for full virulence of Yersinia pestis during bubonic plague. The expression of psaA is dependent upon specific environmental signals, and while the signals (high temperature and acidic pH) are defined, the mechanisms underlying this regulation remain unclear. In the closely related species Yersinia pseudotuberculosis, psaA transcription requires two regulatory genes, psaE and psaF, and it is speculated that posttranscriptional regulation of PsaE and/or PsaF contributes to the regulation of psaA transcrip
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования