The chromatin immunoprecipitation (ChIP) assay has recently been exploited as a powerful and versatile technique for probing protein-DNA interactions within the chromatin environment. In this method, intact cells are fixed with a reversible DNA-protein cross-linking agent (formaldehyde), and associated DNA is enriched by immunoprecipitating a target DNA binding protein. The bound DNA in the immune complexes is then used to identify that specific DNA binding protein's endogenous genomic targets. Nuclear factor kappaB (NF-kappaB) is a highly inducible transcription factor that controls genetic n…
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Dendritic cell (DC) activation by nucleic acid-containing immunoglobulin (Ig)G complexes has been implicated in systemic lupus erythematosus (SLE) pathogenesis. However, the mechanisms responsible for activation and subsequent disease induction are not completely understood. Here we show that murine DCs are much more effectively activated by immune complexes that contain IgG bound to chromatin than by immune complexes that contain foreign protein. Activation by these chromatin immune complexes occurs by two distinct pathways. One pathway involves dual engagement of the Fc receptor FcgammaRIII …
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоддержка службы здравоохранения СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVES: To obtain knowledge on male reproductive toxicity of inorganic lead at current European exposure levels and to establish lowest … ned in a fresh semen sample according to an agreed protocol subject to quality assurance. The sperm chromatin structure assay (SCSA) was performed at a centralised laboratory. Extraneous determinants including centre, period of sexual abstinence, and age were taken into account in the statistical analysis. If appropriate, possible thresholds were examined b …
СтатьяМногоцентровое исследованиеПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Detergent-resistant, lipophilic structures (LSs) at the apex and base of the conical sea urchin sperm nucleus are targets for cytoplasmic me … inding, and reconstitution restores MV binding and GTP-induced fusion activities. Binding of LSs to chromatin or to MVs is mediated, at least in part, by proteins on each structure. Inter-specific LS-chromatin reconstitutions using sea urchin, fish, frog, and mammalian LSs indicate that site-specific binding is not dependent on species. All LSs also bind to …
Сравнительное исследованиеСтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоддержка правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Antikinetochore antibodies from patients with the CREST syndrome of scleroderma were used as probes to study homogeneously staining regions (HSRs) in multidrug resistant (MDR) mouse tumor cells, and chromatin bodies (CBs) in MDR mouse-hamster hybrid cells. In one mouse tumor line the C-band positive HSR showed antigenic properties and displayed many weekly fluorescent spots, i.e. it contained kinetochore proteins. The immunofluorescence pattern of the HSR could also be observed in interphase nuclei. The C-band positive CBs of the hybrid cells had active centromeres, as shown by double kinetoch…
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Millipore filter imprints of conjunctiva in patients with conjunctival symptoms revealed a 'snake-like' appearance of the chromatin in nuclei of epithelial cells. A total of 40 patients were investigated. Abnormal cells were found in 8/16 patients with long-term keratoconjunctivitis sicca and in 6/24 patients suspected for Sjøgrens syndrome. The abnormal cells were typically arranged in clusters among morphologically normal epithelial cells. The finding was significantly correlated to the severity of the disease in patients with keratoconjunctivitis sicca. In all patients the abnormal cells co…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
1alpha,25-Dihydroxyvitamin D3 administration to rachitic chicks results in an increase in the chromatin template activity of intestinal target tissue assayed in vitro using Escherichia coli RNA polymerase. The maximum stimulation of template capacity was 12 to 20% over control values and occurred 2 hours after administration of the sterol. This rapid effect preceded the biologic response to 1alpha,25-dihydroxyvitamin D3 in the intestine and was not observed in other tissues such as liver or kidney. The in vivo enhancement of intestinal chromatin template activity was specific for the 1alpha,25…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Liver-organotropic metastasis occurs in cancers such as uveal melanoma (UM) and pancreatic ductal adenocarcinoma (PDAC) and is a leading cause of mortality at the terminal stage. Colonization is a rate-limiting and converging step in the metastatic cascade. The drivers underlying liver colonization have largely remained elusive. In this report, we hypothesized that pioneer transcription factors (TFs) increase chromatin accessibility and superenhancer (SE) remodeling, which subsequently promote colonization-associated cellular features [e.g., proliferation, survival, cancer stem cells (CSCs), m…
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Multiple myeloma (MM) is monitored using bone marrow-based minimal residual disease (MRD) assays, which provide high sensitivity but require repeated invasive sampling and are limited to a single anatomical site. Cell-free DNA (cfDNA) offers a minimally invasive alternative, yet most cfDNA approaches rely on prior tumor profiling to identify patient-specific genomic alterations for subsequent tracking in plasma. Here, we developed MATADOR, a myeloma-specific, tumor-agnostic framework that leverages cfDNA fragmentation patterns at a fixed set of myeloma-specific chromatin-accessible regulatory …
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Chronic sterile inflammation can persist after the initiating stressor has subsided, indicating that resolution failure may involve more tha … hdrawal-rechallenge experiments that can test whether correcting nucleotide stress produces durable chromatin and inflammatory resetting rather than transient suppression.
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Chromatin regulators (CRs), as key components of the epigenetic machinery, participate in tumor progression and therapeutic resistance by modulating chromatin structure and gene expression. Nonetheless, the precise functions of CRs in cancer immunotherapy and the tumor microenvironment (TME) remain largely unexplored. Here, we integrated multi-omics data to characterize genomic alterations, transcriptomic profiles, and copy number variations (CNVs) of 215 CRs and identified survival-associated CRs using Cox regression analysis. Subsequently, based on CR expression patterns, esophageal squamous…
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Novel SBCP chromatin precipitation bypasses nuclear isolation to recover abundant intact chromatinproteins and enhance ChIP performance in diverse plants. Chromatin isolation remains a major technical bottleneck in plant molecular biology, often compromising studies on genome regulation. We present SBCP (Saline-Based Chromatin Precipitation), a method that directly isolates native chromatin by exploiting its differential solubility in salt solutions, thereby eliminating the need for prior nuclear purification. Compared with the traditional workflow that relies on nuclear isolation, SBCP achiev…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Dosage-sensitive transcription factors (TFs) underlie altered gene regulation in human developmental disorders, and cell type-specific gene regulation is linked to the reorganization of three-dimensional (3D) chromatin during cellular differentiation. In this work, we show dose-dependent regulation of chromatin organization by the congenital heart disease (CHD)-linked, lineage-restricted TF TBX5 in human cardiomyocyte differentiation. Genome organization, including compartments, topologically associated domains, and chromatin loops, was sensitive to reduced TBX5 dosage in a human model of CHD,…
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: The transcription process is controlled by non-coding regulatory elements, more than 70% of which are putative enhancers. These enhancers comprise over 600,000 regions and are marked by histone modifications. However, the mechanisms by which altered enhancers in cancer cooperate within the three-dimensional chromatin architecture to drive oncogenic programs remain poorly understood.
RESULTS: By integrating 201 H3K27ac ChIP-seq datasets from prostate, we identify 3,216 high-confidence prostate cancer-specific putative enhancers. Ultra-high-resolution chromatin interaction profiling…
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Inflammatory osteolysis is primarily characterized by an extensive macrophage-mediated inflammatory response coupled with osteoclast (OC) fo … tic regulatory functions. PUN was found to inhibit bromodomain-containing protein 4 (Brd4)-mediated chromatin space remodeling, consequently upregulating the production of endogenous anti-inflammatory factors and antioxidant factors. This study reveals a new therapeutic mechanism that PUN exerts anti-inflammatory effects and regulates epigenetic regulation …
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Early events that bias germinal-center B cells toward malignant evolution remain incompletely defined. Here, we uncover Sex-determining Region Y Box 5 (SOX5) as an early-stage epigenetic modifier in myelocytomatosis oncogene (MYC)-driven B-cell lymphoma. Single-cell transcriptomics of lymph nodes from CRISPR/Cas9-engineered MycCd19-Cre B-cell lymphoma chimeric mice resolve a Ki67-high proliferative compartment at an early stage with enriched SOX5 transcripts. CRISPRa, CRISPR knockout, and multi-omic profiling reveal a SOX5-centered chromatin program defined by de novo promoter-proximal occupan…
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Epstein-Barr virus (EBV) infects many people and causes T-cell and natural killer (NK)-cell disorders, such as chronic active EBV disease and extranodal NK/T-cell lymphoma, which are aggressive and lack a common genetic driver. This suggests that virus-associated, non-genetic mechanisms contribute to disease. We studied primary T cells, NK cells, Epstein-Barr virus-positive cell lines derived from these disorders, virus-negative controls, and clinical chronic active EBV disease samples. Using genome-wide and single-cell multiome approaches, we examined three-dimensional chromatin organization,…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Maternal protein restriction (PR) is a risk factor for altered fetal neurodevelopment and increased susceptibility to neurometabolic disorders later in life. Although structural and transcriptomic changes in the developing hypothalamus have been reported in PR-exposed offspring, the underlying regulatory mechanisms remain unclear. We hypothesized that maternal PR alters chromatin accessibility in hypothalamic neuroprogenitor cells, potentially disrupting gene regulation critical for cell fate specification. We performed ATAC-seq on hypothalamic neuroprogenitors isolated at gestational day 17 f…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Chromatin-associated RNAs (caRNAs) play critical roles in regulating chromatin organization and transcription, underscoring the importance of their study. Proximity labeling has emerged as a promising and versatile technique for profiling caRNAs with high spatiotemporal resolution. While being a powerful technique, traditional proximity labeling methods depend on complex, high-input enrichment protocols, which significantly limit their wide practical application. Here, we developed a straightforward, enrichment-free caRNA profiling strategy: proximity crosslinking-induced RNA depletion sequenc…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования