BACKGROUND: Scutellaria baicalensis Georgi (SBG) has significant anti-inflammatory and immune-modulating activities and is widely used in the treatment of inflammatory and autoimmune diseases. However, the mechanism of SBG in the treatment of ankylosing spondylitis (AS) remains to be elucidated.
METHODS: Differentially expressed genes (DEGs) related to AS were analyzed based on two GEO gene chips. The DEGs were merged with the data derived from OMIM, GeneCards, and PharmGKB databases to ascertain AS-related targets. Active components of SBG and their targets were acquired from the TCMSP datab
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Bioinformatics was used to analyze the skin cutaneous melanoma (SKCM) gene expression profile to provide a theoretical basis for further studying the mechanism underlying metastatic SKCM and the clinical prognosis.
METHODS: We downloaded the gene expression profiles of 358 metastatic and 102 primary (nonmetastatic) CM samples from The Cancer Genome Atlas (TCGA) database as a training dataset and the GSE65904 dataset from the National Center for Biotechnology Information database as a validation dataset. Differentially expressed genes (DEGs) were screened using the limma package of
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: The healing process of the surgical wound of anal fistulotomy is much slower because of the presence of stool within the wound. Cuyuxunxi (CYXX) prescription is a Chinese herbal fumigant that is being used to wash surgical wound after anal fistulotomy. This study aimed at investigating the molecular mechanism of CYXX prescription using a network pharmacology-based strategy.
MATERIALS AND METHODS: The active compounds in each herbal medicine were retrieved from the traditional Chinese medicine systems pharmacology (TCMSP) database and in Traditional Chinese Medicine Integrated Data
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Egress represents a crucial process employed by Neospora caninum in the establishment of infection. Dense granule proteins (GRAs), secreted by the dense granule, play significant roles in modifying the parasitophorous vacuole, maintenance of morphology, and regulating host-cell interactions. However, their precise involvement in tachyzoite egress remains inadequately characterized. In this study, we identified a homologous gene, Ncgra41, corresponding to the dense granule protein 41 (GRA41) of Toxoplasma gondii, which is associated with egress, utilizing NCBI and ToxoDB databases. NcGRA41 is l
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
In a previous study, we showed that serine/threonine-protein kinase 4 (STK4) is involved in the control on proliferation and migration of endometrial cancer (EC) cells in vitro. In the present paper, we studied STK4 expression in EC tissues from a large cohort of patients to determine whether STK4 can serve as a marker for the aggressiveness and prognosis of EC. Tissue samples from patients with EC were examined for tumor type, grade, and stage. The STK4 protein expression in EC cells was assessed by immunohistochemistry and related to clinicopathological data of patients, such as progression
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАОтозванная публикацияПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVE: Malignant melanoma is a highly invasive cancer whose pathogenesis remains unclear. We analyzed the microarray dataset GDS1375 in the Gene Expression Omnibus database to search for key genes involved in the occurrence and development of melanoma.
METHODS: The dataset included 52 samples (7 normal skin and 45 melanoma samples). We identified differentially expressed genes (DEGs) between the two groups and used integrated discovery databases for Gene Ontology (GO) and Kyoto Gene and Genome Encyclopedia (KEGG) pathway analyses. In addition, we used the STRING and MCODE plugins of Cytos
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
During chronic cerebral hypoperfusion (CCH), the cerebral blood flow gradually decreases, leading to cognitive impairments and neurodegenerative disorders, such as vascular dementia. The reduced oxygenation, energy supply induced metabolic changes, and insufficient neuroplasticity could be reflected in the synaptic proteome. We performed stepwise bilateral common carotid occlusions on rats and studied the synaptic proteome changes of the hippocampus, occipital and frontal cortices. Samples were prepared and separated by 2-D DIGE and significantly altered protein spots were identified by HPLC-M
Сравнительное исследованиеСтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Fibrillin is the major component of extracellular microfibrils. Mutations in the fibrillin gene on chromosome 15 (FBN1) were first described in the heritable connective disorder, Marfan syndrome (MFS). FBN1 has also been shown to harbor mutations related to a spectrum of conditions phenotypically related to MFS, called "type-1 fibrillinopathies." In 1995, in an effort to standardize the information regarding these mutations and to facilitate their mutational analysis and identification of structure/function and phenotype/genotype relationships, we created a human FBN1 mutation database, UMD-FB
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАОбзорПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Maintaining intracellular pH is crucial for preserving healthy cellular behavior and, when dysregulated, results in increased proliferation, migration, and invasion. The Na+/H+ exchanger isoform 1 is a highly regulated transmembrane antiporter that maintains pH homeostasis by exporting protons in response to intra- and extracellular signals. Activation of Na+/H+ exchanger isoform 1 is exquisitely regulated by the extracellular environment and protein cofactors, including calcineurin B homologous proteins 1 and 2. While Na+/H+ exchanger isoform 1 and calcineurin B homologous protein 1 are ubiqu
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Congenital contractural arachnodactyly (CCA) is an extremely rare disease, due to mutations in the FBN2 gene encoding fibrillin-2. Another member of the fibrillin family, the FBN1 gene, is involved in a broad phenotypic continuum of connective-tissue disorders including Marfan syndrome. Identifying not only what is in common but also what differentiates these two proteins should enable us to better comprehend their respective functions and better understand the multitude of diseases in which these two genes are involved. In 1995 we created a locus-specific database (LSDB) for FBN1 mutations wi
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Protein interactions are major driving forces behind the functional phenotypes of biological processes. As such, evolutionary footprints are reflected in system-level collections of protein-protein interactions (PPIs), i.e., protein interactomes. We conducted a comparative analysis of intraviral protein interactomes for representative species of each of the three subfamilies of herpesviruses (herpes simplex virus 1, human cytomegalovirus, and Epstein-Barr virus), which are highly prevalent etiologic agents of important human diseases. The intraviral interactomes were reconstructed by combining
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The prediction of antigenic epitopes on the surface of proteins is of great importance for vaccine development and to specifically design recombinant antibodies. Computational methods based on the three-dimensional structure of the protein allow for the detection of noncontinuous epitopes in contrast to methods based on the primary amino-acid sequence only. A method recently developed to predict protein-protein binding sites is presented, and the application to predict putative antigenic epitopes is described in detail. The prediction approach is based on the local perturbation of the electros
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The apolipoprotein E (APOE) gene remains the most strongly established risk factor for late onset Alzheimer's disease (LOAD). Recently the gene, TOMM40, which is in linkage disequilibrium with APOE, was identified to be associated with LOAD in genome-wide association studies. One of the identified polymorphisms in TOMM40 is rs10524523, which is located in intron 6 and composed of thymidine repeats varying between 14 to 36 base-pairs in length. Reported results are contradictory in regard to the very long poly-T variant that has been associated with both increased and decreased risk of LOAD. Ou
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The phenotype of the genetic polydactyly/ arhinencephaly mouse (Pdn/Pdn) is similar to Greig cephalopolysyndactyly syndrome (GCPS), whose responsible gene is GLI3. Suppression of Gli3 gene expression has been observed in the Pdn/Pdn and integration of retrotransposon in Gli3 gene in the Pdn mouse has been reported. Thus, the responsible gene for Pdn/Pdn is thought to be Gli3, but the site of mutation within the gene has not been demarcated. In the present study, we demonstrated that 5442 bp of early retrotransposon was inserted into intron 3 of Gli3 gene in the Pdn mouse (Gli3 (Pdn) ). This tr
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Large-scale proteomics will play a critical role in the rapid display, identification and validation of new protein targets, and elucidation of the underlying molecular events that are associated with disease development, progression and severity. However, because the proteome of most organisms are significantly more complex than the genome, the comprehensive analysis of protein expression changes will require an analytical effort beyond the capacity of standard laboratory equipment. We describe the first high-throughput proteomic analysis of human breast infiltrating ductal carcinoma (IDCA) u
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Immune system dysregulation plays a critical role in aortic valve calcification (AVC) and metabolic syndrome (MS) pathogenesis. The study aimed to identify pivotal diagnostic candidate genes for AVC patients with MS.
METHODS: We obtained three AVC and one MS dataset from the gene expression omnibus (GEO) database. Identification of differentially expressed genes (DEGs) and module gene via Limma and weighted gene co-expression network analysis (WGCNA), functional enrichment analysis, protein-protein interaction (PPI) network construction, and machine learning algorithms (least abso
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Defensins are a superfamily of antimicrobial peptides, present in vertebrates, invertebrates, fungi and plants, suggesting that they appeared prior to the divergence in eukaryotes. The destitution of toxicity to mammalian cells of plant defensins has led to a new research ground, i.e., their potential medical use against human infectious diseases. Isolating defensins from natural sources, like plant tissues, can be time-consuming, labor intensive and usually present low yields. Strategies for large-scale production of purified active defensins have been employed using heterologous expression s
СтатьяОбзорПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The present study aimed to dissect the underlying mechanism of the Gei Herba (LBZ) in the treatment of type 2 diabetes mellitus (T2DM) based on the gut microbiota and network pharmacology strategies. Thirty-one compounds from LBZ were screened and 187 corresponding targets were identified through the database and literature screening. Multiple disease-associated gene and target databases were used to screen and obtain 726 T2DM-related targets. The gutMGene v1.0 database was used for searching metabolites and targets of gut microbiota. 168 overlapping targets of LBZ, T2DM and the gut microbiota
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Existing studies on PROTAC technology frequently rely on modifications and validation of already marketed drugs, which limits the exploration of non-drug-forming proteins and targets that do not have existing therapeutic agents. In contrast, utilizing easily synthesized combinatorial chemical databases that offer a broad selection of compounds presents a promising strategy for discovering new PROTAC molecules. In this study, virtual screening was conducted on a small molecule database created using combinatorial chemistry, which contains a total of 12,904 active molecules. A potential CDK6 inh
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
To search for potential targets and pathways of solasonine acting on Interstitial cystitis using network pharmacology and molecular docking methods, and to explore the potential mechanism of solasonine in the treatment of IC. Potential therapeutic targets of solasonine were retrieved from three databases: Pharmmapper, Targetnet, and SEA. GO and KEGG analyses were performed. IC-related genes were retrieved from the GEO and Genecards databases, and GO and KEGG analyses were performed. The STRING database combined with Cytoscape was used to map the protein interaction network (PPI) of IC-related
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования