INTRODUCTION: Gastric cancer remains a major global health burden with high incidence and mortality. Despite therapeutic advances, long-term survival remains unsatisfactory. Reliable biomarkers to predict therapeutic efficacy and clinical outcomes are urgently needed. This study aimed to elucidate the heterogeneity of gastric cancer using an integrative bioinformatics approach that combines single-cell RNA-sequencing (scRNA-seq) and bulk RNA-seq data. METHODS: scRNA-seq datasets were obtained from the GEO database, and bulk RNA-seq data were obtained from the TCGA. Cell communication, pseudo
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Cholangiocarcinoma (CCA) has a complex tumor microenvironment (TME) and poor immunotherapy response. Understanding how the adaptive immune response (AIR) affects the TME and prognosis is critical.
METHODS: All data were obtained from publicly available resources. Differentially expressed genes (DEGs) were identified by comparing tumor vs. normal and stromal/immune score-based samples, and were then intersected with an AIR gene set to obtain candidate genes. Prognostic genes identified by univariate Cox regression were used to build a risk model. Analyses included functional enrich
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Macrophage-dependent immune remodeling and altered lipid metabolism are closely related to liver cancer behavior. In hepatocellular carcinoma (HCC), the survival relevance of macrophage-associated lipid metabolism genes (MLMGs) remains insufficiently characterized. This work evaluated MLMG-related molecular features connected with HCC progression and prognosis.
METHODS: Public HCC transcriptomic and single-cell cohorts were analyzed. Macrophage-related differential genes (MRDGs) extracted from GSE149614 were combined with TCGA-HCC differentially expressed genes1 (DEGs1) and lipid
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Hepatoblastoma is the most common primary liver malignancy in children, with metabolic reprogramming playing a critical role in its progression due to the liver's intrinsic metabolic functions. Enhanced glycolysis, glutaminolysis, and fatty acid synthesis have been implicated in hepatoblastoma cell proliferation and survival. In this study, we screened for altered overexpression of metabolic enzymes in hepatoblastoma tumors at tissue and single-cell levels, establishing and validating a hepatoblastoma tumor expression metabolic score using machine learning. Starting from the Mammalian Metaboli
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Ovarian cancer (OC) is the most lethal gynecological malignancy and cellular mechanisms regulating OC progression are not completely understood. miRNAs are involved in many signaling pathways which are critical for the progression of malignant tumors, including OC. In the present study, we aim to identify miRNAs whose expression change in a tumor stage- and/or grade-dependent manner in serous OC. Computational analysis was performed in R using The Cancer Genome Atlas miRNA dataset. Kaplan-Meier plots were constructed to compare the survival of patients with low and high expressions of identifi
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The identification of regulatory networks contributing to fetal/adult gene expression switches is a major challenge in developmental biology and key to understand the aberrant proliferation of cancer cells, which often reactivate fetal oncogenes. One key example is represented by the developmental gene LIN28B, whose aberrant reactivation in adult tissues promotes tumor initiation and progression. Despite the prominent role of LIN28B in development and cancer, the mechanisms of its transcriptional regulation are largely unknown. Here, by using quantitative RT-PCR and single cell RNA sequencing
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Helicobacter pylori (Hp) colonizes the human stomach and can induce gastric cancer and mucosa-associated lymphoid tissue (MALT) lymphoma. Clinical observations suggest a role for the Hp virulence factor cytotoxin-associated gene A (CagA) in pathogenesis. The pathogenic activity of CagA is partly regulated by tyrosine phosphorylation of C-terminal Glu-Pro-Ile-Tyr-Ala (EPIYA) motifs in host cells. However, CagA differs considerably in EPIYA motifs, whose functions have been well characterized in epithelial cells. Since CagA is fragmented in immune cells, different CagA variants may e
Сравнительное исследованиеСтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
DIS3 (defective in sister chromatid joining) is the catalytic subunit of the exosome, a protein complex involved in the 3'-5' degradation of RNAs. DIS3 is a highly conserved exoribonuclease, also known as Rrp44. Global sequencing studies have identified DIS3 as being mutated in a range of cancers, with a considerable incidence in multiple myeloma. In this work, we have identified two protein-coding isoforms of DIS3. Both isoforms are functionally relevant and result from alternative splicing. They differ from each other in the size of their N-terminal PIN (PilT N-terminal) domain, which has be
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
To investigate the underlying causes of chemoresistance in malignant pleural mesothelioma, we have studied mesothelioma cell lines as 3D spheroids, which acquire increased chemoresistance compared to 2D monolayers. We asked whether the gene expression of 3D spheroids would reveal mechanisms of resistance. To address this, we measured gene expression of three mesothelioma cell lines, M28, REN and VAMT, grown as 2D monolayers and 3D spheroids. A total of 209 genes were differentially expressed in common by the three cell lines in 3D (138 upregulated and 71 downregulated), although a clear resist
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Glycosphingolipid GM3, a known suppressor of epidermal growth factor receptor (EGFR) phosphorylation, inhibits cell proliferation. Valproic acid, conversely, is known as an up-regulator of GM3 synthase gene (ST3GAL5). To test the possibility that valproic acid could inhibit EGFR phosphorylation by increasing the level of GM3 in cells, we treated A431 epidermoid carcinoma cells with valproic acid and found that valproic acid treatment caused an about 6-fold increase in the GM3 level but only a marginal increase in the GM2 level in these cells and that the observed increase in GM3 level was valp
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVE: The aim of the study was to detect the effect of COVID-19 on lymphocyte and platelet parameters among Sudanese patients admitted to Intensive Care unit (ICU) and emergency (ER).
PATIENTS AND METHODS: This cross-sectional study was carried out on a total of 787 Sudanese individuals (487 confirmed COVID-19 cases and 300 apparently healthy individuals as controls, in duration between April 2020 to December 2020). Platelets (PLTs) and platelet indices, mean platelet volume (MPV), platelet distribution width (PDW), plateletcrit (PCT) and platelet larger cell ratio (PLCR) were investigat
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The relative expression of matrix metalloproteinases (MMPs) and tissue inhibitors of MMPs (TIMPs) is an important determinant in trophoblast invasion of the uterus and tumor invasion and metastasis. Our previous studies have shown that low oxygen levels increase the in vitro invasiveness of trophoblast and tumor cells. The present study examined whether changes in oxygen levels affect TIMP and MMP expression by cultured trophoblast and breast cancer cells. Reverse zymographic analysis demonstrated reduced TIMP-1 protein secretion by HTR-8/SVneo trophoblast cells as well as MDA-MB-231 and MCF-7
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Transcription factors are proteins that bind to regulatory elements in DNA and have critical roles in gene regulation during development, in cellular growth and differentiation. The four major groups of transcription factors have been classified according to the motif in the DNA-binding domains and include: (1) the helix-turn-helix group, which includes the Pit-1/GHF-1 (Pit-1) transcription factor; (2) the zing finger group, which includes estrogen and other steroid hormone receptors; (3) the leucine zipper group, which includes c-fos protooncogene, and (4) the helix-loop-helix group, which in
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
INTRODUCTION: This study developed a prognostic model for hepatocellular carcinoma (HCC) based on cancer stem cell (CSC)-related modules identified by high-dimensional WGCNA (hdWGCNA).
METHODS: The scRNA-seq data were filtered, dimensionally reduced, and clustered for downstream analysis. CSC-related modules were identified by hdWGCNA. Based on the TCGA liver hepatocellular carcinoma (LIHC) data, we developed a prognostic RiskScore model using univariate Cox, LASSO, and stepwise regression analyses and validated in the ICGC-LIRI-JP dataset. Correlations between the model and the tumor immune
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Chromatin organization regulates transcription to influence cellular plasticity and cell fate. We explored whether chromatin nanoscale packing domains are involved in stemness and response to chemotherapy. Using an optical spectroscopic nanosensing technology we show that ovarian cancer-derived cancer stem cells (CSCs) display upregulation of nanoscale chromatin packing domains compared to non-CSCs. Cleavage under targets and tagmentation (CUT&Tag) sequencing with antibodies for repressive H3K27me3 and active H3K4me3 and H3K27ac marks mapped chromatin regions associated with differentially exp
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Tumor angiogenesis and the presence of cancer stem cells (CSCs) are critical characteristics of tumors. Previous research has demonstrated that cancer stem cells promote tumor angiogenesis, while increased vascularity, in turn, fosters the growth of cancer stem cells. This creates a detrimental cycle that contributes to tumor progression. However, studies investigating the angiogenesis and stemness characteristics in ovarian cancer (OV) are limited. In this study, we employed cluster analysis and LASSO methods to assess the significance of angiogenesis- and stemness-related genes in the effica
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Sine oculis homeobox homolog 1 (SIX1) is a transcription factor that has recently been identified as a crucial regulator of embryonic development and tumorigenesis. SIX1 is upregulated in different types of tumors, including breast cancer. However, the role and mechanism of SIX1 upregulation in breast cancer carcinogenesis remains uncertain.
METHODS: In this study, we utilized various databases such as UALCAN, TCGA, STRING, and Kaplan-Meier Plotter to investigate the mRNA expression, prognosis, transcriptional profile changes, signal pathway rewiring, and interaction with cancer s
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
LncRNA Survival Associated Mitochondrial Melanoma Specific Oncogenic Non-coding RNA (SAMMSON) is located on human chromosome 3p13, and its expression is upregulated in several tumours, including melanoma, breast cancer, glioblastoma and liver cancer and has an oncogenic role in malignancy disorders. It has been reported that SAMMSON impacts metabolic regulation, cell proliferation, apoptosis, EMT, drug resistance, invasion and migration. Also, SAMMSON is involved in regulating several pathways such as Wnt, MAPK, PI3K, Akt, ERK and p53. SAMMSON is considered a potential diagnostic and prognosti
СтатьяОбзорПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Zhonghua lao dong wei sheng zhi ye bing za zhi = Zhonghua laodong weisheng zhiyebing zazhi = Chinese journal of industrial hygiene and occupational diseases2019chi
Objective: To investigate the expression and role of LINC00052 during glycidyl methacrylate (GMA) -induced malignant transformation of 16HBE cells. Methods: Human bronchial epithelial (16HBE) cells were divided into GMA transformation group and corresponding DMSO control group, and the 10th, 20th and 30th generation cells of each group were collected LncRNA microarrays were used to analysis expression of LINC00052 in different stage of malignant transformation. Bioinformatics analysis was applied and the relative expression of LINC00052 and its potentially target genes was detected by real-tim
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
PURPOSE OF REVIEW: Recent clinical and molecular research has shed new light on the biology of meningiomas--a common but understudied CNS neoplasm. This review will focus on recent advances and their significance for future research and treatment.
RECENT FINDINGS: Meningiomas represent the second most common brain tumor in adults, and while improved diagnostic modalities are available, these tumors remain underreported. Radiosurgery is an effective adjuvant therapy against meningioma; however, no effective chemotherapy exists. In addition to histologic grading and estimates of the extent of r
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования