Machine learning (ML) is necessary to efficiently identify potent drug combinations within a large candidate space to combat drug resistance. However, existing ML approaches cannot be applied to emerging and understudied pathogens with limited training data. Hence, we developed a computational framework (TACTIC [transfer-learning and cross-species training to infer combination therapies]) to train ML models on data from multiple model bacteria. TACTIC was built using 2,965 drug interactions from 12 bacterial strains and outperformed traditional ML models in predicting drug interaction outcomes
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVES: This study aims to develop a novel diagnostic approach using the recombinase aided amplification-lateral flow dipstick(RAA-LFD) assay for the distinction of Mycobacterium tuberculosis (MTB) and Mycobacterium avium complex (MAC), enabling rapid and convenient as well as accurate identification of them in clinical samples.
METHODS: Our study established a duplex RAA-LFD assay capable of discriminating between MTB and MAC. Based on the principles of RAA primer and probe design, specific primers and probes were developed targeting the MTB IS6110 and the MAC DT1 separately. Optimizatio
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Omadacycline is a novel antimicrobial belonging to the tetracycline class. It has the ability to evade both efflux and ribosomal methylation types of resistance and therefore has an expanded spectrum compared to other tetracycline agents. Omadacycline is active against a number of multidrug-resistant bacteria, including macrolide and doxycycline-resistant Streptococcus pneumoniae, methicillin-resistant Staphylococcus aureus (MRSA), vancomycin-resistant Enterococcus, and several enteric gram-negative bacilli. It also has activity against many nontuberculous mycobacterium (NTM) species. It is av
СтатьяОбзорПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: The serum antiglycopeptidolipid core IgA antibody test has been proposed as a diagnostic tool for Mycobacterium avium complex pulmonary diseases. Cross-reactivity with other nontuberculous mycobacteria (NTM), including Mycobacterium abscessus, indicates that it may have a role as a broader screening test for nontuberculous mycobacterial pulmonary disease (NTM-PD). NTM-PD is believed to be underdiagnosed in patients with bronchiectasis.
RESEARCH QUESTION: Can the serum antiglycopeptidolipid core IgA antibody test be used to screen for NTM-PD in bronchiectasis?
STUDY DESIGN AND MET
СтатьяМногоцентровое исследованиеПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Mycobacterium tuberculosis causes tuberculosis, an infectious disease; this acid-fast bacillus has various functions that enable it to survive within the host. Importantly, the type VII secretion system plays a vital role in host immune evasion. However, the early secretory antigenic target secretion system (ESX) component is crucial for mycobacteria survival, plays a significant role in bypassing the host immune response, and is linked to the prognosis of the disease. The review aims to analyze the ESX-associated genes' functions in defence mechanisms against host immune response. There are f
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Nontuberculous mycobacteria (NTM) skin infections associated with tattoos and permanent makeup (PMU) have emerged as an important public health concern alongside the growing popularity of these procedures. Since the first reported case in 2003, increasing numbers have been documented worldwide. To better understand their epidemiology and clinical characteristics, we conducted a review of published cases. As of December 2024, 62 articles described 66 tattoo-related NTM skin infection cases, involving 310 individuals across 15 countries. Notably, 25 cases were outbreaks, accounting for 262 affec
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
PURPOSE: Pneumonia is common in ICU patients with neurological dysfunction, but differences in pulmonary pathogen distribution in this population remain unclear. This study aimed to compare pathogen profiles, clinical features, and outcomes between ICU patients with and without neurological dysfunction.
METHODS: This regional multicenter retrospective study included adult patients with severe pneumonia admitted to intensive care units (ICUs) in 11 hospitals across Zhejiang and Henan Provinces in mainland China between December 2018 and November 2023. All patients required invasive mechanical
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The IR Biotyper is a novel real-time typing tool, based on a Fourier-transform infrared (FTIR) spectroscopy system. It has emerged as a promising method for the strain typing of various microorganisms and for the detection of their clonal spread within hospitals. In this review, we aim to present the applications and accuracy of the IR Biotyper in hospital epidemiology. Twenty-nine studies that evaluated the use of IR Biotyper for organism strain typeability and outbreak investigations within hospitals, were included in our review. Twenty studies assessed gram negative bacteria, seven studies
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Reports of skin infections associated with nontuberculous mycobacteria (NTM) following cosmetic procedures are increasing. The diagnosis and treatment of these infections remain a significant challenge for clinicians.
OBJECTIVE: We examined the clinical characteristics, microbiology, histopathology, and treatment strategies of NTM infections following cosmetic procedures, including botulinum toxin injection, lipolysis injection, hyaluronic acid injection, mesotherapy, autologous fat grafting, and other related procedures.
METHODS: This retrospective study of cosmetology-related c
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Nontuberculous mycobacteria are commonly found pathogens; however, skin and soft tissue infections due to nontuberculous mycobacteria are often associated with surgical procedures, particularly after lipoplasty. Although nontuberculous mycobacteria are resistant to some chemical disinfectants, glutaraldehyde, peracetic acid, povidone iodine, alcohol, and chlorine are still used for the sterilization of medical instruments. This study investigated the efficacy of various disinfectants in a fatty environment with adipose and a bloody environment without adipose. In addition, this stu
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The increasing incidence of tuberculosis and other mycobacterial infections due to AIDS epidemic resulted in the need of rapid and accurate identification of isolated mycobacteria. The correct identification result leads to the selection of an appropriate therapeutic regimen. Polymerase chain reaction and restriction enzyme analysis (PCR-REA) has been developed since 1992 and used as the rapid method for identifying mycobacteria. Several genes or sequences have been used as an amplified target for PCR-REA. The present study aims to evaluate the potential use of PCR-REA of gene-encoding heat sh
Сравнительное исследованиеСтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Despite decreased morbidity and mortality in patients with cystic fibrosis (CF) with CFTR modulators, a significant percentage still develop advanced lung disease. Nontuberculous mycobacteria (NTM) remain challenging pathogens with unclear effects on disease progression and post-transplant outcome.
METHODS: NTM-positive patients were identified from all CF patients treated at the University Hospitals of Zurich and Lausanne between 1998 and 2020. Disease course pre- and post-transplant was recorded, and NTM-positive patients were compared to patients without NTM infection for death
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The global burden of nontuberculous mycobacterial pulmonary disease (NTM-PD) continues to increase, particularly in East Asia, including Japan. Although epidemiological understanding has expanded, the clinical course of NTM-PD remains highly heterogeneous and is influenced by host immunity, structural lung abnormalities, comorbidities, and environmental factors. Determining the optimal timing for initiating treatment remains challenging, particularly in cases of non-cavitary or mild disease. Recent evidence has elucidated several key prognostic determinants, including cavitary disease, infecti
СтатьяОбзорПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Nontuberculous mycobacteria (NTM) are environmental organisms increasingly causing chronic respiratory infection. Although NTM pulmonary infection is rising globally, most studies are single-country. This study evaluated temporal trends in pulmonary NTM incidence across Queensland (Australia), Phnom Penh (Cambodia), Japan, Thailand, and the United States (US), and described regional species distribution.
METHODS: Laboratory and insurance claims data were used. Incident infections were defined using region-specific criteria. For Queensland, Japan, and Thailand, data and denominator
СтатьяПрепринтПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The understanding of host responses to pulmonary infection with non-tuberculous mycobacteria (NTM) is incomplete and immunodiagnostic tools are not established. Unlike mycobacteria of the Mycobacterium tuberculosis complex, several NTM express glycopeptidolipids (GPLs) in their cell wall. Here, we investigate the interferon-γ response to mycobacterial GPLs and its diagnostic use in patients with pulmonary NTM infection. M. avium-derived GPLs were used for in vitro stimulation of peripheral blood mononuclear cells in an ELISpot assay of patients with pulmonary NTM infection and 3 control groups
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Non-tuberculous mycobacteria (NTM) management comprises prolonged therapy that includes macrolides. Non-tuberculous mycobacteria can cause disease in patients with predisposing conditions such as HIV and structural lung disease. Local data on NTM disease and macrolide resistance are scarce, and routine antimicrobial susceptibility testing is currently not performed for NTM in South Africa.
OBJECTIVES: This study aims to characterise NTM isolated at Tshepong National Health Laboratory Service (NHLS) according to species and antimicrobial susceptibility pattern.
METHOD: A retrospec
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
PURPOSE: Antimicrobial misuse contributes to antimicrobial resistance in thoracic transplant (TTx) and mechanical circulatory support (MCS) recipients. This study uses a modified Delphi method to define the expected appropriate antimicrobial prescribing for the common clinical scenarios encountered in TTx and MCS recipients.
METHODS: An online questionnaire on managing 10 common infectious disease syndromes was submitted to a multidisciplinary Delphi panel of 25 experts from various disciplines. Consensus was predefined as 80% agreement for each question. Questions where consensus was not ach
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUNDS: The prevalence of pulmonary nontuberculous mycobacterial infection (pNTM) is currently increasing. Furthermore, its clinical feature is reported to be gradually changing. However, few reports to clarify the current features of pNTM have been published. The aim of this study is to investigate microbiological and clinical features of pNTM.
PATIENTS AND METHODS: This study was a retrospective observational study. Patients with pNTM visited to Dokkyo Medical University Koshigaya Hospital between January 2009 and December 2010 were enrolled. All patients fulfilled the diagnostic crite
СтатьяНаблюдательное исследованиеПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVES: A series of cases infected with rapidly growing mycobacteria were studied to reveal the spectrum of disease, antimicrobial susceptibility, pathology, and treatment outcomes.
METHOD: The cases identified as rapidly growing mycobacterial infections in Ramathibodi Hospital from January 1993 to June 1999 were retrospectively studied.
RESULTS: There were 20 patients and most of the cases had no underlying disease. Only two cases were HIV-infected patients. The presenting clinical features were lymphadenitis (7), skin and subcutaneous abscess (7), eye infection (4), pulmonary infection
Duplicate PublicationСтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Pedicure-associated nontuberculous mycobacterial furunculosis has been reported in the setting of either outbreaks or sporadic case reports. The epidemiology of these infections is not well understood.
METHODS: Systematic surveillance for pedicure-associated nontuberculous mycobacterial furunculosis was conducted in 2 North Carolina counties from 1 January 2005 through 31 December 2008. A subset of implicated nail salons and control salons was inspected and sampled for nontuberculous mycobacteria.
RESULTS: Forty cases of suspected or confirmed pedicure-associated nontuberculous m
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования