West Nile virus (WNV) RNA was quantified in WNV infected crows and horses with the help of a real-time reverse transcriptase-PCR assay. A 5' nuclease assay, based on NS5 gene detection with a fluorescent probe was used for quantifying WNV RNA using formalin fixed paraffin embedded tissue specimens. Quantitative detection of WNV RNA showed the presence of a higher amount of the viral RNA in crow tissues compared to equine tissues and these results correlated well with the detection of WNV antigen by immunostaining. In crows, the highest amount of virus was seen in the intestine and in horses in…
Оценочное исследованиеСтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The diagnosis of T-cell lymphoproliferative disorders, which frequently involve the skin and other extranodal sites, is often problematic because of the difficulty in establishing clonality in paraffin-embedded tissue. To this end, we developed a simple, nonradioactive method to detect T-cell receptor gamma (TCR-gamma) gene rearrangements by polymerase chain reaction single-strand conformational polymorphism (PCR-SSCP) in paraffin-embedded tissue. Jurkat and HSB-2 cell lines and peripheral blood samples from normal individuals were used as monoclonal and polyclonal controls, respectively. DNA …
КомментарийСтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The etiologic role of human herpesvirus 8 (HHV8) in Kaposi's sarcoma (KS) remains controversial. This polymerase chain reaction (PCR)-based study was undertaken to evaluate the relationship of HHV8 in KS from our geographical region and to determine its utility in formalin-fixed, paraffin-embedded biopsy specimens. Forty-two biopsy specimens were studied, including nine AIDS-associated cases and four from classic KS. Of the 39 patients included, 21 were HIV+ and 18 had no clinical evidence of HIV infection. Only a single (internal) primer pair was used in the PCR. All PCR products were tested …
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Burkitt's lymphoma (BL) is the most frequent non-Hodgkin's lymphoma in children in Argentina. Although epidemiologic studies have linked Epstein-Barr virus (EBV) to more than 90% of African BL cases but to only 10-20% of American and French cases, increased EBV-specific antibody titers were demonstrated in 73% of Argentinian patients with BL. To characterize the relationship between EBV and BL in Argentina, we analyzed paraffin-embedded tissues from 16 cases of BL for the presence of EBV DNA using the polymerase chain reaction (PCR) and in situ hybridization (ISH). PCR analysis showed that onl…
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
We have studied the possible origin of histiocytic cells, present in fibrous histiocytomas (MFH) by using immunohistochemistry to demonstrate lysozyme, alpha 1-antitrypsin, alpha 1-antichymotrypsin and receptors for peanut and soy bean agglutinin in tumour cells of MFH compared with their presence in tumour cells of malignant histiocytosis (MH) ('true' histiocytic lymphoma, 'true' histiocytic sarcoma). We included in this study a number of other soft tissue tumours (STT). Lysozyme was detected in half of the cases of malignant histiocytosis (n = 16) but in only two out of 77 MFH. alpha 1-Antit
Сравнительное исследованиеСтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Intracytoplasmic lysozyme (muramidase) may be readily identified in paraffin sections of tissues fixed in formalin or Zenker's acetic acid and in smears of peripheral blood or bone marrow using an immunoperoxidase technique. Sites of intracellular lysozyme in normal human tissues and in various specimens from patients with myeloproliferative and lymphoproliferative disorders, hairy cell leukemia, granulomatous diseases, toxoplasmic lymphadenitis, and other pathologic processes were defined by this method. Intracellular lysozyme was demonstrated in mature and immature neutrophilic and eosinophi…
СтатьяПоддержка службы здравоохранения СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
A woman in her mid-50s with Lynch syndrome and a history of malignant neoplasms was found to have a superior vena cava (SVC) thrombus and a necrotic mediastinal mass on surveillance imaging. The initial biopsy yielded necrotic debris, and the procedure was complicated by a mediastinal hematoma. Due to concern for possible infection, the patient was empirically treated with antibiotics while planning further workup. A broad-range 16S polymerase chain reaction (BRPCR) was performed on a formalin-fixed paraffin-embedded (FFPE) tissue, which was negative for fungi and mycobacteria but revealed DNA…
Клинический случайСтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The diagnosis of Helicobacter pylori infection from gastric biopsies requires polymerase chain reaction or culture. However, culture is often unsuccessful due to the bacterial fragility and complex growth requirements. Next-generation sequencing (NGS), performed on primary clinical samples, offers a promising alternative for analysis of the bacterial resistome. In this study, we describe the adaptation of a target-enrichment library preparation and NGS workflow for use on formalin-fixed, paraffin-embedded (FFPE) gastric biopsies to investigate both the H. pylori resistome and virulome. In tota…
Оценочное исследованиеСтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Particulate matter (PM) and contaminants attached to PM can increase the risk of respiratory diseases. However, the health risk assessment of chlorinated paraffins (CPs), an emerging pollutant occupying a high proportion of persistent organic pollutants (POPs) in PM, remains scarce. This study aimed to evaluate the association between PM2.5-bound CPs and asthma, along with relative symptoms, in school-aged children and adolescents. A large sample size cross-sectional study (n = 131,304) was conducted in the Pearl River Delta (PRD). The results showed that increased quantiles of ∑CPs were assoc…
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The HLA system represents a central component of the antigen presentation machinery. As every patient possesses a defined set of HLA molecules, only certain antigens can be presented on the cell surface. Thus, studying HLA type-dependent antigen presentation can improve the understanding of variation in susceptibility to various diseases, including infectious diseases and cancer. In archival formalin-fixed paraffin-embedded (FFPE) tissue, the HLA type is difficult to analyze because of fragmentation of DNA, hindering the application of commonly used assays that rely on long DNA stretches. Addr…
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Short chain chlorinated paraffins (SCCPs) are complex mixtures of polychlorinated n-alkanes, shown to bioaccumulate but with unknown effects in wild birds. The present study examined development-related effects of SCCPs on captive American kestrels (Falco sparverius) treated in ovo on embryonic day (ED) 5 by injection with technical Chloroparaffin® (C10-13, 55.5% Cl) at environmentally relevant nominal (measured) concentrations of 10 (10), 50 (29) or 100 (97) ng ΣSCCP/g egg ww, and artificially incubated until hatching (ED27-ED29). The SCCP concentrations measured in the yolk sacs of the hatch…
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The aim of the present study was to determine whether there is an association between Parvovirus B19 infection and hydrops fetalis setting in fetus and neonate. Twenty-nine samples were analyzed by three methods. Each sample was histologically examined for viral nuclear inclusions in fetal organs and placenta, then immunohistochemical study using Parvovirus B19 antibody that recognized the VP2 protein of the Parvovirus B19 capsid was done in tissue embedded in paraffin (lungs, liver, thymus, kidneys, heart and placenta). Nested-PCR analysis was done after DNA extraction from paraffin blocks an…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Split skin graft is frequently needed in the treatment of burned patients. Scalp is often free of burns. Due to its good skin quality and important surface, scalp is a very interesting skin donor site, specially in case of children. A controlled, randomised clinical trial was carried out in 10 French Plastic Surgery or Burns Units. It assessed the efficacy and the acceptability of calcium alginate dressing (Algosteril) versus paraffin gauze dressing (Jelonet) in the treatment of scalp donor sites in children. 67 children (mean age 54 months) entered the study, 34 in the alginate group and 33 i…
Клиническое исследованиеСтатьяРандомизированное исследованиеПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
An immunohistochemical method for the detection of louping ill virus antigen in formalin-fixed, paraffin wax-embedded tissues by an avidin-biotin-complex (ABC) immunoperoxidase technique was established. The tissues examined were from the brains of 10 mice, five sheep and one pig. The mice were experimentally infected with louping ill virus whereas the sheep and the pig were field cases of louping ill confirmed by clinical examination, and by histological and serological methods.
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
INTRODUCTION: Osteosarcomas (OS), the most common primary malignant bone tumours, are classified as low-grade (characterised by MDM2 amplifi … hod (none, EDTA, or nitric acid), and FISH availability. Five 5-μm sections were obtained from each paraffin block. DNA methylation profiling was performed using the Infinium MethylationEPIC v2.0 platform (Illumina). Univariate and multivariate analyses were performed to identify failure predictors.
RESULTS: A total of 103 samples from 79 patients were an …
СтатьяСравнительное исследованиеПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Cross‑sectional area (CSA) of skeletal myofibers is a primary morphometric indicator of atrophy and regeneration, yet it is most commonly quantified on cryosections after immunofluorescent labeling of basal lamina proteins, which requires specialized reagents and equipment and limits reuse of routine histology slides. Here we present a practical, fully web‑based workflow that leverages Cellpose‑SAM on a public browser interface to segment myofibers directly from formalin-fixed paraffin-embedded (FFPE) skeletal muscle sections stained with hematoxylin and eosin (H&E) or toluidine blue (TB), fol…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Laser capture microdissection (LCM) of formalin-fixed, paraffin-embedded sections is a way to analyze gene expression of morphologically distinct areas of tissue, as microscopically visualized with stained tissue sections. Herein, I describe a method for laser dissecting lymphoid aggregates in canine cutaneous and subcutaneous sarcomas and their adjacent sarcoma tissue to determine the differential expression of RNA as determined by NanoString® nCounter technology. Canine soft tissue sarcomas (STS) are diversely derived mesenchymal neoplasms that, regardless of exact histogenesis, behave simil…
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Formalin-fixed paraffin-embedded (FFPE) tissue is the standard material for companion diagnostic tests (CDx). Although cytological specimens can be useful, their low tumor content (TC) poses challenges. Recently, a high-sensitivity CDx, the "Lung Cancer Compact Panel (cPANEL)," with a recommended TC of 5%, was introduced into clinical practice. This CDx achieves high detection sensitivity by selecting specific genes for analysis, processing them separately, and performing sequence at sufficient depth. This approach enables the detection of mutations even when they are present in on…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Severe pelvic infections present a diagnostic challenge owing to the clinical and radiological resemblance to malignancy. Pelvic actinomycos … ext-generation sequencing (NGS) of 16S ribosomal RNA (rRNA) genes extracted from the formalin-fixed paraffin-embedded (FFPE) tissue revealed a mixed infection of Actinomyces israelii and Fusobacterium nucleatum. The hydronephrosis resolved after treatment, with no recurrence by the six-month follow-up. This case highlights the fact that pelvic actinomycosi …
Клинический случайСтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVE: In approximately 80% of the patients with advanced non-small cell lung cancer (NSCLC), the only samples available are cytological material or a limited amount of tissue specimens. Therefore, we aimed to explore the effect of the Idylla™ system for rapid evaluation of epidermal growth factor receptor (EGFR) mutation status in formalin-fixed and paraffin-embedded (FFPE) samples of NSCLC patients.
METHODS: A total of 221 archived FFPE NSCLC tissue specimens were included in this study. Idylla™ system and amplification refractory mutation system-polymerase chain reaction (ARMS-PCR) wer…
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования