INTRODUCTION: Ventilator-associated pneumonia occurs in 20% to 25% of intubated trauma patients, and early effective antibiotic treatment decreases morbidity and mortality. We sought to determine the sensitivity and specificity of multiplex polymerase chain reaction amplification of bacterial DNA (Biofire FilmArray Pneumonia Panel [BFPP]) obtained during fiberoptic bronchoscopy in predicting the causative bacteria the day of bronchoalveolar lavage (BAL).
METHODS: This diagnostic accuracy study compared results of BAL with quantitative culture and BFPP testing on all intubated trauma and surge…
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND AND AIM: Contribution of organisms causing periodontal disease remains unclear. Strong association has emerged between the presence of gram-positive Filifactor alocis (F.alocis) and periodontitis. Hence, we aimed to identify the presence of F.alocis in periodontal biofilms through PCR technique in health and disease.
SETTINGS AND DESIGN: A cross-sectional study was conducted among 45 participants divided into three equal groups based on their periodontal conditions, namely, healthy, generalized chronic periodontitis (GCP) and generalized aggressive periodontitis (GAP).
METHODS AND
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
INTRODUCTION AND HYPOTHESIS: Prior studies suggest that acute cystitis diagnosis using standard urine culture (SUC) may be suboptimal compared to multiplex polymerase chain reaction (mPCR). mPCR is hypothesized to deliver faster and more accurate results.
METHODS: This was a prospective, paired, within-subject study of female patients ≥ 60 years presenting with symptoms of acute cystitis. For all patients, urine samples were collected and SUC and mPCR results using the Vikor Urine-ID™ platform were obtained. Initial treatment was based on the results of the first available test, either SUC or…
СтатьяСравнительное исследованиеПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVES: To examine the influence of contextual factors upon the evaluation of skin thickness and stiffness by ultrasound and to assess the reliability of these parameters.
METHODS: Ultrasound dermal thickness (by B-mode, 18MHz) and skin stiffness (by shear-wave elastography, 9MHz) were assessed in persons with systemic sclerosis (SSc) and in healthy controls. The influence of contextual factors upon repeated measures was evaluated: (i) room temperature (16-17ºC vs. 22-24ºC); (ii) time of day (morning vs. afternoon), and (iii) menstrual cycle phase (menstrual vs. ovulatory). Differences we
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Flow cytometry (FCM) and quantitative PCR (qPCR) are conventional methods for assessing CAR-T expansion, while digital droplet PCR (ddPCR) is emerging as a promising alternative. We monitored CAR-T transcript expansion in 40 B-NHL patients post-infusion of CAR-T products (axi-cel; tisa-cel; and brexu-cel) with both His-Tag FCM and ddPCR techniques. Sensitivity and predictive capacity for efficacy and safety outcomes of ddPCR were analyzed and compared with FCM. A significant correlation between CAR-T counts determined by FCM and CAR transcripts assessed by ddPCR (p < 0.001) was observed. FCM r
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Colorectal cancer (CRC) is linked to high mortality, mainly when discovered in its advanced stages. Several studies have pointed to the role … sured by an immunoassay automated system. The expression level of CCAT1 was assessed by a real-time polymerase chain reaction. There was a statistically significant elevation of serum CEA levels in patients with CRC compared to patients with precancerous benign colorectal diseases. Furthermore, there was no statistically significant difference in serum CA 19-9 levels betwe …
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Williams Beuren Syndrome (WBS) is a well-recognized and common genetic cause of congenital heart defects, developmental delay, hypercalcemia, and characteristic facial features. It is caused by a 1.5 - 1.8 Mb heterozygous deletion of chromosome 7q11.23 with loss of around 28 coding genes. The aim of this study was to develop a low-cost, semi-quantitative PCR (sqPCR) method to detect the chromosome 7q11.23 deletion.
METHODS: Twenty-four suspected WBS cases were recruited following ethical clearance and informed consent. Blood was obtained, DNA extracted and spectrophotometrically q
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
PURPOSE: Tick-transmitted parasites as Babesia gibsoni, Babesia vogeli, Ehrlichia canis, and Hepatozoon canis are major health concern for dogs. Owing to prevalence and infection severity, there is need of sensitive, specific, and affordable test for their simultaneous detection.
METHODS: Prevalence of B. gibsoni, B. vogeli, E. canis, and H. canis infections was assessed on 719 blood samples by microscopy and multiplex PCR assay targeting 18S rRNA (B. gibsoni & H. canis), ITS1 & 5.8S rRNA (B. vogeli) and VirB9 gene (E. canis). An internal control (canine-actin) was also included to increase t
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Asymptomatic dengue virus (DENV) infections have important public health implications but are challenging to identify. We performed a cross-sectional study of reverse transcription quantitative polymerase chain reaction on pooled sera of asymptomatic individuals from the south coast of Kenya at two time periods to identify cases of asymptomatic viremia. Among 2,460 samples tested in pools of 9 or 10, we found only one positive case (0.04% incidence). Although pooling of samples has the potential to be a cost-effective and time-efficient method for asymptomatic DENV detection, mass cross-sectio…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Treponema pallidum prevalence and burden at oral and lesion sites in adults with early syphilis were assessed by quantitative polymerase chain reaction (qPCR). Factors associated with oral shedding were also examined.
METHODS: Pretreatment oral and lesion swabs were collected from adults with early syphilis in a US multicenter syphilis treatment trial. Oral swabs were collected in the presence and absence of oral lesions. Following DNA extraction, qPCR and whole-genome sequencing (WGS) were performed to assess burden and strain variability.
RESULTS: All 32 participants were male,…
СтатьяМногоцентровое исследованиеПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка службы здравоохранения СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Low sensitivity of the PCR assay for diagnosing scabies has been noted because of the difficulty in obtaining tissue containing Sarcoptes scabiei DNA.
AIM: To evaluate nested real-time quantitative PCR (nRT-qPCR) with nonexpert-dependent standardized cotton swab sampling (CSW) as a tool for diagnosing scabies.
METHODS: All patients underwent dermoscopic and microscopic examination (MS) with scraped sampling (Sc). Patient samples were acquired with a single, dry swab rubbed across the flexor areas of both wrists as well as the eight interdigital spaces and on any suspected scabies
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVE: Congenital cytomegalovirus infection is the most common congenital infection. Although screening of congenital cytomegalovirus infection with polymerase chain reaction studies in blood, urine, and saliva samples has been developed in recent years, it is not yet in routine use in any country.
MATERIALS AND METHODS: In our study, cytomegalovirus deoxyribonucleic acid analysis was per- formed by real-time polymerase chain reaction method in saliva samples taken before the first feeding during the first day following birth in neonates born in a university hospital between January 2021 …
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Ixodes scapularis ticks can carry Borrelia species as well as other pathogens that cause human disease. The frequency of tick-bo … We tested whole blood samples collected at the time of diagnosis using a multiplex high-definition polymerase chain reaction (HDPCR) panel to identify 9 bacterial or protozoan pathogens associated with human disease. We compared the frequency of tick-borne coinfections in children with Lyme disease to matched controls.
RESULTS: Of the 612 selected samples, 594 (97.1%) ha …
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
INTRODUCTION: Initiation of broad-spectrum empiric antibiotics is common when infection is suspected in hospitalized adults. The benefits of early utilization of effective antibiotics are well documented. However, the negative effects of inappropriate antibiotic use have led to antimicrobial stewardship mandates. Recent data demonstrate the utility of methicillin-resistant Staphylococcus aureus (MRSA) polymerase chain reaction (PCR) nasal screening to steward anti-MRSA empiric antibiotics in pneumonia. We hypothesize that MRSA PCR nasal swabs would also be effective to rule out other MRSA infe…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
COVID-19 disease caused by the novel SARS-CoV-2 virus represents a new challenge for healthcare systems. The molecular confirmation of infection is crucial to guide public health decision-making. This task could be made more difficult during the next influenza season. Thus, a rapid and user-friendly diagnostic test to discriminate SARS-CoV-2 from influenza viruses is urgently needed. Here, we present a multiplex quantitative polymerase chain reaction (qPCR) assay capable of distinguishing SARS-CoV-2 from influenza A and B cases. This assay benefits from the use of an inhibitor tolerant PCR mix…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Klinefelter syndrome (KS) is one of the most frequent genetic abnormalities and the leading genetic cause of nonobstructive azoospermia. The … that require rapid identification of target mice. To overcome these limitations, we developed three polymerase chain reaction-based assays to measure specific genetic information, including presence or absence of the sex determining region of chromosome Y (Sry), copy number of amelogenin, X-linked (Amelx), and inactive X specific transcripts (Xist) levels. Through a combin …
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
INTRODUCTION: Early identification of etiology is very important for initiating appropriate therapy promptly in patients with meningoencephalitis (ME). BioFire FilmArray® meningitis/encephalitis (FA-ME) panel is a fully automated multiplex polymerase chain reaction (PCR) that detects 14 pathogens simultaneously in an hour. There is a dearth of studies highlighting its usefulness in ME syndrome in Indian patients.
MATERIALS AND METHODS: We performed a retrospective analysis of patients, admitted to the Kerala Institute of Medical Sciences Hospital, Thiruvananthapuram, Kerala, South India, with…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The journal of maternal-fetal & neonatal medicine : the official journal of the European Association of Perinatal Medicine, the Federation of Asia and Oceania Perinatal Societies, the International Society of Perinatal Obstetricians2021eng
OBJECTIVE: To explore factors associated with a high vaginal GBS load during labor considering (1) the recto-vaginal GBS load at 35-37 weeks' gestation determined by culture and (2) the vaginal GBS colonization determined by a polymerase chain reaction (PCR) assay during labor.
METHODS: From an unselected cohort of 902 pregnant women, we obtained (1) recto-vaginal swabs for culture of GBS at 35-37 weeks' gestation (GBSrectovag-36), (2) vaginal swabs for GBS PCR detection at labor (PCRvag-labor), and (3) vaginal swabs for culture of GBS at labor (GBSvag-labor). The GBS load was classified semi…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BackgroundPneumocystis jirovecii pneumonia (PJP) is a life-threatening infection occurring in patients receiving bendamustine. The poorly defined incidence, particularly when utilizing polymerase chain reaction (PCR)-based diagnostic techniques, precipitates unclear prophylaxis recommendations. Our objective was to determine the cumulative incidence of PJP diagnosed by single copy target, non-nested PCR in patients receiving bendamustine.MethodsPatients were evaluated for PJP from initiation of bendamustine through 9 months after the last administration. The cumulative incidence of PJP was est…
Полный текст найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: The Herpesviridae family plays a significant etiological role in central nervous system viral infections during primary infection or reactivation from a latent form. Early detection is crucial because prescribing some antivirals can prevent severe side effects or life-threatening conditions.
METHODS: In this study, 251 CSF specimens were collected from patients with clinical suspicion of viral encephalitis in Pars Hospital, Tehran, Iran. DNA was extracted, and a multiplex PCR was designed to investigate the presence of herpes simplex virus-1, herpes simplex virus-2, varicella zost
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования