BACKGROUND Juvenile idiopathic arthritis (JIA) is one of the most common inflammatory disorders of unknown etiology. We introduced a novel method to identify dysregulated pathways associated with polyarticular JIA (pJIA). MATERIAL AND METHODS Gene expression profiling of 61 children with pJIA and 59 healthy controls were collected from E-GEOD-13849; 300 pathways were obtained from Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes (KEGG) database and 787,896 protein-protein interaction sets were gathered from the Retrieval of Interacting Genes. Attractor and crosstalk were designed to complement each oth
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: The human genome contains multiple LTR elements including human endogenous retroviruses (HERVs) that together account for approximately 8-9% of the genomic DNA. At least 40 different HERV groups have been assigned to three major HERV classes on the basis of their homologies to exogenous retroviruses. Although most HERVs are silenced by a variety of genetic and epigenetic mechanisms, they may be reactivated by environmental stimuli such as exogenous viruses and thus may contribute to pathogenic conditions. The objective of this study was to perform an in-depth analysis of the influe
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Life-threatening diarrheal cholera is usually caused by water or food contaminated with cholera toxin-producing Vibrio cholerae. For the prevention and surveillance of cholera, it is crucial to rapidly and precisely detect and identify the etiological causes, such as V. cholerae and/or its toxin. In the present work, we propose the use of a hybrid double biomolecular marker (DBM) microarray containing 16S rRNA-based DNA capture probe to genotypically identify V. cholerae and GM1 pentasaccharide capture probe to phenotypically detect cholera toxin. We employed a simple sample preparation method
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
When modeling time course microarray data special interest may reside in identifying time frames in which gene expression levels follow a monotonic (increasing or decreasing) trend. A trajectory may change its regime because of the reaction to treatment or of a natural developmental phase, as in our motivating example about identification of genes involved in embryo development of mice with the 22q11 deletion. To this aim we propose a new flexible Bayesian autoregressive hidden Markov model based on three latent states, corresponding to stationarity, to an increasing and to a decreasing trend.
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
PURPOSE OF REVIEW: Chromosome 22, the first human chromosome to be completely sequenced, is prone to genomic alterations. Copy-number varian … of translational research including treatment outcomes.
RECENT FINDINGS: With the increased use of microarray analysis in both research and clinical practice, variations in CNVs are becoming elucidated. Genomic analysis continues to characterize genes and gene effect. Research on the COMT gene continues to yield interesting findings, including a possible sex-mediate …
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Many multicellular organisms have remarkable capability to regenerate new organs after wounding. As a first step of organ regeneration, adult somatic cells often dedifferentiate to reacquire cell proliferation potential, but mechanisms underlying this process remain unknown in plants. Here we show that an AP2/ERF transcription factor, WOUND INDUCED DEDIFFERENTIATION 1 (WIND1), is involved in the control of cell dedifferentiation in Arabidopsis. WIND1 is rapidly induced at the wound site, and it promotes cell dedifferentiation and subsequent cell proliferation to form a mass of pluripotent cell
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: It has been well documented that pre-eclampsia and unexplained fetal growth restriction (FGR) have a common etiological background, but little is known about their linkage at the molecular level. The aim of this study was to further investigate the mechanisms underlying pre-eclampsia and unexplained FGR.
METHODS: We analyzed differentially expressed genes in placental tissue from severe pre-eclamptic pregnancies (n = 8) and normotensive pregnancies with or (n = 8) without FGR (n = 8) using a microarray method.
RESULTS: A subset of the FGR samples showed a high correlation coeffic
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Microarray technologies have received considerable attention owing to the fact that they serve as powerful tools for the high-throughput analysis of biomolecular interactions and the identification of bioactive substances that bind to biomolecules. Most of the current methods used to construct microarrays rely on the immobilization of substances on properly derivatized surfaces. Among various functional groups used for this purpose, the N-hydroxysuccinimide (NHS) ester group has been largely employed because it can be readily reacted with amine or hydrazide functionalities in substances of int
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVE AND DESIGN: This report describes a focused immediate early gene response by human umbilical vein endothelial cells (HUVEC) to Echis carinatus snake venom.
MATERIALS OR SUBJECTS: Primary cultures of HUVEC were used to assess acute inflammatory gene responses.
TREATMENTS: Crude E. carinatus venom (2.5 µg/ml) was used to stimulate HUVEC.
RESULTS: HUVEC stimulated for 3 h with E. carinatus venom showed a focused response to the venom, with significant increases in metallothionein (e.g., MT1H, MT2A, MT1X) and cytochrome P450 (e.g., CYP1A1, CYP1B1) gene expressions compared to non-stim
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
CONTEXT: HIV-associated wasting and weight loss remain clinically significant concerns even in the era of potent antiretroviral therapy. Although androgen treatment increases muscle mass, the cell-intrinsic mechanisms engaged remain poorly understood.
OBJECTIVE: This study was an unbiased approach to identify expression profiles associated with testosterone treatment using genome-wide microarray analysis of skeletal muscle biopsies.
DESIGN, SETTING, AND PARTICIPANTS: Forty-four HIV-positive men with weight loss were randomized to receive either 300 mg testosterone enanthate or placebo inject…
СтатьяРандомизированное исследованиеПоддержка NIH: внешняя программаПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: A close correlation has been shown between tubulointerstitial (TI) injury and the outcome of renal dysfunction, and nuclear fact … ded proteinuric rats were inhibited by the gene transfer of the truncated form of IkappaBalpha. DNA microarray analysis revealed 45 up-regulated genes and six down-regulated genes in the proteinuric rats, and expression of 23 of these 51 genes was significantly altered by NF-kappaB inhibition. Among these 23 genes, we focused on clusterin and confirmed the results of …
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MicroRNAs (MIRs) are a novel group of conserved short approximately 22 nucleotide-long RNAs with important roles in regulating gene expression. We have established a MIR-specific oligonucleotide microarray system that enables efficient analysis of the expression of the human MIRs identified so far. We show that the 60-mer oligonucleotide probes on the microarrays hybridize with labeled cRNA of MIRs, but not with their precursor hairpin RNAs, derived from amplified, size-fractionated, total RNA of human origin. Signal intensity is related to the location of the MIR sequences within the 60-mer p
Сравнительное исследованиеСтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVE: Utilize high-resolution chromosome analysis and microarray detection to determine the genetic etiology of infertility of a 32-year old female patient.
METHODS: The peripheral blood of the patient was cultured for high-resolution chromosome G and C banding karyotype analysis, and then 750K SNP-Array chip detection was performed.
RESULTS: Karyotype analysis results showed that the patient's karyotype was 45,XX,-13 [7]/46,XX,r(13) (p13q34) [185]/46,XX,dic r(13;13)(p13q34;p13q34) [14]/ 47,XX,+der(13;13;13;13) (p13q34;p13q34;p13q34; p13q34), dic r(13;13) [1]/ 46,XX [3]. The microarray
Клинический случайСтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Genome-wide expression patterns in physiological cardiac hypertrophy. Co-expression patterns in physiological cardiac hypertrophy
RESULTS: In this study, the first large-scale analysis of publicly available genome-wide expression data of several in vivo murine models of physiological LVH was carried out using network analysis. On evaluating 3 million gene co-expression patterns across 141 relevant microarray experiments, it was found that physiological adaptation is an evolutionarily conserved processes involving preservation of the function of cytochrome c oxidase, induction of a
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Cell-free fetal DNA is present in the plasma of pregnant women. It consists of short DNA fragments among primarily maternally derived DNA fragments. We sequenced a maternal plasma DNA sample at up to 65-fold genomic coverage. We showed that the entire fetal and maternal genomes were represented in maternal plasma at a constant relative proportion. Plasma DNA molecules showed a predictable fragmentation pattern reminiscent of nuclease-cleaved nucleosomes, with the fetal DNA showing a reduction in a 166-base pair (bp) peak relative to a 143-bp peak, when compared with maternal DNA. We constructe
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
In our previous transcriptomic studies using DNA microarray analysis, a probe designed from an unknown expressed sequence tag (EST) showed significant differential gene expression in the pharyngeal epithelia. The objectives of this study are to annotate the gene sequence and compare the gene transcription levels among different bovine tissues based on our published microarray data. The gene transcribing the EST contains a 90-amino-acid protein sequence. The results of bioinformatic analyses using comparative genetics, multiple sequence alignments, phylogenetic analysis and promoter sequence an…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Blood gene expression profiling has led to major advances in the field of rheumatology over the last few decades. Specifically, DNA microarray technology has been integral in increasing our knowledge of key players in the pathogenesis of some rare pediatric rheumatic diseases. Our group, using microarray analysis, identified the interferon (IFN) gene signature in pediatric systemic lupus erythematosus (SLE) and has published data that suggest high doses of intravenous corticosteroid treatment may have benefit over strictly oral regimens. Additionally, DNA microarray technology led to our disco…
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАОбзорПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
PURPOSE: Although situational risk factors for incisional hernia formation are known, the methods used to determine who would be most susceptible to develop one are unreliable. We hypothesized that patients with recurrent incisional hernias may possess unique gene expression profiles.
METHODS: Skin and intact fascia were collected from 15 normal control (NC) patients with no hernia history and 18 patients presenting for recurrent incisional hernia (RH) repair. Microarray analysis was performed using whole genome microarray chips on NC (n = 8) and RH (n = 9). These samples were further investi…
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
A variant of the hybridization oligonucleotide microarray, utilizing the principle of many probes-one spot (MPOS-microarrays), is proposed. A case study based on Orthopoxviruses (Variola, Monkeypox, and Ectromelia viruses) demonstrates a considerable increase in the fluorescence signal (up to 100-fold) when several oligonucleotide probes are printed to one spot. Moreover, the specificity of detection also increases (almost 1000-fold), allowing the use of probes that individually lack such high specificity. The optimal probes have a Tm of 32-37 °C and length of 13-15 bases. We suggest that the
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
To understand the molecular mechanisms underlying the development of dyslipidemia and lipodystrophy that occurs after administration of aspa … lated genes, and expression of genes involved in cell adhesion and extracellular matrix remodeling. Microarray analysis also identified a novel gene downregulated by ritonavir, Cidea, whose expression levels may affect free-fatty acid metabolism. These changes suggest a unique, stress-related pattern in adipocytes induced by chronic exposure to the protease inhibitor …
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаResearch Support, N.I.H., IntramuralПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования