VlsE is an outer surface lipoprotein of Borrelia burgdorferi that undergoes antigenic variation through an elaborate gene conversion mechanism and is thought to play a major role in the immune response to the Lyme disease borellia. The crystal structure of recombinant variant protein VlsE1 at 2.3-A resolution reveals that the six variable regions form loop structures that constitute most of the membrane distal surface of VlsE, covering the predominantly alpha-helical, invariant regions of the protein. The surface localization of the variable amino acid segments appears to protect the conserved
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоддержка службы здравоохранения СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The enzyme tissue transglutaminase (tTG) has been recently identified to represent a highly sensitive and specific target of autoantibodies in coeliac disease. To characterize autoantigenic epitopes, we generated novel tTG deletion mutants by polymerase chain reaction, produced radiolabelled fragments by in vitro transcription/translation, immunoprecipitated the mutants using sera from patients with coeliac disease, and related the binding data with putative structural and functional domains of human tTG. We show that tTG antibody positive sera display a heterogeneous autoantibody response cov
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Anhydromuropeptide permease (AmpG) is a transporter protein located in the inner membrane of certain gram -negative bacteria, involved in peptidoglycan (PG) recycling and β-lactamase induction. Decreased AmpG function reduces resistance of antibiotic-resistant bacteria to β-lactam antibiotics. Therefore, AmpG-targeting inhibitors are promising 'antibiotic adjuvants'. However, as the tertiary structure of AmpG has not yet been identified, the development of targeted inhibitors remains challenging. We present four cryo-electron microscopy (cryo-EM) structures: the apo-inward and apo-outward stat
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The multisubunit Golgi-associated retrograde protein (GARP) complex is required for tethering and fusion of endosome-derived transport vesicles to the trans-Golgi network. Mutation of leucine-967 to glutamine in the Vps54 subunit of GARP is responsible for spinal muscular atrophy in the wobbler mouse, an animal model of amyotrophic lateral sclerosis. The crystal structure at 1.7 A resolution of the mouse Vps54 C-terminal fragment harboring leucine-967, in conjunction with comparative sequence analysis, reveals that Vps54 has a continuous alpha-helical bundle organization similar to that of oth
СтатьяResearch Support, N.I.H., IntramuralПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Cutaneous leishmaniasis (CL) is a parasitic disease with a significant burden in the Old World countries.
OBJECTIVE: In the current study, some of the primary biochemical properties and IFN-γ inducing epitopes with specific binding capacity to human and mouse MHC alleles were predicted for Leishmania major gp46 antigenic protein.
METHODS: Several online servers were used to predict physico-chemical traits, allergenicity, antigenicity, transmembrane domain and signal peptide, subcellular localization, post-translational modifications (PTMs), secondary and tertiary structures, tert
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Intrinsic disorder is very important in the biological function of several proteins, and is directly linked to their foldability during interaction with their targets. There is a close relationship between the intrinsically disordered proteins and the process of carcinogenesis involving viral pathogens. Among these pathogens, we have highlighted the human papillomavirus (HPV) in this study. HPV is currently among the most common sexually transmitted infections, besides being the cause of several types of cancer. HPVs are divided into two groups, called high- and low-risk, based on their oncoge
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Rett syndrome causing missense mutations in the methyl-CpG-binding domain (MBD) of methyl CpG-binding protein 2 (MeCP2) were investigated both in silico and in vitro to reveal their effect on protein stability. It is demonstrated that the vast majority of frequently occurring mutations in the human population indeed alter the MBD folding free energy by a fraction of a kcal/mol up to more than 1 kcal/mol. While the absolute magnitude of the change of the free energy is small, the effect on the MBD functionality may be substantial since the folding free energy of MBD is about 2 kcal/mol only. Th
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Nucleotide-binding domain leucine-rich repeat proteins (NLRs) play a key role in immunity and disease through their ability to modulate inflammation in response to pathogen-derived and endogenous danger signals. Here, we identify the requirements for activation of NLRP1, an NLR protein associated with a number of human pathologies, including vitiligo, rheumatoid arthritis, and Crohn disease. We demonstrate that NLRP1 activity is dependent upon ASC, which associates with the C-terminal CARD domain of NLRP1. In addition, we show that NLRP1 activity is dependent upon autolytic cleavage at Ser(121
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Loss-of-function mutations such as L166P, A104T, and M26I in the DJ-1 gene (PARK7) have been linked to autosomal-recessive early onset Parkinson's disease (PD). Cellular and structural studies of the familial mutants suggest that these mutations may destabilize the dimeric structure. To look for common dynamical signatures among the DJ-1 mutants, short MD simulations of up to 1000 ps were conducted to identify the weakest region of the protein (residues 38-70). In an attempt to stabilize the protein, we mutated residue Val 51 to cysteine (V51C) to make a symmetry-related disulfide bridge with
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
J-proteins are obligate cochaperones of Hsp70s and stimulate their ATPase activity via the J-domain. Although the functions of J-proteins have been well understood in the context of Hsp70s, their additional co-evolved "physiological functions" are still elusive. We report here the solution structure and mechanism of novel iron-mediated functional roles of human Dph4, a type III J-protein playing a vital role in diphthamide biosynthesis and normal development. The NMR structure of Dph4 reveals two domains: a conserved J-domain and a CSL-domain connected via a flexible linker-helix. The linker-h
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Nanoparticles (NPs) are extremely small in size and possess very large surface areas, which gives them unique properties and applications distinct from those of bulk systems. When exposed to biological fluid, these NPs may become coated with proteins and other biomolecules given their dynamic nature. Hence, there is a significant possibility of an enhanced rate of protein fibrillation by utilizing the NPs as nucleation centers and, thus, promoting fibril formation. Protein fibrillation is closely associated with many fatal human diseases, including neurodegenerative diseases and a variety of s
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Superantigens (SAgs) are microbial toxins defined by their ability to activate T lymphocytes in a T cell receptor (TCR) β-chain variable domain (Vβ)-specific manner. Although existing structural information indicates that diverse bacterial SAgs all uniformly engage the Vβ second complementarity determining region (CDR2β) loop, the molecular rules that dictate SAg-mediated T cell activation and Vβ specificity are not fully understood. Herein we report the crystal structure of human Vβ2.1 (hVβ2.1) in complex with the toxic shock syndrome toxin-1 (TSST-1) SAg, and mutagenesis of hVβ2.1 indicates
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
We describe a Japanese family in which inheritance of a novel mutation p.A100T in SPG6 resulted in an autosomal dominant form of hereditary spastic paraplegia (ADHSP). Clinical investigation showed a pure form of HSP. Our study demonstrates further allelic heterogeneity of SPG6.
Клинический случайСтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Lectins are a structurally and functionally diverse group of proteins from different sources, capable to recognize and bind specifically carbohydrates. Several snake venoms contain calcium-dependent true lectins (SVLs) that recognize galactose. Herein, in order to enlighten some of the structure-function relationships of snake venom lectins (SVLs), we constructed theoretical models for 10 SVLs based on the Crotalus atrox lectin (CaL), the only SVL crystal structure available, and compared with other animal and plant lectins, and C-type lectin-like proteins (CLPs) that do not bind carbohydrates
Сравнительное исследованиеСтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVE: To study the molecular genetic mechanism of mucopolysaccharidosis type IV A(MPS IV A), and reveal the relationship between the genotype and phenotype, and provide a basis for prenatal gene diagnosis in the future.
METHODS: A preliminary diagnosis was made by qualitative detection of urinary glycosaminoglycans of the suspected MPS IV A proband. Then, mutation detection was performed on the proband and her family members with PCR and direct sequencing of the PCR products. After a novel c.1567T to G mutation was detected, Xsp I restriction enzyme digestion and amplification refractory
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Virus protein U (Vpu) from HIV-1, a small membrane protein composed of a transmembrane helical domain and two α-helices in an amphipathic cytoplasmic domain, down modulates several cellular proteins, including CD4, BST-2/CD317/tetherin, NTB-A, and CCR7. The interactions of Vpu with these proteins interfere with the immune system and enhance the release of newly synthesized virus particles. It is essential to characterize the structure and dynamics of Vpu in order to understand the mechanisms of the protein-protein interactions, and potentially to discover antiviral drugs. In this article, we d
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Heavy metal pumps constitute a large subgroup in P-type ion-transporting ATPases. One of the outstanding features is that the nucleotide binding N-domain lacks residues critical for ATP binding in other well-studied P-type ATPases. Instead, they possess an HP-motif and a Gly-rich sequence in the N-domain, and their mutations impair ATP binding. Here, we describe 1.85 A resolution crystal structures of the P- and N-domains of CopA, an archaeal Cu(+)-transporting ATPase, with bound nucleotides. These crystal structures show that CopA recognises the adenine ring completely differently from other
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Hsp104 is a hexameric AAA+ protein that utilizes energy from ATP hydrolysis to dissolve disordered protein aggregates as well as amyloid fibers. Interestingly, Hsp104 orthologues are found in all kingdoms of life except animals. Thus, Hsp104 could represent an interesting drug target. Specific inhibition of Hsp104 activity might antagonize non-metazoan parasites that depend on a potent heat shock response, while producing little or no side effects to the host. However, no small molecule inhibitors of Hsp104 are known except guanidinium chloride. Here, we screen over 16,000 small molecules and
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Protein-protein interactions play an essential role in almost any biological processes. Therefore, there is a particular need for methods which describe the interactions of a defined target protein in its physiological context. Here we report a method to photo-cross-link interacting proteins in S. cerevisiae by using the non-canonical amino acid p-azido-L-phenylalanine (pAzpa). Based on the expanded genetic code the photoreactive non-canonical amino acid pAzpa was site-specifically incorporated at eight positions into a domain of Aha1 that was previously described to bind Hsp90 in vitro to fun
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVE: We recently described anti-atherogenic properties of the dual domain peptide Ac-hE18A-NH(2) derived by covalently linking the heparin binding domain 141-150 of apoE to 18A, a class A amphipathic helical peptide. In this paper we have compared the properties of Ac-hE18A-NH(2) with the non-heparin binding 151-160 region of apoE linked to 18A (Ac-nhE18A-NH(2)).
METHODS AND RESULTS: Both peptides were highly helical in solution and in association with lipids. Ac-hE18A-NH(2) and not Ac-nhE18A-NH(2) enhanced uptake of low density lipoprotein (LDL) in HepG2 cells. While Ac-hE18A-NH(2) ret
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования