Pseudomonas aeruginosa has been implicated in a wide range of post-operation wound and lung infections. A wide range of acquired resistance and virulence markers indicate surviving strategy of P. aeruginosa. Complete-genome analysis has been identified as efficient approach towards understanding the pathogenicity of this organism. This study was designed to sequence the entire genome of P. aeruginosa UY1PSABAL and UY1PSABAL2; determine drug-resistance profiles and virulence factors of the isolates; assess factors that contribute toward stability of the genomes; and thereafter determine evoluti
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Head and neck cancer is the sixth most common malignancy worldwide, predominantly developing from squamous cell epithelia (HNSCC). The main HNSCC risk factors are tobacco, excessive alcohol use, and the presence of human papillomavirus (HPV). HPV positive (+) cancers are etiologically different from other HNSCC and often show better prognosis. The current knowledge regarding HNSCC miRNA profiles is still incomplete especially in the context of HPV+ cancer. Thus, we analyzed 61 freshly collected primary oral (OSCC) and oropharyngeal (OPSCC) SCC samples. HPV DNA and RNA was found in 21% cases. T
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
HPV integration plays an important role in cervical carcinogenesis. HPV genotypes and the exact integration sites were investigated using HPV capture technology combined with next generation sequencing in 166 women. Three, one and six integration sites were verified in 7 HPV-positive 'normal cervical epithelium', 6 HPV-positive CIN2 and 15 HPV-positive CIN 3 samples, respectively. Of the 10 integrations, one and nine were involved with HPV33 and HPV16, respectively. Our study accurately evaluated HPV integration level in CINs and normal cervical tissues using high-throughput viral integration
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Salmonella Typhimurium is frequently isolated from foodborne infection cases in Hong Kong, but the lack of genome sequences has hindered in-depth epidemiological and phylogenetic studies. In this study, we sought to reconstruct the phylogenetic relationship and investigate the distribution and mutation patterns of virulence determinants among local S. Typhimurium clinical isolates using their genome sequences.
RESULTS: We obtained genome sequences of 20 S. Typhimurium clinical isolates from a local hospital cluster using a 454 GS FLX Titanium sequencing platform. Phylogenetic anal
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The parasite Entamoeba histolytica kills human cells resulting in ulceration, inflammation and invasion of the colonic epithelium. We used the cytotoxic properties of ameba to select a genome-wide RNAi library to reveal novel host factors that control susceptibility to amebic killing. We identified 281 candidate susceptibility genes and bioinformatics analyses revealed that ion transporters were significantly enriched among susceptibility genes. Potassium (K(+)) channels were the most common transporter identified. Their importance was further supported by colon biopsy of humans with amebiasis
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The epithelium lining the epididymis has a pivotal role in ensuring a luminal environment that can support normal sperm maturation. Many of the individual genes that encode proteins involved in establishing the epididymal luminal fluid are well characterized. They include ion channels, ion exchangers, transporters, and solute carriers. However, the molecular mechanisms that coordinate expression of these genes and modulate their activities in response to biological stimuli are less well understood. To identify cis-regulatory elements for genes expressed in human epididymis epithelial cells, we
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Previous meta-analysis of genome-wide association (GWA) studies has identified 180 loci that influence adult height. However, each GWA locus typically comprises a set of contiguous genes, only one of which presumably modulates height. We reasoned that many of the causative genes within these loci influence height because they are expressed in and function in the growth plate, a cartilaginous structure that causes bone elongation and thus determines stature. Therefore, we used expression microarray studies of mouse and rat growth plate, human disease databases and a mouse knockout phenotype dat
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаResearch Support, N.I.H., IntramuralПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
INTRODUCTION: Osteoporosis is characterized by low BMD. Studies have shown that B cells may participate in osteoclastogenesis through expression of osteoclast-related factors, such as RANKL, transforming growth factor beta (TGFB), and osteoprotegerin (OPG). However, the in vivo significance of B cells in human bone metabolism and osteoporosis is still largely unknown, particularly at the systematic gene expression level.
MATERIALS AND METHODS: In this study, Affymetrix HG-U133A GeneChip arrays were used to identify genes differentially expressed in B cells between 10 low and 10 high BMD postm
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
DNA fingerprinting with two minisatellite (33.15, M13) and two simple repeat probes [(GACA)4, (CAC)5/(GTG)s] was performed to screen for somatic changes in the DNA from various solid human tumours in comparison with constitutional DNA from the same patient. Loss of bands or changes in band intensities were observed. Together the probes 33.15 and (CAC)5/(GTG)5 detected deviating fingerprint patterns in 63% of the colorectal carcinomas investigated. In mammary and stomach carcinomas, only 1/11 and 2/11 tumours, respectively, showed differences with either of the three probes, 33.15, (GACA)4 and
Сравнительное исследованиеСтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
All presently available replication-competent proviral clones of human immunodeficiency virus type 1 (HIV-1) are derived from cell culture-amplified virus. Since tissue culture is highly selective for viral strains with an in vitro growth advantage, such clones may not be representative of the biologically relevant virus present in vivo. In this study, we report the molecular cloning and genotypic characterization of 10 HIV-1 genomes directly from uncultured brain tissue of a patient with AIDS dementia complex. Targeting unintegrated circular HIV-1 molecules for recombinant lambda phage clonin
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоддержка правительства СШАПоддержка службы здравоохранения СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Genome-scale metabolic models predict metabolic flux distributions but typically lack explicit transcriptional regulation, limiting their ability to simulate graded effects of epigenetic modulators such as Sirtuin1.
OBJECTIVES: This study aims to develop and validate a continuous regulatory-metabolic framework integrating sirtuin 1-dependent transcriptional control into human genome-scale metabolism and to quantify the metabolic impact of microbiome-derived butyrate in intestinal epithelial cells.
METHODS: A curated Sirtuin1-centered regulatory network comprising 8 transcriptiona
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The study of breast cancer is complicated by the heterogeneity inherent within the disease. Numerous models have been developed to study the initiation, progression, and treatment of breast cancer. These include carcinogen induced mouse models, genetically engineered mouse models, and patient derived xenografts. The relevance of these mouse models to humans must be precisely defined for appropriate understanding of disease mechanisms to derive intervening treatments. Sequencing projects such as The Cancer Genome Atlas Project (TCGA) and Catalogue Of Somatic Mutations In Cancer (COSMIC) were pi
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Over the past decade, considerable attention has been directed toward the plasmid-mediated dissemination of linezolid resistance determinants among Enterococcus faecium (E. faecium). Despite extensive epidemiological research, a systematic global genomic analysis of linezolid resistance gene-positive E. faecium (LRGPEfm) is lacking.
METHODS: This study conducted a comprehensive genomic analysis of 832 LRGPEfm genomes, with the aim of investigating their antibiotic resistance genes (ARGs), virulence factor genes (VFGs), population structure, and transmission pathways.
RESULTS: The
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Human respiratory syncytial virus (HRSV) imposes a substantial burden in the United States. The use of whole-genome sequencing (WGS) for public health surveillance of HRSV lags that for other viral pathogens. The objective of this study was to expand the scope and depth of WGS-based surveillance of HRSV in Minnesota, USA.
METHODS: HRSV-positive specimens collected from outpatients and inpatients from July 2023 to April 2025 were submitted to the Minnesota Public Health Laboratory for WGS. Genomes were sequenced using a tiled amplicon approach, characterized by lineage, phylogeneti
СтатьяСравнительное исследованиеПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Background/Objectives:Streptococcus parasuis is an under-recognized member of the Streptococcus suis complex that can be misidentified by routine diagnostic methods. Human clinical isolates remain sparsely characterized. This study investigated the antimicrobial phenotype, genomic features, population position, and larval pathogenicity of a human pleural-fluid isolate. Methods: Strain HUGSPH was recovered during the care of a patient with pneumonia. Hybrid whole-genome sequencing (WGS), average nucleotide identity analysis, multilocus sequence typing (MLST), core-genome phylogenetics, comparat
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
B-cell acute lymphoblastic leukemia (B-ALL) is the most common childhood cancer, yet the mechanisms by which inherited risk variants predispose to leukemia development remain poorly understood. A major challenge to studying these mechanisms has been the lack of model systems that faithfully capture the transient developmental states in which predisposition alleles are thought to act. Here, we establish a human B-cell differentiation platform from hematopoietic stem/progenitor cells that enables CRISPR-based engineering, recapitulates early B-cell lymphopoiesis, and enriches for rare developmen
СтатьяПрепринтПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
INTRODUCTION: Hepatitis E virus (HEV) is a globally prevalent zoonotic pathogen posing major public health risks. Swine, a major meat source, carry HEV strains genetically similar to those in humans, highlighting the risk of zoonotic foodborne transmission. This study aimed to investigate the evolutionary history of HEV through phylogenetic and recombination analyses, further provide key reference bases for public health management, improve food safety standards, and offer support for developing effective strategies to prevent foodborne hepatitis E infections.
METHODS: We analyzed 348 full-le
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Hepatitis E virus (HEV) is an important public health concern, especially in developing countries. Complete genomes of HEV strains circulating in Cameroon are not available. Here, we report five nearly complete strains of HEV in Cameroon. These strains share a high identity with human African and swine Asian isolates.
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
A Streptococcus suis strain isolated from the blood of a patient in Zhejiang Province, China, was analysed using whole-genome sequencing and tested for antimicrobial resistance. The isolated strain was identified as S. suis serotype 2, and classified to ST25 on multilocus sequence typing (MLST). The minimum core genome group of the strain was identified as Group 4, and multilocus variable-number tandem-repeat analysis (MLVA) assigned it as type 2, 4.4, 0, 9, 3, 2, 0, 0. An antimicrobial resistance analysis showed that the strain was resistant to clindamycin, tetracycline, azithromycin, and ery
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования