The molecular basis of advanced systemic mastocytosis (SM) is not fully understood and despite novel therapies the prognosis remains dismal. Exome sequencing of an index-patient with mast cell leukemia (MCL) uncovered biallelic loss-of-function mutations in the SETD2 histone methyltransferase gene. Copy-neutral loss-of-heterozygosity at 3p21.3 (where SETD2 maps) was subsequently found in SM patients and prompted us to undertake an in-depth analysis of SETD2 copy number, mutation status, transcript expression and methylation levels, as well as functional studies in the HMC-1 cell line and in a
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Germline mutation and functional loss of EXT1 or EXT2 are commonly found in multiple osteochondromas and predispose to the development of chondrosarcoma. Mutations of EXT1 and EXT2 have rarely been detected in sporadic secondary chondrosarcomas from osteochondroma; these frequently display loss of heterozygosity at the EXT1 and EXT2 loci, but primary chondrosarcomas typically do not. To evaluate promoter methylation (which is an epigenetic gene silencing mechanism) of EXT1 and EXT2, we performed methylation-specific polymerase chain reaction (PCR) for 20 chondrosarcoma cases (12 primary, 3 sec…
Сравнительное исследованиеСтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Glioblastoma multiforme (GBM) is an end-stage brain tumor of glial origin. Allelic deletions encompassing all or part of chromosome 10q occur frequently in GBMs, indicating that loss of one or more tumor suppressor genes on 10q plays a role in GBM formation. One of these genes is MMAC1 (PTEN), a gene on 10q23 which encodes a dual-specificity protein phosphatase. We carried out a loss of heterozygosity (LOH) analysis of 66 GBM patients using microsatellite markers for 27 loci on 10q. Overall, LOH was detected in 70% of cases, most showing LOH with every informative marker. Eleven patients showe…
СтатьяПоддержка службы здравоохранения СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
An extended YAC contig has been developed for the 3p14 region containing the hereditary renal carcinoma 3;8 translocation breakpoint and the 3p14.2 fragile site FRA3B. This region of chromosome 3 has been implicated by chromosomal translocation, deletion, and loss of heterozygosity in the pathogenesis of several malignant diseases. The contig allows accurate positioning of candidate genes, polymorphic markers, and other 3p rearrangements within this region. The contig, spanning approximately 6 Mb of DNA, contains 51 YACs identified by 27 markers, including a subset of CA repeats located in the…
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоддержка службы здравоохранения СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Human chromosomal region 13q14 is a deletion hotspot in prostate cancer, multiple myeloma, and chronic lymphocytic leukemia. This region is believed to host multiple tumor suppressors. Chromosome Condensation 1-like (CHC1L) is located at 13q14, and found within the smallest common region of loss of heterozygosity in prostate cancer. Decreased expression of CHC1L is linked to pathogenesis and progression of both prostate cancer and multiple myeloma. However, there is no direct evidence for CHC1L's putative tumor suppressing role in current literature. Presently, we describe the generation and c…
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Both germline and somatic mutations are known to affect phenotypes of human cells in vivo. In previous studies, we cloned mutant peripheral blood T cells from germline heterozygous humans for adenine phosphoribosyltransferase (APRT) (EC 2.4.2.7) deficiency and found that approximately 1.3 x 10-4 peripheral T cells had undergone in vivo somatic mutations. Loss of heterozygosity (LOH) was the major cause of the mutations at the APRT locus since approximately 80% of the mutant T cell clones exhibited loss of normal alleles. In the present study, we identified three heterozygous individuals for AP…
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Beckwith-Wiedemann syndrome (BWS) is an imprinting disorder characterized by overgrowth and tumor predisposition, caused by dysregulated exp … IGF2, with pseudohypoxic tumors exhibiting higher expression compared to other molecular clusters. Loss of heterozygosity and loss of imprinting at 11p15.5 partially explain this overexpression, with PPGL additionally demonstrating globally elevated expression of imprinted genes compared to most other tumor types, suggesting a broader relaxation of genomic imprinting. …
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Neurofibromatosis 1 (NF1) is caused by germline mutations in the NF1 gene and manifests as proliferation of various tissues, including plexi … n pathogenic variant in the LZTR1 gene. Somatic analysis of the plexiform neurofibroma revealed NF1 loss of heterozygosity and a variant in GNAZ, a gene encoding a G protein-coupled receptor. Cells expressing mutant GNAZ exhibited increased ERK 1/2 activation compared to those expressing wild-type GNAZ. Taken together, we suggest the variants in NF1, LZRT1 and GNAZ act …
Клинический случайСтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Mutations in SLC26A4 cause nonsyndromic hearing loss associated with an enlarged vestibular aqueduct (EVA, also known as DFNB4) and Pendred syndrome (PS), the most common type of autosomal-recessive syndromic deafness. In many patients with an EVA/PS phenotype, mutation screening of SLC26A4 fails to identify two disease-causing allele variants. That a sizable fraction of patients carry only one SLC26A4 mutation suggests that EVA/PS is a complex disease involving other genetic factors. Here, we show that mutations in the inwardly rectifying K(+) channel gene KCNJ10 are associated with nonsyndro
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Pyle disease is a rare autosomal recessive bone dysplasia characterized by the broadening of metaphyses with generalized cortical thinning. Homozygous truncating mutations in secreted frizzled-related protein 4 (SFRP4) were, to date, the only known variants causative for this type of skeletal disorder. SFRP4 controls cortical and trabecular bone remodeling by differential regulation of the canonical and non-canonical WNT signaling in both bone compartments. Loss-of-function mutations in the SFRP4 gene lead to the protein deficiency causing skeletal phenotype typical for Pyle diseas
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Superoxide dismutase 1 (Sod1) is long recognized as a frontline antioxidant, yet its broader role in safeguarding the eukaryotic genome remains under-explored. Here, using a yeast model, we reveal that Sod1 is an indispensable guardian of genomic integrity. Its absence unleashes a genomic storm: whole-genome sequencing uncovered a dramatic surge in single nucleotide variations (13-fold), loss of heterozygosity (12-fold), chromosomal rearrangements (4-fold), and a staggering 48-fold increase in aneuploidy. Remarkably, this genomic instability was completely abolished under anaerobic conditions,…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Aging is a major risk factor for breast cancer, yet how it shapes tumor development, molecular phenotype, and immune evasion remains incompl … genomic instability, reduced immune cell infiltration, and impaired antigen presentation linked to loss of heterozygosity at chromosome (Chr) 20p. The age-associated epithelial and immune changes we identified were conserved in human breast cancers, where the loss of the homologous Chr 6p region correlated with reduced lymphocyte infiltration and shorter relapse-free s …
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Extranodal NK/T-cell lymphoma (ENKTL) and primary Epstein-Barr virus (EBV)-positive nodal T/NK-cell lymphoma (nodal-TNKL) are aggressive lym … s, one characterized by higher global methylation, TP53 loss, increased copy number alterations and loss of heterozygosity and significantly poorer overall survival. Together, this study defines fundamental epigenetic differences between ENKTL and nodal-TNKL and links DNA methylation dynamics to genomic instability and clinical outcome, highlighting the value of methyla …
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Monosomy 7 (-7) and deletions of chromosome arm 7q (del(7q)) are prevalent high-risk cytogenetic abnormalities that often co-occur with del(17p) (harboring TP53). To identify novel targeted therapies based on specific vulnerabilities in high-risk myeloid malignancies, we investigated druggable, chromosome 7-encoded essential genes that are monoallelically deleted in the context of -7/del(7q), that is, collateral lethal genes. By mining genome-wide CRISPR-Cas9 screen data sets, we identified nicotinamide phosphoribosyltransferase (NAMPT) on 7q22.3 as a specific susceptibility in 81.5% of -7/del
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
INTRODUCTION: PCARE-associated inherited retinal diseases are rare disorders characterized by progressive vision loss due to photoreceptor degeneration. Although several variants have been identified in diverse populations, limited data are available from the Iberian Peninsula.
METHODS: We conducted a retrospective case series of eight Portuguese patients from six unrelated families with confirmed PCARE mutations. Clinical data, multimodal imaging, and genetic analyses were reviewed.
RESULTS: The most common variant identified was c.3099delinsCCAGG p.(Val1034Glnfs *74), present in homozygosi
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Doyne honeycomb retinal dystrophy (DHRD)/malattia leventinese (ML) is an autosomal dominant, progressive retinal disorder characterized by massive central retinal drusen often partly coalescent forming a characteristic honeycomb-like pattern. Debut of vision loss often occurs in early to mid-adulthood, and the degree varies. A single variant in EFEMP1: c.1033C>T (R345W) has been identified as the cause in all cases.
METHODS: Following DNA isolation, exome sequencing was performed in seven genes associated with flecked retina. Direct sequencing was used for variant verification.
R
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
We present a study of rare germline predisposition variants in 954 unrelated individuals with multiple myeloma (MM) and 82 MM families. Usin … ; and BRIP1, EP300, and FANCM in individuals of African ancestry. Variants were characterized using loss of heterozygosity (LOH), biallelic events, and gene expression analyses, revealing 31 variants in 3.25% of sporadic cases for which pathogenicity was supported by multiple lines of evidence. Our results suggest that the disruption of DNA damage repair pathways may pl …
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVE: Von Hippel-Lindau (VHL) disease is an autosomal dominantly inherited tumor syndrome caused by a VHL gene mutation. Here we report … utation at codon 194 (V194G) in exon 3. This mutation was inherited from the paternal allele, and a loss of heterozygosity was noted in 3 of the patient's distinct tumors. Two independent in silico analyses suggested that this amino acid substitution was pathogenic.
CONCLUSION: We identified a novel missense mutation of VHL in a young patient with malignant pheochromoc …
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Chédiak-Higashi syndrome (CHS) is a rare autosomal recessive (AR) immune disorder that has usually been associated to missense, nonsense or … explain the molecular mechanism of inheritance, respectively. Partial-UPiD leads to a copy neutral loss of heterozygosity (CN-LOH) of the telomeric region of chromosome 1 (1q41q44), unmasking the potential effect of the mutation detected. The mutation (c.8380dupT) is an insertion located in exon 32 of the LYST gene resulting in a premature stop codon and leading to the …
Клинический случайПоддержка исследования: вне правительства СШАСтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Dominantly inherited progressive hearing loss DFNA38 is caused by heterozygosity for a novel mutation in WFS1, the gene for recessively inherited Wolfram syndrome. Wolfram syndrome is defined by juvenile diabetes mellitus and optic atrophy and may include progressive hearing loss and other neurological symptoms. Heterozygotes for other Wolfram syndrome mutations generally have normal hearing. Dominant deafness defined by DFNA38 is more severe than deafness of Wolfram syndrome patients and lacks any syndromic features. In a six-generation kindred from Newfoundland, Canada, WFS1 Ala716Thr (2146
СтатьяПоддержка службы здравоохранения СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования