BACKGROUND: Accurate diagnosis of Clostridium difficile infection (CDI) is paramount for patient management. The wrong diagnosis places patients at risk, delays treatment, and/ or contributes to transmission of infection in the healthcare setting. Although amplification of the toxin B gene by polymerase chain reaction (PCR) is a sensitive method for detecting toxigenic C. difficile, false negative results still occur and could impact the diagnosis and treatment of this infection.
METHODS: This study investigated 48 patients that tested negative for toxigenic C. difficile via GeneXpert C. diff
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Six key viral pathogens-porcine epidemic diarrhea virus (PEDV), transmissible gastroenteritis virus (TGEV), porcine rotavirus (PoRV), porcine deltacoronavirus (PDCoV), pseudorabies virus (PRV), and porcine reproductive and respiratory syndrome virus (PRRSV)-inflict substantial economic losses on the global swine industry. Their frequent cocirculation and the resulting mixed infections severely complicate rapid and accurate diagnosis. To overcome this challenge, we developed a multiplex real-time PCR assay integrated with high-resolution melting (HRM) analysis for their simultaneous detection a
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: The problem of transmissible human herpesvirus infections through blood donation has not been completely resolved by serological testing due to issues such as delayed in seroconversion or false-negative results. This study aimed to develop a cost-effective, In-house designed multiplex real-time PCR assay for the simultaneous detection of Epstein-Barr virus (EBV) and cytomegalovirus (CMV) DNA in pooled blood donor samples.
METHODS: A total of 1000 whole-blood samples were collected from apparently healthy Iraqi blood donors and pooled into mini pools 10(MP10) i.e. 100 MP10 tested b
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Herpes simplex virus type 1 (HSV-1), herpes simplex virus type 2 (HSV-2), and varicella-zoster virus (VZV) are associated with a range of clinical manifestations depending on the anatomical site of infection. HSV and VZV lesions often exhibit similar phenotypical characteristics, making clinical differentiation challenging. Detection and differentiation of HSV-1, HSV-2, and VZV are essential for diagnosis and treatment management. An automated multiplex real-time PCR assay, Alinity m HSV 1 & 2/VZV assay, was developed to detect and differentiate HSV-1, HSV-2, and VZV. The assay was validated f
СтатьяОценочное исследованиеМногоцентровое исследованиеПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Rapid pathogen identification is essential for the management of post-operative intra-abdominal infections. However, conventional culture is often time-consuming and has limited pathogen coverage. Our study aimed to evaluate the performance of multiplex pathogen real-time polymerase chain reaction (MP-PCR) in detecting pathogens and antimicrobial resistance genes (ARGs) from postoperative drainage fluids. A total of 63 drainage fluid specimens were prospectively collected from 52 patients who underwent abdominal surgery and were included in the final analysis. All specimens were detected in pa
СтатьяОценочное исследованиеПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Invasive infections caused by Candida species, especially in immunocompromised patients, are a growing global health concern due to high mortality rates and increasing antifungal resistance. Rapid and accurate identification of the etiological agent is essential for timely and appropriate treatment. In this study, we developed a one-hour multiplex real-time PCR assay coupled with high-resolution melting (qPCR-HRM) for the simultaneous identification of Candida albicans, Candida parapsilosis and Candida auris, using five specifically designed primers and the intercalary dye Syto9. The assay dem
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: After the occurrence of the COVID-19 pandemic, detection of other disseminated respiratory viruses using highly sensitive molecular methods was declared essential for monitoring the spread of health-threatening viruses in communities. The development of multiplex molecular assays are essential for the simultaneous detection of such viruses even at low concentrations. In the present study, a highly sensitive and specific multiplex one-step droplet digital PCR (RT-ddPCR) assay was developed for the simultaneous detection and absolute quantification of influenza A (IAV), influenza B (
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Here we report an ultrafast quadruplex RT-qPCR assay with robust diagnostic ability to detect and distinguish pan-SARS-CoVs and influenza A/B viruses within 35 min. This quadruplex RT-qPCR assay comprised of one novel RNA-based internal control targeting human β2-microglobulin (B2M) for process accuracy and three newly-designed primers-probe sets targeting the envelope protein (E) of pan-SARS-CoV, matrix protein (MP) of influenza A virus and non-structural (NS) region of influenza B virus. This quadruplex assay exhibited a sensitivity comparable to its singleplex counterparts and a slightly hi
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Molecular diagnosis and measurement of minimal residual disease (MRD) in patients with chronic myeloid leukemia (CML) is essential for clinical management. In the era of tyrosine kinase inhibitor therapy molecular tests including BCR-ABL1 transcript monitoring and kinase domain mutation analysis are the main tools used to inform choice of treatment, appropriate dosage and even whether therapy can be safely withdrawn. Quantitation of BCR-ABL1 oncogene transcript by real-time quantitative PCR (qPCR) is currently the gold-standard method for monitoring as it provides superior sensitivity over kar
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Malaria continues to affect over 200 million individuals every year, especially children in Africa. Rapid and sensitive detection and identification of Plasmodium parasites is crucial for treating patients and monitoring of control efforts. Compared to traditional diagnostic methods such as microscopy and rapid diagnostic tests (RDTs), DNA based methods, such as polymerase chain reaction (PCR) offer significantly higher sensitivity, definitive discrimination of Plasmodium species, and detection of mixed infections. While PCR is not currently optimized for routine diagnostics, its r
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The goal of the study was to develop a specific, sensitive, and cost-effective molecular RT-PCR diagnostic assay for the rapid and simultaneous detection of the serotypes of dengue virus (DENV) and Chikungunya virus (CHIKV) from sera of suspected febrile patients. A single-tube, single-step multiplex RT-PCR (mRT-PCR) assay was designed for the detection of viral genomes from clinical and field samples. Specificity and sensitivity of the mRT-PCR assay were evaluated against six different combinations using two reverse transcriptases (AMV-RT and RT-Ace) and three DNA polymerases (LA-Taq, rTaq, a
Оценочное исследованиеСтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Human adenovirus (HAdV) serotypes 2, 3 and 7 are more prevalent than other serotypes and have been associated with severe pneumonia in pediatric children. Molecular typing of HAdV is not routinely performed in clinical diagnostic laboratories as it is time-consuming and labor-intensive.
METHODS: In the present study, we developed a triplex quantitative real-time PCR assay (tq-PCR) in a single closed tube for differential detection and quantitative analysis of HAdV serotypes 2, 3 and 7. The sensitivity, specificity, reproducibility and clinical performance of tq-PCR were evaluated.
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
A real-time PCR (RT-PCR) assay was designed for the simultaneous identification of Neisseria gonorrhoeae and its ciprofloxacin susceptibility status. A SYBR green-based multiplex RT-PCR format was used; it comprised two different forward primers and a common reverse primer to detect single nucleotide polymorphisms (SNPs) in gyrA of N. gonorrhoeae The primer pairs were evaluated for their sensitivity and specificity using genomic DNA from 254 N. gonorrhoeae isolates (82 were ciprofloxacin susceptible and 172 were ciprofloxacin resistant) and 23 non-N. gonorrhoeae species isolates. The performan
СтатьяВалидационное исследованиеПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVE: To explore the epidemiologic characteristics of noroviruses isolated in patients with acute gastroenteritis in Hangzhou between March 2014 and April 2015.
METHODS: Stool specimens and clinical data were collected from 1 109 patients with acute gastroenteritis. Specimens were detected for noroviruses with GⅠand GⅡsubtypes by one-step double real-time RT-PCR. Some of the positive specimens were then randomly selected and amplified by multiplex RT-PCR. Those positive PCR products were sequenced and analyzed phylogenetically for testing the partial capsids of noroviruses.
RESULTS: Of
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
To compare the diagnostic performance for HPV infection using three laboratorial techniques. Ninty-five cervicovaginal samples were randomly selected; each was tested for HPV DNA and genotypes using 3 methods in parallel: Multiplex-PCR, the Nested PCR followed by Sanger sequencing, and the Next_Gen Sequencing (NGS) with two assays (NGS-A1, NGS-A2). The study was approved by the Brazilian National IRB (CONEP protocol 16,800). The prevalence of HPV by the NGS assays was higher than that using the Multiplex-PCR (64.2% vs. 45.2%, respectively; P = 0.001) and the Nested-PCR (64.2% vs. 49.5%, respec
Сравнительное исследованиеОценочное исследованиеСтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Friedreich's ataxia (FRDA) is an inherited recessive disorder characterized by progressive neurological disability and heart abn … s (r=0.93; P<0.002). 8.6 and 9.0 kb deletion in mtDNA was detected in 9 patients out of 12 (75%) by multiplex polymerase chain reaction (PCR) and Southern blot analysis.
CONCLUSIONS: This study suggested that a biochemical defect in complex I activity and ATP production, which may be due to iron accumulation in mitochondria, can be involved in age of onset of FRDA.
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Histiocytic sarcoma (HS) is a rare disease, and there has been much confusion concerning the diagnostic criteria for this entity. Since immu … ocation or other variant] by fluorescence in situ hybridization. The T-cell receptor-gamma chain by multiplex polymerase chain reaction showed a polyclonal pattern. No heavy or light chain gene rearrangements were found. To our knowledge, this is the first reported autopsy case of this rare entity primarily involving the brain and meninges.
Клинический случайСтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND/OBJECTIVES: Multiplex polymerase chain reaction (PCR) assays have transformed the diagnosis of infectious gastroenteritis by enabling rapid, simultaneous detection of multiple enteric pathogens. However, contemporary data describing pathogen distribution, age-specific patterns, co-infection, and seasonality in Saudi Arabia remain limited. This study aimed to characterize the epidemiology of gastrointestinal pathogens detected by multiplex PCR in a tertiary care center in Riyadh, Saudi Arabia.
METHODS: We conducted a retrospective analysis of stool specimens tested using a multiplex…
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Advances in molecular laboratory techniques are changing the prospects for the diagnosis of viral infectious diseases. Multiplex polymerase chain reaction assay (multiplex-PCR) can detect dozens of pathogens simultaneously, greatly reducing turnaround time (TAT) and improving detection sensitivity. But as a double-edged sword, due to the high sensitivity of PCR, the type of respiratory specimens is critical to diagnosis. In this work, we performed a head-to-head comparison to evaluate the multiplex-PCR yields between two samples, sputum and flocked oropharyngeal swabs (OPS).
METHO…
Сравнительное исследованиеСтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVE: To develop a fluorescent polymerase chain reaction (PCR) assay for the detection of circulating fetal DNA in maternal plasma and use the established multiplex in noninvasive prenatal genetic diagnosis and its further applications in forensic casework.
STUDY DESIGN: The DNA template was extracted from 47 pregnant women and the whole blood samples from the stated biological fathers were used to detect genotype. Using multiplex fluorescent PCR at 16 different polymorphic short tandem repeat (STR) loci, maternal DNA extracted from plasma samples at early pregnancy, medium pregnancy and
Оценочное исследованиеСтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования