Antimicrobial resistance (AMR) is one of the most pressing threats to global health system. The human gut harbors a complex microbial ecosystem coordinated through mechanisms of metabolic interdependence. The gut microbiota plays a vital role in normal growth and physiological processes of the human body. It serves both as a target of antibiotic-mediated disruption and as a reservoir for the propagation of antimicrobial resistance genes. Although antibiotics remain indispensable for the treatment of bacterial infections, their broad ecological impact on the gut microbiota can undermine the mic
СтатьяОбзорПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The transportation of antibiotic resistance genes (ARGs) in manure-soil-plant continuums poses risks to human health. Horizontal gene transfer, particularly for bacterial transformation, is an important way for ARG dissemination. As crucial components in soils, iron oxides impacted the fates of various abiotic and biotic contaminants due to their active properties. However, whether they can influence the transformation of ARGs is unknown, which waits to be figured out to boost the assessment and control of ARG spread risks. In this study, we have investigated the effects of goethite, hematite,
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Antibiotic resistance is a globally recognized health concern which leads to longer hospital stays, increased morbidity, increased mortality, and higher medical costs. Understanding how antibiotic resistance persists and exchanges in environmental systems like soil, water, and wastewater are critically important for understanding the emergence of pathogens with new resistance profiles and the subsequent exposure of people who indirectly/directly come in contact with these pathogens. There are concerns about the widespread application of prophylactic antibiotics in the clinical and agriculture
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Bacillus licheniformis is an opportunistic pathogen in clinical settings. However, the emergence of clinical strains carrying horizontally acquired virulence determinants, including chromosomal genomic islands harboring yopX, a putative type IV secretion system (T4SS), and plasmids bearing toxin-antitoxin systems and additional virulence factors, poses a significant challenge to diagnosis and treatment. Moreover, the genetic basis of the pathogenicity of clinical isolates has not been comprehensively studied.
METHODS: A pathogenic B. licheniformis strain (LSDY01) isolated from a s
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Intensified chlorine disinfection during pandemic is widely implemented in hospital and municipal wastewaters to inactivate pathogens. However, high concentrations of residual chlorine in treated wastewaters might bring secondary environmental risks. This study investigated the impacts of intensified chlorine disinfection on disinfection by-product (DBP) formation from six commonly used pandemic-related drugs and antibiotic resistance gene (ARG) enrichment in sewage. Results showed that high chlorine dosage of 2000 µmol/L led to DBP yields and estimated toxicity that were 1-2 orders of magnitu
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
AIMS: The behaviour of an Escherichia coli isolate of broiler origin harbouring a bla(TEM-52) -carrying plasmid (lactose-negative mutant of B1-54, IncII group) was studied in an in situ continuous flow culture system, simulating the human caecum and the ascending colon during cefotaxime administration.
METHODS AND RESULTS: Fresh faeces from a healthy volunteer, negative for cephalosporin-resistant E. coli, were selected to prepare inocula. The microbiota was monitored by plating on diverse selective media, and a shift in the populations of bacteria was examined by 16S rDNA PCR denaturing grad
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Metabolic dysfunction-associated steatotic liver disease (MASLD) is a multifactorial condition in which the gut microbiome (GM) plays a central role. However, taxonomic associations derived from 16S ribosomal RNA (rRNA) gene studies have yielded inconsistent results, likely due to limited resolution and functional redundancy across taxa. We aimed to identify robust, functionally relevant microbial markers of MASLD using metagenomics and gene-centric profiling. METHODS: We analyzed 554 fecal metagenomes from three independent cohorts. Sequencing reads were quality-controlled and tax
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Aerobactin encoding loci is the key virulence factor in the virulence plasmid of Klebsiella pneumoniae (Kp). The iuc1 and iuc2 loci are most commonly detected and well-studied, while the iuc3 lineage is less understood. The study investigated comprehensively the iuc3-carrying plasmids in Kp strains providing insights into the diversity, transmission potential and contribution to Kp virulence. The iuc3 was encoded on plasmids ranging from 177,328 bp to 249,880 bp, primarily of the IncFIBK/FIIK5 type, often carrying multi-drug resistance (MDR) regions. Conjugation experiments demonstrated the tr
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Horizontal gene transfer has been demonstrated to be an important driver for the emergency of multidrug-resistant pathogens. Recently, a transferable gene cluster tmexCD1-toprJ1 of the resistance-nodulation-division (RND) superfamily was identified in the plasmids of animal-derived Klebsiella pneumoniae strains, with a higher efflux capacity for various drugs than the Escherichia coli AcrAB-TolC homolog system. In this study, we focused on the differences in the inner membrane pump of these two systems and identified some key residues that contribute to the robust efflux activity of the TMexCD
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVES: To characterize the optrA-, cfr(D)- and vanA-carrying linear plasmids detected in three MDR enterococcal clinical isolates.
METHODS: Enterococcus faecium (868), E. faecium (1001) and Enterococcus faecalis (2048), which were linezolid- and vancomycin-resistant due to the presence of optrA, cfr(D) and vanA genes, were tested for their susceptibility to several antibiotics. Characterization of the genetic elements carrying antibiotic resistance genes and ST determination were achieved using WGS data. The plasmid topology was evaluated by S1-PFGE. Resistance gene transferability was a
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
A novel, plasmid-mediated, high-level tigecycline resistance tet(X) gene variant, tet(X5), was detected in a clinical Acinetobacter baumannii isolate from China in 2017. Tet(X5) shows 84.5% and 90.5% amino acid identity to Tet(X3) and Tet(X4), respectively, with similar binding sites and a comparable affinity for tetracyclines. The tet(X5)-containing plasmid could only be transferred to A. baumannii via electrotransformation. This report follows the recent study describing the identification of tet(X3) and tet(X4).
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVES: To investigate the prevalence and genetic contexts of the blaCTX-M-14 gene harboured by foodborne isolates of Vibrio spp. in China.
METHODS: A total of 1856 Vibrio spp. isolates collected from raw meat and shrimp samples in Guangdong Province of China were screened for blaCTX-M-14 by PCR. The blaCTX-M-14-positive isolates were characterized by MIC, PFGE, MLST, conjugation, S1-PFGE and Southern blotting and WGS using Illumina and Nanopore platforms.
RESULTS: A total of 35 (1.9%) Vibrio isolates were positive for blaCTX-M-14, including 33 Vibrio parahaemolyticus strains and two Vib
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The clinical strain of Pseudomonas aeruginosa XM8 harbored multiple RND-type antibiotic efflux pump genes and a novel integron In4881 on its plasmid pXM8-2, rendering it resistant to nearly all conventional antibiotics except colistin. The resistance was primarily attributed to the inactivation of the oprD gene and overexpression of several efflux pump genes, including mexAB-oprM, mexCD-oprJ, oprN-mexFE, and mexXY. In this study, the XM8 strain was comprehensively characterized using various methods. Antimicrobial susceptibility testing was performed using the BioMerieux VITEK2 system and manu
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Staphylococcus haemolyticus is an important cause of sepsis in preterm infants, with gut colonization being recognized as a risk factor for infection. To better understand the diversity of S. haemolyticus among preterm infants, we generated genome sequences of S. haemolyticus strains (n = 140) from 44 stool samples of 22 preterm infants from four hospitals in England. Core genome phylogenetic analyses, incorporating 126 publicly available S. haemolyticus genome sequences, showed that 85/140 (60.1%) of the isolates, from three different hospitals, formed a clonal group with 78/85 (91.7%) strain
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Asymptomatic carriers are a likely source of transmission of Neisseria meningitidis to close contacts who are placed at a higher risk for invasive meningococcal disease (IMD). Although N. meningitidis ciprofloxacin-resistance is rare, there have been an increase in the reports of resistant isolates mainly in patients diagnosed with IMD, and little is known about the N. meningitidis ciprofloxacin-resistance in the carrier populations. We performed a pharyngeal carriage study during a 2017 military setting outbreak in Peru, caused by a ciprofloxacin-resistant N. meningitidis B. The isolates anal
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Non-toxigenic non-O1, non-O139 Vibrio cholerae strains isolated from both environmental and clinical settings carry a suite of virulence factors aside from cholera toxin. Among V. cholerae strains isolated from coastal waters of southern California, this includes cholix toxin, an ADP-ribosylating factor that is capable of halting protein synthesis in eukaryotic cells. The prevalence of the gene encoding cholix toxin, chxA, was assessed among a collection of 155 diverse V. cholerae strains originating from both clinical and environmental settings in Bangladesh and Mexico and other countries aro
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
In this study, we identified extended-spectrum beta-lactamase (ESBL) and plasmid-mediated AmpC beta-lactamase which were associated with 16S rRNA methylase gene on the conjugative plasmid. Among 82 clinical isolates of Enterobacteriaceae that carry 16S rRNA methylase gene (64 strains, armA, and 18 strains, rmtB), bla(SHV-12) was detected either alone or combined with bla(DHA-1), bla(CTX-M-3), and bla(CTX-M-14) in 30 strains carrying armA and 6 strains carrying rmtB. The bla(CTX-M-3) was detected in 13 of 64 strains carrying armA but no strains carrying rmtB. Whereas bla(CTX-M-14) was detected
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Dairy farm waste may serve as a reservoir for multidrug-resistant (MDR) Escherichia coli clones, but the genomic characteristics and dissemination potential of such clones remain incompletely understood. Here, we performed whole-genome sequencing and comprehensive genomic analysis of 64 MDR E. coli strains isolated from feces and sewage samples collected from two large dairy farms in Gansu Province, China. Genomic analysis revealed that strains carried 16-32 antibiotic resistance genes (ARGs), 1-6 plasmid replicon types, and 26-96 virulence genes (VGs), with numerically higher (though not stat
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Recently, production of 16S rRNA methylases by Gram-negative bacilli has emerged as a novel mechanism for high-level resistance to aminoglycosides by these organisms in a variety of geographic locations. Therefore, the spread of high-level aminoglycoside resistance determinants has become a great concern.
METHODS: Between January 2006 and July 2008, 680 distinct Escherichia coli clinical isolates were collected from a teaching hospital in Wenzhou, China. PCR and DNA sequencing were used to identify 16S rRNA methylase and extended-spectrum beta-lactamase (ESBL) genes, including arm
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Carbapenem-resistant Enterobacteriaceae (CRE) represent a health threat, but effective control interventions remain unclear. Hospital wastewater sites are increasingly being highlighted as important potential reservoirs. We investigated a large Klebsiella pneumoniae carbapenemase (KPC)-producing Escherichia coli outbreak and wider CRE incidence trends in the Central Manchester University Hospital NHS Foundation Trust (CMFT) (United Kingdom) over 8 years, to determine the impact of infection prevention and control measures. Bacteriology and patient administration data (2009 to 2017) were linked
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования