KRAS, a frequently mutated oncogene, has been challenging to target therapeutically. Although covalent inhibitors like sotorasib against KRA … work presents a small-molecule degrader recruiting FBXO28 and provides a blueprint for exploring E3 ligases in protein degradation.
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
TRIM21 is an exceptionally versatile ubiquitin ligase that can be directed by antibodies to target oligomeric protein scaffolds, viral capsids, and proteopathic aggregates for intracellular degradation. How the cell degrades these typically resistant substrates remains poorly understood. To address this, we used TRIM21 viral restriction to create a genome-wide phenotypic screen for antibody-dependent capsid degradation. We identify an antimicrobial selective macroautophagy pathway in mammalian cells, which we term "antibody-directed xenophagy" (ADX). We show that this mechanism restricts struc
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Selective endoplasmic reticulum (ER) autophagy (reticulophagy) is essential for maintaining ER homeostasis. The E3 ligase AMFR facilitates the ubiquitination of the reticulophagy receptor RETREG1/FAM134B, thereby promoting the dynamic flux of the reticulophagy process. Flaviviruses exploit the ER during their replication cycles, highlighting the importance of ER quantity and accessibility in flavivirus infections. However, the role of reticulophagy in viral replication and the complex mechanisms by which viruses modulate reticulophagy to enhance pathogenicity remain poorly understood. In a rec
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Thalidomide and its derivatives are powerful cancer therapeutics that are among the best-understood molecular glue degraders (MGDs). These drugs selectively reprogram the E3 ubiquitin ligase cereblon (CRBN) to commit target proteins for degradation by the ubiquitin-proteasome system. MGDs create novel recognition interfaces on the surface of the E3 ligase that engage in induced protein-protein interactions with neosubstrates. Molecular insight into their mechanism of action opens exciting opportunities to engage a plethora of targets through a specific recognition motif, the G-loop. Our analys
СтатьяОбзорПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Skin inflammation is a complex process implicated in various dermatological disorders. The chronic proliferative dermatitis (cpd) phenotype driven by the cpd mutation (cpdm) in the Sharpin gene is characterized by dermal inflammation and epidermal abnormalities. Tumour necrosis factor (TNF) and caspase-8-driven cell death causes the pathogenesis of Sharpincpdm mice; however, the role of mind bomb 2 (MIB2), a pro-survival E3 ubiquitin ligase involved in TNF signaling, in skin inflammation remains unknown. Here, we demonstrate that MIB2 antagonizes inflammatory dermatitis in the context of the c
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The tumor suppressor p53 plays a critical role in integrating a wide variety of stress responses. Therefore, p53 levels are precisely regulated by multiple ubiquitin ligases. In this study, we report that FBXW7, a substrate recognition component of the SKP1-CUL1-F-box (SCF) E3 ligase, interacts with and targets p53 for polyubiquitination and proteasomal degradation after exposure to ionizing radiation or etoposide. Mechanistically, DNA damage activates ATM to phosphorylate p53 on Ser33 and Ser37, which facilitates the FBXW7 binding and subsequent p53 degradation by SCFFBXW7. Inactivation of AT…
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Thalidomide, originally developed as a sedative drug, causes multiple defects due to severe teratogenicity, but it has been re-purposed for treating multiple myeloma, and derivatives such as lenalidomide and pomalidomide have been developed for treating blood cancers. Although the molecular mechanisms of thalidomide and its derivatives remained poorly understood until recently, we identified cereblon (CRBN), a primary direct target of thalidomide, using ferrite glycidyl methacrylate (FG) beads. CRBN is a ligand-dependent substrate receptor of the E3 ubiquitin ligase complex cullin-RING ligase
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
DNA double strand breaks (DSBs) are one of the most deleterious DNA lesions that promote cell death, genomic instability and carcinogenesis. The two major cellular mechanisms that repair DSBs are Nonhomologous End-Joining (NHEJ) and Homologous Recombination Repair (HRR). NHEJ is the predominant pathway, in which XLF (also called Cernunnos) is a key player. Patients with XLF mutation exhibit microcephaly, lymphopenia, and growth retardation, and are immunodeficient and radiosensitive. During NHEJ, XLF interacts with XRCC4-Ligase IV, stimulates its ligase activity, and forms DNA-binding filament
СтатьяОбзорПоддержка NIH: внешняя программаПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Several of the functions of the human adenovirus type 5 E1B 55kDa protein are fulfilled via the virus-specific E3 ubiquitin ligase it forms with the viral E4 Orf6 protein and several cellular proteins. Important substrates of this enzyme have not been identified, and other functions, including repression of transcription of interferon-sensitive genes, do not require the ligase. We therefore used immunoaffinity purification and liquid chromatography-mass spectrometry of lysates of normal human cells infected in parallel with HAdV-C5 and E1B 55kDa protein-null mutant viruses to identify specific
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Ankyrin B (AnkB/LegAU13) is a translocated F box effector essential for the intracellular replication of the pathogen Legionella pneumophila. AnkB co-opts a host ubiquitin ligase to decorate the pathogen-containing vacuole with K48-linked polyubiquitinated proteins and degrade host proteins as a source of energy. Here, we report that AnkB commandeers the host ubiquitin-proteasome system through mimicry of two eukaryotic protein domains. Using X-ray crystallography, we determined the 3D structure of AnkB in complex with Skp1, a component of the human SCF ubiquitination ligase. The structure con
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Nucleotide excision repair (NER) is the principal pathway that removes helix-distorting deoxyribonucleic acid (DNA) damage from the mammalian genome. Recognition of DNA lesions by xeroderma pigmentosum group C (XPC) protein in chromatin is stimulated by the damaged DNA-binding protein 2 (DDB2), which is part of a CUL4A-RING ubiquitin ligase (CRL4) complex. In this paper, we report a new function of DDB2 in modulating chromatin structure at DNA lesions. We show that DDB2 elicits unfolding of large-scale chromatin structure independently of the CRL4 ubiquitin ligase complex. Our data reveal a ma
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
UNLABELLED: The tripartite motif-containing (TRIM) proteins have emerged as a new class of host antiviral restriction factors, with several demonstrating roles in regulating innate antiviral responses. Of >70 known TRIMs, TRIM56 inhibits replication of bovine viral diarrhea virus, a ruminant pestivirus of the family Flaviviridae, but has no appreciable effect on vesicular stomatitis virus (VSV), a rhabdovirus. Yet the antiviral spectrum of TRIM56 remains undefined. In particular, how TRIM56 impacts human-pathogenic viruses is unknown. Also unclear are the molecular determinants governing the a
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Long-chain acyl-CoA synthetase 4 (ACSL4) converts free highly unsaturated fatty acids (HUFAs) into their acyl-CoA esters and is important for HUFA utilization. HUFA-containing phospholipids produced via ACSL4-dependent reactions are involved in pathophysiological events such as inflammatory responses and ferroptosis as a source for lipid mediators and/or a target of oxidative stress, respectively. However, the in vivo role of ACSL4 in inflammatory responses is not fully understood. This study sought to define the effects of ACSL4 deficiency on lipopolysaccharide (LPS)-induced systemic inflamma
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
RNA-binding E3 ubiquitin ligases have the ability to link RNA regulation to the protein ubiquitination machinery, thereby influencing diverse biological processes. Here, we identify the RNA-binding E3 ubiquitin ligase DZIP3 as an innate immune sensor that couples viral RNA recognition to downstream immune signaling. Upon viral infection, binding of viral RNA to the DZIP3 RNA-binding motif induces conformational changes that promote K63-linked auto-ubiquitination, oligomerization, and stabilization of DZIP3. Activated DZIP3 associates with RIG-I and MAVS at the mitochondrial membrane, promoting…
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Proteolysis-targeting chimeras (PROTACs) have emerged as powerful chemical tools and therapeutics, yet their translation from preclinical models to humans remains inconsistent. Here, we systematically evaluate the activity of BRD9-targeting PROTACs in human and mouse systems to elucidate a key limitation in preclinical studies. Widely used CRBN- and VHL-recruiting degraders, including dBRD9 and VZ185, exhibit markedly reduced potency in mouse cells despite high sequence conservation of BRD9. Mechanistic interrogation reveals that species-specific differences in E3 ligases, particularly the Crb…
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Ubiquitination is a central regulatory mechanism controlling protein stability and signaling in eukaryotic cells. The precise control of this machinery is crucial to avoid the development of diseases. Here, we identify a previously unrecognized interaction between the E3 ligase RNF8 and HIF1α, the oxygen-sensitive subunit of the hypoxia-inducible transcription factor HIF1. RNF8 antagonizes TRAF6-mediated stabilization of HIF1α under hypoxic conditions. Importantly, this regulatory effect is independent of the RNF8 E3 ligase activity but requires its forkhead-associated (FHA) domain. Yeast two-
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
NSP7 (Non-Structural Protein 7) of SARS-CoV-2 is a crucial component for viral replication and transcription. In this study, it is revealed that the host E3 ubiquitin ligase FBXO5 suppresses viral replication by mediating NSP7 lysine-48-linked ubiquitination and subsequent proteasomal degradation. Interestingly, it is also determined that NSP7 expression impairs the host antiviral response by inhibiting the ISGylation of melanoma differentiation-associated protein 5 (MDA5), a key sensor for viral RNA. Through an unbiased esiRNA screen, it is identified that NSP7 ubiquitination is coregulated b
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Stress granules (SGs) are stress-induced membraneless organelles whose dynamics are tightly regulated by protein interactions and modifications. However, whether SUMOylation directly targets SG core proteins G3BP1/2 and which ligase is involved remains unclear, partly due to their transient and membraneless nature. To investigate this SUMOylation and its ligase, we applied our low-concentration formaldehyde crosslinking (lcFAX) method to stabilize SGs and enhance analysis. Using lcFAX-MS, we identified TRIM28 as a previously undefined SG-associated protein and showed that it SUMOylates G3BP1 a
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Replication stress (RS) poses a threat to genome stability and drives genomic rearrangements. The homologous recombination (HR) pathway repairs stalled replication forks (RFs) and prevents such instability. Through an E3 ubiquitin ligase screen aimed at identifying regulators of RAD51, we identified macrophage erythroblast attacher (MAEA), a core component of C-terminal to Lish (CTLH) E3 ubiquitin ligase complex, as a regulator of the HR pathway. Loss of MAEA impairs RAD51 recruitment at stalled RFs, leading to increased sensitivity to RS-inducing agents and excessive degradation of nascent DN
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.