Pyruvic acid, a key intermediate in pharmaceutical and chemical industries, serves as a central metabolic hub connecting multiple intracellu … by 59% and 56%, respectively, thereby promoting pyruvic acid accumulation. Central carbon-targeted metabolomics identified 43 differentially expressed metabolites, with downregulation of the pyruvic acid metabolic node. Energy metabolism was shifted from the tricarboxylic acid (TCA) cycle to glycolysis. Captan treatment reduced the biomass accumulation of R. …
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The etiology of Alzheimer's disease (AD) remains unclear but is likely driven by gene-environment interactions. We present a multi-organ untargeted metabolomics atlas (n = 2,271) paired with metagenomics data (n = 666) from two AD transgenic mouse models (3xTg and 5xFAD) under colonized and germ-free conditions. Systems-level analyses revealed clusters of dysregulated molecules across tissues, including carnitines, bile acids, B vitamins, neurotransmitters, and N-acyl lipids. Metabolic shifts were associated with the depletion of Akkermansia muciniphila and enrichment of Mucispirillum schaedle…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Elucidating mechanisms of natural product metabolites is key to safer, more effective drugs against drug-induced liver injury (DILI). This study used cellular metabolomics to investigate hepatoprotective effects of three structurally similar platycoside metabolites-platycodigenin (PDN), 3-O-β-D-glucopyranosyl platycodigenin (OPDN), and polygalacic acid (POLA)-against APAP-induced liver injury. Using AML-12 hepatocytes challenged with APAP, intracellular metabolites were profiled by UHPLC-LTQ-Orbitrap mass spectrometry (ESI+ and ESI-), followed by PCA/OPLS-DA to identify differential metabolite…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
INTRODUCTION: Lipidomics and metabolomics have become key approaches for understanding and diagnosing human diseases, including type 2 diabetes, Alzheimer's disease, cancer, and kidney dysfunction. This study provides a comprehensive overview of the evolution of these disciplines through a bibliometric and text-mining analysis of scientific production from 2004 to 2024, based on data from Scopus and validated through a multi-database comparative approach.
METHODS: A total of 9,628 articles were harmonized and analyzed using Bibliometrix, Scimago Graphica, OpenRefine, and custom R scripts to i…
СтатьяСистематический обзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Metabolomics, the study of small molecules in biological systems, is a powerful tool for understanding biochemical pathways, discovering biomarkers, and elucidating disease mechanisms. This chapter provides a guide to performing metabolomics data analysis in R, focusing on enrichment analysis and network-based approaches. It covers essential steps in data processing, quality control (QC), differential expression analysis, integration with proteomics using multi-omics factor analysis (MOFA), and statistical network analysis, as well as enrichment analysis using prior knowledge. The methods outl…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Pancreatic cancer (PC) remains one of the most aggressive malignancies, characterized by late-stage diagnosis and poor prognosis. Identifying reliable biomarkers for early detection is crucial to improving survival outcomes. This study utilizes proton nuclear magnetic resonance (1H-NMR) metabolomics to analyze serum metabolic profiles and identify potential biomarkers differentiating PC patients from healthy controls (HC). Serum samples were collected from PC patients and matched HC individuals. 1H-NMR spectroscopy was employed to profile circulatory metabolites. Multivariate statistical analy…
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Inferring conditional dependency structures from high-dimensional data with small sample sizes remains a fundamental challenge in systems biology, particularly when dependencies span multiple biological compartments. We present QFL, a multilayer network framework that integrates multiple sparse Gaussian graphical models (GGMs) via information-theoretic fusion, and apply it to a controlled multi-organ untargeted metabolomics PM2.5 dataset, a representative benchmark for cross-organ high-dimensional small-sample network inference under systemic toxicological perturbation. Tissue-specific sparse …
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
INTRODUCTION: Gestational diabetes mellitus (GDM) is among the most common metabolic disorders during pregnancy, and early detection is key to reducing complications for both mother and child. Mass spectrometry-based metabolomics enables detailed metabolite profiling, offering opportunities not only for early diagnosis and risk prediction but also for understanding the pathophysiological mechanisms that drive the development of GDM.
METHODS: For the first time, an analysis of such a large number of metabolites was conducted: over 1,000 metabolites across 39 biochemical classes, including 912 …
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The gut microbiota and its "theatre of activity" (the collective pool of metabolites and signaling molecules) function as a plastic interfac … y 21) and endpoint (day 42). These samples were analyzed by 16S rRNA gene sequencing and untargeted metabolomics to distinguish transient perturbations from stabilized ecosystem reorganization. Two-stage ecosystem reconfiguration was observed concurrent with the intervention: an early, high-magnitude reconfiguration phase (D0 - D21), followed by a period of st …
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Bladder cancer (BC) is the ninth most prevalent malignancy worldwide. It remains a significant clinical burden due to high recurrence rates and the need for reliable, non-invasive diagnostic tools. Metabolomics is a powerful strategy for non-invasive cancer detection, with urine representing an ideal biofluid for biomarker discovery, given its direct contact with the urinary tract and its rich diversity of metabolites. This study aimed to identify urinary metabolites showing significant differences in urinary levels between BC patients and controls, and to evaluate their potential for diagnosi…
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Alterations in metabolic pathways are a hallmark of cancer and play a pivotal role in breast cancer development and progression. The inherent metabolic heterogeneity of breast cancer contributes to differences in therapeutic response and patients' prognosis. Clinical metabolomics has emerged as a promising approach for identifying metabolic biomarkers that reflect tumor biology, treatment-related changes after diagnosis, and patients' outcomes.
AIMS OF REVIEW: This review summarizes the metabolomic profiles of breast cancer patients, using various biological materials and analytic…
СтатьяОбзорПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: To evaluate and identify urinary biomarkers for the early diagnosis and staging of diabetic kidney disease (DKD).
METHODS: This study enrolled 200 participants, including healthy controls (NDM, n=50) and patients with type 2 diabetes. The diabetic patients were stratified by urinary albumin-to-creatinine ratio (ACR) into the following groups: normoalbuminuria (SDM, n=50), microalbuminuria (MADKD, n=50), and macroalbuminuria (ADKD, n=50). Utilizing an integrated multi-dimensional screening strategy, we systematically evaluated traditional urinary protein markers (urinary retinol-bi
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
PURPOSE: Diabetic retinopathy (DR) is a leading vision-threatening disease and a common complication of diabetes. However, the understanding of how metabolic dysfunction correlates with ocular inflammation in DR remains poorly understood. Therefore, in this study, we investigated the association between these two factors in DR.
METHODS: Using untargeted metabolomics analysis and mass spectrometry detection, the plasma metabolic characteristics of 27 DR patients (15 with nonproliferative diabetic retinopathy [NPDR] and 12 with proliferative diabetic retinopathy [PDR]) and 8 healthy controls (H…
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Timely and accurate pregnancy detection in the dairy animals is essential for minimizing calving intervals to accelerate reproductive turnover and increase milk production from livestock farming. Urine, a non-invasive sample, is being investigated in many studies as it serves as a pool depicting the varied array of metabolites associated with intricate physiological changes. The study thus aimed to analyze GC-MS based urinary metabolites of pregnant (n = 13) and non-pregnant (n = 13) buffaloes using Bovine Metabolome Database. RESULTS: A total of 102 unique metabolites were annotat
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Nitrous oxide (N2O) is increasingly used as a recreational drug, leading to neurological and systemic toxicities. However, due to the rapid elimination and minimal alteration of nitrogen oxides, the short direct detection window complicates the assessment of N2O exposure.
METHOD: In this study, we investigated the effects of chronic N2O exposure on plasma metabolites using an untargeted metabolomics approach in a mouse model. C57BL/6 mice were exposed to 90,000 ppm N2O (1 h, twice daily for 28 days) or room air. Plasma samples were analyzed via UHPLC -Triple TOF -MS. Orthogonal pa…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Epidemiological evidence has associated metal exposure with altered hemoglobin levels and anemia, but the underlying mechanisms remain unclear. This study evaluated associations of individual metals and metal mixtures with hemoglobin levels and anemia risk, and investigated the potential contributions of metabolites using untargeted metabolomics.
METHODS: In 2939 participants from Zhejiang, China (2021-2023), we measured 14 urinary metals. Generalized linear and logistic regression models assessed individual metal associations with hemoglobin and anemia, respectively, while weight…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Filter-Aided Sample Preparation (FASP) is a well-established method in proteomics, yet its potential for the parallel recovery of metabolites remains largely unexplored. Herein, we evaluate the performance of FASP as a straightforward workflow for the simultaneous isolation of protein and corresponding metabolite fractions from a single urine sample. The FASP-based LC-MS/MS approach for both proteomics and metabolomics analysis identified 3,163 nonredundant peptides corresponding to 957 unique protein groups. The metabolomic profile comparison of three urine fractions, specifically FASP-concen…
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: There is a critical need for objective diagnostic strategies for syndromes that rely on subjective questionnaires to ensure accu … ngs demonstrate the potential of integrating rapid FTIR spectroscopic fingerprinting with MS-driven metabolomics to identify biologically relevant signatures associated with fibromyalgia. The strong classification performance and metabolite correlations support the potential translation of this diagnostic pipeline into a rapid, point-of-care approach for objec …
СтатьяПрепринтПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The impact of pesticide exposure on pregnancy outcomes is of increasing concern, yet the effects of a metabolite of the relatively new herbicide tepraloxydim (DMP) on placental development remain poorly understood. This study combining single-cell RNA sequencing with metabolomics, to systematically investigate the effects of DMP on placental cellular composition, transcriptional programs, and metabolic homeostasis in a mouse model. We found that DMP crosses the placental barrier and is detected in placental tissue with subcellular distribution patterns suggestive of endoplasmic reticulum assoc…
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: The discovery of novel antitumor compounds remains a pressing need to address the global burden of cancer, particularly to fight treatment resistance and the lack of specificity of conventional therapies. The terrestrial flora from New Caledonia (NC), a biodiversity hotspot in the South Pacific, represents a rich and largely underexplored source of candidate antitumor natural products (NPs).
PURPOSE: This study aimed to identify the most potent antitumor extracts among a selection of plants from the terrestrial flora of NC and to further characterize their pharmacological potentia
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования