Biomolecular condensates concentrate molecules to facilitate basic biochemical processes, including transcription and DNA replication. While liquid-like condensates have been ascribed various functions, solid-like condensates are generally thought of as amorphous sites of protein storage. Here, we show that solid-like amyloid bodies coordinate local nuclear protein synthesis (LNPS) during stress. On stimulus, translationally active ribosomes accumulate along fiber-like assemblies that characterize amyloid bodies. Mass spectrometry analysis identified regulatory ribosomal proteins and translati…
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Liquid-liquid phase separation (LLPS) has attracted considerable attention in cell biology as a potentially widespread organizing principle … ocusing on the biophysical mechanisms underlying condensate formation, the molecular composition of biomolecular condensates, and current experimental approaches used to study this process. In particular, we highlight the role of LLPS in aberrant transcriptional regulation, with a specific focus on its regulatory functions and underlying molecular mechanisms in tumor cell …
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Unstable DNA repeat expansions and insertions have been found to cause more than 50 neurodevelopmental, neurodegenerative, and neuromuscular disorders. One of the main hallmarks of repeat expansion diseases is the formation of abnormal RNA or protein aggregates in the neuronal cells of affected individuals. Recent evidence indicates that alterations of the dynamic or material properties of biomolecular condensates assembled by liquid/liquid phase separation are critical for the formation of these aggregates. This is a thermodynamically-driven and reversible local phenomenon that condenses macr…
СтатьяОбзорПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Biomolecular condensates play essential roles in cellular organization and are implicated in diverse pathological processes. Their formation is driven by liquid-liquid phase separation (LLPS), a process that requires coordinated multistep desolvation of biomolecular chains and multivalent inter-chain interactions. Although coarse-grained (CG) models with implicit solvent are widely used to probe LLPS thermodynamics and kinetics, they typically neglect water-mediated desolvation effects, limiting their accuracy and mechanistic interpretability. Here, guided by all-atom simulations and experimen…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Entry of viral capsids into the nucleus induces the formation of biomolecular condensates called HIV-1 membraneless organelles (HIV-1-MLOs). Several questions remain about their persistence, in vivo formation, composition, and function. Our study reveals that HIV-1-MLOs persisted for several weeks in infected cells, and their abundance correlated with viral infectivity. Using an appropriate animal model, we show that HIV-1-MLOs were formed in vivo during acute infection. To explore the viral structures present within these biomolecular condensates, we used a combination of double immunogold la…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Protein condensates formed via liquid-liquid phase separation (LLPS) are increasingly recognized as key players in diverse cellular processes, including those associated with disease. Despite extensive efforts to characterize their formation and function, tools that enable precise, reversible, and spatiotemporal control of LLPS remain limited. Here, we report OptoChaperone, a light-activatable molecular system designed to manipulate protein condensates both in vitro and in living cells. This biohybrid system leverages photoresponsive switching to control chaperone activity: blue light triggers
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
TAR DNA-binding protein 43 (TDP-43) plays a critical role in RNA metabolism and is incorporated into biomolecular condensates called stress granules. In amyotrophic lateral sclerosis (ALS) and several other neurodegenerative disorders, TDP-43 undergoes aberrant phase transitions, forming insoluble amyloid aggregates, including fibrils composed of solely its intrinsically disordered C-terminal domain (CTD). Despite its central role in disease, the conformational dynamics of the CTD remain poorly understood due to its heterogeneous and transient conformational landscape. Here, we employ native i…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Fusion oncoproteins drive aggressive leukemias by mediating aberrant gene expression within specialized biomolecular condensates that contain various biomolecules. While RNA is known to influence condensate properties, the RNA constituents of fusion protein-containing onco-condensates remain poorly defined. Here, we use bicon-seq (biotinylated-isoxazole-mediated precipitation of condensome and RNA sequencing) to globally profile condensate-associated RNAs from cellular samples. Using experimental perturbation of cytoplasmic RNA-containing condensates, we demonstrated that bicon-seq accurately …
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
UNLABELLED: Aberrant biomolecular condensates are implicated in multiple incurable neurological disorders, including Amyotrophic Lateral Sclerosis (ALS), Frontotemporal Dementia (FTD), and DYT1 dystonia. However, the role of condensates in driving disease etiology remains poorly understood. Here, we identify myeloid leukemia factor 2 (MLF2) as a disease-agnostic biomarker for phase transitions, including stress granules and nuclear condensates associated with dystonia. Exploiting fluorophore-derivatized MLF2 constructs, we developed a high-content platform and computational pipeline to screen …
СтатьяПрепринтПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Phase separation is a fundamental principle of cellular organization that typically leads to two coexisting phases: a dense one, where intermolecular interactions are stronger and molecules are more tightly packed, and a dilute, less packed phase, with weaker interactions and lower molecular concentration. This process drives the formation of both lateral membrane domains (rafts) and liquid-like protein and nucleic acid condensates. This Review explores the dynamic interplay between biomolecular condensates and membrane lipid domains and how phase separation occurs in the three-dimensional (bu…
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Assemblysomes are ribosome-nascent chain condensates that regulate co-translational processes through liquid-liquid phase separation, yet the sequence determinants underlying their formation remain incompletely understood. Previous studies identified the DNA helicase Sgs1 as an assemblysome-associated protein; however, whether its N-terminal region possesses intrinsic phase separation propensity has not been experimentally examined. Here, we investigated the first 135 amino acids of Sgs1 using a light-inducible optoDroplet assay. A mCherry-Cry2-Sgs11-135 fusion construct was compared with the
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Biomolecular condensates formed through phase separation are fundamental to the cellular organization. Although the physical principles underlying the phase separation of intrinsically disordered proteins are well understood, the molecular determinants of condensate formation in globular proteins remain elusive. Here, we employ holographic particle characterization, a label-free, high-throughput imaging technique, to investigate the self-assembly of bovine serum albumin (BSA), a model globular protein. We show that this technique reliably differentiates between liquid-like and gel-like condens…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The mechanisms by which core clock components are spatially organized to ensure robust oscillations in mammals remain unclear. Here, we identify the positive limb factor BMAL1 as a phase-separating protein that forms dynamic biomolecular condensates essential for circadian transcription and behavior. Endogenous BMAL1 forms nuclear puncta that oscillate in sync with the circadian cycle. Deletion analysis and optogenetic clustering identify an N-terminal 90-amino acid intrinsically disordered region whose phosphorylation state tunes BMAL1 phase separation. Besides, BMAL1 condensates behave as mu…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Online partner seeking (OPS) among men who have sex with men (MSM) is associated with increased risk behavior including frequency of unprotected anal intercourse, number of partners, and incidence of sexually transmitted infections (STIs). However, the impact on transmission of human immunodeficiency virus (HIV) is uncertain.
METHODS: MSM diagnosed with acute and early HIV infection were recruited from the Primary Infection Resource Consortium. HIV transmission events in the year following infection were inferred using estimated date of infection combined with genetic network anal
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Telomerase-free cancer cells use a recombination-based alternative lengthening of telomeres (ALT) pathway to maintain telomere length. ALT cancer cells exhibit extreme heterogeneity in telomere length, which requires the formation of a specialized nuclear condensate, the ALT telomere-associated PML bodies (APBs). Recent findings on APB assembly reveal that APBs form through two mechanistically and kinetically distinct pathways. These pathways modulate the strength of ALT activity. In this essay, I discuss how APB formation dynamics may contribute to telomere-length variability in ALT cells and
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Bacterial microcompartments (BMCs) and biomolecular condensates are two different forms of protein compartmentalization with different aims and functional advantages, representing specific designs of sequestering enzymes or segments of metabolic pathways. BMCs represent special proteinaceous organelles that are entirely composed of protein and are typically characterized by polyhedral shapes. By encapsulating and organizing metabolic enzymes with their substrates and cofactors BMCs act as specialized compartments within bacterial cells that promote and enhance specific biochemical pathways. Th…
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
UNLABELLED: Bacterial gene expression depends on the coordinated regulation of RNA synthesis, processing, and decay. The conserved RNA degra … ration and additional native IDR-specific activities such as degradosome interactions.
IMPORTANCE: Biomolecular condensates are non-membrane bound organelles that organize biological processes across all domains of life, but their role in bacterial infection is not well characterized. We show that Brucella , an intracellular bacterial pathogen and causative agent of the …
СтатьяПрепринтПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Liquid-liquid phase separation (LLPS) drives the formation of membraneless biomolecular condensates that regulate essential cellular processes including gene expression, stress response, and signal transduction. A critical challenge in this field is distinguishing RNA-dependent from RNA-independent condensates, a distinction central to the pathology of neurodegenerative disorders. Current computational approaches typically overlook this separation. Here, we introduce an interpretable two-stage deep learning framework that first predicts the likelihood of a protein sequence undergoing phase sep…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The genome stores and processes approximately 1.5 gigabytes of encoded information. In this article, we propose that the eukaryotic genome and its adaptable three-dimensional packing in the form of chromatin offer a valuable template for the system architecture of DNA-based digital computers. We examine embryonic and stem cells, which exhibit distinct chromatin-associated condensates enriched in transcription machinery. These dynamic biomolecular condensates facilitate the spatial association of genes, genomic control elements, and molecular machinery responsible for reading the genomic code. …
СтатьяОбзорПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Accumulating evidence indicates that metabolic enzymes can directly couple metabolic signals to transcriptional adaptation and cell differen … exes with the transcription factor NONO/p54nrb and undergoes liquid-liquid phase separation to form biomolecular condensates, leading to its nuclear retention and inhibition of glycogen biosynthesis. Compared to their wild-type littermates, Nono-deficient mice exhibit exercise intolerance, higher muscle glycogen content, and smaller myofibers. Additionally, Gys1 or Nono d …
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования