UNLABELLED: T-cell leukemias and lymphomas (TCL) form a heterogeneous group of rare and often aggressive malignancies. Because of the rarity and heterogeneity of TCL subtypes, clinical trials are challenging to conduct, making pharmacogenomic studies in cell line panels critical for the discovery of targeted therapeutics. The scarcity of data repositories with integrated multiomics and drug screening data hinders the preclinical evaluation of drug vulnerabilities and the identification of molecular markers predictive of responses to monotherapies and combinations. To address this gap, we condu
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Stroke is a complex, multidimensional disorder influenced by interacting inflammatory, immune, coagulation, endothelial, and metabolic pathways. Single-omics approaches seldom capture this complexity, whereas multiomics techniques provide complementary insights but generate high-dimensional and correlated feature spaces. Machine learning (ML) offers strategies to manage these challenges; however, the predictive accuracy and reproducibility of multiomics-based ML models for stroke remain poorly characterized.
OBJECTIVE: This review aimed to conduct a systematic evaluation of ML mod
СтатьяСистематический обзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Retinal artery occlusion (RAO), an acute ocular ischemic stroke, is critically linked to cardiovascular and metabolic dysfunction. To elucidate the interplay between lipid metabolism and immune regulation in RAO, we performed an integrated analysis using serum metabolomics, PBMC transcriptomics, and machine learning in 66 patients with RAO and 66 cataract controls. We identified systemic disruptions in fatty acid metabolism, notably elevated levels of long-chain fatty acids (C22:5n-3, C22:2n-6, C22:1n-9), as distinguishing features of RAO. Upon stratifying patients by lipid status, C20:2n-6 em
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Gastric cancer (GC), a malignant and highly proliferative disease, has profoundly impacts a substantial global population and is associated with several variables, including genetic, epigenetic, and environmental impacts. Global variance is associated with Helicobacter pylori infection and dietary factors.
OBJECTIVES: The aim of the present study was to understand and identify key genes significantly modulated by epigenetic changes that can serve as biomarkers and therapeutic targets for gastric cancer.
METHODS: This study employed an integrative multiomics approach to investigat
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
This study aimed to investigate the effects of glucose selenol (SeGlu) on the immune function of rats, with a particular focus on the spleen. Rats were randomly divided into CK (deionized water, oral), Se0.15 group (0.15 mg/L SeGlu, oral), and Se0.4 group (0.4 mg/L SeGlu, oral) for 30 days continuously. 0.15 mg/L SeGlu significantly increased the serum antioxidant levels and the levels of IgM and IgG. The Se0.4 group upregulated the inflammatory factor levels of IL-2 and IL-6, and both concentrations significantly reduced the serum TNF-α level. Transcriptome analysis indicated that the supplem
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Recurrent glioblastoma (rGBM) remains incurable. One barrier to the development of effective rGBM therapies is the difficulty in collecting posttreatment tumor tissue. Serial multiomic assays from longitudinal rGBM biopsies may uncover tumor responses to a treatment. Here, we obtained 97 serial rGBM biopsy cores over 4 months from the first two patients participating in a clinical trial of repeated intratumoral dosing of the immunotherapeutic agent CAN-3110. Multiomic analysis of the biopsy cores revealed therapeutic effects, including longitudinal and spatial reshaping of the rGBM's microenvi
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Spinocerebellar ataxia type 2 (SCA2) is a polyglutamine disorder, and variants in its disease protein Ataxin-2 act as modifiers in the progression of Amyotrophic Lateral Sclerosis. There are no reliable molecular biomarkers for SCA2. The aim of this study was to define novel molecular biomarker candidates for SCA2. Using cerebellar and cervicothoracic spinal cord RNA/protein from Atxn2-CAG100-KnockIn (KIN) and wildtype mice, a multi-omics study was conducted based on the integration of global transcriptomic, proteomic, and phosphoproteomic data, followed by validation in mice and humans. Venn
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The placenta is essential for pregnancy, and its dysfunction can harm both mother and fetus. To better understand placental physiology and its disruption in disease, we employ a multiomics approach (transcriptomics, metabolomics, and proteomics) combined with clinical data and histopathology from 321 placentas across conditions: severe fetal growth restriction (FGR), FGR with hypertension (FGR + HDP), severe preeclampsia (PE), and spontaneous preterm delivery (PTD). Cellular deconvolution reveals FGR + HDP placentas have more extravillous trophoblasts than controls (p < 0.0001). After adjustin
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Systemic lupus erythematosus (SLE) is a complex autoimmune disorder with diverse clinical manifestations and unpredictable progression, posing significant challenges to accurate diagnosis and effective treatment. Traditional biomarkers and treatments often fail to address the disease's molecular and clinical heterogeneity. Recent advancements in CRISPR gene-editing technology and multiomics approaches offer transformative opportunities for personalized SLE care by unraveling its underlying molecular complexity and enabling precise therapeutic interventions. CRISPR technology allows targeted ed
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Neutrophils contribute to systemic lupus erythematosus (SLE) pathogenesis through reactive oxygen species and neutrophil extracellular trap (NET) production, and increased apoptotic debris which causes autoantibody production and immune complex formation. These processes drive inflammation and tissue damage. The aim of this study was to perform integrated transcriptomic and metabolomic analyses comparing paediatric and adult SLE neutrophils. Adult (aSLE) and paediatric (jSLE) patient and healthy adult (HA) and juvenile (HJ) control neutrophils were subjected to RNAseq and 1H-NMR metabolomics.
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVES: Idiopathic inflammatory myopathies (IIM) are autoimmune disorders with distinct subtype features, but their molecular mechanisms remain unclear. This study integrated multiomics data to identify subtype-specific molecular signatures and evaluate their prognostic significance in a Han Chinese IIM cohort.
METHODS: RNA sequencing, proteomics, and metabolomics were generated on muscle tissues from 203 patients with IIM (including 44 in a validation cohort) and 18 controls. Differential expression was analysed for exons, intron retentions (IRs), proteins, and metabolites, integrated vi
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Cadmium (Cd) is a toxic heavy metal that primarily targets the liver. Cd exposure disrupts specific lipid metabolic pathways; however, the underlying mechanisms remain unclear. This study aimed to investigate the lipidomic characteristics of rat livers after Cd exposure as well as the potential mechanisms of Cd-induced liver injury. Our analysis of established Cd-exposed rat and cell models showed that Cd exposure resulted in liver lipid deposition and hepatocyte damage. Lipidomic detection, transcriptome sequencing, and experimental analyses revealed that Cd mainly affects the sphingolipid me
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The choice of developing thymocytes to become CD8+ cytotoxic or CD4+ helper T cells has been intensely studied, but many of the underlying mechanisms remain to be elucidated. Recent multiomics approaches have provided much higher resolution analysis of gene expression in developing thymocytes than was previously achievable, thereby offering a fresh perspective on this question. Focusing on our recent studies using CITE-seq (cellular indexing of transcriptomes and epitopes) analyses of mouse thymocytes, we present a detailed timeline of RNA and protein expression changes during CD8 versus CD4 T
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Although adamantinomatous craniopharyngioma (ACP) is a tumour with low histological malignancy, there are very few therapeutic options other than surgery. ACP has high histological complexity, and the unique features of the immunological microenvironment within ACP remain elusive. Further elucidation of the tumour microenvironment is particularly important to expand our knowledge of potential therapeutic targets. Here, we performed integrative analysis of 58,081 nuclei through single-nucleus RNA sequencing and spatial transcriptomics on ACP specimens to characterize the features and intercellu
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Ankylosing spondylitis (AS) is a chronic inflammatory joint disorder, necessitating early diagnosis and effective treatment. The specific mechanism of action of Cassia twigs in the treatment of AS is not fully understood.
METHODS: Blood samples and clinical data from 28,458 individuals (6,101 with AS, 22,357 without AS) were collected. To construct a predictive model, we utilized logistic regressions and machine learning techniques to create a dynamic nomogram. Immune cell infiltration was evaluated using the GSE73754 dataset. Subsequently, we obtained vertebral bone marrow blood
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Salmonella infection, also known as Salmonellosis, is one of the most common food-borne illnesses. Salmonella infection can trigger host defensive functions, including an inflammatory response. The provoked-host inflammatory response has a significant impact on the bacterial population in the gut. In addition, Salmonella competes with other gut microorganisms for survival and growth within the host. Compositional and functional alterations in gut bacteria occur because of the host immunological response and competition between Salmonella and the gut microbiome. Host variation and the inherent
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Placental dysfunction, a root cause of common syndromes affecting human pregnancy, such as preeclampsia (PE), fetal growth restriction (FGR), and spontaneous preterm delivery (sPTD), remains poorly defined. These common, yet clinically disparate obstetrical syndromes share similar placental histopathologic patterns, while individuals within each syndrome present distinct molecular changes, challenging our understanding and hindering our ability to prevent and treat these syndromes.
METHODS: Using our extensive biobank, we identified women with severe PE (n = 75), FGR (n = 40), FGR
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоддержка NIH: внешняя программаПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The objective of this study was to understand and measure epigenetic changes associated with the occurrence of CHDs by utilizing the discordant monozygotic twin model. A unique set of monozygotic twins discordant for double-outlet right ventricles (DORVs) was used for this multiomics study. The cardiac and muscle tissue samples from the twins were subjected to whole genome sequencing, whole genome bisulfite sequencing, RNA-sequencing and liquid chromatography-tandem mass spectrometry analysis. Sporadic DORV cases and control fetuses were used for validation. Global hypomethylation status was o
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
INTRODUCTION: Cutaneous leishmaniasis (CL) is the most frequent form of leishmaniases, associated with skin inflammation and ulceration. Understanding the interaction of different phagocytic cells in the recognition and uptake of different Leishmania species is critical for controlling the infection. Phagocytic cells have a pivotal role as professional antigen-presenting cells that bridge the innate and adaptive immunity and shape the outcome of the disease.
AREAS COVERED: Here we reviewed new technologies with high-throughput data collection capabilities along with systems biology approaches
ОбзорСтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The Coronavirus Disease 2019 (COVID-19) caused by Severe Acute Respiratory Syndrome Coronavirus 2 (SARS-CoV-2) is a global pandemic that seriously threatens health and socioeconomic development, but the existed antiviral drugs and vaccines still cannot yet halt the spread of the epidemic. Therefore, a comprehensive and profound understanding of the pathogenesis of SARS-CoV-2 is urgently needed to explore effective therapeutic targets. Here, we conducted a multiomics study of SARS-CoV-2-infected lung epithelial cells, including transcriptomic, proteomic, and ubiquitinomic. Multiomics analysis s
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования