Capping of viral messenger RNAs is essential for efficient translation, for virus replication, and for preventing detection by the host cell innate response system. The SARS-CoV-2 genome encodes the 2'-O-methyltransferase nsp16, which, when bound to the coactivator nsp10, uses S-adenosylmethionine (SAM) as a donor to transfer a methyl group to the first ribonucleotide of the mRNA in the final step of viral mRNA capping. Here, we provide biochemical and structural evidence that this reaction requires divalent cations, preferably Mn2+, and a coronavirus-specific four-residue insert. We determine
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVE: Autoantibodies directed against the aminoacyl tRNA synthetases are associated with myositis, arthritis, Raynaud's phenomenon, mechanic's hands, fever and interstitial pneumonia, clinically referred to as the anti-synthetase syndrome (ASS). The aim of this study was to characterize the autoantibody profile in a patient with clinical features of ASS whose routine diagnostic testing was negative for the previously identified anti-synthetase autoantibodies.
METHODS: Serum from a patient presenting with interstitial pneumonia followed by proximal myopathy, Raynaud's phenomenon and arthr
Клинический случайСтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVE: Circulating small noncoding RNAs represent potential biomarkers of temporal lobe epilepsy (TLE). Recently, two transfer RNA fragments (tRFs), 5'tRF Glu-CTC and Gly-GCC, were found to be elevated in plasma samples collected in advance of a seizure in TLE patients, suggesting they may serve as potential wet biomarkers of seizure risk or occurrence. The optimal biofluid source for tRF assay, species conservation, and whether their levels reflect specific ictal or interictal states remain uncertain.
METHODS: Here, we analyzed the longitudinal dynamics of 5'tRF Glu-CTC and Gly-GCC in bo
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVES: To systemically analyse the heterogeneity in the clinical manifestations and prognoses of patients with antisynthetase syndrome (ASS) and evaluate the transcriptional signatures related to different clinical phenotypes.
METHODS: A total of 701 patients with ASS were retrospectively enrolled. The clinical presentation and prognosis were assessed in association with four anti-aminoacyl transfer RNA synthetase (ARS) antibodies: anti-Jo1, anti-PL7, anti-PL12 and anti-EJ. Unsupervised machine learning was performed for patient clustering independent of anti-ARS antibodies. Transcriptom
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: The HPTN 083 trial demonstrated that long-acting cabotegravir (CAB-LA) was superior to tenofovir-disoproxil fumarate/emtricitabine for human immunodeficiency virus (HIV) preexposure prophylaxis (PrEP). Integrase strand transfer inhibitor (INSTI) resistance-associated mutations (RAMs) were detected in some participants with HIV infection. We used a low viral load INSTI genotyping assay to evaluate the timing of emergence of INSTI RAMs and assessed whether HIV screening with a sensitive RNA assay would have detected HIV infection before INSTI resistance emerged.
METHODS: Single-geno
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Bovine leukemia virus (BLV) affects cattle health and productivity worldwide, causing abnormal immune function and immunosuppression. Transfer RNA fragments (tRFs) are known to be involved in inhibition of gene expression and have been associated with stress and immune response, tumor growth, and viral infection. The objective of this study was to identify tRFs associated with antibody response to BLV in Holstein cattle. Sera from 14 animals were collected to establish IgG reactivity to BLV by ELISA. Seven animals were seropositive (positive group) and seven were seronegative (negative group)
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The advances in single-cell RNA sequencing (scRNA-seq) technologies enable the characterization of transcriptomic profiles at the cellular level and demonstrate great promise in bulk sample analysis thereby offering opportunities to transfer gene signature from scRNA-seq to bulk data. However, the gene expression signatures identified from single cells are typically inapplicable to bulk RNA-seq data due to the profiling differences of distinct sequencing technologies. Here, we propose single-cell pair-wise gene expression (scPAGE), a novel method to develop single-cell gene pair signatures (sc
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
In Huntington's disease (HD) the imperfect expanded CAG repeat in the first exon of the HTT gene leads to the generation of a polyglutamine (polyQ) protein, which has some neuronal toxicity, potentially mollified by formation of aggregates. Accumulated research, reviewed here, implicates both the polyQ protein and the expanded repeat RNA in causing toxicity leading to neurodegeneration in HD. Different theories have emerged as to how the neurodegeneration spreads throughout the brain, with one possibility being the transport of toxic protein and RNA in extracellular vesicles (EVs). Most cell t
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
A key determinant of the frequency of IncF plasmid-mediated DNA transfer between enterobacterial cells is the FinOP system. traJ, a positive regulator of the transfer (tra) genes is controlled at the post-transcriptional level by two negative elements, finP and finO. FinP is a plasmid-specific antisense RNA, whereas finO encodes a proteic co-repressor which is not plasmid specific but exchangeable among F-like plasmids. We designed a traJ-lacZ test system that allowed us to monitor the effects of FinP and various FinP mutants on traJ expression. Furthermore, the introduction of finO into the t
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: The early diagnostic rate of gastric cancer (GC) is relatively low. Transfer RNA-derived fragments (tRFs), as a class of non-coding RNAs with tumor-specific expression and stability in body fluids, have emerged as highly promising diagnostic candidate biomarkers. However, their application value in GC still requires systematic validation. Therefore, this study aims to systematically evaluate the value of specific tsRNA molecules as novel diagnostic biomarkers for GC by identifying and validating them.
METHODS: After identifying differentially expressed tsRNAs through the OncotRF d
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
INTRODUCTION: Embryo implantation provides an efficient way for patients with repeated implantation failure (RIF) to achieve pregnancy. The aim of this study is to compare the implantation outcomes of RIF patients in artificial cycle to those in natural cycle, both were treated with RNA sequencing endometrial receptivity test (rsERT) based personalized embryo implantation.
METHODS: The endometrial receptivity (ER) analysis was performed using rsERT followed by personalized embryo transfer at optimal window of implantation (WOI). The implantation rate (IR), clinical pregnancy rate (CPR) and li
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVE: Autoantibodies targeting histidyl-transfer RNA synthetase (HisRS; anti-Jo-1) are common in the idiopathic inflammatory myopathies (IIMs) and antisynthetase syndrome. This study was undertaken to investigate immunity against HisRS in the blood and lungs of patients with IIM/antisynthetase syndrome.
METHODS: Bronchoalveolar lavage (BAL) fluid, BAL fluid cells, and peripheral blood mononuclear cells (PBMCs) from patients with IIM/antisynthetase syndrome (n = 24) were stimulated with full-length HisRS protein or a HisRS-derived peptide (HisRS11-23 ). BAL fluid and PBMCs from patients w
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
We report a novel heteroplasmic point mutation G8299A in the gene for mitochondrial tRNA(Lys) in a patient with progressive external ophthalmoplegia complicated by recurrent respiratory insufficiency. Biochemical analysis of respiratory chain complexes in muscle homogenate showed a combined complex I and IV deficiency. The transition does not represent a known neutral polymorphism and affects a position in the tRNA acceptor stem which is conserved in primates, leading to a destabilization of this functionally important domain. In vitro analysis of an essential maturation step of the tRNA trans
Клинический случайСтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
HIV-1 and HIV-2 share transmission and replication characteristics, but require clinical differentiation. HIV-2 exhibits lower viral loads and slower disease progression, and most patients remain long-term non-progressors. Differentiation is crucial for selecting appropriate viral load monitoring tests and avoiding ineffective antiretroviral treatments, particularly non-nucleoside reverse transcriptase inhibitors, and certain protease inhibitors that do not work against HIV-2. Increased PrEP use may result in new infections testing negative for viral markers. This study aims to identify circul
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Epigenetic modifications play critical roles during somatic cell nuclear transfer (SCNT) embryo development. Whether RNA N6-methyladenosine (m6A) affects the developmental competency of SCNT embryos remains unclear. Here, we showed that porcine bone marrow mesenchymal stem cells (pBMSCs) presented higher RNA m6A levels than those of porcine embryonic fibroblasts (pEFs). SCNT embryos derived from pBMSCs had higher RNA m6A levels, cleavage, and blastocyst rates than those from pEFs. Compared with pEFs, the promoter region of METTL14 presented a hypomethylation status in pBMSCs. Mechanistically,
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Patients with anti-tRNA autoantibodies are characterized by arthritis, mechanic´s hands, fever, Raynaud´s phenomenon, and interstitial lung disease (ILD), in at least two clinical scenarios: the antisynthetase syndrome (ASSD) and interstitial pneumonia with autoimmune features (IPAF). The anti-tRNA-ILD treatment is centered on the administration of corticosteroids and a wide variety of immunosuppressive drugs; however, the effectiveness of the treatment depends on factors not fully understood. This research work aimed to quantify the serum levels of two molecules related to pulmonary fibrosis
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Background. Lymphatic filariasis is a chronic human parasitic disease in which the parasites repeatedly provoke acute and chronic inflammatory reactions in the host bloodstream and lymphatics. Excretory-secretory products derived from filariae are believed to play an important role in the development of associated immunologic conditions; however, the specific mechanisms involved in these changes are not well understood. Recently, human cytoplasmic aminoacyl-transfer (t) RNA synthetases, which are autoantigens in idiopathic inflammatory myopathies, were shown to activate chemokine receptors on
Сравнительное исследованиеСтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Gallbladder cancer, the most common malignancy of the bile duct, has a poorly understood etiopathogenesis. Non-coding RNAs are implicated in various cancers, but their role in gallbladder carcinogenesis remains unclear.
METHODS: Transcriptomic data from gallbladder cancer patients were analyzed to identify differentially expressed long non-coding RNAs (lncRNAs). These data underwent cross-species phylogenetic analysis and BLAST comparison with bacterial and ancient human genomes, including Homo heidelbergensis and Homo neanderthalensis. Pathway analysis, gene-gene interactions, an
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVE: To report on the molecular identification of a novel heteroplasmic G-to-A transition at mitochondrial DNA position 3249 in transfer RNA(Leu) gene in a patient with a clinical phenotype resembling Kearns-Sayre syndrome.
PATIENT AND METHODS: A 34-year-old patient had been suffering for more than 10 years from progressive visual failure, neurosensorial hearing loss, exercise intolerance, muscle weakness, paresthesia in the lower limbs, and difficulties swallowing. Clinical examination revealed generalized muscle wasting, ptosis, external ophthalmoplegia, and ataxia. Ophthalmologic exa
Клинический случайСтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
INTRODUCTION: Leukodystrophy is a group of hereditary leukoencephalopathies predominantly affecting the white matter. Multiple genes and mutations have been reported to be associated with this disorder. Identification of pathogenic genes can facilitate diagnosis of leukodystrophy and development of therapeutic strategies.
METHODS: A case was presented with clinical examinations. Exome sequencing was applied to identify potential mutations. Sanger sequencing of blood DNA was applied to confirm the mutation and to examine additional members.
RESULTS: We reported a Chinese male patient of adult
Клинический случайСтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования