The single-molecule dynamics of π-conjugated organic molecules on surfaces is fundamental for applications ranging from catalysis to molecular electronics. Adsorption and diffusion, in particular of organic aromatics, are typically driven by van der Waals forces, energy dissipation in terms of friction, and quantum effects, making them ideal for probing surface energy landscapes. However, their fast motion at thermal equilibrium poses experimental challenges. Recent advances have provided unprecedented insights into the diffusion mechanisms of several organic molecules on metallic and graphiti
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
This chapter describes the applications of the fragment molecular orbital (FMO) method to analyzing the protein-protein interactions (PPIs). Employing the protein complexes related to influenza virus, measles virus, SARS-CoV-2 and HER2, the intermolecular interactions between amino acid residues are quantitatively evaluated. Recent advances in computational methodology, such as the systematic identification of interaction hotspots, the incorporation of conformational fluctuations and the clustering-based statistical averaging are addressed.
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Nanostructures are tiny objects at the molecular and microscopic scale, with carbon nanotubes being the most notable among them. The elements possess exceptional microelectronic properties and other unique characteristics. Researchers have recently focused on the mathematical features of these materials. Molecular descriptors are crucial in mathematical chemistry, particularly in QSAR and QSPR modeling. Topological indices hold a significant position among them. This study presents the precise formulation of the ten most crucial topological indices for a benzene ring positioned on a P-type sur
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Irritable bowel syndrome with diarrhea (IBS-D) is the most prevalent subtype of IBS, characterized by chronic gastrointestinal symptoms in the absence of identifiable pathological findings. This study aims to investigate the molecular mechanisms underlying IBS-D using transcriptomic data. By employing causal network inference methods, we identify key transcriptomic modules associated with IBS-D. Utilizing data from public databases and applying advanced computational techniques, we uncover potential biomarkers and therapeutic targets. Our analysis reveals significant molecular alterations that
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The resonance-stabilized 2-methylallyl radical, 2-MA, is considered as a possible intermediate in the formation of polycyclic aromatic hydrocarbons (PAHs) in combustion processes. In this work, we report on its contribution to molecular growth in a high-temperature microreactor and provide mass-selective IR/UV ion dip spectra of the radical, as well as the various jet-cooled reaction products, employing free electron laser radiation in the mid-infrared region. Small (aromatic) hydrocarbons such as fulvene, benzene, styrene, or para-xylene, as well as polycyclic molecules, like (methylated) nap
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The transmembrane protein 16 (TMEM16) family consists of Ca2+-activated ion channels and Ca2+-activated phospholipid scramblases (CaPLSases) that passively flip-flop phospholipids between the two leaflets of the membrane bilayer. Owing to their diverse functions, TMEM16 proteins have been implicated in various human diseases, including asthma, cancer, bleeding disorders, muscular dystrophy, arthritis, epilepsy, dystonia, ataxia, and viral infection. To understand TMEM16 proteins in health and disease, it is critical to decipher their molecular mechanisms of activation gating and regulation. St
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Molecular vibrations underpin important phenomena such as spectral properties, energy transfer, and molecular bonding. However, obtaining a detailed understanding of the vibrational structure of even small molecules is computationally expensive. While several algorithms exist for efficiently solving the electronic structure problem on a quantum computer, there has been comparatively little attention devoted to solving the vibrational structure problem with quantum hardware. In this work, we discuss the use of quantum algorithms for investigating both the static and dynamic vibrational properti
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
We introduce a computational framework that is able to describe general many-body coarse-grained (CG) interactions of molecules and use it to model the free energy surface of molecular liquids as a cluster expansion in terms of monomer, dimer, and trimer terms. The contributions to the free energy due to these terms are inferred from all-atom molecular dynamics (MD) data using Gaussian Approximation Potentials, a type of machine-learning model that employs Gaussian process regression. The resulting CG model is much more accurate than those possible using pair potentials. Though slower than the
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The DNA molecule is a target for plethora of anticancer and antiviral drugs that forms covalent and non-covalent adducts with major or minor groove of DNA. In present study we synthesized series of novel Pyrazolo [1,5-a]pyrimidine derivatives. The newly synthesized compounds were characterized by elemental analysis, IR, (1)H NMR, and mass spectral data. The selected compounds were studied for interaction with Calf thymus DNA (CT-DNA) using electronic spectra, viscosity measurement and thermal denaturation studies. Further, molecular interactions were revealed for compound IIIa and IVa by compu
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
We report a child in whom multiple cardiac rhabdomyomas were identified on routine fetal ultrasonography. Molecular genetic studies identified the TSC2 gene missense mutation (E36; 4672 G>A, 1558 E>K TSC2). Both general and neurodevelopment of the patient have been normal. When last examined at age 6 years, he had no skin manifestations of tuberous sclerosis complex. Computed tomography of the brain revealed two periventricular calcifications consistent with the molecular diagnosis. This is the first report of molecularly confirmed tuberous sclerosis complex in a child with multiple cardiac rh
Клинический случайСтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Creative thinking drives the generation of novel and useful ideas, contributing to scientific progress and the resolution of social challenges. Evidence from the earliest stone tools, dating to approximately 3.3 million years ago, suggests that creativity among hominin ancestors played a key role in the emergence of human culture and civilization. Although creativity arises from brain activity, the underlying molecular mechanisms and neural substrates remain incompletely understood. Neurotransmitters involved in motivation, reward, and mood play crucial roles in promoting creative processes. R
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The stability-activity trade-off remains a major bottleneck in engineering robust biocatalysts for industrial applications. Here, we developed an integrated computational strategy to simultaneously enhance the catalytic activity and thermostability of 7α-hydroxysteroid dehydrogenase (7α-HSDH) by engineering highly flexible regions, with a particular focus on α-helices. Evolutionary conservation analysis combined with multi-temperature molecular dynamics (MD) simulations was first applied to identify weakly conserved and flexible α-helices. Subsequently, computational tools (PROSS and Pythia) w
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Steroid sulfatase (STS) is a membrane-bound enzyme and a key therapeutic target for hormone-dependent disorders. This study evaluates four sulfamate-based STS inhibitors Coumate, Irosustat (STX64), STX213, and STX1938 across both the catalytic core (Site 1) and the secondary membrane-gate vestibule (Site 2) of human STS (hSTS; PDB ID: 8EG3). Molecular docking and molecular dynamics (MD) simulations were integrated with Prime MM-GBSA energetic calculations, residue contact mapping, and computational ADMET profiling. At the catalytic site, key interactions with formylglycine (FGly75), Lys368, Hi
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Biomolecular interactions, naturally occurring in living organisms, mediate most of the cellular functions, contribute to understanding the nature, function, and behavior of macromolecules, like proteins, and help to predict the biological processes involving macromolecules with unknown functions. Serum albumin (SA), the most important transport protein in the blood, has the capability to bind, covalently or reversibly, a great number of small endogenous and exogenous compounds. Structural changes in SA determine alterations in its biological function, and denaturation processes may affect bot
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Accurately predicting how point mutations influence protease activity is a major challenge in protein engineering and in the study of coagulation disorders. Factor Xa (FXa) catalyzes the proteolytic activation of prothrombin, a critical step in thrombin generation, yet the molecular details of direct enzyme-substrate recognition and the impact of pathogenic variants remain incompletely defined. Here, we combined AlphaFold-Multimer modeling with explicit-solvent molecular dynamics (MD) simulations to investigate simplified FXa-substrate interactions using prothrombin-derived peptides encompassi
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: TMC1 variants cause autosomal dominant (DFNA36) and recessive (DFNB7/11) sensorineural hearing loss. However, the clinical significance of novel missense variants, particularly in East Asian populations, remains unclear.
OBJECTIVE: Our study aims to clarify the pathogenicity of a novel variant p.S390C by clinical characterization, genetic and molecular model analysis in China.
MATERIAL AND METHODS: Auditory features of the hearing loss were characterized in proband. Variant screening of 406 known deafness-associated genes was performed in proband by targeted next-generation seque
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Walnut protein hydrolysates (WPHs) have attracted considerable attention owing to their functional properties. However, the enzymatic hydrolysis process frequently leads to the formation of bitter peptides, which impart an undesirable taste to the hydrolysates, consequently limiting their applications. To elucidate the mechanisms underlying bitterness perception, this study used a combined computational and experimental approach to systematically explore bitter peptides derived from walnut proteins and their interaction mechanisms with bitter-taste receptors (type 2 taste receptors, T2Rs). Ini
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Identifying safe and effective anti-inflammatory agents is challenging, especially given the adverse effects of long-term conventional therapies. Here, we present a multistage computational framework to prioritize early natural compounds with potential anti-inflammatory activity across diverse chemical spaces. The proposed workflow integrates machine learning, consensus prediction, drug-likeness evaluation, synthetic accessibility assessment, toxicity prediction, and molecular docking to enable stepwise refinement of candidate selection. Six predictive models were developed and evaluated with
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Predicting how mutations alter enzyme catalysis remains a central challenge in enzymology and enzyme engineering. Although quantum mechanics/molecular mechanics (QM/MM) simulations can in principle compute the activation free energy associated with enzymatic reactions, their high computational cost limits systematic studies across many variants. Here, we benchmark a mechanical-embedding machine learning potential/molecular mechanics (ML/MM) protocol for predicting mutation effects on chorismate mutase catalysis, a model system extensively studied both experimentally and computationally. In thi
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
TGF-beta-activated kinase 1 (TAK1) is a critical regulator of inflammatory and oncogenic signaling pathways and represents a promising therapeutic target for diseases ranging from chronic inflammation to cancer. However, existing therapies targeting downstream mediators often face limitations such as drug resistance and inconsistent efficacy. Here, we report on drug repurposing to discover FDA-approved compounds that can suppress TAK1 activity. Molecular docking of 3500 drugs from the DrugBank database was performed, followed by drug profiling, biological activity analysis, and 500-nanosecond
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования