Persistent infection by helminths requires limiting inflammatory damage despite incomplete pathogen clearance, yet how helminths mobilize resident microbiota to establish this state remains unclear. Here we identify a cross-kingdom metabolic relay through which Trichinella spiralis promotes systemic disease tolerance. Infection selectively expanded Ligilactobacillus murinus and redirected microbial tryptophan metabolism toward indole-3-lactic acid (ILA), a direct ligand of the aryl hydrocarbon receptor (AhR). Antibiotic perturbation abrogated ILA production, AhR activation and Treg-Th17 remode
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
IgE-mediated food allergy is a global health issue with rising prevalence that cannot be explained by genetic change alone, strongly suggesting that environmental exposures are a key driver. The external exposome encompasses several exposures that influence the developing immune system and modify food allergy risk. Environmental exposure to food allergens in household dust is increasingly recognized as a risk factor for sensitization, whereas early oral introduction promotes tolerance. Early-life microbial exposures, especially those associated with rural and farming environments, may protect
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Data-driven machine learning (ML) approaches offer powerful tools for modeling and optimizing complex fermentation processes, yet their application is often limited by the need for large experimental datasets, which is difficult to meet in low-throughput microbial fermentation systems. Here, we present a practical genetic algorithm (GA)-assisted adaptive sampling strategy to support sample-efficient ML-assisted optimization of microbial biotransformation processes. In this strategy, GA is employed upstream to iteratively select informative experimental conditions and generate a compact dataset
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Hosts must distinguish mutualistic symbionts from antagonists while avoiding harmful immune overactivation, yet the mechanisms maintaining this balance remain unclear. This challenge is acute during biological invasions, where exposure to novel microbial communities can outpace host genetic adaptation. Dendroctonus valens (RTB) associates with its mutualistic fungus Leptographium procerum (Lp), forming an invasive beetle-fungus complex during attacks on Chinese pines. Lp fails to trigger antimicrobial peptide expression but induces the heat shock protein 83 (HSP83). The native antagonist Ophio
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The intestinal microbiota has emerged as a crucial regulator of host physiological functions, significantly influencing various forms of regulated cell death (RCD). Among these, pyroptosis and ferroptosis play pivotal roles in immune regulation, metabolic homeostasis, and disease progression. The gut microbiota modulates these cell-death pathways through microbial metabolites, inflammatory signaling, oxidative stress, and immune-cell polarization, thereby affecting intestinal disorders, metabolic diseases, cardiovascular diseases, and neurodegenerative diseases. However, current evidence remai
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Psoriasis and Crohn's disease are chronic immune-mediated inflammatory diseases affecting distinct barrier organs, yet epidemiological, genetic, transcriptomic, and therapeutic evidence supports partial immune convergence between them. This review argues that the relationship between psoriasis and Crohn's disease reflects partial immune convergence shaped by tissue context, rather than a single shared disease entity. TNF-α and IL-23-centered type 17 immunity represent the most clinically relevant shared upstream programs, whereas downstream effector pathways, especially IL-17-related responses
СтатьяОбзорПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Colorectal cancer (CRC) is a multifactorial disease influenced by genetic, environmental, and microbial factors. Within the gut microbiota, pks + Escherichia coli has emerged as a key contributor to colorectal carcinogenesis through the production of colibactin, a genotoxic secondary metabolite. Colibactin induces DNA damage by forming interstrand crosslinks and promoting replication-associated double-strand breaks, thereby triggering host DNA damage response pathways and genomic instability. Recent advances in genomic profiling have identified distinct mutational signatures, such as SBS88 and
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND AND AIM: Primary Immunodeficiencies (PIDs) arise from rare genetic defects affecting humoral and cellular immunity, which can lead to reduced dental plaque control. This study aimed to characterise the subgingival dental plaque microbiome in neutropenic PID children compared to healthy controls and assess their response to non-surgical periodontal therapy.
METHODS: Subgingival plaque was collected from three first molars and one first incisor at baseline and 6 months post therapy from children with PID (n = 24) and systematically healthy control participants (n = 24) who were recru
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
INTRODUCTION: Aquaculture is an important source of antibiotics and ARGs in environmental waters. However, the occurrence of antibiotics and ARGs under different modes and stages of aquaculture has rarely been systematically studied.
METHODS: This paper uses qPCR, LC-MS, and High-Throughput sequencing across different culture modes and stages to investigate antibiotics, resistance genes, and microbial communities in the water bodies, and analyze contamination differences between these modes.
RESULTS: The quinolone and chloramphenicol were the main antibiotics, and the highest absolute abunda
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Commensal bacteria have been implicated in the modulation of steroid hormones, including circulating androgen levels in the host. However, the microbial genetic pathways involved in androgen production have not been fully characterized. Here we identify a microbial gene encoding an enzyme that catalyses the conversion of androstenedione to epitestosterone in the gut microbiome member Clostridium scindens and named this gene desF. We demonstrate that epitestosterone impacts androgen receptor-dependent prostate cancer cell proliferation in vitro. We also demonstrate that stool desF levels are el
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The fight against climate change requires consideration of carbon as a critical parameter in production systems, with the ultimate aim of creating a truly sustainable circular carbon economy. In this context, microbial bioproduction systems are a promising route to renewably generate value-added chemicals and fuels. Methanol and formate have recently gained interest as microbial one-carbon feedstocks, which can be produced sustainably from carbon dioxide and renewable energy, are easy to store and transport and readily dissolve in aqueous solutions. Acetogenic bacteria are strictly anaerobic m
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Lignin is a vast yet underutilized source of renewable energy. The microbial valorization of lignin is challenging due to the toxicity of its degradation intermediates, particularly formaldehyde. In this study, we engineered Methylobacterium extorquens PA1 to metabolize lignin-derived methoxylated aromatics, vanillate (VA) and protocatechuate (PCA), by introducing the van and pca gene clusters. Compared to Pseudomonas putida, M. extorquens PA1 exhibited better formaldehyde detoxification, enabling robust growth on VA without accumulation of formaldehyde. Genetic analyses confirmed that formald
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Emerging evidence indicates an association between the gut microbiota and the incidence of osteonecrosis (ON), yet the literature has not adequately addressed whether this relationship is causal. This study uses data from the MiBioGen Consortium and the UK Biobank for Mendelian randomization (MR) analysis to identify pathogenic gut microbial taxa associated with ON. Sensitivity analyses confirmed causal relationships, while reverse MR ruled out reverse causation. SNP annotation located genetic variants linked to gut microbiota instrumental variables in ON. The inverse variance weighted method
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Inflammatory bowel disease (IBD) is a chronic condition that includes two main types, Crohn's disease (CD) and ulcerative colitis (UC), involving inflammation of the gastrointestinal (GI) tract. The exact cause of IBD is unknown but could be a combination of genetic, environmental, and immune system factors. This study investigated the impact of IBD on microbiota diversity by evaluating the differences in microbial composition and the microbiota of a control group (A) of healthy individuals and a group (B) of IBD patients. Sixty biopsies were collected from participants recruited from hospital
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Inflammatory bowel disease is a multifaceted condition that is influenced by nutritional, microbial, environmental, genetic, psychological, and immunological factors. Polyphenols and polysaccharides have gained recognition for their therapeutic potential. This review emphasizes the biological effects of polyphenols and polysaccharides, and explores their antioxidant, anti-inflammatory, and microbiome-modulating properties in the management of inflammatory bowel disease (IBD). However, polyphenols encounter challenges, such as low stability and low bioavailability in the colon during IBD treatm
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Cystic fibrosis (CF) is a genetic disorder characterized by chronic microbial colonization and inflammation of the respiratory tract (RT), leading to pulmonary exacerbation (PEx) and lung damage. Although the lung bacterial microbiota has been extensively studied, the mycobiome remains understudied. However, its importance as a contributor to CF pathophysiology has been highlighted. The objective of this review is to provide an overview of the current state of knowledge regarding the mycobiome, as described through NGS-based studies, in patients with CF (pwCF).Several studies have demonstrated
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Gastrodin, a phenolic glycoside, is a prominent component of Gastrodia elata, which is renowned for its sedative, hypnotic, anticonvulsant, and neuroprotective activities. Engineering heterologous production of plant natural products in microbial host represents a safe, cost-effective, and scalable alternative to plant extraction. Here, we present the construction of an engineered Yarrowia lipolytica yeast that achieves a high-titer production of gastrodin. We systematically refactored the yeast genome by enhancing the flux of the shikimate pathway and optimizing the glucosyl transfer system.
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Biological material from the oral cavity is an excellent source of samples for genetic diagnostics. This is because collection is quick, easy-to-access, and non-invasive. We have set-up clinical whole genome sequence testing for patients with suspected hereditary disease. Beside the excellent quality of human DNA that can be isolated from such samples, we observed the presence of non-human DNA sequences at varying percentages. We investigated the proportion of non-human mapped reads (NHMR) sequenced from buccal swabs and saliva, the type of microbial genomes from which they were derived, and i
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The host-microbiota relationship has evolved to shape mammalian processes, including immunity, metabolism, and development 1-3 . Host phenotypes change in direct response to microbial exposures by the individual. Here we show that the microbiota induces phenotypic change not only in the individual but also in their succeeding generations of progeny. We found that germ-free mice exhibit a robust sebum secretion defect and transcriptional changes in various organs, persisting across multiple generations despite microbial colonization and breeding with conventional mice. Host-microbe interactions
ПрепринтСтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
As two pollutants with similar transport pathways, microplastics (MPs) and antibiotics (ATs) inevitably co-exist in water environments, and their interaction has become a topic of intense research interest for scholars over the past few years. This paper comprehensively and systematically reviews the current interaction between MPs and ATs, in particular, the role played by biofilm developed MPs (microplastic biofilm). A summary of the formation process of microplastic biofilm and its unique microbial community structure is presented in the paper. The formation of microplastic biofilm can enha
СтатьяОбзорПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования