Half the world's population is chronically infected with Helicobacter pylori, causing gastritis, gastric ulcers and an increased incidence of gastric adenocarcinoma. Its proton-gated inner-membrane urea channel, HpUreI, is essential for survival in the acidic environment of the stomach. The channel is closed at neutral pH and opens at acidic pH to allow the rapid access of urea to cytoplasmic urease. Urease produces NH(3) and CO(2), neutralizing entering protons and thus buffering the periplasm to a pH of roughly 6.1 even in gastric juice at a pH below 2.0. Here we report the structure of HpUr
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПоддержка правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The opioid receptor family is composed of three members, the µ, δ and κ opioid receptors, that respond to classical opioid alkaloids such as morphine and heroin as well as endogenous peptide ligands like endorphins. They belong to the G-protein-coupled receptor (GPCR) superfamily, and are excellent therapeutic targets for pain control. I will discuss new insights into conserved elements of opioid ligand recognition and structural features associated with ligand subtype selectivity based on the crystal structures we obtained for µ-OR and δ-OR. These data also provide a structural explanation an
Аннотация на английскомСтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
We report a new and label-free method to detect and characterize the clustering of membrane-bound proteins and, by extension, the lateral segregation of nanosized particles adsorbed to planar surfaces in liquid environment. The method exploits the contrast between two different mass and surface sensitive detection methods, quartz crystal microbalance with dissipation monitoring and ellipsometry. The time-resolved correlation of both techniques provides insight into subtle changes in the clustering state of surface-bound molecules that is not accessible with either technique alone. A theoretica
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The study was to express prME protein of Japanese encephalitis virus (JEV) in Pichia pastoris and then to evaluate the immunological properties of the recombinant protein in mice, so as to explore a new way for subunit vaccine development of JEV. The JEV prME gene was amplified by RT-PCR with genome RNA of JEV vaccine strain SA14-14-2 and subcloned into pPICZa-A vector, designated as pPICZα-prME. pPICZα-SprME was constructed same as pPICZα-prME besides with the additional 19 Aa signal peptides coding gene of the JEV cap protein C terminal. The linearized expression vector was integrated into t
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
General anesthetics are known to modulate pentameric ligand-gated ion channels (pLGICs), including GABAA, glycine, serotonin, and glutamate receptors, among others. The bacterial (Gloeobacter) ion channel GLIC captures anesthetic modulation while providing high-resolution structures in each of its distinct functional conformations, allowing for molecular definition of state-dependent binding and quantification of allosteric mechanisms. This study uses molecular dynamics, metadynamics, and free energy simulations to calculate the free energy surfaces of propofol binding to open and closed chann
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Peptidyl-tRNA hydrolase (Pth2) hydrolyzes peptidyl-tRNA, an immature product of aborted translation, into peptide and tRNA, thereby maintaining cellular protein synthesis through peptide release and tRNA recycling. Here, we present the crystal structure of Pth2 from Candidatus Lokiarchaeum sp. GC14_75 (LokiPth2) at 2.12 Å resolution. This is the first structure of Pth2 from a lineage within Promethearchaeati, a kingdom of archaea closely related to eukaryotes. The structure reveals that LokiPth2 forms a homodimer and closely resembles Pth2 structures from other species. However, LokiPth2 exhib
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The increasing occurrence of multidrug-resistant Mycobacterium tuberculosis (Mtb) is a serious threat to global public health. Among the many mechanisms of drug resistance, only resistance-nodulation-division (RND)-type multidrug efflux systems can simultaneously render bacteria tolerant to numerous toxic compounds, including antibiotics. The elevated expression of RND-type xenobiotic efflux transporter complexes, which consist of an inner membrane transporter, membrane fusion protein, and outer membrane channel, plays a major role in multidrug resistance. Among the 14 mycobacterial membrane p
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Organophosphates (OPs) have been used widely as insecticides for protecting the agricultural crops from the pests. These compounds are highly toxic because they can cause the irreversible damage to human nervous system. Phosphotriesterases (PTEs), widely exist in many different kinds of bacteria, insects and mammals, can hydrolyze phosphotriesters (one major kind of OP) sufficiently. The phosphotriesterase-activities of PTEs are considered to derive from the lactonase-activities during the evolution, and phosphotriesterase-like lactonase family (PLL), is the closest protein family to PTE famil
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Alzheimer's disease (AD) is a progressive neurodegenerative disorder leading to dementia caused by advanced neuronal dysfunction and death. The most significant symptoms of AD are observed at late stages of the disease when interventions are most likely too late to ameliorate the condition. Currently, the predominant theory for AD is the "amyloid hypothesis," which states that abnormally increased levels of amyloid β (Aβ) peptides result in the production of a variety of aggregates that are neurotoxic. The specific mechanisms for Aβ peptide-induced cytotoxicity have not yet been completely elu
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Human γS-crystallin is an important component of the human eye lens nucleus and cortex. The mutation V42M in the molecule causes severe congenital cataract in children. We compare the structure of the mutant protein with that of the wild type in order to understand how structural changes in the mutant relate to the mechanism of opacification.
METHODS: Both proteins were made using conventional cloning and expression procedures. Secondary and tertiary structural features of the proteins were analyzed using spectral methods. Structural stabilities of the proteins were analyzed using
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Regulation of a variety of different cellular processes, including posttranslational modifications, is critical for the ability of many viruses to replicate efficiently within host cells. The adenovirus (Ad) E4-ORF3 protein assembles into polymers and forms a unique nuclear scaffold that leads to the relocalization and sequestration of cellular proteins, including small ubiquitin-like modifiers (SUMOs). Previously, we showed that E4-ORF3 functions as a SUMO E3 ligase of transcriptional intermediary factor-1 gamma (TIF-1γ) and promotes poly-SUMO chain formation. Here, we present cellular and bi
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Basic helix-loop-helix leucine zipper (bHLHLZ) transcription factors (TFs), such as MycMax, MaxMax, and the engineered mutant Omomyc dimers, regulate gene expression by binding to the E-box (5'-CACGTG-3') motif in DNA. Here, we used microsecond molecular dynamics (MD) simulations along with MMGBSA energetic and hydrogen bonding (HB) analyses to investigate how MycMax, Omomyc, and MaxMax dimers interact with both canonical E-box and homogeneous polyA reference sequences. Our MD results indicate that protein-DNA van der Waals (VDW) interactions and surface complementarity dominate the binding af
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
d-Ribulose and l-fuculose are potentially valuable rare sugars useful for anticancer and antiviral drugs in the agriculture and medicine industries. These rare sugars are usually produced by chemical methods, which are generally expensive, complicated and do not meet the increasing demands. Furthermore, the isomerization of d-arabinose and l-fucose byDd-arabinose and l-fucose by d-arabinose isomerase from bacterial sources for the production of d-ribulose and l-fuculose have not yet become industrial due to the shortage of biocatalysts, resulting in poor yield and high cost of production. In t
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Boron is increasingly added to food supplements due to multiple effects that have been reported in mammals after boric acid administration. Among these effects are inflammatory process control, bone and muscle strength enhancement, protein expression regulation, and a decreased risk of developing some pathologies in which these processes are key, such as osteoporosis, dermatological inflammatory non-infectious maladies and diseases affecting the central nervous system. Experimental data have suggested that steroid hormone levels in plasma change after boric acid administration, but a clear mec
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MicroRNAs (miRNAs) play important roles in several neurobiological processes, including the development and progression of diseases. Previously, we identified that one specific miRNA, miR-196a, provides neuroprotective effects on Huntington's disease (HD), although the detailed mechanism is still unclear. Based on our bioinformatic analyses, we hypothesize miR-196a might offer neuroprotective functions through improving cytoskeletons of brain cells. Here, we show that miR-196a could enhance neuronal morphology, further ameliorating intracellular transport, synaptic plasticity, neuronal activit
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Targeting of cryptic binding sites represents an attractive but underexplored approach to modulating protein function with small molecules. Using the dimeric protease (Pr) from Kaposi's sarcoma-associated herpesvirus (KSHV) as a model system, we sought to dissect a putative allosteric network linking a cryptic site at the dimerization interface to enzyme function. Five cryogenic X-ray structures were solved of the monomeric protease with allosteric inhibitors bound to the dimer interface site. Distinct coordinated movements captured by the allosteric inhibitors were also revealed as alternativ
Сравнительное исследованиеСтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Human islet amyloid polypeptide (hIAPP, or amylin) forms amyloid deposits in the islets of Langerhans, a phenomenon that is associated with type-2 diabetes impacting millions of people worldwide. Accordingly, strategies against hIAPP aggregation are essential for the prevention and eventual treatment of the disease. Here, it is shown that generation-3 OH-terminated poly(amidoamine) dendrimer, a polymeric nanoparticle, can effectively halt the aggregation of hIAPP and shut down hIAPP toxicity in pancreatic MIN6 and NIT-1 cells as well as in mouse islets. This finding is supported by high-throug
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПоддержка правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Alzheimer's disease involves accumulation of senile plaques in which filamentous aggregates of amyloid beta (Aβ) peptides are deposited. Recent studies demonstrate that oligomerization pathways of Aβ peptides may be complicated. To understand the mechanisms of Aβ(1-42) oligomer formation in more detail, we have established a method to produce (15)N-labeled Aβ(1-42) suited for nuclear magnetic resonance (NMR) studies. For physicochemical studies, the starting protein material should be solely monomeric and all Aβ aggregates must be removed. Here, we succeeded in fractionating a "precipitation-r
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Glucocerebrosidase (GCase) functions as a lysosomal enzyme and its mutations are known to be related to many neurodegenerative diseases, including Gaucher's disease (GD), Parkinson's disease (PD), and Dementia with Lewy Bodies (DLB). However, there is little information about the role of GCase in the pathogenesis of Alzheimer's disease (AD). Here we demonstrate that GCase protein levels and enzyme activity are significantly decreased in sporadic AD. Moreover, Aβ1-42 oligomer treatment results in neuronal cell death that is concomitant with decreased GCase protein levels and enzyme activity, as
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.