Proximity labeling methods (including BioID, TurboID, and ultraID), along with surface proteomics and microdomain mapping, enable proteome-wide identification of spatially proximal proteins via MS-based analysis. These workflows require specific enrichment of biotinylated proteins using affinity purification, yet enrichment specificity can often be compromised by nonspecifically bound proteins. As labeling strategies are increasingly applied to complex biological samples with low protein input or low biotin stoichiometry, accurately distinguishing true targets from the background becomes a maj…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Chronic prostatitis/chronic pelvic pain syndrome (CP/CPPS) is a prevalent pelvic pain disorder in men, yet effective pharmacotherapies remain limited. Emerging evidence suggests that oxidative stress and dysregulated iron metabolism contribute to the pathogenesis of CP/CPPS, with ferroptosis increasingly implicated in CP/CPPS-related pathology. Qianlie Zhitong Formula (QLZTF) has shown therapeutic potential in treating CP/CPPS; however, its underlying mechanisms remain incompletely understood. This study integrated proteomics, metabolomics, and in vivo experiments to investigate the therapeuti…
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Dictyostelium discoideum is a genetically tractable amoebozoan model organism widely used to study conserved eukaryotic cellular processes, yet a comprehensive map of its subcellular proteome has been lacking. Here, we combined subcellular fractionation with label-free mass spectrometry to resolve a global protein localization map for D. discoideum . We detected 6,337 proteins (~50% of the predicted proteome) and generated protein abundance profiles across 10 subcellular fractions. Using a curated marker set and a support vector machine classifier with a median cutoff, we assigned high-confide
СтатьяПрепринтПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Mass-spectrometry-based proteomics is rapidly advancing, becoming fast, affordable, and increasingly accessible to environmental scientists. This perspective outlines how proteomics can illuminate biotransformation processes and sublethal organism-level effects, and highlights future opportunities enabled by emerging technologies. Our goal is to give a concise overview on realistic expectations of current capabilities while inspiring scientists to adapt and develop novel proteomic approaches addressing fundamental questions in contaminant science.
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Mass spectrometry-based label-free proteomics data often suffer from missing values, especially for low-abundance proteins or when a protein is completely absent in one condition. This makes it challenging to estimate fold changes reliably and perform downstream analyses. Traditional imputation methods often show inconsistent performance across datasets and they typically treat imputed values as fixed rather than uncertain. This can lead to an underestimation of variability in downstream analyses. To address those problems, we present a hierarchical model that accounts for both observed protei…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The hemotoxic venom from Lonomia caterpillars is known to cause severe human envenomation in Latin America. The cases have mainly been assoc … anarensis serum against these two species. Bristle extracts were digested and prepared for shot-gun proteomics. Clustering and principal component analysis (PCA) based on protein relative abundance were performed, and toxin abundance was compared between species. The immunoreactivity of an anti-L. casanarensis serum was evaluated by immunoprecipitation and w …
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Chronic obstructive pulmonary disease (COPD) is a leading cause of global mortality, yet existing risk prediction models remain limited. This study aimed to develop and validate a protein-based risk score for COPD, comparing its performance against COPD polygenic risk scores (PRSs) and clinical risk factors, while exploring underlying biological pathways and causal protein-disease associations.
METHODS: The study analysed 27 796 UK Biobank participants from England (70% training and 30% testing set) and 3534 from Scotland/Wales (validation cohort). Least absolute shrinkage and sel
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
STUDY DESIGN: A prospective study.
BACKGROUND: In clinical practice, it is challenging to tell major depressive disorder (MD-D) apart from bipolar disorder depressive episodes (BD-D). This study focuses on using inflammatory proteins as biomarkers to differentiate MD-D from BD-D.
MATERIALS AND METHODS: Admission plasma was collected from 30 healthy participants, 30 BD-D patients, and 30 MD-D patients. Ten samples from each group were randomly chosen for analysis using Olink Proteomics, and all samples were confirmed with ELISA. Then, we established a nomogram prediction model to assess the d…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Diabetic retinopathy (DR) is a microvascular complication of diabetes with its exact underlying mechanisms have not been fully elucidated. This study aimed to investigate the effects of key proteins and metabolites on the development of DR. Undiluted vitreous fluid samples were collected from eight patients with proliferative diabetic retinopathy (PDR) and six non-diabetic idiopathic macular hole (iMH) controls. Integration of TMT-tagged quantitative proteomics and untargeted metabolomics analyses was combined with bioinformatics approaches (PCA, differential expression, PPI network, OPLS-DA, …
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Multimorbidity, defined here as the co-occurrence of cardiovascular disease (CVD), type 2 diabetes (T2D), and/or cancer is a major public health challenge. However, its underlying biological mechanisms remain unclear, limiting progress toward identifying shared interventional targets.
METHODS: We applied large-scale plasma proteomics (SomaScan 7k; 7,289 aptamers) in 13,270 European Prospective Investigation into Cancer and Nutrition (EPIC) participants to identify protein signatures of multimorbidity. We modelled multimorbidity progression as sequential disease transitions, i.e., …
СтатьяМногоцентровое исследованиеПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
This study performs untargeted metabolomics on mouse serum and quantitative proteomics on xenograft tumors to explore the potential anti-tumor mechanisms of Inonotus obliquus polysaccharides (IOPs) against non-small cell lung cancer (NSCLC), revealing candidate pathways that warrant further experimental validation. Building on our prior discovery of IOP-induced apoptosis, we combined functional assays with multi-omics analyses using a well-characterized IOPs preparation (average molecular weight: 4.5 × 104 Da; polysaccharide content: 70.3%; primarily composed of glucose). IOPs potently inhibit…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Mass spectrometry-based proteomic profiling of cerebrospinal fluid (CSF) in large patient cohorts, particularly among childhood cancer survivors, remains scarce, limiting opportunities for benchmarking, method development, and validation. Here, we present a longitudinal CSF proteomics dataset from survivors of childhood acute lymphoblastic leukemia (ALL). Samples were collected from 178 patients enrolled in the TOTXVI therapeutic protocol at two timepoints: diagnosis (pre-treatment) and during the consolidation phase of chemotherapy (totaling 356 samples). CSF proteomes were profiled using tan…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND AND AIMS: Non-alcoholic Fatty Liver Disease (NAFLD) affects about a quarter of the world's population. Liver biopsy remains the gold standard for diagnosing the progressive form of NAFLD called Non-alcoholic Steatohepatitis (NASH) but it is invasive, prone to sampling errors and observer variability, and impractical for widespread use. Fecal non-invasive biomarkers have emerged as a new approach to diagnose, stage, and monitor NAFLD over time.
METHODS: Proteomic analysis was performed using Liquid Chromatography-Mass Spectrometry (LC-MS/MS) in fecal samples derived from mice fed wi
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Amyloidosis is a group of disorders caused by extracellular deposition of insoluble fibrillar proteins, leading to progressive organ dysfunction. Cardiac amyloidosis is clinically significant, as myocardial infiltration results in restrictive cardiomyopathy, arrhythmias, and heart failure. The main subtypes are light-chain (AL) and transthyretin (ATTR) amyloidosis, while AA and isolated atrial amyloidosis (IAA) are less common. Accurate subtype identification is crucial for management and prognosis. Diagnosis requires a multimodal approach combining imaging and tissue-based techniques. Echocar
СтатьяОбзорПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
INTRODUCTION: Common forms of dementia include Alzheimer's disease (AD), dementia with Lewy bodies (DLB), and frontotemporal dementia (FTD). Disease specific biomarkers are needed for differential disease diagnosis.
METHODS: We performed cerebrospinal fluid (CSF) mass spectrometry proteomics on three cohorts (n = 110, n = 112, n = 78) including AD, DLB, FTD, mild cognitive impairment (MCI) with or without abnormal cerebrospinal fluid (CSF) amyloid-beta 1-42 (Aβ1-42) levels (MCI Aβ+ and MCI Aβ-, respectively) and controls.
RESULTS: We identified and validated 11, 3, and 5 differentially expre…
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Platelets are blood components not regularly analysed with proteomics due to the conventional wisdom that plasma for platelet research must be citrate-treated and freshly sampled to minimize artifactual changes. Information from platelets is complementary to plasma, specifically regarding immunophenotyping of patients with challenged immune systems due to infection or inflammation. We sought to develop a sample-sparing, high-throughput-compatible platelet proteomics workflow applicable to previously frozen, non-citrate platelet-rich plasma, in contrast to the field's standard, and test its eff…
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Lactic acid fermentation is a promising strategy to valorize dairy by-products and plant proteins by modifying composition and enhancing functionality; however, links between microbial metabolism, chemical profiles, and bioactivity remain poorly understood. In this study, whey, pea, and their mixture were used as model systems for fermented beverages to investigate how substrate composition influences metabolic pathways and shapes chemical profiles during fermentation by Lacticaseibacillus paracasei AF43. Proteomic and metabolite profiling were integrated to link metabolism to compound formati
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The neurovascular unit, composed of brain endothelial cells, pericytes, and astrocytes, regulates molecular exchange between blood and the c … n blot followed by sample preparation for liquid chromatography-tandem mass spectrometry (LC-MS/MS) proteomics. For complete details on the use and execution of this protocol, please refer to Huang et al.1.
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
This study characterised differential protein expression using label-free proteomics of the lung microenvironment using bronchoalveolar lavage fluid and identified increased immune protein expression in the IPAF lung compared to IPF https://bit.ly/4edhp3B.
Письмо в редакциюПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Small extracellular vesicles (sEVs) are lipid-bilayer-enclosed vesicles secreted by cells into the extracellular environment, carrying a variety of biomolecules, including proteins that reflect the molecular profile of their cell of origin. In particular, cancer-derived sEVs hold significant potential for cancer diagnosis due to their unique biomolecular content. In this study, we utilized mass spectrometry to profile the protein expression in plasma-derived sEVs from both healthy controls (HCs) and breast cancer (BC) patients with the aim of discovering new protein biomarkers for potential BC
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования