S23906 belongs to a novel class of alkylating anticancer agents forming bulky monofunctional DNA adducts. A unique feature of S23906 is its "helicase-like" activity leading to the destabilization of the surrounding duplex DNA. We here characterize the recognition and repair of S23906 adducts by the nucleotide excision repair (NER) machinery. All NER-deficient human cell lines tested showed increased sensitivity to S23906, which was particularly pronounced for cells deficient in XPC, CSB and XPA. In comparison, deficiencies in ERCC1 or XPF had lesser impact on the sensitivity to S23906. The sen
Сравнительное исследованиеСтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Xeroderma pigmentosum B (XPB/ERCC3/p89) is an ATP-dependent 3'-->5' directed DNA helicase involved in basal RNA transcription and the nucleotide excision repair (NER) pathway. While the role of NER in alleviating oxidative DNA damage has been acknowledged it remains poorly understood. To study the involvement of XPB in repair of oxidative DNA damage, we utilized primary fibroblasts from a patient suffering from XP with Cockayne syndrome and hydrogen peroxide (H(2)O(2)) to induce oxidative stress. Mutant cells retained higher viability and cell cycle dysfunction after H(2)O(2) exposure. Cytokin
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: CHARGE syndrome represents a constellation of malformations: C, coloboma of the iris or retina; H, heart defects; A, atresia of the choanae; R, retardation of growth and/or development; G, genital anomalies; and E, ear abnormalities. Recently, the Chromodomain helicase DNA-binding protein-7 (CHD7) at chromosome 8q12.1 was identified as a causative gene for CHARGE syndrome. Because CHD7 was identified as a causative gene using a positional cloning approach, the role of CHD7 in early embryogenesis needs to be further investigated.
METHODS: Fertilized chick eggs were incubated to Ham
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Immunoglobulin mu binding protein 2 (IGHMBP2) is a DNA/RNA helicase with a putative role in transcriptional regulation and splicing. A recessive mutation of the Ighmbp2 gene in neuromuscular degeneration (nmd) mice causes progressive neurogenic atrophy of limb muscles. Affected mice show significant loss of motor neurons with large caliber axons and a moderate reduction of neurons with small caliber axons in the ventral nerve roots of the spinal cord. To investigate the role of Ighmbp2 in the pathogenesis of neuromuscular degeneration, we generated two independent lines of transgenic mice expr
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоддержка службы здравоохранения СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Sertoli cells provide essential structural and nutritional support for germ cell development and play critical roles in spermatogenesis. Post-transcriptional regulation exerts important functions in Sertoli cells. Complex alternative splicing processes exist in Sertoli cells. This study focuses on splicing factor SRSF1 to investigate its function and mechanisms in Sertoli cell development. Sertoli cell-specific SRSF1 ablation from embryonic development arrests cell proliferation and increases apoptosis, thereby reducing Sertoli cell number, constricting the germ cell microenvironment, and caus
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: RNA editing plays critical roles in cancer development, and multiple editing events collectively exert greater effects than individual events. However, the coordinated impact of RNA editing remains poorly understood.
METHODS: A comprehensive framework was proposed to investigate interactions among RNA editing events, capturing both the global editing landscape and site-specific functional effects. The resulting RNA editing modules were further explored to reveal gene interactions and regulatory mechanisms from the perspective of RNA editing.
RESULTS: Using non-small cell lung can
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Up-frameshift protein 1 (UPF1)-mediated mRNA decay maintains transcriptome integrity and cellular homeostasis. However, its role in amyotrophic lateral sclerosis (ALS), a neurodegenerative disease characterized by TAR DNA-binding protein 43 (TDP-43) pathology and disrupted mRNA metabolism in motor neurons (MNs), remains unresolved. Here, we integrated RNA sequencing (RNA-seq) after UPF1 knockdown with RNA immunoprecipitation (RIP)-seq of phosphorylated UPF1 to delineate direct UPF1 targets in induced pluripotent stem cell (iPSC)-derived MNs. These transcripts are enriched for autophagy and str
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
INTRODUCTION: We previously reported a phenomenon called exercise hypertrophic preconditioning (EHP), the underlying mechanisms of which need further clarification.
OBJECTIVES: We aimed to investigate whether circular RNAs (circRNAs) are involved in EHP.
METHODS: CircRNA sequencing of myocardial tissue was performed in male C57BL/6 mice with EHP and sedentary. Bioinformatics analysis and Sanger sequencing were used to screen hub circRNA expression and to detect full-length circRNAs, respectively. Loss-of-function analyses were conducted to assess the effects of circ-Ddx60 (c-Ddx) on EHP. Aft
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Retinoic acid-inducible gene-I (RIG-I) is considered to play a role in innate immunity against virus infections. We showed by immunohistochemical study that RIG-I expression is upregulated in vivo in hepatic Kupffer cells and in splenic reticular cells of mice infected with Listeria monocytogenes. Both heat-killed L. monocytogenes and live L. monocytogenes induced the expression of RIG-I in cultured RAW264.7 murine macrophage-like cells in vitro. RIG-I may also be involved in innate immunity against Listeria infection.
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
This study was to investigate the genetic contribution of optineurin (OPTN), a gene associated with primary open-angle glaucoma and amyotrophic lateral sclerosis (ALS), in Chinese patients with ALS. To gain additional insight into the spectrum and pathogenic relevance of this gene for ALS, we sequenced all the coding exons of OPTN and intron-exon boundaries in 398 patients with ALS [33 familial ALS (FALS), 365 unrelated sporadic ALS (SALS)] using next-generation sequencing. Six nonsynonymous variants were identified in 6 unrelated patients with SALS, in which one patient harbored 2 different O
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Fanconi anemia is a genetically and phenotypically heterogeneous disorder characterized by congenital anomalies, bone marrow failure, cancer, and sensitivity of chromosomes to DNA cross-linking agents. One of the 22 genes responsible for Fanconi anemia is BRIP1, in which biallelic truncating mutations lead to Fanconi anemia group J and monoallelic truncating mutations predispose to certain cancers. However, of the more than 1000 reported missense mutations in BRIP1, very few have been functionally characterized. We evaluated the functional consequence of BRIP1 p.R848H (c.2543G > A), which was
Клинический случайСтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Ataxia with oculomotor apraxia type 2 (AOA2) is a recently described autosomal recessive cerebellar ataxia caused by mutations in the SETX gene. It is a rare monogenic disease characterized by progressive cerebellar ataxia, oculomotor apraxia, axonal sensorimotor neuropathy, and an elevated serum α-fetoprotein level. To date, >100 AOA2 patients have been described and 75 different mutations in the SETX gene have been identified. We report here the clinical and genetic findings of 13 AOA2 patients from 5 unrelated Tunisian consanguineous families. DNA was collected from probands and available f
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The V protein of Sendai virus (SeV) suppresses innate immunity, resulting in enhancement of viral growth in mouse lungs and viral pathogenicity. The innate immunity restricted by the V protein is induced through activation of interferon regulatory factor 3 (IRF3). The V protein has been shown to interact with melanoma differentiation-associated gene 5 (MDA5) and to inhibit beta interferon production. In the present study, we infected MDA5-knockout mice with V-deficient SeV and found that MDA5 was largely unrelated to the innate immunity that the V protein suppresses in vivo. We therefore inves
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Ataxia with oculomotor apraxia type 2 (AOA2) is an autosomal recessive disease due to mutations in the senataxin gene, causing progressive cerebellar ataxia with peripheral neuropathy, cerebellar atrophy, occasional oculomotor apraxia and elevated alpha-feto-protein (AFP) serum level. We compiled a series of 67 previously reported and 58 novel ataxic patients who underwent senataxin gene sequencing because of suspected AOA2. An AOA2 diagnosis was established for 90 patients, originating from 15 countries worldwide, and 25 new senataxin gene mutations were found. In patients with AOA2, median A
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Retinoic acid-inducible gene 1-like receptors (RLRs) are a novel family of pattern recognition receptors that include retinoic acid-inducible gene 1 (RIG-1), melanoma differentiation-associated gene 5 (MDA-5), and laboratory of genomics and physiology 2 (LGP-2). The knowledge of RLRs and their function in the human airway is limited. This study explores the role of RLRs in the upper respiratory tract.
METHODS: Tonsils, adenoids, nasal polyps, and biopsy specimens from the nasal mucosa were examined for the occurrence of the RIG-1, MDA-5, and LGP-2 using real-time reverse-transcrip
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Deletion of hnRNPK in mouse spermatogonia leads to male sterility due to arrest permatogenesis, yet the underlying molecular mechanisms remain elusive. This study investigated the testicular proteome on postnatal day 28 (P28) to elucidate the infertility associated with Hnrnpk deficiency, identifying 791 proteins with altered expression: 256 were upregulated, and 535 were downregulated. Pathway enrichment analysis demonstrated that the downregulated proteins are primarily involved in spermatogenesis, fertilization, and piRNA metabolic processes. In Hnrnpk cKO mice, key proteins essential for p
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Aberrantly enhanced DNA damage repair contributes to therapy resistance and poor prognosis in nasopharyngeal carcinoma (NPC), but its regulatory mechanisms remain unclear. Stress granules (SGs) mediate tumor stress adaptation, yet their role in NPC DNA damage repair is unknown. Here, we show that SGs are significantly enriched in NPC cells under stress, and the SG core protein G3BP1 is highly expressed in NPC tissues (n = 111), correlating with metastasis and poor survival. Mechanistically, under stress, N-acetyltransferase 10 (NAT10)-catalyzed N4-acetylcytosine (ac4C) modification targets mRN
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Viruses continue to threaten global health, highlighting the urgent need for antiviral strategies with broad-spectrum activity. The nucleocapsid (N) protein undergoes liquid-liquid phase separation (LLPS), a conserved process essential for viral assembly. However, pharmacological targeting of this process remains largely unexplored.
PURPOSE: This study aimed to establish a high-content screening platform to discover small-molecule inhibitors of the conserved LLPS of the SARS-CoV-2 nucleocapsid protein and to evaluate their broad-spectrum antiviral activity and anti-inflammatory ef
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Cellular stress pathways that inhibit translation initiation lead to transient formation of cytoplasmic RNA/protein complexes known as stress granules. Many of the proteins found within stress granules and the dynamics of stress granule formation and dissolution are implicated in neurodegenerative disease. Whether stress granule formation is protective or harmful in neurodegenerative conditions is not known. To address this, we took advantage of the alphavirus protein nsP3, which selectively binds dimers of the central stress granule nucleator protein G3BP and markedly reduces stress granule f
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The mosquito-borne West Nile virus (WNV) causes a wide range of symptoms ranging from fever to the often fatal viral encephalitis. To date, no vaccine or drug therapy is available. The trypsin-like WNV NS2B-NS3 protease is deemed a plausible drug target and was shown to be inhibited by bovine pancreatic trypsin inhibitor (BPTI), a 58-residue protein isolated from bovine lung. Herein, we report a protein truncation study that resulted in a novel 14-residue cyclic peptide with equipotent inhibitory activity to native BPTI. We believe our truncation strategy can be further applied in the developm
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.