BACKGROUND: Bacterial plasmids often carry antibiotic resistance genes and are a significant factor in the spread of antibiotic resistance. … rt; two assemblers (Miniasm and Flye); BLAST searching; the detection of antibiotic resistance- and replicon genes and several plasmid visualizations. A user-friendly interface displays the main features of WeFaceNano and gives access to the analysis tools.
RESULTS: Publicly available ONT sequence data of 21 plasmids were used to validate WeFaceNano, with …
Оценочное исследованиеСтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Patients with inherited blood disorders (IBLD) have a high risk of hepatitis C virus (HCV) infection. The aim of this work was t … 2 subtype 2m relapsed. Subtype 2m naturally carries the NS5A L31M RAS. In a genotype 2a subgenomic replicon model, L31M increased daclatasvir effective concentration 50% (EC50) by 97-fold, but velpatasvir EC50 by only 3-fold, without altering the replication capacity. This patient was successfully retreated with sofosbuvir/velpatasvir for 12 weeks.
CONCL …
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Salmonella is the primary cause of community-acquired foodborne infections, so its resistance to antimicrobials, such as aminoglycosides, is … to serovar Indiana. The armA gene of these strains were all carried on plasmids, which spanned five replicon types with IncHI2 being the dominant plasmid type. All the armA-carrying plasmids were transferable into Escherichia coli and Acinetobacter baumannii recipients. The conjugation experiment results revealed that the armA-harboring S. Indiana strains …
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVES: To define characteristics of Klebsiella pneumoniae isolated from carriage and infections in mothers and their neonates belonging … d to investigate the genomic content of antimicrobial resistance genes, virulence genes and plasmid replicon types.
RESULTS: Five percent (n = 101) of mothers were K. pneumoniae positive. Of 251 collected K. pneumoniae isolates, 102 (40.6%) were from mothers and 149 (59.3%) were from neonates. A total of 49 (19.5%; all from infants except 1) isolates were …
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: We describe the molecular epidemiology and resistance patterns of blaOXA-48Klebsiella pneumoniae and Escherichia coli in Taiwan. … PFGE) and multilocus sequence typing (MLST). Plasmid incompatibility was determined using PCR-based replicon typing.
RESULTS: Forty-three blaOXA-48K. pneumoniae and two E. coli isolates were analyzed. The annual incidence of blaOXA-48K. pneumoniae isolates from 2012 to 2015 were 0%, 1.1%, 2.4%, and 7.6%, respectively. Forty-three (95.5%) of 45 isolates we …
СтатьяМногоцентровое исследованиеПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVES: Food animals have been recognised as an important reservoir of extended-spectrum β-lactamase-producing Escherichia coli (ESBL-Ec … y were used to find out for analysis of antimicrobial resistance genes, sequence type (ST), plasmid replicon type, serotype and phylogenetics.
RESULTS: Escherichia coli strain PK-1421 showed multiple drug resistance. The draft genome was calculated at 4 869 610 bp, comprising a total of 131 contigs with a G + C content of 50.6% and 4487 protein-coding seq …
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
We investigated the characteristics and persistence of Escherichia coli resistant to third-generation cephalosporins (3GCs) by early adminis … M-15 (three isolates), blaCMY-2 (five isolates), and blaTEM-1 (twenty-five isolates) genes. Plasmid replicon typing revealed that blaCTX-M-14, blaCTX-M-15, blaCMY-2, and blaTEM-1 were located on F, F and FIB, I1 and K, and I1 and FII, respectively. Furthermore, 18 isolates carried class 1 integrons, with four different gene cassettes. These results reveale …
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVES: Extended-spectrum β-lactamase/AmpC β-lactamase-producing Escherichia coli (ESBL/AmpC-E. coli) are common in developing countries … ravel events had ESBL-E. coli for 12 months. Multiplex PCR showed blaCTX-M-55 and blaCTX-M-27, with replicon types FIA and F, and FIB and F, respectively. PFGE showed that two travellers harboured a single clonal ESBL-E. coli strain for 12 months. By PFGE, the follow-up study showed that a single type of ESBL/AmpC-E. coli was only detected in individuals l …
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVES: The aim of this study was to characterise the molecular drivers of multidrug resistance in Proteus mirabilis isolated from Alger … amases (ESBLs), quinolone resistance and aminoglycoside-modifying enzymes (AMEs) as well as plasmid replicon typing were characterised by PCR. Clonal relationships were also determined by enterobacterial repetitive intergenic consensus PCR (ERIC-PCR) typing and were compared with MALDI-TOF/MS proteomic typing.
RESULTS: Of the 166 P. mirabilis isolates, 14 …
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVES: Colistin is regarded as one of the last-resort antimicrobials for severe infections. Isolates carrying the plasmid-borne mobile … A17, sul2, tet34 and tetA. plasmidSPAdes revealed that the mcr-1 gene was harboured by a plasmid of replicon type IncI2.
CONCLUSIONS: This study highlights the potential risk of spread of MCR-1-carrying, ESBL-producing E. coli in the community. The genome sequence of E. coli LX13 will facilitate the understanding of colistin resistance mechanisms and geno …
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVES: Carbapenemase-producing Escherichia coli are a major clinical concern. The current study aimed to identify NDM-5-producing E. co … ical methods. The presence of blaNDM and ESBL genes was determined by PCR and sequencing. PCR-based replicon typing was performed. Plasmid stability of all β-lactamase-producers and their transformants was analysed by serial passage, and the MIC creep phenomenon was analysed by studying revertants.
RESULTS: Among 34 blaNDM-5-positive E. coli isolates, 21 …
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Increasing rate of silent intestinal carriers with extended-spectrum betalactamase (ESBL)-producing Klebsiella pneumonia (ESBL-KP) has given … detection of ESBL, carbapenemase, and virulence factor genes. Conjugation experiments and PCR-based replicon typing were performed. Clonal relatedness was investigated by multilocus sequence typing (MLST) and multiple locus variable number tandem repeat analysis (MLVA). Out of a total of 120 RSs, 18.3% (22/120) ESBL-KP were isolated. The rate of blaCTXM-15 …
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
This study was performed to investigate the distribution of antimicrobial resistance genes and extra-intestinal virulence determinants in a … s in gyrA and parC genes were detected in four isolates and qnrS1 gene in two strains. Nine plasmid replicon types were detected; IncFIB (n=36) and IncI1 (n=7) were the most frequent ones. Isolates frequently belonged to phylogenetic groups A (51.1%) and D (27.5%). Extra-intestinal pathovar (n=38) occurred mainly in B2 phylogroup (P=0.0002). Amongst them, …
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Carbapenem-resistance among enterobacteriaceae has become a global health concern. The objective of this study was to understand NDM produci … isolates. The transfer of resistant markers was confirmed by conjugation experiment. The PCR-based replicon typing was carried out using DNA of transconjugants. These isolates carried NDM-1 (20.45%), NDM-4 (36.36%), NDM-5 (38.64%), NDM-7 (4.55%), along with OXA, CMY, and SHV variants on conjugative plasmid of IncFIA, IncFIC, IncF, IncK, IncFIB, IncB/O, In …
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Escherichia coli is one of the major pathogens causing urinary tract infections (UTIs) and pyometra in dogs. The aims of this study were to investigate canine E. coli isolates for the presence of class 1 and 2 integrons by PCR/sequencing and to characterize these isolates and their integron-carrying plasmids. Isolates were characterized by phylotyping, XbaI-macrorestriction analysis and plasmid transfer experiments. Plasmids were analyzed by S1 nuclease-PFGE, replicon typing, conjugation and restriction analysis. Antimicrobial resistance was investigated by antimicrobial susceptibility testing…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Extended-Spectrum Beta-Lactamase (ESBL)-producing bacteria are a common cause of healthcare and community-associated infections worldwide. T … rea were ESBL producers. Antibiotic resistance genes, multi locus sequence types (MLST) and plasmid replicon types in 24 selected isolates from both populations were identified with whole genome sequencing using Illumina MiSeq. Nine of eleven sequenced fish isolates had the blaCTX-M-15 gene whereas 12/13 from environment carried blaCTX-M-15. Antibiotic res …
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The objective of this study was to describe a hospital cluster of NDM-1-producing Enterobacter cloacae infections observed in the surgical i … r AmpC and the armA and rmtB aminoglycoside resistance genes. All strains were positive for the HI2 replicon, suggesting that an IncHI2 plasmid is likely the plasmid carrying the blaNDM-1 gene. Infection control measures were implemented after the first case although they were not effective in avoiding spread of this organism to other patients in the surgi …
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
UNLABELLED: Nucleocapsid formation is a primary function of the rubella virus capsid protein, which also promotes viral RNA synthesis via an unknown mechanism. The present study demonstrates that in infected cells, the capsid protein is associated with the nonstructural p150 protein via the short self-interacting N-terminal region of the capsid protein. Mutational analyses indicated that hydrophobic amino acids in this N-terminal region are essential for its N-terminal self-interaction, which is critical for the capsid-p150 association. An analysis based on a subgenomic replicon system demonst…
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVES: The global occurrence of antibiotic resistance genes in bacteria in water environments is an increasing concern. Treated wastewa … detected among 19 E. coli isolates, and 17 of the B2-O25b-ST131 isolates were positive for the FIA replicon and the afa/dra operon and had an IS26 element flanking bla(CTX-M-15). Seventeen of the B2-O25b-ST131 isolates showed closely related PFGE profiles (defined by 84% band similarity) and belonged to identical clonal groups.
CONCLUSIONS: The results h …
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Increasing resistance to quinolones, aminoglycosides, and/or cephamycins in extended-spectrum-β-lactamase (ESBL)-producing Enterobacteriacea … ISCR1 associated with armA, bla(DHA-1), and qnrB4 genes in the four transconjugants were identical. Replicon-type analysis revealed a FIIA plasmid among the four self-transferable plasmids, although the other three were nontypeable. The cotransfer of multiple resistance genes with the ISCR1 element-carrying plasmids has a clinical impact and warrants close …
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования