CRISPR/Cas12a has emerged as a powerful tool for nucleic acid detection; however, its clinical utility is severely hampered by intrinsic limitations in single-nucleotide variant (SNV) discrimination, reliance on pre-processed single-stranded DNA (ssDNA) templates, and cumbersome multi-step workflows. Here, we report a novel molecular design principle by engineering crRNAs with site-specific dual mismatches (positions 12 and 14 relative to the PAM), which we systematically demonstrate to drastically enhance the SNV discrimination capability of Cas12a. Leveraging this breakthrough, we developed
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
An effective strategy for accurately detecting single nucleotide variants (SNVs) is of great significance for genetic research and diagnostics. However, strict amplification conditions, complex experimental instruments, and specialized personnel are required to obtain a satisfactory tradeoff between sensitivity and selectivity for SNV discrimination. In this study, we present a CRISPR-based transistor biosensor for the rapid and highly selective detection of SNVs in viral RNA. By introducing a synthetic mismatch in the crRNA, the CRISPR-Cas13a protein can be engineered to capture the target SN
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
CHARGE syndrome is an autosomal dominant inherited disorder characterized by a specific and recognizable pattern of anomalies. De novo mutations or deletions of the gene encoding chromodomain helicase DNA binding protein 7 (CHD7) are the major cause of CHARGE syndrome. In this report, we describe a patient with a typical phenotype characterized by psychomotor retardation, hypertrichosis, facial asymmetry, synophria, failure to thrive, developmental delay and gastro-esophageal reflux, carrying a de novo 6.04Mb interstitial deletion in 8q12.1q12.3 detected by single nucleotide polymorphism (SNP)
Клинический случайСтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
DUF1220 domains show the largest human-lineage-specific increase in copy number of any protein-coding region in the human genome and map primarily to 1q21, where deletions and reciprocal duplications have been associated with microcephaly and macrocephaly, respectively. Given these findings and the high correlation between DUF1220 copy number and brain size across primate lineages (R(2) = 0.98; p = 1.8 × 10(-6)), DUF1220 sequences represent plausible candidates for underlying 1q21-associated brain-size pathologies. To investigate this possibility, we used specialized bioinformatics tools devel
СтатьяResearch Support, American Recovery and Reinvestment ActПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Array comparative genomic hybridization has led to the identification of new syndromes by identifying genomic imbalances not detectable by standard karyotyping methods and by allowing correlations with physical findings. Deletions in the 17p13.1 region have been reported in patients with dysmorphic features and developmental delay but a consistent phenotype has yet to emerge. This report describes two unrelated patients with a characteristic phenotype associated with overlapping de novo deletions in the distal region of 17p13.1 detected with array comparative genomic hybridization and confirme
Клинический случайСтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Chromosome interstitial deletion (i.e., deletion of a chromosome segment in a chromosome arm) is a critical genetic event for the inactivation of tumor suppressor genes and activation of oncogenes leading to the carcinogenic conversion of human cells. The deletion at chromosome 9p21 removing the p16 tumor suppressor gene is a genetic alteration frequently observed in a variety of human cancers. Thus, structural analyses of breakpoints for p16 deletions in several kinds of human cancers have been performed to elucidate the molecular process of chromosome interstitial deletion consisting of form
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Hereditary neuralgic amyotrophy (HNA) is an autosomal dominant recurrent neuropathy affecting the brachial plexus. HNA is triggered by environmental factors such as infection or parturition. We report three mutations in the gene septin 9 (SEPT9) in six families with HNA linked to chromosome 17q25. HNA is the first monogenetic disease caused by mutations in a gene of the septin family. Septins are implicated in formation of the cytoskeleton, cell division and tumorigenesis.
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПоддержка правительства СШАПоддержка службы здравоохранения СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Familial juvenile hyperuricemic nephropathy (FJHN) is an autosomal-dominant disease characterized by hyperuricemia of underexcretion type, gout, and chronic renal failure. We previously reported linkage on chromosome 16p12 in a large Japanese family designated as family 1 in the present study. Recent reports on the discovery of mutations of the uromodulin (UMOD) gene in families with FJHN encouraged us to screen UMOD mutations in Japanese families with FJHN, including family 1.
METHODS: Six unrelated Japanese families with FJHN were examined for mutations of the UMOD gene by direc
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The recognized urologic tumor spectrum in hereditary non-polyposis colon cancer includes ureteral and renal pelvis malignancies. Here, we report a family in which the proband, who had three metachronous adenocarcinomas of the colon and rectum (at ages 54, 57, and 60), presented with an adenocarcinoma of the prostate at age 61. Immunohistochemical (IHC) staining of colonic, rectal, and prostatic tumor tissues demonstrated lack of expression of both MSH2 and MSH6. Accordingly, microsatellite instability (MSI) was found in the rectal, colonic, and prostatic tumors. The kindred complies with the A
Клинический случайСтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Primary ciliary dyskinesia (PCD; MIM 242650) is an autosomal recessive disorder of ciliary dysfunction with extensive genetic heterogeneity. PCD is characterized by bronchiectasis and upper respiratory tract infections, and half of the patients with PCD have situs inversus (Kartagener syndrome). We characterized the transcript and the genomic organization of the axonemal heavy chain dynein type 11 (DNAH11) gene, the human homologue of murine Dnah11 or lrd, which is mutated in the iv/iv mouse model with situs inversus. To assess the role of DNAH11, which maps on chromosome 7p21, we searched for
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Substantial progress has been made regarding the molecular etiology of the dentin diseases dentinogenesis imperfecta types II and III, and dentin dysplasia type II. Genetic linkage studies have identified the critical loci for these diseases on human chromosome 4q21. Located within an overlapping segment of these disease loci is a dentin/bone gene cluster that includes osteopontin, bone sialoprotein, dentin matrix protein 1, dentin sialophosphoprotein, and a new gene MEPE also known as OF45, renamed osteoregulin. In this paper, we report the location of MEPE/OF45 in relationship to the other m
СтатьяПоддержка службы здравоохранения СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Rhp14 of Schizosaccharomyces pombe is homologous to human XPA and Saccharomyces cerevisiae Rad14, which act in nucleotide excision repair of DNA damages induced by ultraviolet light and chemical agents. Cells with disrupted rhp14 were highly sensitive to ultraviolet light, and epistasis analysis with swi10 (nucleotide excision repair) and rad2 (Uve1-dependent ultraviolet light damage repair pathway) revealed that Rhp14 is an important component of nucleotide excision repair for ultraviolet light-induced damages. Moreover, defective rhp14 caused instability of a GT repeat, similar to swi10 and
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The human gene for cartilage oligomeric matrix protein contains five tandem repeats of the GAC trinucleotide. Its expansion by one repeat causes multiple epiphyseal dysplasia, while expansion by two repeats or, remarkably, deletion of one repeat causes pseudoachondroplasia. Here we used CD spectroscopy, PAGE and UV absorption spectroscopy to compare conformational properties of the DNA strands containing four, five, six and seven repeats of the GAC trinucleotide. The (GAC)n strands were found to form four distinct ordered conformations, depending on the solution conditions. The first was a fol
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The adeno-associated virus type 2 (AAV-2) Rep78 and Rep68 proteins are required for replication of the virus as well as its site-specific integration into a unique site, called AAVS1, of human chromosome 19. Rep78 and Rep68 initiate replication by binding to a Rep binding site (RBS) contained in the AAV-2 inverted terminal repeats (ITRs) and then specifically nicking at a nearby site called the terminal resolution site (trs). Similarly, Rep78 and Rep68 are postulated to trigger the integration process by binding and nicking RBS and trs homologues present in AAVS1. However, Rep78 and Rep68 clea
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Three hundred million individuals are at risk of infection by schistosomes, and thousands die each year of severe hepatic disease. Previous studies have shown that the intensity of infection by Schistosoma mansoni in a Brazilian population is controlled by a major gene, denoted as SM1. We report here the full results of a genome-wide search that was performed on this population to localise SM1. Two hundred and forty-six microsatellites were used for the primary map, and only one region in 5q31-q33 provided significant evidence of linkage. SM1 was subsequently mapped to this region, which conta
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Moyamoya disease is characterized by bilateral stenosis and/or occlusion of the terminal portion of the internal carotid artery. Moyamoya disease is prevalent among patients <10 years of age. Although most cases appear to be sporadic, approximately 10% occur as familial cases. The incidence of familial cases has been increasing because noninvasive diagnostic equipment, such as magnetic-resonance imaging and magnetic-resonance angiography, can detect the disease in almost all affected patients, including asymptomatic patients, during screening studies. In this study, we performed a total genome
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Spontaneous hydrolytic deamination of 5-methylcytosine leads to T:G mismatches in double-stranded DNA and comprises a major threat for the integrity of both the DNA primary sequence as well as the epigenetic information stored in the DNA methylation pattern. Failure of the cellular DNA repair machinery to recognize and repair such mismatched nucleotides can lead to a mutator phenotype and subsequent carcinogenesis. A thymine-DNA glycosylase (TDG) has been described that initiates T:G mismatch repair by specifically excising the mismatched T. We have studied the TDG genomic locus and the expres
СтатьяПоддержка службы здравоохранения СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The Sanfilippo syndrome type B is a lysosomal storage disorder caused by deficiency of alpha-N-acetylglucosaminidase; it is characterized by profound mental deterioration in childhood and death in the second decade. For understanding the molecular genetics of the disease and for future development of DNA-based therapy, we have cloned the cDNA and gene encoding alpha-N-acetylglucosaminidase. Cloning started with purification of the bovine enzyme and use of a conserved oligonucleotide sequence to probe a human cDNA library. The cDNA sequence was found to encode a protein of 743 amino acids, with
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоддержка службы здравоохранения СШАПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Carbonic anhydrase V (CA V) is expressed in mitochondrial matrix in liver and several other tissues. It is of interest for its putative roles in providing bicarbonate to carbamoyl phosphate synthetase for ureagenesis and to pyruvate carboxylase for gluconeogenesis and its possible importance in explaining certain inherited metabolic disorders with hyperammonemia and hypoglycemia. Following the recent characterization of the cDNA for human CA V, we report the isolation of the human gene from two lambda genomic libraries and its characterization. The CA V gene (CA5) is approximately 50 kb long a
СтатьяПоддержка службы здравоохранения СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования