BACKGROUND: Alveolar capillary dysplasia with or without misalignment of the pulmonary veins (ACD/MPV) is a lethal congenital lung disorder … e search for potential therapeutic targets for ACD/MPV. To investigate the contribution of aberrant DNA methylation, genome wide methylation patterns of ACD/MPV lung tissues were compared with methylation patterns of control lung tissues using the recently developed technique Methylated DNA sequencing (MeD-seq).
RESULTS: Eight ACD/MPV lung tissue samples and thr …
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
This study aimed to evaluate tissue-associated circulating cell-free DNA (cfDNA) as indicators of radiotherapy-related effects and treatment-associated toxicity in prostate cancer. In addition, inter-individual variability in these markers and their responses to radiotherapy-induced cystitis and rectitis were investigated. The DNA methylation status of six tissue-associated genes representing the prostate (KLK3, TGM4), colon (MUC2, MS4A12), and bladder (UPK2, DHRS2) was analyzed in serum-derived cfDNA using methylation-sensitive melting curve analysis (MS-MCA). Five of the six analyzed genes d…
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Early hepatocellular carcinoma (HCC) remains difficult to diagnose because of its insidious and asymptomatic onset. Liquid biopsy provides a promising non-invasive approach for early tumor detection. 5-Hydroxymethylcytosine (5-hmC), the oxidation product of 5-methylcytosine (5-mC), has emerged as an informative epigenetic mark reflecting tumor-associated alterations during hepatocarcinogenesis. This study aimed to identify and validate a circulating cell-free DNA (cfDNA) 5-hmC-based signature for the early detection of HCC and to evaluate its diagnostic and prognostic potential.
M
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Placenta Accreta Spectrum (PAS) is a serious placental abnormality assosiated with significant maternal death during pregnancy. Due to its invasive characteristics resembling tumor growth, PAS is often associated with tumor-related proteins. While DNA methylation is known to regulate genes involved in development, its potential role in the development of PAS remains unclear. The aim of our study was to investigate the impact of PAS on DNA methylation and DNA methyltransferases (DNMTs). The groups were categorized into three groups: vaginal birth, cesarean delivery, and cesarean delivery with P…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Ascending aortic dilatation/aneurysm and dissection are life-threatening cardiovascular conditions. However, the epigenetic regulatory mechanisms within aortic cells underlying these pathologies remain poorly understood. This study aimed to identify differentially methylated genes (DMGs) in aortic tissues from patients with ascending aortic dilatation/aneurysm and dissection by performing a re-analysis of publicly available DNA methylation datasets. A re-analysis was conducted on three DNA methylation datasets (GSE50192, GSE202047, GSE84274) from the Illumina Infinium HumanMethylation450 BeadC…
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND AND HYPOTHESIS: SETD1A, a histone methyltransferase, is implicated in schizophrenia through rare loss-of-function mutations. While SETD1A regulates gene expression via histone H3K4 methylation, its influence on broader epigenetic dysregulation remains incompletely understood. We explored the hypothesis that SETD1A haploinsufficiency contributes to neurodevelopmental disruptions associated with schizophrenia risk via alterations in DNA methylation.
STUDY DESIGN: We profiled DNA methylation in the frontal cortex of Setd1a+/- mice across prenatal and postnatal development using Illumi…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Prenatal maternal stress is a common exposure implicated in childhood allergies. However, evidence for placental DNA methylation as a mediator is limited, with prior studies focusing narrowly on HPA-axis genes. This study aimed to examine the impact of prenatal maternal stress on offspring allergic diseases and placental DNA methylation's mediating role from an epigenome-wide perspective.
METHODS: Within the Shanghai Parent-Child Cohort (n = 3883 pairs), maternal stress and childhood allergic diseases were assessed via questionnaires and medical records. Latent class analysis iden…
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
INTRODUCTION: Primary Sclerosing Cholangitis (PSC) remains a significant challenge in hepatology with an unclear pathogenesis and limited treatment options. This study employed Mendelian Randomization (MR) to explore novel pathogenic mechanisms of PSC.
METHODS: We analyzed publicly available datasets, including cis-eQTL, cis-pQTL, 731 immune cell profiles, DNA methylation data, and PSC GWAS summary statistics. Using Inverse Variance Weighted (IVW) as our primary method, we identified genes causally associated with PSC. Subsequent mediation analyses elucidated how DNA methylation regulates gen…
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
DNA methylation, particularly 5-methylcytosine (5 mC), is a key epigenetic modification involved in the regulation of gene expression and genomic stability, and has emerged as a promising biomarker for early cancer screening and molecular stratification. CRISPR-Cas12a systems have been increasingly exploited to convert methylation-associated sequence information into detectable signals owing to their programmability and collateral cleavage-mediated signal amplification. However, many CRISPR-based assays remain constrained by the high background and relatively slow response kinetics of conventi…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: This study investigated DNA methylation-related changes in cows during early pregnancy and constructed gene pools associated with pregnancy. METHODS: We used peripheral blood samples from six healthy, productive, and similar cows 30 days post-insemination (Pre 30) and six non-pregnant cows (Ctrl), and performed association analysis using Reduced Representation Bisulfite Sequencing (RRBS) and transcriptomic sequencing methods. Targeted bisulfite sequencing (TBS) and quantitative real-time PCR (qRT-PCR) methods were used to identify differentially methylated genes. RESULTS: An obviou…
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Mental health conditions, including perinatal suicidality, remains a significant health burden representing a leading cause of maternal mortality in the United States. Although the etiology of perinatal suicidal ideation (SI) is not well understood, DNA methylation may provide meaningful mechanistic insights and/or serve as clinical biomarkers during the peripartum period. Using data provided by the Swedish BASIC cohort, we performed a retrospective analysis of DNA methylation changes associated with perinatal SI at three perinatal timepoints (17- and 38-weeks gestation and 8 weeks post-partum…
СтатьяПрепринтПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Epigenetic modifications to DNA are proposed to underpin plastic responses to environmental change, and the manner in which DNA methylation contributes to plasticity likely differs among tissues. However, few studies have investigated tissue-specific DNA methylation responses to ecologically relevant environmental stressors in natural settings. Here, we used reduced representation bisulfite sequencing to examine the influence of in situ microhabitats on DNA methylation in gill and foot of juvenile California mussels (Mytilus californianus), a foundation species with widespread dispersal and li…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
DNA methylation has long been regarded as a stable, maintenance-based epigenetic marker. However, this classical binary model struggles to fully explain the dynamic and situational dependence of methylation regulation at the multi-biological level. This review defines DNA methylation as a programmable information layer that systematically integrates the latest advances in three interrelated dimensions of molecular coding, disease status indication, and epigenomic engineering. At the molecular level, this paper describes how the chemical diversity of cytosine modification, the writing-erasing e…
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Cognitive reserve (CR) refers to differences in the adaptability of cognitive processes that modify the impact of Alzheimer's disease (AD) pathology on cognitive performance. Currently there are no established blood-based biomarkers of CR in prodromal AD. In this study, we operationalize CR as memory reserve, defined as moderation (attenuation) of the CSF pTau181-memory association. DNA methylation (DNAm) integrates genetic and environmental influences and may capture biological processes that mitigate the impact of AD pathology on memory. We aimed to identify blood DNAm loci that …
СтатьяПрепринтПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Fine particulate matter measuring less than 2.5 μm in diameter (PM(2.5)) is a significant risk factor for acute asthma episodes in children. … GPX4, leading to reduced GPX4 expression and promoting ferroptosis. Furthermore, the status of GPX4 DNA methylation was significantly associated with IL-6/8 levels in mild/moderate and severe childhood asthma patients. In conclusion, our research highlights the critical interplay between PM(2.5) exposure, DNA methylation, and ferroptosis in asthma exacerbation, p …
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Based on their ability to analyze methylation differences genome-wide in a large number of samples at a reasonable cost and time, microarrays were rapidly adopted by Alzheimer's disease (AD) researchers to isolate CpG sites with methylation levels that were changed in the blood of AD patients. However, concerns gradually arose about the reproducibility of these methylation markers. I attribute the cause to the lack of confirmation of methylation changes detected by DNA methylation arrays. Only by simply plotting an individual's methylation distribution can some false methylation differences be…
СтатьяОбзорПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Trimethylamine N-oxide (TMAO) and its related metabolites have been linked to cardiovascular disease (CVD), but their impact on DNA methylation remains unclear. Investigating these relationships may clarify the role of epigenetic mechanisms in diseases.
METHODS: This study analyzed data from 1,356 adults from the Cardiovascular Health Study (CHS) and the Multi-Ethnic Study of Atherosclerosis (MESA). Using stable-isotope dilution liquid chromatography with on-line electrospray ionization tandem mass spectrometry (LC-MS), we quantified TMAO and five related metabolites. DNA methylat…
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Differentiating benign prostatic hyperplasia (BPH) from prostate cancer (PCa) remains a diagnostic challenge due to overlapping clinical features and the limited specificity of prostate-specific antigen (PSA) testing. Recent studies highlight the promise of DNA methylation patterns in cell-free DNA (cfDNA) as non-invasive biomarkers for prostate disease stratification. This study aimed to develop a targeted methylation-based diagnostic model capable of distinguishing PCa from BPH using cfDNA. We hypothesized that specific genomic regions exhibit consistent hyper- or hypomethylation…
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Stress has been negatively associated with reproductive outcomes, including poor semen quality in men; however, the molecular mechanisms underlying these associations remain poorly understood.
OBJECTIVES: This study aimed to evaluate the association between perceived stress and sperm DNA methylation patterns in men undergoing infertility treatment.
MATERIALS AND METHODS: The study was conducted on 169 men attending the Massachusetts General Hospital Fertility Clinic who provided a semen sample and completed the short version of the Cohen Perceived Stress Scale (PSS-4) to quantify…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Early-onset preeclampsia (EOPE) is a pregnancy disorder characterized by abnormal placental development and substantial maternal and fetal risk. DNA methylation at CpG sites has emerged as a key epigenetic mechanism in EOPE. In this study, we developed machine learning models for EOPE classification using β-values from CpG sites in placental tissue. Starting from 599 EOPE-associated CpG sites reported earlier, we used attribute selection in WEKA to identify 30 statistically significant descriptors, which mapped to 19 unique genes. Multiple classifiers were trained and evaluated, and the SPegas…
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования