BACKGROUND: The relationship between aging and epigenetic profiles has been highlighted in many recent studies. Models using somatic cell methylomes to predict age have been successfully constructed. However, gamete aging is quite distinct and as such age prediction using sperm methylomes is ineffective with current techniques.
RESULTS: We have produced a model that utilizes human sperm DNA methylation signatures to predict chronological age by utilizing methylation array data from a total of 329 samples. The dataset used for model construction includes infertile patients, sperm donors, and i…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
To elucidate molecular mechanisms responsible for the sexually dimorphic phenotype of soluble epoxide hydrolase (sEH) expression, we tested the hypothesis that female-specific down-regulation of sEH expression is driven by estrogen-dependent methylation of the Ephx2 gene. Mesenteric arteries isolated from male, female, ovariectomized female (OV), and OV with estrogen replacement (OVE) mice, as well as the human cell line (HEK293T) were used. Methylation-specific PCR and bisulfite genomic sequencing analysis indicate significant increases in DNA/CG methylation in vessels of female and OVE compa…
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Offspring of persons exposed to childhood abuse are at higher risk of neurodevelopmental and physical health disparities across the life course. Animal experiments have indicated that paternal environmental stressors can affect sperm DNA methylation and gene expression in an offspring. Childhood abuse has been associated with epigenetic marks in human blood, saliva, and brain tissue, with statistically significant methylation differences ranging widely. However, no studies have examined the association of childhood abuse with DNA methylation in gametes. We examined the association of childhood…
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
AIM: To investigate the DNA methylation profiles of immune response-related genes in apical periodontitis (AP) lesions.
METHODOLOGY: The methylation profiles on the cytosine-phosphate-guanine (CpG) regions of 22 gene promoters involved in inflammation and autoimmunity were assessed in 60 human AP lesions and 24 healthy periodontal ligaments (controls) using a pathway-specific real-time polymerase chain reaction array (EpiTect® Methyl Signature PCR Array Human Inflammatory Response). Differentially methylated genes were subsequently assessed for their mRNA expression. Data analyses (One-way an…
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: The gene of pituitary homeobox 1 (PITX1) has been reported to be down-regulated in adolescent idiopathic scoliosis (AIS), of which the cause has not been well addressed. The abnormal DNA methylation was recently assumed to be an important mechanism for the down-regulated genes expression. However, the association between PITX1 promoter methylation and the etiology of AIS was not clear.
METHODS: The peripheral blood samples of 50 AIS patients and 50 healthy controls were collected and the genomic DNA was extracted. The pyrosequencing assay was used to assess the methylation status …
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVES: Aberrant methylation of promoter CpG islands (CGIs) of tumour suppressor genes is a common epigenetic mechanism underlying cancer pathogenesis. The methylation patterns of thymic tumours have not been studied in detail since such tumours are rare. Herein, we sought to identify genes that could serve as epigenetic targets for thymic neuroendocrine tumour (NET) therapy.
MATERIALS AND METHODS: Genome-wide screening for aberrantly methylated CGIs was performed in three NET samples, seven thymic carcinoma (TC) samples, and eight type-B3 thymoma samples. The methylation status of thymic…
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The placenta relies on phenotypes that are characteristic of cancer to successfully implant the embryo in the uterus during early pregnancy. Notably, it has to invade its host tissues, promote angiogenesis-while surviving hypoxia-, and escape the immune system. Similarities in DNA methylation patterns between the placenta and cancers suggest that common epigenetic mechanisms may be involved in regulating these behaviors. We show here that megabase-scale patterns of hypomethylation distinguish first from third trimester chorionic villi in the placenta, and that these patterns mirror those that …
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
By means of functional genomics analysis, we recently described the mRNA expression profiles of various genes involved in the neuroinflammatory response in the brains of subjects with late-onset Alzheimer Disease (LOAD). Some of these genes, namely interleukin (IL)-1β and IL-6, showed distinct expression profiles with peak expression during the first stages of the disease and control-like levels at later stages. IL-1β and IL-6 genes are modulated by DNA methylation in different chronic and degenerative diseases; it is also well known that LOAD may have an epigenetic basis. Indeed, we and other…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: The GSK3β has been associated to pathological functions in neurodegenerative diseases. This kinase is involved in hyperphosphory … atients (AD patients both at Braak stages I-II and at stages V-VI) , allowed us to characterize the methylation pattern of a putative CpG islands in human GSK3β 5'- flanking region.
RESULTS: The analysis evidenced overall hypomethylation of CpG and non-CpG cytosine residues both in cells and in human brain (AD patients and control subjects). We found that GS …
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Background: Acute myeloid leukemia (AML) is a heterogeneous clonal disorder characterized by immature myeloid cell proliferation and bone marrow failure. Various genetic and epigenetic factors have been found to be influential in such patients. Methylation silencing of APAF-1, a putative tumor suppressor gene (TSG), has been found in several human malignancies. In this study, we explored the association of APAF-1 methylation status with AML patients. Materials and Methods: We studied the methylation status of APAF-1 gene in 101 AML patients and 50 healthy subjects as controls. Genomic DNA was …
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Cytosine modifications, including DNA methylation, are stable epigenetic marks that may translate environmental change into transcriptional regulation. Research has begun to investigate DNA methylation dynamics in relation to cocaine use disorders. Specifically, DNA methylation machinery, including methyltransferases and binding proteins, are dysregulated in brain reward pathways after chronic cocaine exposure. In addition, numerous methylome-wide and candidate promoter studies have identified differential methylation, at the nucleotide level, in rodent models of cocaine abuse and drug seeking…
СтатьяОбзорПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The objective of this paper is to study the global DNA Methylation in monozygotic (MZ) twins with cerebral palsy. Two pairs of twins (a cerebral palsy children, a normal child) admitted to the First Affiliated Hospital of Zhengzhou University were selected as subjects. The phenol-chloroform method was used to extract DNA from venous blood and micro satellite DNA genotyping technique was used to identify the eggs of the twins. DNA methylation fragments were enriched by MBD affinity column chromatography, followed by Solexa sequencing and bioinformatics analysis. In this study, we found that the…
СтатьяTwin StudyПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Latency is a hallmark of all herpesviruses, during which the viral genomes are silenced through DNA methylation and suppressive histone modifications. When latent herpesviruses reactivate to undergo productive lytic replication, the suppressive epigenetic marks are replaced with active ones to allow for transcription of viral genes. Interestingly, by using Kaposi's sarcoma-associated herpesvirus (KSHV) as a model, we recently demonstrated that the newly transcribed viral RNAs are also subjected to post-transcriptional N6-adenosine methylation (m6A). Blockade of this post-transcriptional event …
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Thymomas are uncommon neoplasms that arise from epithelial cells of the thymus and are often associated with myasthenia gravis (MG), an autoimmune disease characterized by autoantibodies directed to different targets at the neuromuscular junction. Little is known, however, concerning epigenetic changes occurring in thymomas from MG individuals. To further address this issue, we analyzed DNA methylation levels of genes involved in one-carbon metabolism (MTHFR) and DNA methylation (DNMT1, DNMT3A, and DNMT3B) in blood, tumor tissue, and healthy thymic epithelial cells from MG patients that underw…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Oxidative stress has been related to type 2 diabetes (T2D) and cardiovascular disease (CVD), the leading global cause of death. Contributions of environmental factors such as oxidative stress on complex traits and disease may be partly mediated through changes in epigenetic marks (e.g. DNA methylation). Studies relating differential methylation with intermediate phenotypes and disease endpoints may be useful in identifying additional candidate genes and mechanisms involved in disease.
METHODS: To investigate the role of epigenetic variation in oxidative stress marker levels and su…
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVES: Patients with anorexia nervosa (AN) are ideally suited to identify differentially methylated genes in response to starvation.
METHODS: We examined high-throughput DNA methylation derived from whole blood of 47 females with AN, 47 lean females without AN and 100 population-based females to compare AN with both controls. To account for different cell type compositions, we applied two reference-free methods (FastLMM-EWASher, RefFreeEWAS) and searched for consensus CpG sites identified by both methods. We used a validation sample of five monozygotic AN-discordant twin pairs.
RESULTS:…
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАTwin StudyПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Rett syndrome is a severe neurodevelopmental disorder caused by mutations in the methyl-CpG binding protein gene (MECP2). MeCP2 is a methyl- … mCG within gene bodies appears to be the primary driver of gene repression by MeCP2. Disruption of methylation at CA sites within the brain results in depletion of MeCP2 across genes that normally contain a high density of gene-body mCA. We further find that the degree of gene repression by MeCP2 is proportional to the total number of methylated cytosine MeC …
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVES: Atypical antipsychotics (AAPs) carry a significant risk of cardiometabolic side effects, including insulin resistance. It is thought that the insulin resistance resulting from the use of AAPs may be associated with changes in DNA methylation. We aimed to identify and validate a candidate gene associated with AAP-induced insulin resistance by using a multi-step approach that included an epigenome-wide association study (EWAS) and validation with site-specific methylation and metabolomics data.
METHODS: Subjects with bipolar disorder treated with AAPs or lithium monotherapy were rec…
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Loss-of-function mutations in the cytosine-5 RNA methylase NSUN2 cause neurodevelopmental disorders in humans, yet the underlying cellular processes leading to the symptoms that include microcephaly remain unclear. Here, we show that NSUN2 is expressed in early neuroepithelial progenitors of the developing human brain, and its expression is gradually reduced during differentiation of human neuroepithelial stem (NES) cells in vitro. In the developing Nsun2-/- mouse cerebral cortex, intermediate progenitors accumulate and upper-layer neurons decrease. Loss of NSUN2-mediated methylation of tRNA i…
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Much of the toxic methylmercury (MeHg) that biomagnifies in the aquatic food chain and accumulates in fish and seafood is believed to originate from microbial methylation of inorganic Hg(+2) in anoxic sediments. We examined the effect amending wetland sediments with activated carbon and biochar on Hg methylation potentials using microcosms and Hg stable isotope tracers. The inorganic (200)Hg(+2) spike was methylated at ~0.37 %/day in the untreated sediment, but that rate decreased to <0.08 %/day for the amended sediments, with 80 % and 88 % reductions in methylation rates for activated carbon …
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования