Vibrio cholerae cytolysin (VCC) is a potent membrane-damaging cytolytic toxin that belongs to the family of β barrel pore-forming protein toxins. VCC induces lysis of its target eukaryotic cells by forming transmembrane oligomeric β barrel pores. The mechanism of membrane pore formation by VCC follows the overall scheme of the archetypical β barrel pore-forming protein toxin mode of action, in which the water-soluble monomeric form of the toxin first binds to the target cell membrane, then assembles into a prepore oligomeric intermediate, and finally converts into the functional transmembrane
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The hydrolysis of ATP associated with actin and profilin-actin polymerization is pivotal in cell motility. It is at the origin of treadmilling of actin filaments and controls their dynamics and mechanical properties, as well as their interactions with regulatory proteins. The slow release of inorganic phosphate (Pi) that follows rapid cleavage of ATP gamma phosphate is linked to an increase in the rate of filament disassembly. The mechanism of Pi release in actin filaments has remained elusive for over 20 years. Here, we developed a microfluidic setup to accurately monitor the depolymerization
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Candidate von Willebrand factor (VWF) mutations were identified in 70% of index cases in the European study 'Molecular and Clinical Markers for the Diagnosis and Management of type 1 von Willebrand Disease'. The majority of these were missense mutations.
OBJECTIVES: To assess whether 14 representative missense mutations are the cause of the phenotype observed in the patients and to examine their mode of pathogenicity.
METHODS: Transfection experiments were performed with full-length wild-type or mutant VWF cDNA for these 14 missense mutations. VWF antigen levels were measured, an
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
For the first time, the structure of a catalytic inactive phospholipase A(2) homolog (Lys49-PLA(2)s) complexed with p-bromophenacyl bromide (BPB) has been solved by X-ray crystallography. Lys49-PLA(2)s are among the main components of Viperidae snake venoms, causing myonecrosis and other actions despite their catalytic inactivity. BPB, a classic inhibitor of catalytic-active PLA(2)s, has been used since the 1970s because it binds specifically the His48 residue of the catalytic site. Curiously, when Lys49-PLA(2) is chemically modified by BPB, it causes a partial inhibition of the myotoxic funct
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
We identified small-molecule dimer disruptors that inhibit an essential dimeric protease of human Kaposi's sarcoma-associated herpesvirus (KSHV) by screening an alpha-helical mimetic library. Next, we synthesized a second generation of low-micromolar inhibitors with improved potency and solubility. Complementary methods including size exclusion chromatography and 1H-13C HSQC titration using selectively labeled 13C-Met samples revealed that monomeric protease is enriched in the presence of inhibitor. 1H-15N HSQC titration studies mapped the inhibitor binding site to the dimer interface, and mut
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The age-dependence of the incidence of magnocellular neurosecretory neurons containing abnormal accumulations of peptide in the rough endoplasmic reticulum was examined in homozygous Brattleboro rats and in their wild-type Long Evans counterparts. Neurons in which the immunophenotype of the peptide aggregates indicate that somatic cross-over mutations involving the 5' end of the vasopressin gene and the 3' end of the oxytocin gene have occurred, increased with age in homozygous Brattleboro rats, reaching a maximum of 24 cells per hypothalamus (approximately 0.6% of the vasopressin neurons). Th
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Cholera toxin, an 84-kDa multimeric protein and a major virulence factor of Vibrio cholerae, uses the ADP-ribosyltransferase activity of its A subunit to intoxicate host cells. ADP-ribosylation is a posttranslational modification of proteins, in which the ADP-ribose moiety of NAD+ is transferred to an acceptor. In mammalian cells, ADP-ribosylation of acceptors appears to be reversible. ADP-ribosyltransferases (ARTs) catalyze the modification of acceptor proteins, and ADP-ribose-acceptor hydrolases (ARHs) cleave the ADP-ribose-acceptor bond. ARH1 specifically cleaves the ADP-ribose-arginine bon
СтатьяResearch Support, N.I.H., IntramuralПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Class I MHC peptide (MHC-Ip) multimers are well-established reagents that detect antigen-specific T cells. The classical method for production of MHC-Ip multimers begins with the expression of MHC heavy chains (HCs) and β2-microglobulin (β2m) subunits as inclusion bodies in Escherichia coli and is followed by denaturant solubilization, in vitro folding in the presence of a defined peptide ligand, and purification by size exclusion chromatography. This protocol is labor intensive, difficult to scale, and represents a significant bottleneck in application of the technology. Herein, we present a
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Several peptides derived from the SARS-CoV-2 spike protein (S-protein) are amyloidogenic, suggesting a potential role in COVID-19 disease-associated pathogenesis. Many disease-related amyloids form a variety of intermediate oligomeric aggregates and directly damage lipid membranes. Gain of toxic function is commonly observed for oligomeric and fibrillar aggregates of amyloid peptides. Therefore, the ability of four S-protein-derived peptides (s192, s258, s601, and s1166) to form oligomers and fibrils was investigated. Additionally, their ability to bind and damage lipid membranes was also dete
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Alzheimer's disease (AD) is a progressive neurodegenerative disorder characterized by the pathological aggregation of amyloid-beta (Aβ) peptides, particularly Aβ-42, which plays a central role in disease progression. Soluble Aβ dimers have been implicated as the primary neurotoxic species contributing to synaptic dysfunction and cognitive impairment. In this study, we employ a comprehensive computational framework integrating molecular dynamics (MD) simulations, neural relational inference (NRI) modeling, and largest Lyapunov exponent (LLE) analysis to elucidate the molecular mechanisms underl
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Isolated atrial amyloidosis (IAA) is a localized cardiac disorder characterized by atrial natriuretic peptide (ANP) amyloids deposition in the atria, linked to aging and atrial fibrillation (AF). While monomeric ANP regulates blood pressure, its dimeric form is associated with cardiovascular conditions, including AF. The mechanistic link between ANP aggregation, IAA, and AF remains unclear. Here, we present the first high-resolution structural characterization of ANP fibrils extracted from AF patients, revealing two distinct fibril polymorphs. Both present covalent ANP dimers as building block
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The molecular approach to understanding the mechanisms of emerging diseases, like COVID-19, has largely accelerated the search for successful therapeutical strategies. In this work, we present an extensive molecular dynamics (MD) analysis of two forms of the SARS-CoV-2 main protease MPro. We analyzed the free form (apo) and compared the results with those coming from the (holo) form bound to the inhibitor Boceprevir, an FDA-approved drug repurposed for COVID-19 therapy. We applied Dynamic Cross Correlation (DCC) analysis to the MD simulations to trace the concerted motion patterns within the p
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Spinal and bulbar muscular atrophy (SBMA) is a neuromuscular degenerative disease caused by a polyglutamine expansion in the androgen receptor (AR). This mutation causes AR to misfold and aggregate, contributing to toxicity in and degeneration of motor neurons and skeletal muscle. There is currently no effective treatment or cure for this disease. The role of an interdomain interaction between the amino- and carboxyl-termini of AR, termed the N/C interaction, has been previously identified as a component of androgen receptor-induced toxicity in cell and mouse models of SBMA. However, the mecha
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Misfolding and aggregation of α-Synuclein (α-Syn), which are hallmark pathological features of neurodegenerative diseases such as Parkinson's disease (PD) and dementia with Lewy Bodies, continue to be significant areas of research. Among the diverse forms of α-Syn - monomer, oligomer, and fibril, the oligomer is considered the most toxic. However, the mechanisms governing α-Syn oligomerization are not yet fully understood. In this study, we utilized genome-wide CRISPR/Cas9 loss-of-function screening in human HEK293 cells to identify negative regulators of α-Syn oligomerization. We found that t
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Metal-targeting drugs are being widely explored as a possible treatment for Alzheimer's disease, but most of these ligands are developed to coordinate Cu(ii). In a previous communication (E. Atrián-Blasco, E. Cerrada, A. Conte-Daban, D. Testemale, P. Faller, M. Laguna and C. Hureau, Metallomics, 2015, 7, 1229-1232) we showed another strategy where Cu(i) was targeted with the PTA (1,3,5-triaza-7-phosphaadamantane) ligand that is able to target Cu(ii) as well, reduce it and keep it in a safe complexed species. Removal of Cu(ii) from the amyloid-β peptide prevents the stabilization of oligomers a
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Despite the numerous techniques developed for the studying nanoparticle and peptide interaction nowadays, sensitive and convenient assay in the process of flow, especially to simulate the self-assembly of quantum dots (QDs) and peptide inflow in blood vessels, still remains big challenges. Here, we report a novel assay for studying the self-assembly of QDs and peptide, based on CE using a bending capillary. We demonstrate that the semicircles numbers of the bending capillary affect the self-assembly kinetics of CdSe/ZnS QDs and ATTO-D3 LVPRGSGP9 G2 H6 peptide. Moreover, benefitting from this n
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The translocase of the outer mitochondrial membrane (TOM) complex is the entry gate for mitochondrial proteins synthesized in the cytosol. Previous biochemical studies indicated that the TOM complex functions as a trimer and exists in a dynamic equilibrium with a Tom22-lacking dimer in intact mitochondria. In contrast, recent cryo-electron microscopy (cryo-EM) studies revealed near-atomic structures of the Tom22-containing core dimer. However, the relationship between the core dimer and the functional trimer remains unclear. Here, we analyzed the oligomeric organization and structural properti
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The aromatic hydrocarbon (Ah) receptor is a cytosolic protein that binds halogenated ligands such as 2,3,7,8-tetrachlorodibenzo-p-dioxin (TCDD) and nonhalogenated ligands such as 3-methylcholanthrene (MC) and benzo[a]pyrene. The best characterized biological response mediated by the Ah receptor is induction of cytochrome P4501A1 (CYP1A1). Photoaffinity labeling of the Ah receptor has been reported only with halogenated ligands such as TCDD and some of its iodinated derivatives. In this study, photolabeling of the Ah receptor was achieved with the nonhalogenated aromatic hydrocarbon [3H]MC. Sou
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The dimerization of BRAF with CRAF is a critical regulatory mechanism within the MAPK/ERK signaling cascade, and its disruption by mutations in the BRAF kinase domain contributes to tumorigenesis across various cancers. While wild-type BRAF depends on RAS-mediated dimerization for activation, oncogenic mutations alter this dependency, impacting structural conformation, ATP/drug binding, and downstream signaling. Despite extensive functional data, the structural and biophysical consequences of these mutations remain poorly defined. Here, we examine five BRAF mutations oncogenic (V600E, G469E, D
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Vangl is a planar cell polarity (PCP) core protein essential for aligned cell orientation along the epithelial plane perpendicular to the apical-basal direction, which is important for tissue morphogenesis, development and collective cell behavior. Mutations in Vangl are associated with developmental defects, including neural tube defects (NTDs), according to human cohort studies of sporadic and familial cases. The complex mechanisms underlying Vangl-mediated PCP signaling or Vangl-associated human congenital diseases have been hampered by the lack of molecular characterizations of Vangl. Here
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования