MN1::BEND2 fusion is well established in CNS tumors but exceptionally rare in extracranial mesenchymal neoplasms. We report a subcutaneous upper-back tumor in a 41-year-old woman, composed of bland round-to-epithelioid cells with branching capillary vasculature and focal infiltrative growth. The tumor recurred 42 months after excision. Targeted RNA sequencing identified an in-frame MN1 exon 1::BEND2 exon 9 fusion, supported by Sanger sequencing and MN1 break-apart FISH; Nuclear BEND2 immunoreactivity was an ancillary finding. Unlike two previously reported extracranial MN1::BEND2-harboring tum
СтатьяКлинический случайПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Homeostatic macrophages maintain tissue health and resolve inflammation. Upon sustained exposure to type II cytokine IL4, transcription factors STAT6, KLF4, EGR2 and a ligand-regulated nuclear receptor PPARγ orchestrate the M2IL4 'polarization', marked by enhancer RNA (eRNA) production near multiple M2 genes. The mechanisms of enhancer activation by unliganded PPARγ are poorly understood. We interrogated cofactor requirements for PPARγ-driven gene expression in M2IL4, including those lacking PPARγ or a ligand-dependent nuclear receptor coregulator NCoA2/GRIP1 vs. macrophages treated with the P
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Ultraviolet-B radiation is a major environmental factor contributing to the development of cutaneous squamous cell carcinoma (cSCC). In our previous study, we found that UVB exposure induces the expression of the long non-coding RNA (lncRNA) MALAT1 in HaCaT cells, and that MALAT1 promotes cSCC progression. In the present study, we observed that MALAT1 regulates the expression of the nuclear transporter protein Importin 7 (IPO7) in human cSCC. Both in vitro and in vivo experiments showed that IPO7 plays a pro-tumorigenic role in cSCC by promoting cell proliferation, migration, and invasion, and
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Heat stress destabilizes chloroplast function and frequently leads to leaf chlorosis in crops, yet the genetic mechanisms linking chloroplast integrity to nuclear stress responses remain poorly defined. Here, we identify CsANU10, encoding a chloroplast-localized homolog of Arabidopsis ANGULATA10, as a key regulator of thermosensitive chloroplast stability in cucumber. A recessive missense mutation in CsANU10 causes temperature-dependent and largely irreversible chlorosis accompanied by enlarged and structurally disorganized chloroplasts. Under heat stress, CsANU10 deficiency accelerates chloro
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
KANSL2 is a subunit of the non-specific lethal (NSL) chromatin-modifying complex associated with glioblastoma (GBM) progression, but the intrinsic role of KANSL2 in GBM cells is poorly understood. By analyzing TCGA-GBM and GTEx datasets, we found that KANSL2 is upregulated in GBM and positively correlates with genes involved in ribosome biogenesis. Immunofluorescence and cell cycle analyses reveal a dynamic nuclear distribution, with KANSL2 becoming enriched in nucleoli mainly during G1/early S and G2 phases. Overexpression of KANSL2 increases 45S pre-rRNA and 28S rRNA levels, whereas its sile
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The mechanisms underlying molecular targeting to mitochondria remain enigmatic, yet this process is crucial for normal cellular function. The RNA-binding proteins U2AF1 and U2AF2 form a heterodimer (U2AF) that shuttles between the nucleus and cytoplasm, regulating splicing in the nucleus and translation in the cytoplasm. Our study in human bronchial epithelial cells (HBECs) identifies an unexpected role for U2AF in mitochondrial function. We demonstrate that U2AF interacts with nuclear-encoded mitochondrial (NE-mt) mRNAs and proteins, inhibits translation, localizes to the mitochondria, and re
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Parkinson's disease (PD) is commonly associated with dysfunctional mitochondrial homeostasis. PINK1, a S/T kinase mutated in early-onset PD, generates phosphoserine 65 ubiquitin (pS65Ub) on damaged mitochondria facilitating their removal. Here, we show that pS65Ub translocates into the nucleus after generation at damaged mitochondria and is directly attached to substrates by resident E3 ligases. Histone H2A is a major substrate and is modified at lysine 119 (H2AK119) by the polycomb silencer, E3 ligase RING1B. At nucleosomes, pS65Ub simultaneously suppresses RING1B and potentiates H2A deubiqui
СтатьяПрепринтПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Long terminal repeat (LTR) retrotransposons belong to the transposable elements (TEs), autonomously replicating genetic elements that integrate into the host's genome. Among animals, Drosophila melanogaster serves as an important model organism for TE research and contains several LTR retrotransposons, including the Ty1-copia family, which is evolutionarily related to retroviruses and forms virus-like particles (VLPs). In this study, we use cryo-focused ion beam (FIB) milling and lift-out approaches to visualize copia VLPs in ovarian cells and intact egg chambers, resolving the in situ copia c
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Osteoporosis is a common skeletal disease that results in an increased risk of fractures. However, there is no definitive cure, warranting the development of potential therapeutic agents. 3'-Sialyllactose (3'-SL) in human milk regulates many biological functions. However, its effect on bone metabolism remains unknown. This study aimed to investigate the molecular mechanisms underlying the effect of 3'-SL on bone homeostasis. Treatment of human bone marrow stromal cells (hBMSCs) with 3'-SL enhanced osteogenic differentiation and inhibited adipogenic differentiation of hBMSCs. RNA sequencing sho
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Transcriptional changes in Rett syndrome (RTT) are assumed to directly correlate with steady-state mRNA levels, but limited evidence in mice suggests that changes in transcription can be compensated by post-transcriptional regulation. We measure transcription rate and mRNA half-life changes in RTT patient neurons using RATEseq, and re-interpret nuclear and whole-cell RNAseq from Mecp2 mice. Genes are dysregulated by changing transcription rate or half-life and are buffered when both change. We utilized classifier models to predict the direction of transcription rate changes and find that combi
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Progesterone withdrawal signals labor in mammals. Elevated intracellular metabolism contributes to progesterone functional withdrawal through unknown mechanism, which is thought to act via progesterone receptor (PR). This study aims to investigate molecular mechanisms underlying progesterone withdrawal during pregnancy and labor. We investigated the role of 5α-reductase type I (SRD5A1) in enzymatic catalysis of progesterone and loss of PR function in a human trophoblast choriocarcinoma cell line JEG3. The PR isoform B (PR-B) was robustly expressed in JEG3 cells. The SRD5A1 small-interfering RN
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Formation of intracellular aggregates is the hallmark of polyglutamine (polyQ) diseases. We analyzed the components of purified nuclear polyQ aggregates by mass spectrometry. As a result, we found that the RNA-binding protein translocated in liposarcoma (TLS) was one of the major components of nuclear polyQ aggregate-interacting proteins in a Huntington disease cell model and was also associated with neuronal intranuclear inclusions of polyQ diseases. In vitro study revealed that TLS could directly bind to truncated N-terminal huntingtin (tNhtt) aggregates but could not bind to monomer, indica
Аннотация на английскомСтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Human cytomegalovirus encodes a number of phosphorylation-regulated proteins, including the autophosphorylating protein kinase pUL97 and the nuclear mRNA export factor pUL69. Recently, it was reported that the kinase inhibitor roscovitine induces an intranuclear aggregation of pUL69 in infected fibroblasts. Here, we demonstrate that pUL97-specific kinase inhibitors induce a similar pUL69 aggregation. Furthermore, a direct pUL69-pUL97 interaction was demonstrated by coimmunoprecipitation analyses. Deletion mapping identified the domains required for interaction in both proteins (1-140/478-532 i
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Mitochondria are the only organelles containing metabolically active DNA besides nuclei. By analogy with the nuclear topoisomerases, mitochondrial topoisomerase activities are probably critical for maintaining the topology of mitochondrial DNA during replication, transcription, and repair. Mitochondrial diseases include a wide range of defects including neurodegeneracies, myopathies, metabolic abnormalities and premature aging. Vertebrates only have one known specific mitochondrial topoisomerase gene (TOP1mt), coding for a type IB topoisomerase. Like the mitochondrial DNA and RNA polymerase, t
СтатьяResearch Support, N.I.H., IntramuralОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein B1, an RNA-binding protein required for mRNA maturation, reportedly is overexpressed in early lung cancer and in several other tumors, including precancerous lesions. Expression of the protein was assessed immunohistochemically in 39 specimens of malignant mesothelioma and five of non-neoplastic pleura, and by flow cytometry in a human epithelioid mesothelioma cell line. No tumor showed overexpression, but 29 of 39 cases showed modest expression. Patients whose tumors showed expression had significantly better survival rates than others. Epithelioid tumo
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Somatic cell nuclear transfer embryos exhibit extensive epigenetic abnormalities, including aberrant methylation and abnormal imprinted gene expression. In this study, a thorough analysis of X chromosome inactivation (XCI) was performed in both preimplantation and postimplantation nuclear transfer embryos. Cloned blastocysts reactivated the inactive somatic X chromosome, possibly in a gradient fashion. Analysis of XCI by Xist RNA and Eed protein localization revealed heterogeneity within cloned embryos, with some cells successfully inactivating an X chromosome and others failing to do so. Addi
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПоддержка службы здравоохранения СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The promyelocytic leukemia protein (PML) forms nuclear bodies which are altered in some disease conditions. We report that the cytoplasmic RNA virus lymphocytic choriomeningitis virus (LCMV) influences the distribution of PML bodies. In cells infected with LCMV, the Z protein and PML form large bodies primarily in the cytoplasm. Transient transfection studies indicate that Z alone is sufficient to redistribute PML to the cytoplasm and that PML and Z colocalize. Coimmunoprecipitation studies show specific interaction between PML and Z proteins. A similar result was observed with a Z protein fro
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоддержка службы здравоохранения СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
We have investigated the process of transcriptional termination in the duplicated human alpha globin genes which lie 4 kb apart on chromosome 16. In the human erythroleukemic cell line, K562, which expresses high levels of alpha globin, nuclear run-off experiments suggest that termination occurs within a region of 600 bp past the poly(A) site of both alpha 1 and alpha 2 globin genes. However, a thalassaemic alpha 2 globin gene with a non-functional poly(A) site AAUAAG, when transfected into HeLa cells, not only fails to 3' end process but also fails to terminate transcription. Studies on both
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Single cell technologies have advanced at a rapid pace, providing assays for various molecular phenotypes. Droplet-based single cell technologies, particularly those based on nuclei isolation, such as simultaneous RNA+ATAC single-cell multiome, are susceptible to exogenous ambient molecule contamination, which can increase noise in cell type-level associations. We reasoned that genotype-based sample multiplexing can provide an opportunity to infer this ambient contamination by leveraging DNA variation in sequenced reads. Thus, we developed ambimux, a likelihood-based method to estimate ambient
СтатьяПрепринтПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Amyotrophic lateral sclerosis (ALS) is a motor neuron disease characterized by progressive degeneration of motor neurons. Mislocalization of TAR DNA-binding protein 43 (TDP-43) is an early event in the formation of cytoplasmic TDP-43-positive inclusions in motor neurons and a hallmark of ALS. However, the underlying mechanism and the pathogenic impact of this mislocalization are relatively unexplored. We previously reported that abnormal AMPK activation mediates TDP-43 mislocalization in motor neurons of humans and mice with ALS. In the present study, we hypothesized that other nuclear protein
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования