Mesenchymal neoplasms driven by protein kinases represent an increasing group with a broad clinicopathologic and genetic spectrum. Recently, tumors harboring a GAB1::ABL1 fusion have been reported, resulting in constitutive activation of the non-receptor tyrosine kinase ABL1. We describe six cases (one previously reported) investigated by fusion gene analysis and DNA-methylation profiling. Tumors were from three males and three females aged 7-71 years and arose in the neck, axilla, lower back, thigh, and digits. Lesions were excised. Available follow-up was uneventful. Neoplasms were circumscr
СтатьяКлинический случайПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Alzheimer's disease (AD) is a common and increasing societal problem due to the extending human lifespan. In males, loss of chromosome Y (LOY) in leukocytes is strongly associated with AD. We studied here DNA methylation and RNA expression in sorted monocytes and granulocytes with and without LOY from male AD patients. Through multi-omic analysis, we identified new candidate genes along with those previously associated with AD. Global analyses of DNA methylation in samples with LOY vs. normal state showed that hypomethylation dominated both in granulocytes and monocytes. Our findings highlight
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
UNLABELLED: Base excision repair (BER), a critical pathway for repairing DNA single-strand breaks, is mediated by PARP, which plays a pivotal role in maintaining genomic stability. Targeting PARP with PARP inhibitors (PARPi) has emerged as an effective strategy for treating BRCA-mutated breast cancers characterized by homologous recombination deficiency. However, PARPi resistance remains a major challenge in the treatment of BRCA-mutated breast cancer. Using bioinformatics analysis and cellular-level experiments, we discovered that the RNA-binding protein PCBP2 contributes to resistance to the
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Acquired cystic disease (ACD)-associated renal cell carcinoma (RCC) develops uniquely and frequently in patients receiving long-term dialysis for end-stage renal disease (ESRD). In our previous study, the molecular alteration profiles of ACD-associated RCC were partially similar to those of papillary RCC (PRCC). However, the specific profiles of molecular alterations in ACD-associated RCC and their pathogenic mechanisms remain largely unknown. Therefore, we compared genome-wide transcription and DNA methylation profiles of 12 ACD-associated RCC and 26 PRCC samples, which comprised eight ESRD-i
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Benzene exposure leads to hematotoxicity, and epigenetic modification is considered to be a potential mechanism of benzene pathogenesis. As a newly discovered post-transcriptional modification, the roles of N6-methyladenosine (m6A) in benzene hematotoxicity are still unclear. m6A can only exert its gene regulatory function after being recognized by m6A reading proteins. In this study, we found that the expression of m6A reader IGF2BP1 decreased in benzene poisoning workers and in 20 μM benzene metabolite 1,4-BQ-treated AHH-1 cells. Further overexpression of IGF2BP1 in mice alleviated 50 ppm be
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Expression quantitative trait methylation (eQTM) analysis identifies DNA CpG sites at which methylation is associated with gene expression. The present study describes an eQTM resource of CpG-transcript pairs derived from whole blood DNA methylation and RNA sequencing gene expression data in 2115 Framingham Heart Study participants. We identified 70,047 significant cis CpG-transcript pairs at p < 1E-7 where the top most significant eGenes (i.e., gene transcripts associated with a CpG) were enriched in biological pathways related to cell signaling, and for 1208 clinical traits (enrichment false
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Post-traumatic stress disorder (PTSD) is a complex trauma-related disorder, the etiology and underlying molecular mechanisms of which are still unclear and probably involve different (epi)genetic and environmental factors. Protein N-glycosylation is a common post-translational modification that has been associated with several pathophysiological states, including inflammation and PTSD. Hepatocyte nuclear factor-1α (HNF1A) is a transcriptional regulator of many genes involved in the inflammatory processes, and it has been identified as master regulator of plasma protein glycosylation. The aim o
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Beyond the haploid genome, mammalian sperm carry a payload of epigenetic information with the potential to modulate offspring phenotypes. Recent studies show that the small RNA repertoire of sperm is remodeled during post-testicular maturation in the epididymis. Epididymal maturation has also been linked to changes in the sperm methylome, suggesting that the epididymis might play a broader role in shaping the sperm epigenome. Here, we characterize the genome-wide methylation landscape in seven germ cell populations from throughout the male reproductive tract. We find very few changes in the cy
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Protein arginine methylation is a prevalent post-translational modification. The protein arginine methyltransferase family (PRMT) is involved in many cellular processes in eukaryotes, including transcriptional regulation, epigenetic regulation, RNA metabolism, and DNA damage repair. Toxoplasma gondii, an opportunistic protozoan parasite, encodes five conserved PRMTs. PRMT5 is thought to be responsible for substantial PRMT activity in T. gondii; however, it has not yet been characterized.
METHODS: We tagged the 3' end of the endogenous TgPRMT5 genomic locus with sequence encoding a
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: The most common sex chromosomal aneuploidy in males is Klinefelter syndrome, which is characterized by at least one supernumerary X chromosome. While these men have long been considered infertile, focal spermatogenesis can be observed in some patients, and sperm can be surgically retrieved and used for artificial reproductive techniques. Although these gametes can be used for fertility treatments, little is known about the molecular biology of the germline in Klinefelter men. Specifically, it is unclear if germ cells in Klinefelter syndrome correctly establish the androgenetic DNA
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Early-onset, familial Alzheimer's disease (AD) is rare and may be attributed to disease-causinq mutations. By contrast, late onset, sporadic (non-Mendelian) AD is far more prevalent and reflects the interaction of multiple genetic and environmental risk factors, together with the disruption of epigenetic mechanisms controlling gene expression. Accordingly, abnormal patterns of histone acetylation and methylation, as well as anomalies in global and promoter-specific DNA methylation, have been documented in AD patients, together with a deregulation of noncoding RNA. In transgenic mouse models fo
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The dysregulation of matrix metalloproteinases (MMPs) in skin cutaneous melanoma (SKCM) represents a critical aspect of tumorigenesis. In this study, we investigated the diagnostic, prognostic, and therapeutic aspects of the MMPs in SKCM. Thirteen SKCM cell lines and seven normal skin cell lines were cultured under standard conditions for experimental analyses. RNA and DNA were extracted, followed by RT-qPCR to assess MMP expression and promoter methylation analysis to determine methylation levels. Functional assays, including cell proliferation, colony formation, and wound healing, were condu
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
N6-methyladenosine (m6A), the most abundant epitranscriptomic modification in eukaryotic messenger RNA (mRNA), plays important roles in regulation of gene expression for fundamental biological processes and diverse physiological functions, including combating with pathogen infection. Here, we were first profile transcriptome-wide m6A sequencing in four stages of skin ulceration syndrome-diseased Apostichopus japonicus following Vibrio splendidus infection, including Control (healthy), Early (small ulcer), Later (extensive ulcer), and Resistant (no ulcer) groups. Our results revealed that three
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Uterine fibroids, or leiomyomas, are noncancerous tumors of the myometrium and the most common tumors in women, with a cumulative incidence of approximately 80% by age 50. Currently, hysterectomy is the only definitive cure, and effective non-hormonal therapeutics are lacking. Understanding the etiology of fibroids may lead to alternative, less invasive treatments. Several obstetric disorders, including polycystic ovary syndrome (PCOS), have been linked to uterine fibroids, and women with PCOS often exhibit hormonal imbalances, particularly elevated serum testosterone levels. However, the impa
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Previous studies have demonstrated that inflammation-related interleukin-17 (IL-17) signaling plays a pivotal role in the pathogenesis of non-alcoholic steatohepatitis (NASH)- and alcoholic liver disease (ALD)-induced hepatocellular carcinoma (HCC). However, rare efforts have been intended at implementing the analysis of N6-methyladenosine (m6A) mRNA methylation to elucidate the underpinning function of the IL-17 receptor A (IL-17RA) during the inflammation-carcinogenesis transformation of HCC.
METHODS: We performed methylated RNA immunoprecipitation sequencing (MeRIP-seq) using n…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Methyl-CpG-binding protein 2 (MeCP2) is a chromatin-associated factor whose dysfunction causes Rett syndrome. Although MeCP2 preferentially binds methylated DNA, its affinity for methylated substrates is only ∼ threefold higher than for unmethylated DNA, raising the question of how MeCP2 selectively recognizes its targets. Here, we quantify binding of full-length WT MeCP2 and Rett-associated variants (R106W, T158M, R270X, and R306C) to nucleic acid substrates that vary in length, secondary structure, methylation pattern, CpG symmetry, and strand composition. WT and mutant MeCP2 preferentially
СтатьяПоддержка правительства СШАПоддержка NIH: внешняя программаПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
N6-methyladenosine (m6A) RNA methylation is crucially involved in the genesis and advancement of gastric cancer (GC) by controlling various pathobiological aspects including gene expression, signal transduction, metabolism, cell death, epithelial-mesenchymal transition, angiogenesis, and exosome function. Despite its importance, the exact mechanisms by which m6A modification influences GC biology remain inadequately explored. This review consolidates the latest advances in uncovering the mechanisms and diverse roles of m6A in GC and proposes new research and translational directions. Key regul…
СтатьяОбзорПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The fish's immune response is affected by different factors, including a wide range of environmental conditions that can also disrupt or promote changes in the host-pathogen interactions. How environmental conditions modulate the salmon genome during parasitism is poorly understood here. This study aimed to explore the environmental influence on the Salmo salar transcriptome and methylome infected with the sea louse Caligus rogercresseyi. Atlantic salmon were experimentally infected with lice at two temperatures (8 and 16 °C) and salinity conditions (32 and 26PSU). Fish tissues were collected
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Specific, regulated modification of RNAs is important for proper gene expression1,2. tRNAs are rich with various chemical modifications that affect their stability and function3,4. 7-Methylguanosine (m7G) at tRNA position 46 is a conserved modification that modulates steady-state tRNA levels to affect cell growth5,6. The METTL1-WDR4 complex generates m7G46 in humans, and dysregulation of METTL1-WDR4 has been linked to brain malformation and multiple cancers7-22. Here we show how METTL1 and WDR4 cooperate to recognize RNA substrates and catalyse methylation. A crystal structure of METTL1-WDR4 a
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПоддержка правительства СШАПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Plant height affects crop production and breeding practices, while genetic control of dwarfism draws a broad interest of researchers. Dwarfism in soybean (Glycine max) is mainly unexplored. Here, we characterized a dwarf mutant dm screened from ethyl methanesulfonate (EMS) mutated seeds of the soybean cultivar Zhongpin 661(ZP). Phenotypically, dm showed shorter and thinner stems, smaller leaves, and more nodes than ZP under greenhouse conditions. Genetically, whole-genome sequencing and comparison revealed that 210K variants of SNPs and InDel in ZP relative to the soybean reference genome Will
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования