Cardiomyopathies are progressive disease conditions that give rise to an abnormal heart phenotype and are a leading cause of heart failures in the general population. These are complex diseases that show co-morbidity with other diseases. The molecular interaction network in the localised disease neighbourhood is an important step toward deciphering molecular mechanisms underlying these complex conditions. In this pursuit, we employed network medicine techniques to systematically investigate cardiomyopathy's genetic interplay with other diseases and uncover the molecular players underlying thes
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Molecular Hessians, the second derivatives of the potential energy, are fundamental to many workflows in computational chemistry. Usually, accurate Hessians are computationally expensive to calculate and scale poorly with system size, whether computed using quantum chemistry methods or machine learning interatomic potentials. Here we introduce Hessian Interatomic Potentials (HIPs), a deep learning model that directly predicts Hessians without relying on automatic differentiation or finite differences. To do so, we construct SE(3)-equivariant, symmetric Hessians from irreducible representation
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Streptococcus mutans, a bacterium commonly found in the human oral cavity, is considered the primary causative agent of dental caries. A key player in the pathophysiology of S. mutans is SloR, a 25-kDa metalloregulatory protein. SloR plays a crucial role in coordinating the uptake of essential metal ions, particularly manganese, with the transcription of the bacterium's virulence genes. To elucidate the molecular mechanism underlying the enhanced binding affinity of SloR to DNA upon Mn2+ ion binding, a combination of computational (QM and MD) and experimental (ITC, DSC, CD, EPR) methods have b
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The human inosine monophosphate dehydrogenase (hIMPDH) is a metabolic enzyme that possesses a unique ability to self-assemble into higher-order structures, forming cytoophidia. The hIMPDH II isoform is more active in chronic myeloid leukemia (CML) cancer cells, making it a promising target for anti-leukemic therapy. However, the structural details and molecular mechanisms of the dynamics of hIMPDHcytoophidia assembly in vitro need to be better understood, and it is crucial to reconstitute the computational nucleoplasm model with cytophilic-like polymers in vitro to characterize their structure
СтатьяОбзорПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Ataluren was reported to suppress nonsense mutations by promoting the readthrough of premature stop codons, although its mechanism of action (MOA) is still debated. The likely interaction of Ataluren with CFTR-mRNA has been previously studied by molecular dynamics. In this work we extended the modeling of Ataluren's MOA by complementary computational approaches such as induced fit docking (IFD), quantum polarized ligand docking (QPLD), MM-GBSA free-energy calculations, and computational mutagenesis. In addition to CFTR-mRNA, this study considered other model targets implicated in the translati
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The monosolvate crystal energy landscapes of dapsone (DDS) including the solvents carbon tetrachloride, acetone, cyclohexanone, dimethyl formamide, tetrahydrofuran, methyl ethyl ketone, 1,2-dichloroethane, 1,4-dioxane, dichloromethane and chloroform were established using experimental and computational approaches. To rationalise and understand solvate formation, solvate stability and desolvation reactions a careful control of the experimental crystallisation and storage conditions, a range of thermoanalytical methods and crystal structure prediction were required. Six of the eight DDS monosolv
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The popular AMBER force-field has been extended to provide an accurate description of large and flexible nitroxide free-radicals in condensed phases. New atom types have been included, and relevant parameters have been fitted based on geometries, vibrational frequencies and potential energy surfaces computed at the DFT level for several different classes of nitroxides, both in vacuo and in different solvents. The resulting computational tool is capable of providing reliable structures, vibrational frequencies, relative energies and spectroscopic observables for large and flexible nitroxide sys
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Gastrointestinal stromal tumors (GIST) are the most frequent mesenchymal tumors of the gastrointestinal tract. They are generally located in the stomach or the small bowel and the potential for becoming malignant varies. Due to their expression of c-kit protein, a positive diagnosis as well as a specific targeted treatment by molecular biology (imatinib) are available. Computed tomography is the best imaging method for diagnosis, staging and follow-up of GIST. They appear as a well-defined exophytic mass with heterogeneous enhancement after intravenous injection of iodinated contrast material.
СтатьяОбзорПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Molecular target anticancer drugs are commonly used in various forms of cancers. It is a concern that the risk of serious adverse events (SAEs) and fatal adverse events (FAEs) of molecular target drugs are increasing. An up-to-date meta-analysis of all Phase II/III/IV randomized trials of molecular target anticancer drugs was conducted to calculate the increased risk of SAEs and FAEs. A systematic search of PubMed, Web of Science, and Cochrane Library up to April 6, 2017, was conducted. The study enrolled Phase II/III/IV randomized trials of cancer that compared molecular target drugs alone ve
СтатьяМетаанализОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Breast cancer, particularly estrogen receptor-positive subtypes, is a leading cause of cancer-related mortality worldwide. Aromatase inhibitors, which target estrogen biosynthesis, are a cornerstone of therapeutic intervention. Panax ginseng, a widely recognized medicinal herb, contains bioactive compounds known as ginsenosides, which possess various pharmacological activities, including anticancer properties. This study is aimed at evaluating the potential of ginsenosides and their derivatives from Panax ginseng as aromatase inhibitors for breast cancer treatment through in silico methods. Mo
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Second-generation anticoagulant rodenticides (SGARs) were developed to overcome warfarin resistance in rodent populations; however, their prolonged hepatic retention has raised concerns regarding secondary poisoning of non-target wildlife. All major SGARs exist as cis-trans isomeric pairs, and differences in biological half-life between isomers have been reported, yet the molecular basis for such isomer-dependent pharmacokinetic behavior remains poorly understood. In this study, we conducted an integrated evaluation of cis and trans isomers of SGARs using in vivo, in vitro, and in silico appro
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Prostaglandin F2α (PGF2α) is associated with preterm labor and preterm birth. PGF2α inhibitors have thus proven to be a promising target in the development of lead compounds to prevent preterm birth. In this work, Quantitative Structural Activity Relationship (QSAR) was implemented on a dataset of 77 compounds of 6-bromo-3-methylquinoline analogues using statistical approach and random selection in the QSARINS software. The Genetic Algorithm-Multiple Linear Regression (GA-MLR) approach was used to predict the best model (R 2 = 0.8943 and Q 2 LOO = 0.8836). The inclusion of descriptors FNSA-2 a
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Alpha-chymotrypsin is a serine protease. Its overexpression is responsible for several ailments, such as chronic obstructive pulmonary disease, autoimmune diseases, pancreatitis, and colon cancers. Therefore, the discovery of potent α-chymotrypsin inhibitors is essential for the treatment of the aforementioned ailments. In this study, we identified new α-chymotrypsin inhibitors through a systematic approach, utilizing the in silico and in vivo studies to predict and confirm the inhibitory potential of isoniazid derivatives. During this study, six compounds 2, 3, 4, 7, 9, and 10 were shortliste
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
According to the 2018 WHO R&D Blueprint, Nipah virus (NiV) is a priority disease, and the development of a vaccine against NiV is strongly encouraged. According to criteria used to categorize zoonotic diseases, NiV is a stage III disease that can spread to people and cause unpredictable outbreaks. Since 2001, the NiV virus has caused annual outbreaks in Bangladesh, while in India it has caused occasional outbreaks. According to estimates, the mortality rate for infected individuals ranges from 70 to 91%. Using immunoinformatic approaches to anticipate the epitopes of the MHC-I, MHC-II, and B-c
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The Crimean Congo virus has been reported to be a part of the spherical RNA-enveloped viruses from the Bunyaviridae family. Crimean Congo fever (CCHF) is a fatal disease with having fatality rate of up to 40%. It is declared endemic by the World Health Organization. Many outbreaks of CCHF have been reported over the years. Former studies on CCHF have reported that the nucleoprotein of CCHF, being a pivotal protein in the replication process of the virus, is a potential target for antiviral drugs. However, there is no specific drug that can be used to treat this fatal disease and laboratory tes
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Lymphatic filariasis (LF) remains a significant health challenge for populations in developing countries. LF is a parasitic disease transmitted by mosquitoes, mainly caused by the filarial nematode, Wuchereria bancrofti, prevalent in tropical and subtropical regions. Since the present drugs develop complications, including adverse side effects, lack of specificity, and development of drug resistance, the present study focused on developing the potential anti-filariasis drugs targeting crucial proteins for the nematode life cycle. We have identified the therapeutic compounds by targeting the en
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Since diarrhoea is reportedly the third largest cause of fatality among kids, therefore it is considered to be one of the major areas of concerns among developing nations. The main causative agents of diarrhoea include Escherichia coli, Vibrio cholera, and Shigella spp where E. coli shares the maximum contribution. The roots of the plant Eriosema chinense Vogel. (Fabaceae) are traditionally used by the native tribes of Meghalaya, India to treat diarrhoea. From previous reports, the plant and its marker eriosematin E have been reported to have antidiarrhoeal potential against pathogenic and non
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Early and sensitive diagnosis of pancreatic diseases is a contemporary clinical challenge. Zinc level in pancreatic tissue and its secretion in pancreatic juice has long been considered a surrogate marker of pancreatic function. The objective of this study was to design a Zn-chelating imaging probe (ZCIP) which could be labeled with 99mTc radionuclide for imaging of pancreas using single photon emission tomography (SPECT). We synthesized ZCIP as a bifunctional chelate consisting of diethylene triamine pentaacetic acid for 99mTc-chelation at one end and bispicolylethylamine for Zn-complexation
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Non-typhoidal Salmonella (NTS) is one of the leading bacterial causes of many invasive human infections with a high antibiotic resistance profile. With this concern, the current study aimed to design an effective epitope-based peptide vaccine against NTS species as a successive and substitutive protective measure of invasive NTS disease. To design rationally, the current study considered a comprehensive in silico workflow combination of both immunoinformatics and molecular modeling approaches, including molecular docking and molecular dynamics (MD) simulation. We identified the two most promis
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Staphylococcus aureus is an opportunistic bacterium that produces various types of toxins, resulting in serious food poisoning. Staphylococcal enterotoxins (SEs) are heat-stable and resistant to hydrolysis by digestive enzymes, representing a potential hazard for consumers worldwide. In the present study, we used amino-acid sequences encoding SEA and SEB-like to identify their respective template structure and build the three-dimensional (3-D) models using homology modeling method. Two natural compounds, Betulin and 28-Norolean-12-en-3-one, were selected for docking study on the basis of the c
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования