BACKGROUND: Intrahepatic cholangiocarcinoma (ICC) is an aggressive hepatobiliary malignancy characterized by a complex pathogenesis and poor prognosis. Telomere dysfunction and cellular senescence are involved in the pathogenesis of various types of cancers. However, the prognostic significance of telomere- and aging-related genes in ICC remains unclear. This study aimed to identify such genes with prognostic significance, and construct a prognostic risk model for ICC.
METHODS: We screened prognostic genes associated with telomere-aging in patients using The Cancer Genome Atlas (TCGA) and Gen
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Colon adenocarcinoma (COAD) remains a leading cause of cancer-related mortality worldwide, partly due to the lack of robust biomarkers for early diagnosis and accurate prognosis. Glycoproteins play critical roles in tumorigenesis and may serve as promising sources of biomarkers. This study aimed to identify glycoprotein-related candidate diagnostic and prognostic biomarkers for COAD through integrated bioinformatics approaches and experimental validation. Gene expression profiles and clinical information of COAD patients were obtained from The Cancer Genome Atlas database (TCGA). The expressio
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
INTRODUCTION: The availability of a large number of cancer expression profiles presents an excellent opportunity to re-investigate various biological and clinical questions. While several expression profiles have been established for different cancers, merging them may provide a more powerful platform for extensively extrapolating molecular and clinical features across multiple cohorts.
MATERIALS AND METHODS: In this study, five gastric tumor expression profiles from the Gene Expression Omnibus [GEO] and one in-house cohort comprising a total of 1,060 samples were merged. The batch effect was
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: The prognostic and therapeutic implications of R-loop regulators in lower-grade glioma (LGG) remain largely unexplored.
METHODS: We constructed a R-loop prognostic index (RLPI) by benchmarking 9 machine-learning algorithms through nested cross-validation. Associations between RLPI and clinical outcomes, immune microenvironment, and metabolic features were assessed across -11 bulk transcriptomic, 2 single-cell RNA-sequencing, and 1 spatial transcriptomic LGG cohorts. Functional validation was performed for key RLPI genes.
RESULTS: Among the 9 algorithms tested, Elastic Net demonst
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Breast cancer progression reflects malignant cell programs coupled with immune remodeling. Biomarkers that connect tumor intrinsic states with microenvironmental interactions remain needed. We evaluated TMEM132A as a candidate marker in breast cancer. Bulk cohorts from The Cancer Genome Atlas, Genotype Tissue Expression, and Gene Expression Omnibus were analyzed to quantify TMEM132A expression, diagnostic discrimination, and associations with clinicopathologic features and survival. Single cell RNA sequencing and spatial transcriptomics localized TMEM132A across cell populations and tissue reg
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Cell division cycle 25A (CDC25A) is a key regulator of cell cycle progression, DNA replication and apoptosis in cancer cells. This study employed multiple well-characterised breast cancer cohorts to evaluate the prognostic significance of CDC25A and to characterise the molecular association linked to its expression in early-stage breast cancer.
METHODS: CDC25A transcriptomic expression was systematically assessed for statistical associations with key genes and pathways implicated in cell cycle regulation, DNA damage repair, cyclin-dependent signalling, tumour microenvironment and
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Myoepithelial cells (MECs) are integral to mammary gland physiology, classically serving a structural and tumor-suppressive role. While their function in normal breast tissue and ductal carcinoma in situ is well characterized, their behavior in human invasive breast cancer has not been previously examined. In this study, we performed a comprehensive transcriptomic analysis of MECs isolated from seven archived human breast cancer specimens, directly comparing them with MECs from adjacent normal tissue to define gene expression changes associated with invasive progression. The analysis revealed
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
As cancer survivorship is steadily increasing, second primary breast cancers (SPBCs) are becoming a more common disease linked to poorer clinical outcomes compared to first primary breast cancers (FPBCs). While the molecular features of FPBCs are well characterized, the biological drivers of SPBCs remain largely unexplored. We performed genome-wide DNA methylation profiling and analysis of clinically and demographically paired ER-positive, HER2-negative SPBC (n = 13) and FPBC (n = 29). We validated our findings by integrating genomic, transcriptomic, proteomic, and epigenomic data from paired
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Luminal breast cancer is rising rapidly among East Asian women, particularly younger patients, with variable clinical outcome, yet current risk-stratification models inadequately predict early recurrence of under-studied young-onset cases. We hypothesize that the interplay between endogenous mutagenic processes and overlooked environmental carcinogen exposure drives molecular diversity, revealing novel etiologic and therapeutic insights.
METHODS: We performed integrative proteogenomic profiling of 164 prospective, treatment-naïve early-stage Taiwanese breast cancer patients using
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Background/Objectives: Gene expression-guided drug repurposing has emerged as a strategy to identify new therapy opportunities by associating disease transcriptional signatures with drug-induced gene expression profiles. This is relevant for prostate and bladder cancers, which have high molecular heterogeneity and therapy resistance limits for their standard treatment regimens. Antiretrovirals have been of great interest as repurposed candidates for these cancers due to their various effects on cancer cell pathways. The objective of this review is to assess the principles, applications, and ch
СтатьяОбзорПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Cervical cancer remains a significant global health burden, with chemoradioresistance representing a major obstacle to successful treatment. To elucidate the mechanisms underlying this resistance, we established a unique pair of isogenic primary cervical cancer cell lines, AdMer35 and AdMer43, obtained from a patient with squamous cell carcinoma of the cervix before and after radiation therapy. The aim of our study was to characterize the transcriptomic and cellular heterogeneity of these cells. We conducted an in-depth comparative analysis using single-cell RNA sequencing. Analysis of this pa
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Triple-negative breast cancer (TNBC) is an aggressive subtype of breast cancer characterized by high invasiveness, limited therapeutic options, and unfavorable clinical outcomes. Ribosomal protein L5 (RPL5), a component of the large ribosomal subunit, has been implicated in ribosome biogenesis, translational regulation, and p53-associated cellular processes. This study investigated the immunohistochemical expression pattern of RPL5 in TNBC tissues and explored its potential biological significance through integrated transcriptomic analyses. Tumor tissues from 37 patients with TNBC and 7 adjace
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Prostate cancer (PCa) is one of the most prevalent malignancies in men worldwide, and metabolic reprogramming particularly of lipid metabolism plays a pivotal role in its initiation and progression. Lipid biosynthesis and cholesterol regulation are closely linked to androgen receptor signaling and therapeutic resistance. However, the molecular mechanisms underlying lipid metabolic heterogeneity in prostate cancer remain poorly understood. We integrated multi-omics, single-cell RNA sequencing (scRNA-seq), and spatial transcriptomic data to characterize lipid metabolism-related gene expression i
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Bladder cancer (BLCA) is a highly heterogeneous malignancy with considerable variability in clinical outcomes. Reliable biomarkers for prognosis and treatment guidance remain urgently needed. Migrasomes, recently identified cellular organelles involved in intercellular communication, have been implicated in cancer progression, yet their associated long non-coding RNAs (lncRNAs) and prognostic relevance in BLCA remain unclear.
METHODS: We integrated transcriptomic and clinical data from The Cancer Genome Atlas (TCGA) to identify migrasome-related lncRNAs through co-expression analy
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Accurate assessment of early indicators of breast cancer (BC) is critical to improve detection strategies and patient prognosis. Our research group takes a comparative species approach to study early BC detection by capitalizing on data from species with inherently low or high incidence of mammary cancer to supplement rare human samples. Circulating microRNAs (c-miRNAs) are a promising class of molecules that have the potential to serve as biomarkers for BC risk and disease detection. The expression of these non-coding RNAs controls numerous cellular processes and their dysregulation is associ
СтатьяСравнительное исследованиеПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Neuroendocrine neoplasms (NENs) are a biologically heterogeneous group of epithelial malignancies arising from neuroendocrine cells across multiple organs. Although considered rare in comparison to other solid tumors, their incidence has increased more than six-fold in recent decades. A major clinical challenge is the accurate stratification between aggressive, poorly differentiated (PD) neuroendocrine carcinomas (NECs) and slow growing well-differentiated (WD) neuroendocrine tumors (NETs), which differ significantly in prognostic outcomes and treatment response. Conventional histo
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Left-sided colon-cancer (LCC) and right-sided colon cancer (RCC) harbor different clinical entities and different therapy protocols. Our study aimed to demonstrate genomic expression differences and clarify the clinical differences between LCC and RCC by using in-silico methods.
METHODS: Our study compares mRNA expression levels between clinical groups to describe variations in molecular characteristics between right-left-sided colon cancer (216 right-141 left) using the TCGA-COAD database. We identified differentially expressed genes and analyzed survival profiles for RCC and LCC
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Background Bladder and kidney cancer burden rises globally, with environmental toxicants driving their progression. Methods We integrated global epidemiological analysis, single-cell transcriptomics, cell-cell communication analysis, epithelial subclustering, pseudotime inference, toxicological target prediction, survival modeling, cross-cohort validation, single-cell virtual knockout, spatial transcriptomic deconvolution, molecular docking/dynamics, CETSA, and in vitro assays to define a shared molecular interface linking triphenyl phosphate (TPP) to bladder and kidney cancer. Results Both ma
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: To investigate the molecular genetic features of multiple primary lung cancer (MPLC) to provide a basis and new methods for its identification, diagnosis, and treatment.
METHODS: Transcriptome sequencing (RNA-seq) was performed on 16 tissue samples from eight patients with synchronous multiple primary lung adenocarcinoma (sMP-LUAD) and eight tissue samples from eight patients with single primary lung adenocarcinoma (SP-LUAD). Differentially expressed genes selected by bioinformatic methods were validated in 24 sets of sMP-LUAD and SP-LUAD samples using quantitative reverse transcr
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The clinical management of cutaneous melanoma (SKCM) is particularly challenging due to the disease's high degree of heterogeneity, which leads to unpredictable patient outcomes and highly variable responses to therapy. Clinicians are in urgent need of a reliable molecular profile system to predict patient trajectory and guide therapeutic decisions. Recent research emphasizes the pivotal role of N4-acetylcytidine (ac4C) modification, a novel epigenetic mechanism, in promoting diverse human diseases pathogenesis and progression. Nevertheless, its specific impact and the clinical relevance of ac
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования