The extant crocodylians comprise 23 species divided among three families, Alligatoridae, Crocodylidae, and Gavialidae. Currently, based on morphological data sets, Tomistoma schlegelii (false gharial) is placed within the family Crocodylidae. Molecular data sets consistently support a sister-taxon relationship of T. schlegelii with Gavialis gangeticus (Indian Gharial), which is the sole species in Gavialidae. To elucidate the placement of T. schlegelii within the extant crocodylians, we have sequenced 352bp of the dentin matrix protein 1 (DMP1) nuclear gene in 30 individuals and 424bp of the n
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоддержка правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Group B streptococcus (GBS; Streptococcus agalactiae) is the most common cause of neonatal and obstetric sepsis and is an increasingly important cause of septicemia in elderly individuals and immunocompromised patients. Epidemiological studies of GBS infections require comprehensive typing systems that provide information about variable characteristics, such as antigenic type, virulence, or antibiotic resistance, as well as the "backbone" structure or the genetic lineage of isolates. We have previously described a 3-set genotyping system that identifies the molecular serotype (MS) or molecular
Сравнительное исследованиеОценочное исследованиеСтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
We describe the cDNA cloning, overproduction and purification of a 22.6-kDa antigen from the human blood fluke Schistosoma japonicum. A 777-bp cDNA (C32) was isolated from a S. japonicum lambda ZAPII cDNA expression library immuno-screened with hyperimmune rabbit serum (HRS) raised against soluble adult S. japonicum proteins. The open reading frame of C32 encodes a protein of 191 amino acids (aa) which exhibits 71% identity to a 22.6-kDa membrane-associated antigen of S. mansoni, a putative vaccine candidate for schistosomiasis. We have identified a sequence motif known as an EF-hand calcium-b
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Mutation screening of the major autosomal dominant polycystic kidney disease (ADPKD) locus, PKD1, has proved difficult because of the large transcript and complex reiterated gene region. We have developed methods, employing long polymerase chain reaction (PCR) and specific reverse transcription-PCR, to amplify all of the PKD1 coding area. The gene was screened for mutations in 131 unrelated patients with ADPKD, using the protein-truncation test and direct sequencing. Mutations were identified in 57 families, and, including 24 previously characterized changes from this cohort, a detection rate
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Osmotin, a pathogenesis-related antifungal protein, is relevant in induced plant immunity and belongs to the thaumatin-like group of proteins (TLPs). This article describes comparative structural and functional analysis of the two osmotin isoforms cloned from Phytophthora-resistant wild Piper colubrinum. The two isoforms differ mainly by an internal deletion of 50 amino acid residues which separates them into two size categories (16.4 kDa-PcOSM1 and 21.5 kDa-PcOSM2) with pI values 5.6 and 8.3, respectively. Recombinant proteins were expressed in E. coli and antifungal activity assays of the pu
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Taking all the proteins of four virus genomes as samples, the segments of alpha-helix and beta-strand in proteins of the four viruses were obtained. Linear regression analyses between the average polarities and the folding rates of peptide chains were performed for alpha-helices and beta-strands respectively. The results indicated that the folding rates show significant positive linear correlation for alpha-helices and negative linear correlation for beta-strands with the average polarities. Based on the corresponding protein coding sequences of these amino acid segments, the influences of GC
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Neurofascin belongs to the L1 subgroup of the immunoglobulin superfamily of cell adhesion molecules and is implicated in axonal growth and fasciculation. We used yeast two-hybrid screening to identify proteins that interact with neurofascin intracellularly and therefore might link it to trafficking, spatial targeting, or signaling pathways. Here, we demonstrate that rat syntenin-1, previously published as syntenin, mda-9, or TACIP18 in human, is a neurofascin-binding protein that exhibits a wide-spread tissue expression pattern with a relative maximum in brain. Syntenin-1 was found not to inte
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The structural gene, pkmA, was cloned and sequenced from a rifamycin SV-producing Amycolatopsis mediterranei U32 strain. The N-terminal portion of the deduced amino acid sequence of pkmA showed significant similarity to the family of serine/threonine protein kinases. It contains all the structural features which are highly conserved in protein kinases, including the Gly-X-Gly-X-X-Gly motif of ATP binding and the essential amino acids known to be important for the recognition of the correct hydroxyamino acid in serine/threonine protein specific kinases. The protein possesses a region rich in Al
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Senescence-accelerated mice (SAM) are a series of mouse strains originally derived from unexpected crosses between AKR/J and unknown mice, from which phenotypically distinct senescence-prone (SAMP) and -resistant (SAMR) inbred strains were subsequently established. Although SAMP strains have been widely used for aging research focusing on their short life spans and various age-related phenotypes, such as immune dysfunction, osteoporosis, and brain atrophy, the responsible gene mutations have not yet been fully elucidated.
RESULTS: To identify mutations specific to SAMP strains, we
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
We found that human genome coding regions annotated by computers have different kinds of many errors in public domain through homologous BLAST of our cloned genes in non-redundant (nr) database, including insertions, deletions or mutations of one base pair or a segment in sequences at the cDNA level, or different permutation and combination of these errors. Basically, we use the three means for validating and identifying some errors of the model genes appeared in NCBI GENOME ANNOTATION PROJECT REFSEQS: (I) Evaluating the support degree of human EST clustering and draft human genome BLAST. (2)
Аннотация на английскомСтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
A new homodimeric PII metalloproteinase, named BlatH1, was purified from the venom of the Central American arboreal viperid snake Bothriechis lateralis by a combination of anion-exchange chromatography, hydrophobic interaction chromatography, and gel filtration. BlatH1 is a glycoprotein of 84 kDa. The mature protein contains a metalloproteinase domain, with the characteristic zinc-binding motif (HEXXHXXGXXH) followed by the sequence CIM at the Met-turn. In the disintegrin domain, the tripeptide sequence TDN substitutes the characteristic RGD motif found in many disintegrins. BlatH1 hydrolyzed
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
No broadly protective vaccine is available for the prevention of group B meningococcal disease. One promising candidate is factor H-binding protein (fHbp), which is present in all strains but often sparsely expressed. We prepared seven murine immunoglobulin G monoclonal antibodies (MAbs) against fHbp from antigenic variant group 2 (v.2) or v.3 ( approximately 40% of group B strains). Although none of the MAbs individually elicited bactericidal activity with human complement, all had activity in different combinations. We used MAb reactivity with strains expressing fHbp polymorphisms and site-s
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
RS-12 mumps virus strain was isolated in 1986, in monkey kidney cells, from the throat-washing of an Iranian patient and developed to RS-12 vaccine by serial passage of the pathogen in MRC-5 cells. During the present study, an early passage RS-12 containing its virulent pathogenic phenotype, was characterized genetically. Its F, SH and HN genes were isolated by RT-PCR amplification and sequenced. It is quite evident that RS-12 belongs to genotype H, closely related to European strains but distinguishable from Asian strains. The deduced amino acid sequences of HN and F proteins that comprise im
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Alagille syndrome is an autosomal dominant disorder that results from defects in the Notch signaling pathway, which is most frequently due to JAG1 mutations. This study investigated the rate, spectrum, and origin of JAG1 mutations in 91 Chinese children presenting with at least two clinical features of Alagille syndrome (cholestasis, heart murmur, skeletal abnormalities, ocular abnormalities, characteristic facial features, and renal abnormalities). Direct sequencing and/or multiplex-ligation-dependent probe amplification were performed in these patients, and segregation analysis was performed
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
AIMS: Calmodulin (CaM), acts as a kind of multifunctional Ca2+ sensing protein, which is ubiquitous in fungi, is highly conserved across eukaryotes and is involved in the regulation of a range of physiological processes, including morphogenesis, reproduction and secondary metabolites biosynthesis. Our aim was to understand the characteristics and functions of AaCaM in Alternaria alternata, the causal agent of pear black spot.
METHODS AND RESULTS: A 450 bp cDNA sequence of AaCaM gene of A. alternata was cloned by the PCR homology method. Sequence analysis showed that this protein encoded by Aa
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
An adult stage Opisthorchis viverrini cDNA library was constructed and screened for abundant transcripts. One of the isolated cDNAs was found by sequence comparison to encode a glutathione S-transferase (GST) and was further analyzed for RNA expression, encoded protein function, tissue distribution and cross-reactivity of the encoded protein with other trematode protein counterparts. The cDNA has a size of 893 bp and encodes a GST of 213 amino acids length (OV28GST). The most closely-related GST of OV28GST among those published for trematodes is a 28 kDa GST of Clonorchis sinensis as shown by
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Visceral leishmaniasis (VL, also known as kala-azar) is a vector borne disease caused by obligate intracellular protozoan parasite Leishmania donovani. To overcome the limitations of currently available drugs for VL, molecular target-based study is a promising tool to develop new drugs to treat this neglected tropical disease. One such target we recently identified from L. donovani (Ld) genome (WGS, clinical Indian isolate; BHU 1220, AVPQ01000001) is a small GTP-binding protein, Rab6 protein. We now report a specific inhibitor of the GTPase activity of Rab6 protein of L. donovani (LdRab6) with
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Whether certain Epstein-Barr virus (EBV) strains are associated with pathogenesis of nasopharyngeal carcinoma (NPC) is still an unresolved question. In the present study, EBV genome contained in a primary NPC tumor biopsy was amplified by Polymerase Chain Reaction (PCR), and sequenced using next-generation (Illumina) and conventional dideoxy-DNA sequencing. The EBV genome, designated HKNPC1 (Genbank accession number JQ009376) is a type 1 EBV of approximately 171.5 kb. The virus appears to be a uniform strain in line with accepted monoclonal nature of EBV in NPC but is heterogeneous at 172 nucl
Клиническое исследованиеСравнительное исследованиеСтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The presence of phospholipase A(2) (PLA(2)) in the venom of Malayan krait (Bungarus candidus) and its structure were studied. The PLA(2) cDNAs from the venom gland of B. candidus (Indonesia origin) were amplified by the polymerase chain reactions (PCR) and cloned. The primers used were based on the cDNA sequences of several homologous B. multicinctus venom PLA(2)s. In addition to the A-chains of beta-bungarotoxins, a novel B. candidus PLA(2) was cloned and its full amino acid sequence deduced. Having totally 125 amino acid residues, the PLA(2) contains a pancreatic loop and is 61% identical to
Сравнительное исследованиеСтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Progressive multifocal leukoencephalopathy (PML) is a fatal demyelinating disease of the central nervous system caused by a ubiquitous human polyomavirus designated as JC virus (JCV). JCVs in the brain of PML patients (PML-type JCVs) contain various regulatory regions generated from the archetypal regulatory region during persistence in the patients. We determined the complete DNA sequences of 2 PML-type isolates and 5 archetype isolates. Amino acid sequences of individual viral proteins were deduced from complete DNA sequences, and were compared among 16 isolates (6 PML types and 10 archetype
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.