The aim was to compare the detection frequency of periodontopathogens by using the Pado Test 4.5 and checkerboard DNA-DNA hybridization technique in chronic periodontitis patients.Thirty patients with chronic periodontitis were tested cross-sectionally with DNA/RNA oligogenomic probe method (IAI Pado Test 4.5) and DNA/DNA whole genomic probe (checkerboard) method. Samples were taken by two paper points at the deepest site in each of the four quadrants and pooled into one sample for each of the two methods. The samples were sent to the two laboratories (IAI, Zuchwil, Switzerland, and Oral Micro
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Epstein-Barr virus (EBV) is associated with several malignancies including nasopharyngeal carcinoma and lymphoma in immunocompromised patients. Quantitative monitoring of EBV DNA in these patients has recently become essential for management of the disease. In the present study the authors developed a rapid and reliable real-time PCR to quantify the EBV DNA in peripheral blood mononuclear cell (PBMC) using hybridization probe technique. The real-time primers and probes in this real-time PCR system were designed based on EBNA-1 sequence. The newly-established real-time PCR demonstrated its high
Оценочное исследованиеСтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАВалидационное исследованиеПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Genetic relationships of 20 Trichinella isolates from Indiana wildlife were assessed and compared to Trichinella isolated from an infected swine herd. Trichinella larvae were isolated from coyotes, mink, raccoons, and red foxes. The larvae were maintained and amplified in white mice (ICR) and wild mice (Peromyscus leucopus). Differences in phenotypic characters of sylvatic isolates in the 2 laboratory hosts included an approximately 10-30-fold increase in parasite fecundity in wild mice. DNA for each isolate was extracted from Trichinella larvae and analyzed by dot-blot hybridization using a r
Сравнительное исследованиеСтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоддержка правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
In the present paper, we first demonstrated the possibility of electrohydrodynamic (EHD) dispensing method for preparing nanoliter probe DNA droplets on surfaces in DNA microarrays. To study the effect of an electric field on the dynamic behavior of pendent DNA droplet, visualization experiments with three kinds of electrode shapes are performed. In the early stage of droplet dispensing, it is shown that applied electric field assists a gravitational force exerted on DNA droplet. The pendent droplet is elongated in the parallel direction of applied electric field. However, after making fluid b
Оценочное исследованиеСтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVE: This study aimed to establish a cell-free fetal DNA (cffDNA) assay using multiplex digital PCR (dPCR) for identifying fetuses at increased risk of 22q11.2 deletion/duplication syndrome.
METHODS: Six detection sites and their corresponding probes were designed for the 22q11.2 recurrent region. A dPCR assay for the noninvasive screening of 22q11.2 deletion/duplication syndrome was established. A total of 130 plasma samples from pregnant women (including 15 samples with fetal 22q11.2 deletion/duplication syndrome) were blindly tested for evaluating the sensitivity and specificity of t
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
AIM: to develop an additional criterion for objective diagnosis of purulent-destructive forms of acute pyelonephritis.
MATERIALS AND METHODS: A total of 35 blood samples from patients with acute pyelonephritis aged from 19 to 85 years (mean age was 52 years) were studied. For the analysis, a classical bacteriological method of isolating blood culture and a modern molecular genetic method of fluorescent in situ hybridization (FISH) using DNA probes complementary to species-specific regions of the 16S rRNA gene of microorganisms were used. The obtained results were processed using the Statistic…
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The functional morphology of the neuroendocrine system producing sodium influx-stimulating (SIS) peptide in the pond snail, Lymnaea stagnalis, was studied by in situ hybridization and immunocytochemistry. The SIS-peptide, which is 76 amino acids long, stimulates sodium uptake from the ambient medium. Two synthetic DNA probes were used for in situ hybridization. The nucleotide sequences were chosen from the cDNA structure; they encode amino acids 8-17 and 64-73, respectively. SIS-peptide sequences 10-20 and 67-76 were synthesized and antibodies were raised to them and affinity-purified. In addi…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Wolf-Hirschhorn syndrome is a clinically recognizable, multiple congenital anomaly syndrome usually associated with terminal deletion of the short arm of chromosome 4. A girl with clinical features of Wolf-Hirschhorn syndrome did not show an obvious deletion of chromosome 4, and a molecular defect was suspected. RFLPs of genomic DNA from the proband and her parents were studied using DNA probes from the distal region of chromosome 4p. Fluorescence in situ hybridization using a cosmid p847.351 containing the fragment 847 E-C was performed to investigate the possibility of a subtle translocation…
Клинический случайСтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоддержка службы здравоохранения СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Hepatic ischemia-reperfusion injury (HIRI) is an inevitable complication of clinical surgeries such as liver resection or transplantation, often resulting in postoperative liver dysfunction, hepatic failure in up to 13% of postresection patients, and early graft failure in 11-18% of liver transplantation patients. HIRI involves a series of biochemical events triggered by abnormal alterations in multiple biomarkers, characterized by short lifespans, dynamic changes, subcellular regional distribution, and multicollaborative regulation. However, traditional diagnosis, including serology, imaging,
СтатьяОбзорПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND/AIMS: Liver failure in infancy can result from several disorders of the mitochondrial respiratory chain. In some patients, levels of mitochondrial DNA are markedly reduced, a phenomenon referred to as mitochondrial DNA depletion. To facilitate diagnosis of this condition, we have reviewed the clinical and pathological features in five patients with mitochondrial DNA depletion.
METHODS: Cases were identified by preparing Southern blots of DNA from muscle and liver, hybridising with appropriate probes and quantifying mitochondrial DNA relative to nuclear DNA.
RESULTS: All our patien
Клинический случайСтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
In the process of selecting fluorescence in situ hybridization probes to be used for preimplantation genetic diagnosis in couples with balanced reciprocal translocations, we found 2 individuals with unexpected breaks in the centromeric alpha-satellite DNA. Subsequently, centromere breaks were specifically sought in reciprocal translocations in which 1 or both breakpoints appeared cytogenetically near the centromere. In a total of 11 individuals studied, we found 8 centromere breaks in 6 individuals; in 2 individuals, the alpha-satellite DNA of both chromosomes involved in the translocation spl
Клинический случайСтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The simple tetranucleotide repeat GATA (GACA) occurs in all eukaryotes so far studied. In many species, the arrangement of these sequences varies considerably among individuals. Thus GATA (GACA) type probes produce DNA fingerprints when hybridized with restricted DNA from different individuals within a species. Banded krait minor (Bkm) satellite DNA (related to sequences originally recovered from the W chromosome of the banded krait and consisting essentially of a series of GATA repeats) is found in a wide spectrum of vertebrates and invertebrates. We used the Bkm 2(8) clone to evaluate the oc
СтатьяПоддержка службы здравоохранения СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Unintegrated MAV-2(O) DNA was isolated from infected chicken embryo fibroblasts and inserted into the lambda bacteriophage vector lambda gtWES lambda B. Three x 10(6) bacteriophage plaques were screened, yielding a total of seven clones, six of which contained DNA representing the complete MAV-2(O) genome. Viral DNA was isolated from four of the clones and was used to transfect chicken embryo fibroblasts. All four clones produced virus as monitored by reverse transcriptase assay. When the four cloned viruses were inoculated into 10-day-old embryos, all hatched chickens developed osteopetrosis.
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоддержка службы здравоохранения СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
DNA computation offers a promising route for multi-input cancer diagnosis, yet its translation into practical classifiers is often impeded by complex probe design and operational intricacies. Here, we introduce a bead-based DNA classifier (BDC) platform designed for multimiRNA-based diagnostic applications. This platform performs weighted molecular computation through a combination of magnetic bead capture and polymerase-mediated strand displacement. An in silico diagnostic model for breast cancer was built using an SVM algorithm trained on TCGA miRNA-seq data, which revealed a three-miRNA sig
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The approach for DNA detection was established by using a fluorescence resonance energy transfer (FRET) system, in which the energy donor was poly-diallyldimethylammonium chloride-protected quantum dots and the energy receptor was ethidium bromide (EB) inserting into the double stranded DNA. The concentration of the probe DNA, EB and NaCl was optimized. Under the optimized conditions, the FRET system has a stable signal and good reproducibility. The linear range is 7.7-61.6 nM with the correlation coefficient of 0.998 and the limit of detection is 7.7 nM. This method is simple and sensitive, a
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The polymerase chain reaction was used to amplify rearrangements of T-cell receptor gamma genes from 2 leukemic DNA samples involving the same variable segment. One V-J junction was sequenced and an anti-junctional oligonucleotide synthesized. This oligonucleotide was used as probe on in vitro amplified DNA. We show that this strategy allows the detection of the corresponding clonal DNA at dilutions of up to 10(6) fold in germline DNA. Moreover we demonstrate that it is possible to differentiate this clone from the second leukemic clone and from polyclonal T-cells.
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
One of the limitations of fluorescence probe molecules during biomedical estimation is their lack of ability to selectively determine the targeted species. To overcome this there have been various approaches that involve attaching a functional group or aptamers to the fluorescence probe. However, encapsulating probe molecules in a matrix using nanotechnology can be a viable and easier method. Curcumin (Cur) as a fluorescence marker cannot distinguish DNA and RNA. This research reports a novel selective approach involving the use of nanocapsules composed of liposomal curcumin coated with chitos
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
To diagnose brucellosis effectively, many genus- and species-specific detection methods based on PCR have been developed. With conventional PCR assays, real-time PCR techniques have been developed as rapid diagnostic tools. Among them, real-time PCR using hybridization probe (hybprobe) has been recommended for bacteria with high DNA homology among species, with which it is possible to make an accurate diagnosis by means of an amplification curve and melting peak analysis. A hybprobe for B. abortus was designed from a specific single-nucleotide polymorphism (SNP) on the fbaA gene. This probe on
Оценочное исследованиеСтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Rapidly growing mutation databases for various inherited metabolic diseases raise the possibility of neonatal screening by DNA-based diagnosis. It is therefore important to develop a simple DNA diagnostic method which is suitable for processing a large number of samples. We have devised an allele-specific amplification (ASA) method with a fluorogenic probe (TaqMan probe) to detect point mutations. A pairwise PCR amplification with two sets of allele-specific primers was performed in the presence of the TaqMan probe with real-time fluorescence monitoring on an ABI PRISM 7700 sequence detector.
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Primer design for highly variable DNA sequences is difficult, and experimental success requires attention to many interacting constraints. The advent of next-generation sequencing methods allows the investigation of rare variants otherwise hidden deep in large populations, but requires attention to population diversity and primer localization in relatively conserved regions, in addition to recognized constraints typically considered in primer design.
RESULTS: Design constraints include degenerate sites to maximize population coverage, matching of melting temperatures, optimizing d
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования