OBJECTIVE: This paper aims at screening the common differential genes of coronary atherosclerotic heart disease (CAD) and ischemic cardiomyopathy (ICM), and to conduct pathway analysis and protein-protein interaction (PPI) network analysis for the differential genes.
MATERIALS AND METHODS: The CAD and ICM datasets were collected from the Gene Expression Omnibus (GEO) database for human tumors to extract data components of peripheral blood RNA of patients and normal people in GSE71226 and GSE9128 chips; "limma" package of "R" software was used to screen the differential genes, and "pheatmap" p
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: All proteins associate with other molecules. These associated molecules are highly predictive of the potential functions of proteins. The association of a protein and a molecule can be determined from their co-occurrences in biomedical abstracts. Extensive semantically related co-occurrences of a protein's name and a molecule's name in the sentences of biomedical abstracts can be considered as indicative of the association between the protein and the molecule. Dependency parsers extract textual relations from a text by determining the grammatical relations between words in a senten
Сравнительное исследованиеСтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Cryptococcus neoformans causes life-threatening meningoencephalitis in humans, but its overall biological and pathogenic regulatory circuits remain elusive, particularly due to the presence of an evolutionarily divergent set of transcription factors (TFs). Here, we report the construction of a high-quality library of 322 signature-tagged gene-deletion strains for 155 putative TF genes previously predicted using the DNA-binding domain TF database, and examine their in vitro and in vivo phenotypic traits under 32 distinct growth conditions. At least one phenotypic trait is exhibited by 145 out o
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
One of the most influential theories has conceived unexpected panic attack (PA) as a primal defensive reaction to threat within the internal milieu of the body. This theory is based on findings suggesting the involvement of dysfunctional respiratory regulation and/or abnormally sensitive central neural network of carbon dioxide (CO2)/hydrogen ion (H+) chemoreception in PA. Thus, unexpected PA may be related to phylogenetically older brain structures, including the brainstem areas, which process basic functions related to the organism's internal milieu. The brainstem represents a crucial area f
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Transcription factors (TFs) are essential for the expression of all proteins, including those involved in human health and disease. However, TFs are resistant to proteomic characterization because they are frequently masked by more abundant proteins due to the limited dynamic range of capillary liquid chromatography-tandem mass spectrometry and protein database searching. Purification methods, particularly strategies that exploit the high affinity of TFs for DNA response elements (REs) on gene promoters, can enrich TFs prior to proteomic analysis to improve dynamic range and penetrance of the
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Fibrillar collagens are ubiquitous proteins essential for the structural integrity of bones, skin, blood vessels, and other tissues. Mutations in collagen genes result in disorders including osteogenesis imperfecta, chondrodysplasias, and Ehlers-Danlos syndromes, but the molecular basis for the heterogeneity of clinical phenotypes is not well understood. A more complete understanding of the relationship between sequence and phenotype requires synthesis of multiple facets of collagen structure and function. To facilitate such an analysis, we developed COLdb, a freely available database integrat
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The identification of small molecules that fall within the biologically relevant subfraction of vast chemical space is of utmost importance to chemical biology and medicinal chemistry research. The prerequirement of biological relevance to be met by such molecules is fulfilled by natural product-derived compound collections. We report a structural classification of natural products (SCONP) as organizing principle for charting the known chemical space explored by nature. SCONP arranges the scaffolds of the natural products in a tree-like fashion and provides a viable analysis- and hypothesis-ge
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Fibrillin is the major component of extracellular microfibrils. Mutations in the fibrillin gene on chromosome 15 (FBN1) were described at first in the heritable connective tissue disorder, Marfan syndrome (MFS). More recently, FBN1 has also been shown to harbor mutations related to a spectrum of conditions phenotypically related to MFS. These mutations are private, essentially missense, generally non-recurrent and widely distributed throughout the gene. To date no clear genotype/phenotype relationship has been observed excepted for the localization of neonatal mutations in a cluster between ex
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
von Willebrand disease (vWD), the most common congenital bleeding disorder in man, is related to quantitative and/or qualitative abnormalities of von Willebrand factor (vWF), a protein necessary for platelet-vessel wall interactions and for carrying factor VIII. Distinct abnormalities of vWF are responsible for the three main types of vWD. Types 1 and 3 are defined by a quantitative defect of vWF whereas type 2, comprising subtypes 2A, 2B, 2M and 2N, refers to patients with a qualitative defect of vWF. Recent progress in the molecular biology of vWF has led to the identification of the molecul
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The recent publication of a commentary article by Dadkhah et al. (J Cell Commun Signal 11:181-185, 2017) which addressed issues raised by the citation of questionable scientific papers in current databases and the recent retraction of manuscripts dealing with the biological properties of the CCN1 protein by Lin et al. (J Biol Chem 291(53):27433, 2016) prompted us to examine how this situation reflects an evolution of the original citation system, endangering scientific communication. We argue that the increasing number of publication retractions that have been witnessed over several years is a
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Many insects manipulate plants by injecting effector proteins. In one extreme example of this molecular "hijacking," Hormaphis cornu aphids inject bicycle proteins into Hamamelis virginiana, contributing to the development of novel organs called galls. Bicycle proteins share no amino acid sequence similarity with proteins of known function. Here, we report the crystal structures of two divergent bicycle proteins. Both proteins contain saposin-like folds: one with multiple disulfide bonds exhibits a swapped domain topology; the other has no disulfide bonds and possesses two distinct, tandem dom
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVE: This study investigated the locations of amino acid modifications within two major human hair keratins (Type I K31 and Type II K85) with probable implications for protein and hair structural component integrity. The particular focus was on cysteine modifications that disrupt intra-protein and inter-protein disulphide bonds.
METHODS: Human hair was exposed to accelerated, sequential heat or UV treatments, simulating effects resulting from the use of heated styling tools and environmental exposure over a time frame approximating one year. The proteins were extracted and detected usin
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Iris tectorum Maxim. (CSG) is a notable traditional Chinese medicinal herb recognized for its broad pharmacological activities, indicating potential therapeutic effects in treating tonsillitis and dyspepsia. This study employed a network pharmacology approach to elucidate the shared mechanisms of CSG in the treatment of tonsillitis and dyspepsia. First, potential targets of CSG were predicted. Second, disease-related genes for tonsillitis and dyspepsia were retrieved from public databases. Third, a protein-protein interaction network was constructed and analyzed using gene ontology and Kyoto e
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Menin/MEN1 is a scaffold protein that participates in proliferation, regulation of gene transcription, DNA damage repair, and signal transduction. In hematological malignancies harboring the KMT2A/MLL1 (MLLr) chromosomal rearrangements, the interaction of the oncogenic fusion protein MLLr with MEN1 has been shown to be essential. MEN1 binders inhibiting the MEN1 and KMT2A interaction have been shown to be effective against MLLr AML and B-ALL in experimental models and clinical studies. We hypothesized that in addition to the MEN1-KMT2A interaction, alternative mechanisms might be instrumental
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Approximately 500,000 new head and neck squamous cell carcinoma (HNSCC) cases are detected every year around the world, and its incidence ranks sixth among all cancer types globally. Among these cases, oral squamous cell carcinoma (OSCC) and laryngeal squamous cell carcinoma (LSCC) are HNSCC subtypes with high incidence rates, especially in China. The present study examines the association between the apolipoprotein L1 (APOL1) mRNA and protein expression and clinical parameters in HNSCC. The two most common types (oral and larynx) of HNSCC were selected for subgroup analyses. Immunohistochemis
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
After the first reported case of Zika virus (ZIKV) in Brazil, in 2015, a significant increase in the reported cases of microcephaly was observed. Microcephaly is a neurological condition in which the infant's head is significantly smaller with complications in brain development. Recently, two small membrane-associated interferon-inducible transmembrane proteins (IFITM1 and IFITM3) have been shown to repress members of the flaviviridae family which includes ZIKV. However, the exact mechanisms leading to the inhibition of the virus are yet unknown. Here, we assembled an interactome of IFITM1 and
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: The clinical presentation of the inflammatory bowel diseases (IBD) is extremely heterogenous and is characterized by various extraintestinal manifestations and complications (EIM). Increasing genetic insight for IBD and EIM shows multiple shared susceptibility loci. We hypothesize that, next to these overlapping genetic risk loci, distinct disease pathways are shared between IBD and EIM.
METHODS: The overlapping genetic risk loci for IBD and its EIM were searched in literature. We assessed shared disease pathways by performing an extensive pathway analysis by protein-protein inter
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАОбзорПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND AND AIMS: Calcific aortic valve disease (CAVD) is characterized by progressive leaflet thickening and calcification, with no available pharmacological treatments. Plasma proteins play a pivotal role in disease regulation. This study aimed to uncover novel therapeutic targets for CAVD using Mendelian randomization (MR) integrated with transcriptomic analysis.
METHODS: Protein quantitative trait loci (pQTL) from the deCODE and UK Biobank Pharma Proteomics Project (UKB-PPP) plasma protein databases were used as exposure data. The FinnGen cohort (9870 cases, 402,311 controls) served as
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVE: To explore the potential molecular mechanism of Qigu capsule (，QGC) in the treatment of sarcopenia through network pharmacology and to verify it experimentally.
METHODS: The active compounds of QGC and common targets between QGC and sarcopenia were screened from databases. Then the herbs-compounds-targets network, and protein-protein interaction (PPI) network was constructed. Gene ontology (GO) and Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes (KEGG) pathway enrichment analysis were performed by R software. Next, we used a dexamethasone-induced sarcopenia mouse model to evaluate the anti
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Diagnosing oral submucous fibrosis (OSMF) is invariably challenging. The disease can be detected after reaching its final stage and requires complex treatment. Changes in its salivary profile can be used as a reference to see this disorder and as a basis for diagnostic prediction. This study is aimed to analyze the salivary profile as a diagnosis marker in patients with OSMF. The study using Preferred Reporting Items for Systematic Reviews and Meta-analyses was conducted using PubMed, Science Direct, and Scopus databases. A thorough literature search between 1991 and 2023 was performed. Twenty
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования