Legionella pneumophila is a bacterial pathogen present in aquatic environments that can cause a severe pneumonia called Legionnaires' disease. Soon after its recognition, it was shown that Legionella replicates inside amoeba, suggesting that bacteria replicating in environmental protozoa are able to exploit conserved signaling pathways in human phagocytic cells. Comparative, evolutionary, and functional genomics suggests that the Legionella-amoeba interaction has shaped this pathogen more than previously thought. A complex evolutionary scenario involving mobile genetic elements, type IV secret
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
In 1996 a large, 300-bed pediatric hospital in Warsaw, Poland, started a program of monitoring infections caused by extended-spectrum beta-lactamase (ESBL)-producing microorganisms. Over the first 3-month period eight Klebsiella pneumoniae isolates were identified as being resistant to ceftazidime. Six of these were found to produce the TEM-47 ESBL, which we first described in a K. pneumoniae strain recovered a year before in a pediatric hospital in Lódź, Poland, which is 140 km from Warsaw. Typing results revealed a very close relatedness among all these isolates, which suggested that the clo
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Research into the evolution and pathogenesis of Vibrio cholerae has benefited greatly from the generation of high-throughput sequencing data to drive molecular analyses. The steady accumulation of these data sets now provides a unique opportunity for in silico hypothesis generation via coexpression analysis. Here, we leverage all published V. cholerae RNA sequencing data, in combination with select data from other platforms, to generate a gene coexpression network that validates known gene interactions and identifies novel genetic partners across the entire V. cholerae genome. This network pro
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
UNLABELLED: The emergence of third-generation cephalosporin-resistant bacteria poses a significant human health hazard worldwide. We aimed to investigate the prevalence of extended-spectrum β-lactamase (ESBL)/AmpC β-lactamase-producing third-generation cephalosporin-resistant Escherichia coli in ceftiofur-use and non-use pig farms. A total of 585 E. coli isolates were collected from pig feces (n = 354) and farm environments (n = 231) across various farms between 2022 and 2023 in South Korea. Among them, 61% of E. coli from pigs and 22.9% from the environment were resistant to ceftiofur, with s
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Mobile colistin resistance (mcr) genes (mcr-1 to mcr-10) threaten the efficacy of colistin (COL), a polymyxin antibiotic that is used as a last-line agent for the treatment of deadly infections caused by multidrug-resistant and extensively drug-resistant bacteria in humans and animals. COL has been used for more than 60 years for the prophylactic control and treatment of infections in livestock husbandry but not in horses. Polymyxin B is used for the prophylactic control and empirical treatment of infections in horses without conducting sensitivity tests. The lack of sensitivity testing exerts
СтатьяОбзорПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Acinetobacter baumannii is a multidrug resistant nosocomial pathogen that shows an outstanding ability to undergo genetic exchange, thereby acquiring different traits that contribute to its success. In this work, we identified genetic features of an indigo-pigmented A. baumannii strain (Ab33405) that belongs to the clonal complex CC113B/CC79P. Ab33405 possesses a high number of genes coding for antibiotic resistance and virulence factors that may contribute to its survival, not only in the human host, but also in the hospital environment. Thirteen genes conferring resistance to different antib
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Chiral pesticides often exhibit an enantioselective environmental behavior and ecological effects. Using a soil-earthworm microcosm, we investigated the dissipation and bioaccumulation of metalaxyl enantiomers and their effects on gut microbiota and antibiotic resistance genes (ARGs). R-metalaxyl dissipated rapidly (half-life 7-9 d), whereas S-metalaxyl persisted much longer (about 90 d), imposing prolonged selective pressure. Earthworms preferentially accumulated R-metalaxyl, with a maximum bioaccumulation factor of 0.42. High-concentration S-metalaxyl increased the total ARG abundance in ear
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Enterococcus faecalis is a Gram-positive bacterium and opportunistic pathogen that acquires resistance to a wide range of antibiotics by horizontal gene transfer (HGT). The rapid increase of multidrug-resistant (MDR) bacteria including MDR E. faecalis necessitates the development of alternative therapies and a deeper understanding of the factors that impact HGT. CRISPR-Cas systems provide sequence-specific defense against HGT. From previous studies, we know that E. faecalis CRISPR-Cas provides sequence-specific anti-plasmid defense during agar plate biofilm mating and in the murine intestine.
СтатьяПрепринтПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Dissemination of carbapenemase-encoding plasmids by horizontal gene transfer in multidrug-resistant bacteria is the major driver of rising carbapenem-resistance, but the conjugative mechanics and evolution of clinically relevant plasmids are not yet clear. We performed whole-genome sequencing on 1,215 clinical Enterobacterales isolates collected in Singapore during 2010-2015. We identified 1,126 carbapenemase-encoding plasmids and discovered pKPC2 is becoming the dominant plasmid in Singapore, overtaking an earlier dominant plasmid, pNDM1. pKPC2 frequently conjugates with many Enterobacterales
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
An estimated 1.3 million Salmonella infections and 420 deaths occur annually in the United States, with an estimated economic burden of $3.7 billion. More than 50% of US swine operations test positive for Salmonella according to the National Animal Health Monitoring System, and 20% of Salmonella from swine are multidrug resistant (resistant to ≥3 antimicrobial classes) as reported by the National Antimicrobial Resistance Monitoring System. This review on Salmonella in swine addresses the current status of these topics by discussing antimicrobial resistance and metal tolerance in Salmonella and
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Yersinia pestis is transmitted by fleas and causes bubonic plague, characterized by severe local lymphadenitis that progresses rapidly to systemic infection and life-threatening septicemia. Here, we show that although flea-borne transmission usually leads to bubonic plague in mice, it can also lead to primary septicemic plague. However, intradermal injection of Y. pestis, commonly used to mimic transmission by fleabite, leads only to bubonic plague. A Y. pestis strain lacking the plasmid-encoded cell-surface plasminogen activator, which is avirulent by intradermal or s.c. injection, was able t
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
In this study, we examined molecular mechanisms associated with multidrug resistance (MDR) in a collection of Escherichia coli isolates recovered from hospitalized animals in Ireland. PCR and DNA sequencing were used to identify genes associated with resistance. Class 1 integrons were prevalent (94.6%) and contained gene cassettes recognized previously and implicated mainly in resistance to aminoglycosides, β-lactams, and trimethoprim (aadA1, dfrA1-aadA1, dfrA17-aadA5, dfrA12-orfF-aadA2, bla(OXA-30)-aadA1, aacC1-orf1-orf2-aadA1, dfr7). Class 2 integrons (13.5%) contained the dfrA1-sat1-aadA1 g
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
This study reports phenotypic and molecular characterization of a novel CTX-M beta-lactamase carried by two Klebsiella pneumoniae isolates collected from two hospitals in China. Conjugation experiment, Southern hybridization, susceptibility testing, isoelectric focusing, PCR, and sequencing techniques as well as clone, expression, purification and kinetics were carried out to describe the characterization of the novel CTX-M-type enzyme. The analyses of plasmid profiling and pulsed-field gel electrophoresis of the novel enzyme were performed to investigate epidemiology. The PCR products had 967
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
In this review, I describe recent findings on the molecular architecture and genomic characterization of giant viruses that infect microbial eukaryotes (protists) across diverse ecosystems and ecological niches. Giant viruses are distinguished by their large and complex genomes, which encode a wide range of functions, including protein translation, carbohydrate and lipid metabolism, nitrogen cycling, light assimilation, and key metabolic pathways such as glycolysis and the tricarboxylic acid cycle. Additionally, these genomes feature unique genes, often acquired through horizontal gene transfe
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Legionella pneumophila is an intracellular pathogen that causes a severe pneumonia called Legionnaires' disease that is often fatal when not promptly diagnosed and treated. Legionella parasitize aquatic protozoa with which it co-evolved over an evolutionary long time. The close relationship between hosts and pathogens, their co-evolution, led to molecular interactions such as the exchange of genetic material through horizontal gene transfer (HGT). Genome sequencing of L. pneumophila and of the entire genus Legionella that comprises over 60 species revealed that Legionellae have co-opted genes
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Methicillin-resistant Staphylococcus aureus (MRSA) is an intractable nosocomial pathogen. The chemotherapeutic intransigence of this organism stems from its predilection to antimicrobial resistance as a consequential response to selective pressures prevailing in the clinical environment. MRSA isolates are frequently resistant to all practicable antimicrobials except the glycopeptide, vancomycin. Although antimicrobial resistance sometimes arises via chromosomal mutation, the emergence of multiply-antibiotic-resistant staphylococci is primarily due to the acquisition of pre-existent resistance
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The CRISPR-Cas defense system safeguards prokaryotes against foreign genetic elements. Its activity is determined by the combined effects of adaptation and interference. However, the dynamic regulation of these two processes remains not fully understood. In this study, we identify the LysR-type transcriptional regulator LrhA, which is differentially expressed in various Escherichia coli strains, as a novel CRISPR-Cas activator that plays a critical role in modulating host defense levels. In a representative strain expressing a high level of LrhA, the regulator enhances CRISPR-Cas-mediated adap
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Polyaromatic hydrocarbons (PAHs) are widely spread ecological contaminants. Antibiotic resistance genes (ARGs) are present with mobile genetic elements (MGE) in the bacteria. There are molecular evidences that PAHs may induce the development of ARGs in contaminated soils. Also, the abundance of ARGs related to tetracycline, sulfonamides, aminoglycosides, ampicillin, and fluoroquinolones is high in PAH-contaminated environments. Genes encoding the efflux pump are located in the MGE and, along with class 1 integrons, have a significant role as a connecting link between PAH contamination and enri
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Mosaic penA alleles have caused most of the cephalosporin resistance in Neisseria gonorrhoeae, but their evolution is mostly unknown. The penA gene from Neisseria cinerea strain AM1601 (ceftriaxone MIC, 1.0 μg/ml) caused ceftriaxone resistance (MIC, 1 μg/ml) in a ceftriaxone-susceptible gonococcal strain. The 3'-terminal half of AM1601 penA was almost identical to that of the ceftriaxone-resistant gonococcal GU140106 and FC428 strains. N. cinerea can serve as a reservoir of ceftriaxone resistance-mediating penA sequences that can be transferred to gonococci.
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The aim of this study was to identify genes conferring resistance to fluoroquinolones and extended-spectrum β-lactams in non-typhoidal Salmonella (NTS) from food-producing animals in China. In total, 31 non-duplicate NTS were obtained from food-producing animals that were sick. Isolates were identified and serotyped and the genetic relatedness of the isolates was determined by pulsed-field gel electrophoresis of XbaI-digested chromosomal DNA. Antimicrobial susceptibility was determined using Clinical and Laboratory Standards Institute methodology. The presence of extended-spectrum β-lactamase
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования