Infectious bovine keratoconjunctivitis (IBK) is associated with 2 species of Moraxella: M. bovis and M. bovoculi. A third novel Moraxella spp., designated tentatively as M. oculi, has been identified from the eyes of cattle with and without pinkeye. These 3 Moraxella spp. can be found in various combinations within the same clinical sample, making speciation of this genus directly from a sample impossible with Sanger sequencing. Assessing Moraxella diversity found in IBK- and non-IBK-affected cattle eyes, independent of culture, may provide additional information about IBK by avoiding the sele
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Pneumocystis jirovecii (PJ) is an opportunistic pathogenic fungus, and PJ pneumonia (PJP) is a commonly problem in HIV-positive patients. While PJP is not caused by HIV, it generally advances rapidly and can quickly lead to severe respiratory failure. To improve pediatricians' understanding of the condition and aid early accurate diagnoses and therapy, we examined the clinical characteristics of five instances of non-HIV related PJP (NH-PJP) in children and the efficacy of metagenomic next-generation sequencing (mNGS) in its diagnosis.
METHODS: From January 2020 to June 2022, five
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVE: As an opportunistic pathogen, Nocardia often occurring in the immunocompromised hosts. As the unspecifc clinical presentation and low identification rate of the culture dependent methods, Nocardia infection may be under-diagnosis. Recent study have reported physicians could benefit from metagenomic next-generation sequencing (mNGS) in Nocardia diagnosis. Herein, we present patients with a positive detection of nocardiosis in mNGS, aiming to provide useful information for an differential diagnosis and patients management.
METHODS: A total of 3756 samples detected for mNGS from March
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Leptospirosis is an infectious disease caused by pathogenic Leptospira spp., which could result in severe illnesses. Indirect contact with these pathogens is more common. Individuals could contract this disease through contact with contaminated water or during floods. In this case, we present the details of a 40-year-old male pig farmer who suffered from severe pulmonary hemorrhagic leptospirosis and multiple organ failure. The diagnosis of leptospirosis was confirmed through metagenomics next-generation sequencing (mNGS) while the patient received extracorporeal membrane oxygenati
Клинический случайСтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Objective: To investigate the effects of Modified Sijunzi Decoction on the diversity of intestinal microflora of in severe scald rabbits based on 16S ribosomal RNA (16S rRNA) high-throughput sequencing. Methods: The experimental research method was adopted. Ninety Japanese big-ear rabbits regardless gender, aged 6 to 8 months, were randomly divided into normal control group, scald alone group, scald+low-dose group, scald+medium-dose group, and scald+high-dose group, with 18 rabbits in each group. The rabbits in normal control group were free to eat and drink, and the rabbits in scald alone gro
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
CONTEXT.—: Next-generation sequencing is a powerful clinical tool for cancer management but can produce incidental/secondary findings that require special consideration.
OBJECTIVE.—: To discuss clinical and laboratory issues related to incidental or secondary germline findings in the clinical setting of tumor testing and inform future guidelines in this area.
DESIGN.—: A College of American Pathologists workgroup including representation from the American Society of Clinical Oncology, the Association for Molecular Pathology, and the American College of Medical Genetics and Genomics created a
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
COVID-19 is caused by SARS-CoV-2, several virulent variants of which have emerged since 2019. More than 529 million people have been infected, and at least 6 million have died. Our aim was to develop a fast, accurate, low-cost method for detecting and identifying newly emerging variants of concern (VOCs) that could pose a global threat. The 341-bp DNA sequence of a specific region of the SARS-CoV-2's spike protein was amplified by a one-step PCR on RNA samples from 46 patients. The product was sequenced using next-generation sequencing (NGS). DNA sequences from seven genomes, the original Wuha
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: We report a rare case of Gardnerella vaginalis found in the cerebrospinal fluid of a young boy.
CASE PRESENTATION: A 14-year-old boy was admitted to hospital with headache, vomiting, fever, drowsiness and positive meningeal irritation signs on examination. Cerebrospinal fluid (CSF) shows white blood cell and protein were elevated, and glucose was low. Traditional aerobic and anaerobic culture of CSF did not grow any organisms. However, metagenomic next-generation sequencing (mNGS) reveals G. vaginalis in his CSF. The patient was diagnosed with purulent meningitis, and treated with
Клинический случайСтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: The effectiveness of metagenomic next-generation sequencing (mNGS) in respiratory pathogen detection and clinical decision-making in critically rheumatic patients remains largely unexplored.
METHODS: A single-center retrospective study of 58 rheumatic patients who were admitted to ICU due to suspected pneumonia with acute respiratory failure if they underwent both bronchoalveolar lavage fluid specimen mNGS and combined microbiological tests (CMTs) was conducted to compare their diagnostic performance, using clinical composite diagnosis as the gold standard. Treatment modifications
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
PURPOSE OF REVIEW: Hematologic malignancies were previously thought to be primarily sporadic cancers without germline predispositions. However, over the last two decades, with the widespread use of next generation sequencing (NGS), there have been several genes have been identified that carry a risk of inheriting hematologic malignancies. Identification of individuals with hereditary hematologic malignancies (HHM) involves a high index of suspicion and careful attention to family history, clinical features, and variant allele frequency on somatic NGS panels.
RECENT FINDINGS: Over the last sev
СтатьяОбзорПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Three novel HLA-C alleles were identified during routine next-generation sequencing.
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
In children undergoing genetic testing for physical health concerns, we examined how often the results also revealed information about their risk for neurodevelopmental disorders. The study sample consisted of 3056 genetic tests (1686 chromosomal microarrays--CMAs, and 1378 next-generation sequencing--NGS panels) ordered at a tertiary pediatric hospital because of a physical/congenital health problem. Tests ordered to investigate developmental concerns were excluded. Pathogenic, or likely pathogenic variants were manually reviewed for diagnostic likelihood, and for evidence of an association w
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Next-generation sequencing holds unprecedented throughput in terms of informational content to cost. The technology has entered the scene in laboratory diagnostics and offers flexible workflows in biomedical research. However, the rapid acquisition of genomic data also gives rise to a substantial fraction of sequencing artifacts, causing the detection of false-positive germline variants or erroneous somatic mutations. Consequently, there is a pressing need for efficient and practical quality assessment in sequencing projects. In this study, we investigate using heterozygous variant allele freq
МетаанализСтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: The purpose of the study is to assess the etiology detection ability of Metagenomic Next-Generation Sequencing (mNGS) on formalin fixation and paraffin embedding (FFPE) tissue from postoperative biopsy specimens.
METHODS: We prospectively enrolled specimens from patients undergone surgery biopsy due to undefinite diagnosis and pathologically indicated granulomatous lesions. FFPE tissues were tested by mNGS and histopathology. The etiology detection rate of mNGS was calculated and compared with histopathology..
RESULTS: Among the 69 cases eventually included, 41 (59.42%) were diag
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Growing evidence supports syndromic and nonsyndromic causes of obesity, including genome-wide association studies, candidate gene analysis, advanced genetic technology using next-generation sequencing (NGS), and identification of copy number variants. Identification of susceptibility genes impacts mechanistic understanding and informs precision medicine. The cause of obesity is heterogeneous with complex biological processes playing a role by controlling peptides involved in regulating appetite and food intake, cellular energy, and metabolism. Evidence for heritability shows genetic components
СтатьяОбзорПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Elucidating the mechanism by which biallelic inactivation evolved could provide a mechanistic understanding for NF2 tumorigenesis and also a rationale for clinical management.
METHODS: A cohort of 60 NF2 patients was recruited. Next-generation sequencing of tumor and paired control samples was used to explore how NF2 mutations evolve in determining the clinical phenotypes.
RESULTS: In total, 60 blood samples (one from each patient) and 61 (from 35 patients) NF2-associated tumors were collected. Next-generation sequencing of the blood samples detected "first hit" NF2 mutation in 3
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Clinical studies suggest that the dysfunction of T cells and B cells may play an essential role in the pathogenesis of idiopathic nephrotic syndrome (INS), but laboratory evidence is lacking. Therefore, this study explored T-cell receptor (TCR) and B-cell receptor (BCR) profiling in children with idiopathic nephrotic syndrome.
METHODS: High-throughput sequencing technology was used to profile the TCR and BCR repertoires in children with INS. Peripheral blood was collected from ten INS patients, including five vinculin autoantibody-positive patients and five vinculin autoantibody-n
Video-Audio MediaСтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Cystic kidney disease is a clinically and genetically diverse group of diseases, with more than 100 genes known to date. One in 500 is affected worldwide, mostly due to a malfunction of cilia. New genes have been identified recently for the most common form autosomal dominant polycystic kidney disease (ADPKD). Every fourth ADPKD patient is lacking a positive family history (mostly due to a de novo mutation); in these cases remaining family members can be relieved. Differentiation of entities just based on clinical and imaging data is often most challenging. However, an accurate classification
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Objective: To analyze the clinical characteristics and molecular mechanisms of 5 cases of hypoparathyroidism caused by GATA3 gene mutation. Methods: A total of 5 childhood-onset hypoparathyroidism patients with GATA3 mutation were identified from 198 hypoparathyroidism (aged ≤18 years) from 1975 to 2021 in Peking Union Medical College Hospital. Clinical data and biochemical indices of the 5 patients were collected and analyzed retrospectively. Genetic screening was conducted by targeted next-generation sequencing (T-NGS), and bioinformatics analysis was performed to analyze the underline mecha
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: A prosthetic joint infection (PJI) is a devastating complication following total joint arthroplasties with poor prognosis. Identifying an accurate and prompt diagnostic method is particularly important for PJI. Recently, the diagnostic value of metagenomic next-generation sequencing (mNGS) in detecting PJI has attracted much attention, while the evidence of its accuracy is quite limited. Thus, this study aimed to evaluate the accuracy of mNGS for the diagnosis of PJI.
METHODS: We summarized published studies to identify the potential diagnostic value of mNGS for PJI patients by se
СтатьяМетаанализСистематический обзорПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования