Acquired TERT promoter (TERTp) variants are found in the blood of patients with telomere biology disorders and carry diagnostic and prognostic significance. Detection of these variants is challenging because of low variant allele frequencies (VAFs) and high GC content. The sensitivity of long-read amplicon sequencing with deepSNV analysis, referred to as LR-deep AmpSeq, for TERTp variant detection was tested. Among 47 patients with telomere biology disorder features, an average depth of coverage of 7943× was achieved, and seven TERTp variants were detected in six individuals (13%) with VAFs ra
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Understanding the immunogenetic structure of the major histocompatibility complex (MHC) in Arabian horses helps to clarify the population health structure-related phenotypes of this historically influential breed. Straight Egyptian (SE) Arabian horses, which fall under Equus ferus caballus, are of global value but are limited in number, raising concerns about their distribution and the genetic diversity associated with immunity. In this study, we examined 57 Egyptian Arabian horses from two breeding programs: one in Germany (AR-DE) and the other in Qatar (AR-QA). Sixteen polymorphic intra-MHC
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The HLA system has been extensively studied due to its crucial role in the immune system, as well as its application in population, anthropological and epidemiological research. This study analysed 11 loci of HLA allele and haplotype frequency (HLA-A, -B, -C, -DRB1, -DQA1, -DQB1, -DPA1, -DPB1 and -DRB3/4/5) using high-resolution next-generation sequencing technology. A total of 5287 volunteer bone marrow donors from the Northwestern region of the state of Paraná, in Southern Brazil, were rated. Most of the analysed loci were in Hardy-Weinberg equilibrium, except for HLA-DPA1 and -DPB1. The mos
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Human PTGS1 and PTGS2 encode cyclooxygenase paralogs that regulate prostaglandin biosynthesis and are major targets of nonsteroidal anti-inflammatory drugs (NSAIDs). Interpreting population-differentiated PTGS variation requires integration of allele-frequency structure with transcript consequence, protein topology, splice-prediction evidence and structural context. This study integrated allele-resolved population differentiation, transcript-aware consequence annotation, splice-prediction boundary checks, protein-domain mapping, direct leader-sequence property calculations and controlled struc
СтатьяСравнительное исследованиеПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Genome sequencing has improved rare disease diagnosis and is now part of routine clinical care in the National Health Service in England. Automated prioritisation pipelines narrow millions of variants per patient to a small subset for clinical review, a process that relies on allele frequency resources that do not fully represent human genetic diversity. We assessed ancestry-related differences in variant prioritisation and diagnostic outcomes in patients from the UK 100,000 Genomes Project.
METHODS: We analysed 29,405 rare disease probands with genome sequencing and linked clinic
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
RATIONALE: Hemophilia A is an X-linked recessive bleeding disorder caused by a deficiency or dysfunction of factor VIII (FVIII), affecting approximately 1 in 5,000 males globally, including those in northern India. Accurate carrier detection is vital for genetic counseling and early diagnosis. This study aimed to assess the allele frequencies of three key intronic polymorphisms-IVS7-SNP (G/A), rs4898352 (T/A) in intron 18 (Bcl-I), and rs4074307 (C/T) in intron 19 (Hind-III)-in Indian children with Hemophilia A and evaluate their utility in carrier detection and linkage analysis.
METHODS: A to
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Inborn errors of immunity (IEI) contribute substantially to morbidity in the Middle East and North Africa (MENA), particularly in the United Arab Emirates (UAE), where high consanguinity increases the prevalence of autosomal-recessive and complex genetic disorders. Regional IEI genomic data remain limited, and population-specific variants are underrepresented in global databases, limiting diagnostic accuracy and precision-medicine implementation. We retrospectively reviewed 2,500 patients assigned immunodeficiency-related ICD codes over ten years at two tertiary centers in Al Ain, UAE. Based o
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVES: To estimate the global prevalence of genetic carriers of pheochromocytoma-paraganglioma syndromes (PPGLs) in a large multiethnic genomic database.
METHODS: We analyzed sequencing data from 807 162 unrelated individuals in the gnomAD v4.1 database, representing a global population of diverse ethnic ancestries. Eleven PPGLs-associated genes were examined: FH, NF1, RET, SDHA, SDHAF2, SDHB, SDHC, SDHD, TMEM127, VHL, and MAX. Pathogenic or likely pathogenic variants (P/LP) were identified from ClinVar, while additional predicted deleterious variants were included based on loss-of-funct
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Tooth agenesis (TA), one of the most common craniofacial developmental anomalies, is characterized by the congenital absence of one or more teeth. While numerous genes have been implicated in non-syndromic tooth agenesis (NSTA), its genetic architecture often remains complex. In this study, we investigated the genetic basis of NSTA in a two-generation Chinese family utilizing whole-exome sequencing (WES) complemented by Sanger sequencing. Our analysis revealed a complex segregation pattern of multiple variants. After systematic filtering based on pathogenicity predictions and minor allele freq
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Multiplexed Assays of Variant Effects (MAVEs) can test all possible single variants in a gene of interest. The resulting saturation-style functional data may help resolve variant classification disparities between populations, especially for Variants of Uncertain Significance (VUS).
METHODS: We analyzed clinical significance classifications in 213,663 individuals of European-like genetic ancestry versus 206,975 individuals of non-European-like genetic ancestry from All of Us and the Genome Aggregation Database. Then, we incorporated clinically calibrated MAVE data into the Clinica
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
PURPOSE: To investigate the number of rare missense variants observed in human genome sequences by ACMG/AMP PP3/BP4 evidence strength, following the ClinGen-calibrated PP3/BP4 computational recommendations.
METHODS: Missense variants from the genome sequences of 300 probands from the Rare Genomes Project with suspected rare disease were analyzed using computational prediction tools that were able to reach PP3_Strong and BP4_Moderate evidence strengths (BayesDel, MutPred2, REVEL, and VEST4). The numbers of variants at each evidence strength were analyzed across disease-associated genes and gen
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Knockdown resistance (kdr) is one of the primary resistance mechanisms present in anopheline species. Although this mutation is largely spread across the Anopheles gambiae s.l. members, its prevalence in other species is still not well documented.
METHODS: The present study investigated the distribution and allelic frequencies of kdr in An. gambiae s.l., An. pharoensis, and An. ziemanni samples collected in 2022 and 2023 in nine sites spread across five ecogeographical settings in Cameroon. Members of the An. gambiae complex were identified molecularly by polymerase chain reaction
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Human leukocyte antigen (HLA) class I molecules are expressed on platelets and can represent a source of alloimmunization in recipients of platelet transfusions. HLA mismatch between donors and recipients may be associated with the induction of anti-HLA antibodies, which can culminate in refractoriness to platelet transfusions. In the present study we analyzed HLA allele group frequencies and HLA expression levels on human platelets from blood donors.
MATERIALS AND METHODS: Platelet-rich plasma was collected from 139 donors to monitor platelet HLA class I expression by flow cytome
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The diagnosis of familial Mediterranean fever (FMF) is primarily based on clinical standards. The purpose of this study was to investigate the relevance of Mediterranean fever (MEFV) genetic testing in the diagnosis of FMF as well as to identify the most frequent variant alleles and their relationship to clinical symptoms in Egyptian patients. Egyptian patients with a clinical suspicion of having FMF were studied in order to determine MEFV genotypes. Each patient was meticulously evaluated through an extensive collection of their medical history, a thorough clinical examination, and a series o
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: 'Benign ethnic neutropenia' (BEN) is a heritable condition characterized by lower neutrophil counts, predominantly observed in individuals of African ancestry, and the genetic basis of BEN remains a subject of extensive research. In this study, we aimed to dissect the genetic architecture underlying neutrophil count variation through a linear-mixed model genome-wide association study (GWAS) in a population of African ancestry (N = 5976). Malaria caused by P. falciparum imposes a tremendous public health burden on people living in sub-Saharan Africa. Individuals living in malaria en
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: The Kumamoto strain of Japanese Brown (JBRK) cattle is a sub-breed of Wagyu and has a different genetic background than that of Japanese Black (JB) cattle. Bovine leukemia virus (BLV) is the pathogen causing enzootic bovine leukosis (EBL), the predominant type of bovine leukosis (BL). EBL is one of the most common bovine infectious diseases in dairy countries, including Japan. Some host genetic factors, including the bovine leukocyte antigen (BoLA)-DRB3 gene, have been associated with the proviral load (PVL) of BLV and/or onset of EBL. Here, we determined the number of BL cases by
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Anaplastic lymphoma kinase (ALK) is the most common fusion gene involved in non-small cell lung cancer (NSCLC), and remarkable response has been achieved with the use of ALK tyrosine kinase inhibitors (ALK-TKIs). However, the clinical efficacy is highly variable. Pre-existing intratumoral heterogeneity (ITH) has been proven to contribute to the poor treatment response and the resistance to targeted therapies. In this work, we investigated whether the variant allele frequencies (VAFs) of ALK fusions can help assess ITH and predict targeted therapy efficacy. Through the application of next-gener
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVES: To research the associations between fructose-bisphosphate aldolase B (ALDOB) gene polymorphisms and intrahepatic cholestasis of pregnancy (ICP) risk.
MATERIAL AND METHODS: Whole-genome sequencing (WGS) was performed to detect ALDOB polymorphisms. Five web-available tools were employed to predict the effect of the site variant on the protein. Protein structure comparisons between the reference and ALDOB-modified samples were performed by SWISS-MODEL and Chimera 1.14rc, respectively.
RESULTS: We identified 28 genetic variants in the ALDOB gene. When the cut-off value of minor alle
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
We evaluated the variation in the frequency of benzimidazole (BZ) resistance-associated alleles at codons 200, 167 and 368 (F200Y, F167Y, V368L) of the β-tubulin isotype 1 gene during the patent period in isolates of Haemonchus contortus susceptible and resistant to BZ using pyrosequencing. Four lambs 5-6 months old were infected with 5000-6000 infective third-stage larvae (L3) of the susceptible MHco1 and the multi-resistant MHco4 isolates, respectively. Faecal samples were collected 28-times during 20-90 days post-infection (dpi). Coprocultures were subsequently prepared to produce L3 for ge
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Clonal hematopoiesis (CH) gives rise to mutated leukocyte clones that induce cardiovascular inflammation and thereby impact the disease course in atherosclerosis and ischemic heart failure. CH of indeterminate potential refers to a variant allele frequency (VAF) (a marker for clone size) in blood of ≥2%. The impact of CH clones-including small clone sizes (VAF <0.5%)-in nonischemic dilated cardiomyopathy (DCM) remains largely undetermined.
OBJECTIVES: The authors sought to establish the prognostic impact of CH in DCM including small clones.
METHODS: CH is determined using an ultr
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования