Solution 2D (1)H NMR was carried out on the azide-ligated substrate complex of human heme oxygenase, hHO, to provide information on the active site molecular structure, chromophore electronic/magnetic properties, and the distal H-bond network linked to the exogenous ligand by catalytically relevant oriented water molecules. While 2D NMR exhibited very similar patterns of two-dimensional nuclear Overhauser spectroscopy cross peaks of residues with substrate and among residues as the previously characterized cyanide complex, significant, broadly distributed chemical shift differences were observ
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Alpha-synuclein remains a protein of interest due to its propensity to form fibrillar aggregates in neurodegenerative disease and its putative function in synaptic vesicle regulation. Herein, we present a series of atomistic molecular dynamics simulations of wild-type alpha-synuclein and three Parkinson disease familial mutants (A30P, A53T, and E46K) in two distinct environments. First, in order to match recent NMR experiments, we have simulated each protein bound to an SDS detergent micelle. Second, in order to connect more closely to the true biological environment, we have simulated the pro
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Ornithine aminotransferase (OAT) deficiency (MIM: 258870) is a rare congenital metabolic disorder characterized by gyrate atrophy of the choroid and retina. Here, we report a 37-year-old male with gyrate atrophy of the choroid and retina who has been treated for 18 years. At the age of 7 years, the patient consulted an ophthalmologist due to progressive loss of vision. A large atrophied area was observed in his retina, and OAT deficiency was suspected. At the age of 19 years, amino acid analysis revealed high serum ornithine levels (1,140 nmol/ml), with the normal range being 40-100 nmol/ml. H
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The structure of Gd-DTPA-polylysine, Gd-DOTA-polylysine, Gd-SCN-Bz-DOTA-polylysine, and Gd-DTPA-poly(glu:lys) was investigated with circular dichroism, gel permeation chromatography, low angle light scattering, and proton longitudinal relaxivity. Molecular modeling calculations were performed and predicted helical secondary structure for charged Gd-chelator residues, i.e., Gd-DTPA, when the DTPA conjugation levels reached 90% and higher. This helical secondary structure was observed with circular dichroism. The conformational transition from coiled to extended linear was observed also by gel p
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Deficiency of glucose-6-phosphatase (G6Pase), an endoplasmic reticulum transmembrane glycoprotein, causes glycogen storage disease type 1a. We have recently shown that human G6Pase contains an odd number of transmembrane segments, supporting a nine-transmembrane helical model for this enzyme. Sequence analysis predicts the presence of three potential asparagine (N)-linked glycosylation sites, N96TS, N203AS, and N276SS, conserved among mammalian G6Pases. According to this model, Asn96, located in a 37-residue luminal loop, is a potential acceptor for oligosaccharides, whereas Asn203 and Asn276,
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The three-dimensional structures of the class II anticoagulant phospholipase A2 (PLA2) toxin RVV-VD from the venom of Russell's viper, Vipera russelli russelli, and the class I neurotoxic PLA2 Notechis II-5 from the, Australian tiger snake, Notechis scutatus scutatus, were determined to 2.2 A and 3.0 A resolution, respectively. Both enzymes are monomeric and consist of 121 and 119 residues, respectively. A comparison of ten class I/II PLA2 structures showed, among other differences, that the beta-sheet of these enzymes (residues 76-83) is about 90 degrees less twisted in class I than in class
СтатьяОбзорПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
A 15-residue hybrid peptide (KWKLFKKIGAVLKVL-amide) incorporating partial sequences of cecropin A and melittin causes the release of carboxyfluoresceine encapsulated in phosphatidylcholine liposomes. Succinylation of the amino groups in the N-terminus and lysine side chains inhibits the effect of this peptide on liposome permeability. Conformational analysis of the parent peptide and its succinyl derivative by CD and nmr indicates that both peptides form amphipathic alpha-helices in the presence of hexafluoro-2-propanol, but only the unmodified peptide acquires a relevant level of alpha-helica
Сравнительное исследованиеСтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
This study investigated the effect of heat treatment combined with pH-shifting-assisted glycosylation using oligosaccharide (COS) on the properties of pea protein isolate (PPI) high internal phase emulsions (HIPEs). The results showed that heat treatment combined with pH-shifting-assisted glycosylation altered the secondary structure of PPI, exposing internal hydrophobic groups and enhancing solubility, foaming, and emulsifying properties. Microscopic structure and rheological behavior revealed that the resulting HIPEs exhibited improved protein adsorption capacity, forming smaller, more unifo
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
We previously described a pig junction protein of M(r) 37,000 found in oral epithelium but not in epidermis, limited to suprabasal cells, and colocalizing by immunofluorescence with adherens junction proteins. A 1.1-kilobase pair cDNA of the 37-kDa protein yielded an open reading frame encoding a 323-amino acid protein of 35,852 Da, and Northern analysis demonstrated a band of 1.2 kilobases in tongue RNA. Secondary structure predictions indicate that the 37% identical 16-17-kDa N- and C-terminal domains from beta-sheet-rich barrels linked by a compact proline-rich segment. The protein is 72% i
Сравнительное исследованиеСтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Haemophilus influenza persists as a well-known root of ill health in children throughout the entire world. Before the introduction of the vaccine, Haemophilus influenza remained a well-known and eminent source of septic arthritis, pneumonia, and epiglottitis. Haemophilus influenza, Neisseria meningitides, and staphylococcus pneumonia spreads through respiratory droplets and cause diseases such as meningitis, pneumonia, and other secondary infections related to respiratory diseases. Objective was to analyze the 3D structure of the protein of Haemophilus influenzae by homology modell
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Type II toxin-antitoxin (TA) systems are expressed from two-gene operons that encode a cytoplasmic protein toxin and its cognate protein antitoxin. These gene cassettes are often present in multiple copies on bacterial chromosomes, where they have been reported to regulate stress adaptation and persistence during antimicrobial treatment. We have identified a novel type II TA cassette in the intracellular pathogen Brucella abortus that consists of the toxin gene, brnT, and its antitoxin, brnA. BrnT is coexpressed and forms a 2:2 tetrameric complex with BrnA, which neutralizes BrnT toxicity. The
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Cathepsin V is a lysosomal cysteine protease that is expressed in the thymus, testis and corneal epithelium. We have determined the 1.6 A resolution crystal structure of human cathepsin V associated with an irreversible vinyl sulfone inhibitor. The fold of this enzyme is similar to the fold adopted by other members of the papain superfamily of cysteine proteases. This study provides a framework for understanding the structural basis for cathepsin V's activity and will aid in the design of inhibitors of this enzyme. A comparison of cathepsin V's active site with the active sites of related prot
СтатьяПоддержка правительства СШАПоддержка службы здравоохранения СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Sesame can trigger a systemic allergic reaction. In the present study, we investigated the responses of the structure and IgE binding of sesame allergens to different roasting treatments (120, 150, and 180 °C for 5 to 30 min). We analyzed the tryptic digestion peptides using a label-free mass spectrometry method. The total amount of soluble proteins in sesame was significantly reduced by roasting at 180 °C, followed by 150 °C. Ses i 1 was the most stable protein during processing as it still possessed a higher protein abundance compared to other allergens after roasting under 180 °C. The most
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The lysosomal enzyme glucocerebrosidase-1 (GCase) catalyzes the cleavage of a major glycolipid glucosylceramide into glucose and ceramide. The absence of fully functional GCase leads to the accumulation of its lipid substrates in lysosomes, causing Gaucher disease, an autosomal recessive disorder that displays profound genotype-phenotype nonconcordance. More than 250 disease-causing mutations in GBA1, the gene encoding GCase, have been discovered, although only one of these, N370S, causes 70% of disease. Here, we have used a knowledge-based docking protocol that considers experimental data of
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПоддержка правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The formation of senile plaques in central neural system resulting from the aggregation of the amyloid β (Aβ) of 40 and 42 residues is one of the two hallmarks of Alzheimer's disease. Numerous experiments and computational studies have shown that the aggregation of Aβ peptides in vitro is very complex and depends on many factors such as pH, agitation, temperature, and peptide concentration. The impact of a static electric field (EF) on amyloid peptide aggregation has been much less studied, although EFs may have some applications to treat Parkinson's disease symptoms. Here, we study the influe
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Rubella virus (RuV) infection of pregnant women can cause fetal death, miscarriage, or severe fetal malformations, and remains a significant health problem in much of the underdeveloped world. RuV is a small enveloped RNA virus that infects target cells by receptor-mediated endocytosis and low pH-dependent membrane fusion. The structure of the RuV E1 fusion protein was recently solved in its postfusion conformation. RuV E1 is a member of the class II fusion proteins and is structurally related to the alphavirus and flavivirus fusion proteins. Unlike the other known class II fusion proteins, ho
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Outer surface protein A (OspA) is a crucial protein in the infection of Borrelia burgdorferi causing Lyme disease. We studied conformational fluctuations of OspA with high-pressure (15)N/(1)H two-dimensional NMR along with high-pressure fluorescence spectroscopy. We found evidence within folded, native OspA for rapid local fluctuations of the polypeptide backbone in the nonglobular single layer β-sheet connecting the N- and C-terminal domains with τ << ms, which may give the two domains certain independence in mobility and thermodynamic stability. Furthermore, we found that folded, native OspA
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПоддержка правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
New World arenaviruses, which cause severe hemorrhagic fever, rely upon their envelope glycoproteins for attachment and fusion into their host cell. Here we present the crystal structure of the Machupo virus GP1 attachment glycoprotein, which is responsible for high-affinity binding at the cell surface to the transferrin receptor. This first structure of an arenavirus glycoprotein shows that GP1 consists of a novel alpha/beta fold. This provides a blueprint of the New World arenavirus attachment glycoproteins and reveals a new architecture of viral attachment, using a protein fold of unknown o
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
We previously demonstrated that a beta-hairpin peptide, termed BH(9-10), derived from a single-layer beta-sheet of Borrelia OspA protein, formed a native-like beta-turn in trifluoroethanol (TFE) solution, and it assembled into amyloid-like fibrils at higher TFE concentrations. This peptide is highly charged, and fibrillization of such a hydrophilic peptide is quite unusual. In this study, we designed a circularly permutated peptide of BH(9-10), termed BH(10-9). When folded into their respective beta-hairpin structures found in OspA, these peptides would have identical cross-strand interactions
СтатьяПоддержка службы здравоохранения СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
One of the histopathological features of Alzheimer's disease (AD) is higher order neurofibrillary tangles formed by abnormally aggregated tau protein. The sequence 275VQIINK280 in the microtubule-binding domain of tau plays a key role in tau aggregation. Therefore, an aggregation inhibitor targeting the VQIINK region in tau may be an effective therapeutic agent for AD. We have previously shown that the Fab domain (Fab2r3) of a tau antibody that recognizes the VQIINK sequence can inhibit tau aggregation, and we have determined the tertiary structure of the Fab2r3-VQIINK complex. In this report,
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования