This paper describes the development of a rapid probe-based real-time polymerase chain reaction assay (PCR) for the diagnosis of Pneumocystis pneumonia. To develop the PCR, primers and fluorescent resonance energy transfer probes were designed after sequencing products obtained using previously published primers. This gave results that were concordant with conventional cytological staining techniques, but were available within 2 h instead of greater than 24 h.
Оценочное исследованиеСтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Coxsackievirus A6 (CV-A6) is an important pathogen causing hand, foot and mouth disease (HFMD). The aim of this study was to develop and evaluate a rapid real-time reverse transcription recombinase polymerase amplification (RT-RPA) assay for detection of CV-A6. The sensitivity of this assay was 202 copies/reaction, with 100 % specificity. Furthermore, this assay yielded consistent results comparable with a commercial qRT-PCR diagnostic kit. This assay is therefore potentially useful for surveillance of CV-A6 infections and outbreak control.
Оценочное исследованиеСтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
In the absence of a vaccine or specific treatments for Ebola virus disease (EVD), early identification of cases is crucial for the control of EVD epidemics. We evaluated a new extraction kit (SpeedXtract (SE), Qiagen) on sera and swabs in combination with an improved diagnostic reverse transcription recombinase polymerase amplification assay for the detection of Ebola virus (EBOV-RT-RPA). The performance of combined extraction and detection was best for swabs. Sensitivity and specificity of the combined SE and EBOV-RT-RPA were tested in a mobile laboratory consisting of a mobile glovebox and a
Оценочное исследованиеСтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
PURPOSE: Reflux nephropathy (RN) is a major cause of end stage renal failure in children and hypertension is a frequent complication. Cyclooxygenase-2 (COX-2) is an enzyme responsible for the prostaglandin synthesis. It has been shown that COX-2 up-regulates renin production leading to renovascular hypertension. We investigate COX-2 expression in the kidneys of children with RN.
MATERIALS AND METHODS: Kidney specimens from 12 patients 2 to 13 years old with severe RN secondary to primary high grade vesicoureteral reflux obtained at the time of nephrectomy and 5 controls were examined. Single
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
STUDY OBJECTIVES: PROK2 is a peptide expressed in the adult brain mediating neuroprotective functions. Previous studies reported an upregulation of prokineticin system in Parkinson's disease (PD), but evidence in prodromal α-synucleinopathies was lacking. We investigated the expression of prokineticin-2 (PROK2) and its receptors (PKR1 and PKR2), along with oligomeric α-synuclein (oligo α-syn) as a marker of α-synuclein pathology, in olfactory neurons (ONs) from individuals with idiopathic rapid eye movement sleep behavior disorder (iRBD).
METHODS: Olfactory neurons, obtained by nasal brush fr
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
PURPOSE: The human orbit is an environment that is vulnerable to inflammation and edema in the setting of autoimmune thyroid disease. Our study investigated the tenet that orbital adipose tissue lacks lymphatic vessels and analyzed the clinicopathologic differences between patients with acute and chronic thyroid eye disease (TED). The underlying molecular mediators of blood and lymphatic vessel formation within the orbital fat also were evaluated.
DESIGN: Retrospective cohort study.
PARTICIPANTS: The study included fat specimens from 26 orbits of 15 patients with TED undergoing orbital decom
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
We examined clinical samples from Nigerian patients with acute watery diarrhea for Vibrio cholerae during the 2010 cholera outbreak. A total of 109 suspected isolates were characterized, but only 57 V. cholerae strains could be confirmed using multiplex real-time PCR as well as rpoB sequencing and typed as V. cholerae O:1 Ogawa biotype El Tor. This finding highlighted the need for accurate diagnosis of cholera in epidemic countries to implement life-saving interventions.
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Conventional diatom-based assays for drowning diagnosis present multiple inherent limitations, including prolonged testing durations, poor adaptability to field examination, compromised detecta‑ bility in aquatic environments with low diatom abundance, and reliance on a single type of forensic evidence. To address the above limitations, our team selected drowning-relevant planktonic microorga‑ nisms, including diatoms, cyanobacteria, and planktonic bacteria, as molecular biomarkers and established a rapid planktonic microorganism DNA detection system based on real-time quantitative polymerase
Аннотация на английскомСтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Human mpox, formerly known as monkeypox, has twice been declared a Public Health Emergency of International Concern (PHEIC) by the World Health Organization, in 2022 and 2024. Despite this, global access to rapid, reliable diagnostics remains limited, hindering outbreak control and equitable clinical response. To address this gap, we developed and validated a rapid direct real-time PCR assay capable of detecting and differentiating Clade I and Clade II monkeypox virus (MPXV) directly from clinical samples. We designed a new pan-specific B15L assay to complement the published F3L assay and intr
СтатьяОценочное исследованиеВалидационное исследованиеПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Leptospirosis is a globally-distributed zoonotic disease caused by pathogenic Leptospira spp., affecting humans, domestic animals, and wildlife. Despite its importance, little is known about the ecological and epidemiological aspects of Leptospira spp. infection in wild carnivores, particularly martens. This study investigated the presence of Leptospira spp. in stone martens (Martes foina) and pine martens (Martes martes) in northern Poland using serological (MAT) and molecular (real-time PCR and MLST) methods.
RESULTS: Samples from 129 martens collected between 2012 and 2022 reve
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Surveillance of infected insect vectors of vector-transmitted diseases has been recognized for its ability to estimate pathogen prevalence and transmission potential. Classically restricted to microscopic dissection and examination of individual insects, the potential of entomological monitoring has grown due to the advent of rapid molecular DNA detection methods with high specificity and sensitivity. Despite such advancement, a recurring question concerning DNA detection of parasitic pathogens is related to the fact that DNA amplification, by itself, does not differentiate between insects car
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Turbot (Scophthalmus maximus ) is an economically important farming fish in China. Turbot circovirus (TCV), a recently discovered member of the Circovirus genus within the Circoviridae family, has emerged as a significant threat to the turbot aquaculture industry in China. This virus is the causative agent of turbot acute hemorrhagic disease (TAHD), resulting in substantial economic losses in recent years. As a novel pathogen, the development of more accurate and efficient detection methods for TCV remains an urgent need. In this study, the specific probe and primers were designed based on the
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Brucellosis is a zoonotic disease occurring worldwide. Brucella melitensis is the main cause of malta fever in humans and a major cause of abortion in sheep. In herd control and prevention programs, applying a suitable noninvasive method for accurate, rapid, and cost-effective monitoring of infected animals is a major concern. This study aimed to investigate lots of pooled sheep milk using qPCR to detect Brucella spp. infection in sheep. By calculating the limit of detection of Brucella in qPCR and microbial culture, the maximum number of pooled milk lots that retained the ability
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
PURPOSE OF REVIEW: Mucorales quantitative PCR (qPCR) was first developed and evaluated in 2013, and since then, substantial evidence has accumulated supporting its clinical utility. This review highlights the major advances this technique has brought to the management of mucormycosis.
RECENT FINDINGS: Different in-house and commercial assays are now available, targeting a broad range of clinically relevant Mucorales species. Performance depends strongly on preanalytical parameters such as volume of plasma or serum used for DNA extraction, and ratio of DNA input in the PCR reaction mix. Multip
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
PURPOSE: In some precise clinical manifestations of Lyme borreliosis, PCR can be helpful for diagnosis: suspicion of atypical erythema migrans, borrelial lymphocytoma, acrodermatitis chronica atrophicans, Lyme arthritis or in very early seronegative neuroborreliosis. This study aimed to evaluate: (1) the analytical sensitivity of commercial real-time PCR kits for Borrelia burgdorferi sensu lato (Bbsl), (2) their specificity, and (3) their practicability.
METHODS: The performances of 11 CE-IVD marked commercial kits and the French NRC Borrelia's in-house PCR were evaluated. PCRs were performed
СтатьяСравнительное исследованиеОценочное исследованиеПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Vernal keratoconjunctivitis (VKC) is a serious eye allergy characterized by poorly understood pathogenic mechanisms and a lack of effective treatments. Autophagy, a process involved in both triggering and suppressing immune and inflammatory responses, plays a role in VKC's pathophysiology. Understanding autophagy's involvement in VKC could lead to new treatment possibilities, such as utilizing specific topical substances to induce or inhibit autophagy and prevent severe complications of this eye condition. In our current protocol, we present a robust methodology established in our laboratory f
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Orthohantaviruses are zoonotic pathogens that cause severe diseases in humans primarily through inhalation of aerosols from rodent excreta. … rouped into 204 pools by collection sites and tested for the Orthohantavirus RNA using quantitative real-time polymerase chain reaction (PCR) and reverse transcription-nested PCR. OrthoHantavirus RNA was detected in seven trombiculid mite pools, with a minimum infection rate of 0.4/100 mites. Orthohantavirus hantanense was identified in trombiculid mites from Cheongju, Gimcheon, and …
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Cochlosoma anatis is a flagellated protozoan parasite in the Trichomonadidae family that causes an enteric disease of turkeys and ducks known as cochlosomosis. Following the withdrawal of effective antiprotozoal medications from commercial poultry production, this organism has become of increased concern for the turkey industry. Historically, this organism has been detected by light microscopic evaluation of enteric mucosal scrapings. However, live trophozoites must be present in the sample for this method of detection because the parasite is differentiated from other protozoa by its character
СтатьяВалидационное исследованиеПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
INTRODUCTION AND PURPOSE: Brucellosis is a prevalent bacterial zoonosis globally, affecting a broad range of hosts. The role of rodents in the survival and transmission of Brucella species to humans remains uncertain. This study aimed to investigate the prevalence of Brucella infection among wild rodents in western Iran, specifically in KabudarAhang County within Hamadan Province.
MATERIALS AND METHODS: Sampling was conducted across various regions of KabudarAhang County in western Iran between April 2014 and September 2017. Serological testing was performed using the standard tube agglutinat
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Quantitative real-time PCR (qPCR) is a highly reliable method for validating gene expression data in molecular studies due to its sensitivity, specificity, and efficiency. To ensure accurate qPCR results, it's essential to normalize the expression data using stable reference genes.
METHODS: This study aimed to identify suitable reference genes for qPCR studies in goats by evaluating 18 candidate reference genes (ACTB, BACH1, B2M, GAPDH, HMBS, HPRT1, PGK1, PPIA, PPIB, RPLP0, RPL19, RPS9, RPS15, RPS28, SDHA, TBP, UXT, and YWHAZ) in 10 different caprine tissues (heart, intestine, kid
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.