Berberis species are rich in isoquinoline alkaloids with promising therapeutic properties for various diseases, including SARS-CoV-2. Despite their known medicinal attributes, the potential for combining them at suitable doses remains underexplored. This study investigated the compound-target interactions, functional enrichment, and pharmacokinetic profiles of seven B. vulgaris alkaloids (berberine, palmatine, berberrubine, lambertine, obamegine, berbidine, and berbamine) using an in-silico approach. Compound-target interactions were identified using SwissTargetPrediction. Protein-protein inte
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
This study employed Illumina HiSeq™ 2000 sequencing to compare spleen transcriptomes of Uronema marinum-infected and healthy Takifugu rubripes. High-throughput analysis generated 25.6 Gb (infected) and 23.39 Gb (control) high-quality reads, meeting stringent quality standards (Q20 ≥ 98.3%, Q30 ≥ 95.1%). DESeq analysis identified 238 differentially expressed genes (116 upregulated/122 downregulated), functionally categorized into Gene Ontology (GO) domains: biological processes (54.03%), molecular functions (31.78%), and cellular components (14.19%). Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes (KEG
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
We used an untargeted mass spectrometric approach, tandem mass tag proteomics, for the identification of proteomic signatures in genetic frontotemporal dementia (FTD). A total of 238 cerebrospinal fluid (CSF) samples from the Genetic FTD Initiative were analyzed, including samples from 107 presymptomatic (44 C9orf72, 38 GRN, and 25 MAPT) and 55 symptomatic (27 C9orf72, 17 GRN, and 11 MAPT) mutation carriers as well as 76 mutation-negative controls ("noncarriers"). We found shared and distinct proteomic alterations in each genetic form of FTD. Among the proteins significantly altered in symptom
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Amelogenesis imperfecta type 1G (AI1G), also known as Enamel-Renal-Gingival Syndrome (ERGS), is an autosomal recessive disorder caused by variants in FAM20A, encoding a Golgi apparatus protein crucial for protein processing and secretion. AI1G presents with enamel defects, nephrocalcinosis and gingival overgrowth. Building upon our previous findings demonstrating the impact of FAM20A insufficiency on deciduous dental pulp cells, this study investigated the molecular mechanisms underlying gingival fibromatosis in AI1G. RNA sequencing of gingival fibroblasts from an AI1G patient revealed widespr
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Jeju native pig (JNP) is an indigenous breed originating from Korea, characterized by short black hair, small stature, and superior meat quality compared with commercial breeds. This study investigated meat quality and transcriptome differences in the Longissimus dorsi muscles of Landrace and JNP pigs. Phenotypic analysis of meat quality traits was performed on each breed, revealing significant differences in cooking loss, crude fat, moisture, CIE L*, CIE a*, shear force, pH, hardness, gumminess, and chewiness (p<0.05). JNP exhibited significantly higher intramuscular fat content and CIE a* (p
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
This study aims to examine ferroptosis-associated genes in primary open-angle glaucoma (POAG) and offer new insights into the underlying disease mechanisms and potential therapeutic approaches. Differentially expressed genes (DEGs) between the POAG and control groups were identified using bioinformatics analysis and subsequently intersected with a ferroptosis gene set to isolate ferroptosis-related DEGs (Ferr DEGs). Gene Ontology (GO) and Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes (KEGG) enrichment analyses were conducted to examine their biological functions. Core genes were identified through p
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Clear cell renal cell carcinoma (ccRCC) is a subtype of renal cancer primarily originating from renal tubular epithelial cells. The absence of effective treatments has contributed to its poor prognosis. PDLIM7 is a protein containing PDZ and LIM structural domains, which performs varied functions through interactions with different proteins. To elucidate the role of PDLIM7 in ccRCC, we aimed to investigate its potential functions in relation to drug sensitivity. We analyzed multiple databases to assess the relationship between PDLIM7 expression and clinicopathological features, and conducted s
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Extracellular vesicles (EVs) are emitted from cells throughout the body and serve as signaling molecules that mediate disease development. Emerging evidence suggests that per- and polyfluoroalkyl substances (PFAS) impact EV release and content, influencing liver toxicity. Still, the upstream regulators of EV changes affected by PFAS exposure remain unclear. This study evaluated the hypothesis that PFAS exposures, individually and in a mixture, alter the expression of genes involved in EV regulation at concentrations comparable to genes involved in global biological response mechanisms. HepG2 l
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Alcoholic liver fibrosis (ALF) is a severe hepatic disorder caused by chronic excessive alcohol consumption, involving hepatic stellate cells (HSCs) activation. Fucoidan oligosaccharides (FOS) are marine algae-derived oligosaccharides with diverse biological activities. This study investigated FOS's protective effects against ALF and its molecular mechanisms through in vivo and in vitro experiments. The results indicated that FOS ameliorated liver function injury in mice. FOS reduced serum levels of alanine aminotransferase (ALT) and aspartate aminotransferase (AST) while increasing the levels
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Spermatogenesis is a complex biological process encompasses several stages of cellular divisions, ultimately resulting in producing mature spermatozoa capable of fertilization. Numerous factors involved in the precise regulation of the spermatogenesis, and any disruptions or alterations in these regulatory mechanisms can lead to spermatogenesis arrest, which may result in male infertility. Among these factors, genetic influences play essential role in regulating the process. This study aimed to identify genes that are differentially expressed in relation to spermatogenesis arrest. Testicular b
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVE: Preeclampsia (PE) is a severe pregnancy complication with unclear molecular mechanisms. Emerging evidence suggests that circadian rhythm disruption contributes to PE pathogenesis. The study aims to identify circadian rhythm-related genes in PE and explore their diagnostic value and immune characteristics.
METHODS: Four gene expression datasets (GSE75010, GSE60438, GSE186257, GSE14722) were downloaded from the GEO database. Modules correlated with PE were identified via weighted gene co-expression network analysis (WGCNA). Differential expression was assessed with the limma package
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVES: Determination of differential gene expression in idiopathic subglottic stenosis.
METHODS: Subglottic and tracheal tissues were collected from 19 prospectively recruited patients with laryngotracheal stenosis undergoing surgery: 11 patients with idiopathic subglottic stenosis (iSGS) and 8 patients with post-intubation laryngotracheal stenosis (iLTS). Total RNA was extracted from specimens. Bulk RNA sequencing (RNAseq) was done. Differential gene expression analyses were carried out using DESeq2. Bioinformatic approaches were utilized to gain insight into pathways significant for iS
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
With the increasing prevalence of environmental pollutants, there is growing concern about the potential effects of these substances in major diseases such as liver cancer. Previous studies have suggested that various chemicals, such as benzo[a]pyrene(BaP), produced by burning carbon containing fuels, may negatively affect liver health, but the exact mechanisms remain unclear. This study aimed to explore the potential molecular mechanisms of BaP in the progression of liver cancer. Through an exhaustive study of databases such as ChEMBL, SwissTargetPrediction, STITCH and TCGA, we identified 169
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
INTRODUCTION: N6-methyladenosine (m6A) is a common epigenetic modification of eukaryotic RNA that plays a vital role in the physiological and pathogenesis of preeclampsia (PE). Methyltransferase-like 3 (METTL3) is a methyltransferase of m6A. However, the function of METTL3 in early onset severe pre-eclampsia (EO-sPE) remains to be studied.
METHODS: Immunohistochemistry, qRT-PCR, and western blotting, as well as colorimetric RNA m6A methylation quantification assay, were used to assess the METTL3 expression level and global RNA m6A modification level in placental tissues collected from females
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Patients with rheumatoid arthritis (RA) have an increased risk of developing cardiovascular disease (CVD). However, the mechanisms underlying the comorbidity between RA and CVD remain poorly understood. This study aimed to identify the shared genes between RA and CVD and to explore their functional relationships.
METHODS: Rheumatoid arthritis- and CVD-associated genes were obtained from the DisGeNET and Malacards databases, respectively. Shared genes between the 2 diseases were identified, and gene ontology and Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes pathway enrichment analyses we
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVES: Steroid-induced osteonecrosis of the femoral head (SIONFH) represents a global therapeutic challenge, and its pathogenesis requires in-depth investigation. While oxidative stress is recognized as a critical contributor to SIONFH, the underlying mechanism remains incompletely elucidated.
METHODS: In this study, multi-omics analysis of clinical specimens was performed to screen for oxidative stress-related molecules in SIONFH and identify hub molecules among them. Subsequently, the functional significance of these hub molecules was validated via Gene Ontology (GO) analysis and both
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND/AIM: Prostate cancer remains a major global health burden, with treatment resistance posing a significant challenge. Enhancer of zeste 2 polycomb repressive complex 2 subunit (EZH2), a histone methyltransferase, is frequently overexpressed in prostate cancer, contributing to tumor progression and castration resistance. Clinical trials of EZH2 inhibitors may have therapeutic benefits. This study aimed to evaluate the impact of genetic variants in EZH2-related genes on survival outcomes in prostate cancer.
PATIENTS AND METHODS: We conducted a genetic association study evaluating 76 s
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVE: Dystonia is one of the most common movement disorders, with variants in multiple genes identified as causative. However, an understanding of which developmental stages, brain regions, and cell types are most relevant is crucial for developing relevant disease models and therapeutics. One approach is to examine the timing and anatomical expression of genes in which variants are dystonia-causing, on the assumption that deleterious variants have a greater impact where higher levels of expression are observed.
METHODS: We investigated the expression patterns of 44 genes linked with a d
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Echinococcosis, a zoonotic disease, significantly impacts the liver, with alveolar echinococcosis (AE) often leading to liver fibrosis and, in severe cases, cirrhosis. However, the molecular mechanisms by which AE infection promotes liver fibrosis remain incompletely understood. This study utilized bioinformatic analysis of existing microarray data to explore the shared mechanisms between AE and liver fibrosis and to identify potential therapeutic drug candidates. We analyzed gene expression datasets to identify common differentially expressed genes (DEGs), followed by enrichment analyses usin
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Background/Objectives: Transcriptome assembly and functional annotation are essential in understanding gene expression and biological function. Nevertheless, many existing pipelines lack the flexibility to integrate both short- and long-read sequencing data or fail to provide a complete, customizable workflow for transcriptome analysis, particularly for non-model organisms. Methods: We present TrAnnoScope, a transcriptome analysis pipeline designed to process Illumina short-read and PacBio long-read data. The pipeline provides a complete, customizable workflow to generate high-quality, full-le
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования