Hermansky-Pudlak syndrome (HPS) is an autosomal recessive disorder characterized by oculocutaneous albinism, platelet dysfunction and ceroid deposition. We report suspected ocular albinism in two Japanese sisters, caused by mutations in the HPS6 (Hermansky-Pudlak syndrome 6) gene. Trio-based whole-exome sequencing (WES) identified novel compound heterozygous mutations in HPS6 (c.1898delC: mother origin and c.2038C>T: father origin) in the two sisters. To date, 10 associated mutations have been detected in HPS6. Although we detected no general manifestations, including platelet dysfunction, in …
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Next-generation sequencing (NGS) has an established diagnostic value for inherited ataxia. However, the need of a rigorous process of analysis and validation remains challenging. Moreover, copy number variations (CNV) or dynamic expansions of repeated sequence are classically considered not adequately detected by exome sequencing technique. We applied a strategy of mini-exome coupled to read-depth based CNV analysis to a series of 33 patients with probable inherited ataxia and onset <50 years. The mini-exome consisted of the capture of 4,813 genes having associated clinical phenotypes. Pathoge…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
In a clinical setting, the number of organ systems involved is crucial for the differential diagnosis of congenital genetic disorders. When more than one organ system is involved, a syndromic diagnosis is suspected. In this report, we describe three patients with apparently syndromic features. Exome sequencing identified non-syndromic gene mutations as a potential cause of part of their phenotype. The first patient (Patient 1) is a girl with cleft lip/palate, meningoencephalocele, tetralogy of Fallot, and developmental delay. The second and third patients (Patients 2 and 3) are brothers with d…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Exome sequencing has been widely used to identify the genetic variants underlying human genetic disorders for clinical diagnoses, but the identification of pathogenic sequence variants among the huge amounts of benign ones is complicated and challenging. Here, we describe a new Web server named mirVAFC for pathogenic sequence variants prioritizations from clinical exome sequencing (CES) variant data of single individual or family. The mirVAFC is able to comprehensively annotate sequence variants, filter out most irrelevant variants using custom criteria, classify variants into different catego…
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
IMPORTANCE: Previous studies have indicated a heritable component of the etiology of neurodegenerative diseases such as Alzheimer disease (AD), frontotemporal dementia (FTD), and progressive supranuclear palsy (PSP). However, few have examined the contribution of low-frequency coding variants on a genome-wide level.
OBJECTIVE: To identify low-frequency coding variants that affect susceptibility to AD, FTD, and PSP.
DESIGN, SETTING, AND PARTICIPANTS: We used the Illumina HumanExome BeadChip array to genotype a large number of variants (most of which are low-frequency coding variants) in a coh…
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Coeliac disease (CeD) is a highly heritable common autoimmune disease involving chronic small intestinal inflammation in response to dietary wheat. The human leukocyte antigen (HLA) region, and 40 newer regions identified by genome wide association studies (GWAS) and dense fine mapping, account for ∼40% of the disease heritability. We hypothesized that in pedigrees with multiple individuals with CeD rare [minor allele frequency (MAF) <0.5%] mutations of larger effect size (odds ratios of ∼2-5) might exist. We sequenced the exomes of 75 coeliac individuals of European ancestry from 55 multiply …
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
A major challenge in current exome sequencing in autosomal recessive (AR) families is the lack of an effective method to prioritize single-nucleotide variants (SNVs). AR families are generally too small for linkage analysis, and length of homozygous regions is unreliable for identification of causative variants. Various common filtering steps usually result in a list of candidate variants that cannot be narrowed down further or ranked. To prioritize shortlisted SNVs we consider each homozygous candidate variant together with a set of SNVs flanking it. We compare the resulting array of genotype…
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Deficiency of Asparagine Synthetase (ASNSD, MIM 615574) is a very rare autosomal recessive disorder presenting with some brain abnormalities … ati family presenting with congenital microcephaly and epileptic encephalopathy. In addition, whole-exome sequencing revealed a novel homozygous substitution mutation (c.1193A > C) in the ASNS gene. This mutation resulted in the substitution of highly conserved tyrosine residue by cysteine (p.Y398C). Molecular modeling analysis predicts hypomorphic and …
Клинический случайСтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Rod-cone dystrophy (RCD), also known as retinitis pigmentosa, is a progressive inherited retinal disorder characterized by photoreceptor cell death and genetic heterogeneity. Mutations in many genes have been implicated in the pathophysiology of RCD, but several others remain to be identified. Herein, we applied whole-exome sequencing to a consanguineous family with one subject affected with RCD and identified a homozygous nonsense mutation, c.226C>T (p.Arg76(∗)), in KIZ, which encodes centrosomal protein kizuna. Subsequent Sanger sequencing of 340 unrelated individuals with sporadic and autos…
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVE: Autosomal recessive hypercholesterolemia is a rare inherited disorder, characterized by extremely high total and low-density lipoprotein cholesterol levels, that has been previously linked to mutations in LDLRAP1. We identified a family with autosomal recessive hypercholesterolemia not explained by mutations in LDLRAP1 or other genes known to cause monogenic hypercholesterolemia. The aim of this study was to identify the molecular pathogenesis of autosomal recessive hypercholesterolemia in this family.
APPROACH AND RESULTS: We used exome sequencing to assess all protein-coding regi…
СтатьяМетаанализПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАTwin StudyПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Congenital stationary night blindness (CSNB) is a heterogeneous retinal disorder characterized by visual impairment under low light conditio … lead to disruption of the ON-bipolar cell response and have been seen in patients with cCSNB. Whole-exome sequencing in cCSNB patients lacking mutations in the known genes led to the identification of a homozygous missense mutation (c.1807C>T [p.His603Tyr]) in one consanguineous autosomal-recessive cCSNB family and a homozygous frameshift mutation in GP …
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Autosomal recessive polycystic kidney disease (ARPKD) is a rare inherited disease, which is a disorder with multiple organ involvement, mainly the kidney and liver. It is caused by mutations in the PKHD1 gene. Here, we reported the clinical characteristics of a case with ARPKD and analyze the genetic features of this patient as well as of his father using targeted exome sequencing and Sanger sequencing.
METHODS: Genomic DNA was extracted from peripheral blood leukocytes obtained from a patient with ARPKD. The mutations were identified using exome sequencing and confirmed by Sanger…
Клинический случайСтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Heritable and idiopathic pulmonary arterial hypertension (PAH) are phenotypically identical and associated with mutations in several genes related to transforming growth factor (TGF) beta signaling, including bone morphogenetic protein receptor type 2, activin receptor-like kinase 1, endoglin, and mothers against decapentaplegic 9. Approximately 25% of heritable cases lack identifiable mutations in any of these genes.
METHODS AND RESULTS: We used whole exome sequencing to study a 3-generation family with multiple affected family members with PAH, but no identifiable TGF beta mutat…
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Whole-exome sequencing using next-generation technologies has been previously demonstrated to be able to detect rare disease-causing variants. Progressive external ophthalmoplegia (PEO) is an inherited mitochondrial disease that follows either autosomal dominant or recessive forms of inheritance (adPEO or arPEO). AdPEO is a genetically heterogeneous disease and several genes, including POLG1 and C10orf2/Twinkle, have been identified as responsible genes. On the other hand, POLG1 was the only established gene causing arPEO with mitochondrial DNA deletions. We previously reported a c…
Клинический случайСтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Ketosis-prone diabetes (KPD) is characterized by episodes of diabetic ketosis or diabetic ketoacidosis (DKA) requiring insulin therapy, followed by periods during which insulin treatment may be discontinued. We herein report a case of a young obese male with clinical features consistent with KPD. He developed diabetic ketosis at the age of 16 years but recovered insulin secretion soon after undergoing intensive therapy, allowing for insulin withdrawal. At 25 years of age, he developed severe DKA again, but was able to discontinue insulin therapy after two months. Whole-exome sequencing identif…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Metabolic syndrome (MetS) is a cluster of interconnected cardiometabolic risk factors with a substantial but incompletely characterized genetic basis. To identify novel genetic determinants, particularly rare variants, we here conducted a large-scale exome-wide association study in 367,188 individuals from the UK Biobank (78,300 cases and 288,888 controls). Single-variant analysis identified 74 independent loci, three of which correspond to rare variants in CARMIL2, ACTR6, and PLA2G12A without prior documented MetS association. Furthermore, gene-based burden testing pinpointed three key genes:…
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Idiopathic pulmonary fibrosis (IPF) is a progressive interstitial lung disease in which both environmental exposures and genetic predisposition contribute to disease susceptibility. Studying the burden of rare variants in a genetically homogeneous founder population may help identify disease-associated alleles that are difficult to detect in more heterogeneous populations.
METHODS: Whole exome sequencing was performed on 123 patients with IPF and 1110 unrelated controls from Sardinia (Italy). Variant prioritisations were conducted according to the American College of Medical Genet…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
INTRODUCTION: Muscular dystrophies (MDs) are a heterogeneous group of inherited neuromuscular disorders. In Morocco, where consanguinity is … ed patients underwent next-generation sequencing (NGS), either via a customized gene panel or whole-exome sequencing (WES).
RESULTS: Multiplex PCR for DMD deletions and targeted Sanger sequencing of the SGCG:c.525delT variant resolved nearly half of cases, demonstrating the efficiency of these cost-effective first-line tests. Unsolved patients underwen …
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Pediatric cardiomyopathies (CM) are rare and heterogeneous heart disorders, including hypertrophic, dilated, restrictive, arrhythmogenic, and non-dilated CM. While their genetic basis is well characterized in adults, it remains less clearly defined in children particularly in early-onset apparently isolated and syndromic forms. We conducted a retrospective study (2018-2024) of 59 pediatric patients who underwent Whole-Exome Sequencing (WES) for CM at Amiens and Lille University Hospitals, aiming to characterize the genetic architecture of pediatric CM. WES identified at least one Variant Of In…
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования