The evaluation of the homologous recombination repair (HRR) status is emerging as a predictive tumor agnostic biomarker for poly (ADP-ribose) polymerase (PARP) inhibition across different tumor types and testing for HRR-signature is currently a developing area with promising therapeutic implications. Treatment with PARP inhibitors (PARPi) either as single agent or in combination with chemotherapy have shown so far limited activity in patients with thoracic malignancies. A deeper understanding of the biological background underlying HRR-deficient tumors, along with the recent advent of new effe…
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The evolution of precision medicine in the field of oncology has led to a radical change in the course of malignancies. PARP inhibitors are drugs that block the activity of the PARP enzyme responsible for base excision repair and have shown significant positive response when used for tumors lacking homologous recombination, namely high efficacy among BRCA-mutated tumors. Since 2014, when olaparib received an accelerated US FDA approval in ovarian cancer, we witnessed many other FDA approvals for olaparib, rucaparib, niraparib and talazoparib. Additionally, many Phase I, II and III trials were …
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Although Cas9-mediated genome editing has been widely used to engineer alleles in animal models of human inherited diseases, very few homolo … lease enzyme to generate double-strand breaks (DSBs) and bacterial recombinase A (RecA) to increase homologous recombination. Our data revealed that Cas9/RecA treatment significantly promoted the survival of both rod and cone photoreceptors, restored the expression of PDE6B in rod photoreceptors, and enhanced the visual functions of rd1 mice. Thus, this study provides a p …
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Aspergillus niger, which is a fungal pathogen, causes rot in a variety of fruits. In this study, the cystathionine β-synthase cbsA gene was deleted by homologous recombination to study its role in sulfur metabolism and pathogenicity of A. niger. The results showed that Δ cbsA strain maintained normal mycelia growth and sporulation compared with the control strain A. niger MA 70.15, whereas the contents of cysteine and glutathione (GSH) increased significantly after cbsA deletion. However, Δ cbsA strain showed reduced endogenous H2S production. Further results showed that cbsA gene deletion ind…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BRCA1-deficient tumor cells have defects in homologous-recombination repair and replication fork stability, resulting in PARP inhibitor sensitivity. Here, we demonstrate that a deubiquitinase, USP1, is upregulated in tumors with mutations in BRCA1. Knockdown or inhibition of USP1 resulted in replication fork destabilization and decreased viability of BRCA1-deficient cells, revealing a synthetic lethal relationship. USP1 binds to and is stimulated by fork DNA. A truncated form of USP1, lacking its DNA-binding region, was not stimulated by DNA and failed to localize and protect replication forks
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The azoospermia factor (AZF) region on the Y chromosome consists of genes required for spermatogenesis. Among the three subregions, the AZFc subregion located at the distal portion of AZF is the driver for genetic variation in Y chromosome. The candidate gene of AZFc is known as deleted in azoospermia gene, which is studied with interest because it is involved in germ cell development and most frequently deleted genes leading to oligozoospermia and azoospermia. Recently, two partial deletions in AZFc gr/gr and b2/b3 are characterized at the molecular level which showed homologous recombination…
СтатьяОбзорПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Mutations in citron (CIT), leading to loss or inactivation of the citron kinase protein (CITK), cause primary microcephaly in humans and rod … omised by CITK loss, and CITK physically interacts with RAD51, suggesting an involvement of CITK in homologous recombination. Consistent with this scenario, in doubly CitK and Trp53 mutant mice, neural progenitor cell death is dramatically reduced; moreover, clinical and neuroanatomical phenotypes are remarkably improved. Our results underscore a crucial role of CIT in th …
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
A novel human adenovirus was isolated from a pediatric case of acute respiratory disease in Panama City, Panama in 2011. The clinical isolat … ed to HAdV-37. Bioinformatic analysis of the complete genomic sequence of HAdV-84 revealed multiple homologous recombination events and provided deeper insight into HAdV evolution.
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVE: To develop a new method to cline large DNA fragment by combining whole genome sequence information and the principle of plasmid rescue.
METHODS: First, we amplified a fragment downstream the region to be cloned and cloned the fragment into a suicide plasmid to construct targeting plasmid, which was then targeted into chromosome by homologous recombination. Then, genomic DNA was isolated, digested with appropriate enzyme, re-ligated and transformed into host bacteria to rescue the plasmid and the large DNA fragment. The rescued DNA fragment was sub-cloned into new plasmids for speci…
Аннотация на английскомСтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Sortase A (SrtA), originally identified as a transpeptidase in Staphylococcus aureus, plays key roles in full virulence of pathogenic bacteria. In silico genome-wide search suggested a srtA homologue from 05ZYH33, a Chinese human isolate of streptococcal toxic shock syndrome (STSS)-causing Streptococcus suis serotype 2 (S. suis 2, SS2). An isogenic srtA mutant (DeltasrtA) of 05ZYH33 strain was obtained by homologous recombination. Immunofluorescence analysis revealed that two known virulence-associated surface proteins featuring Leu-Pro-X-Thr-Gly motif, muramidase-released protein and surface …
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The mammalian ERCC1-XPF endonuclease has a suggested role in the repair of DNA double-strand breaks (DSB) by single-strand annealing (SSA). Here, we investigated the role of ERCC1 in homologous recombination in mammalian cells, and confirm a role of ERCC1 in SSA. Interestingly, we also report an unexpected role for ERCC1 in gene conversion. This provides support that gene conversion in mammalian somatic cells is carried out through synthesis-dependent strand annealing, rather than through a double Holliday Junction mechanism. Moreover, we find low frequencies of SSA and gene conversion in G1-a…
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Human cancers exhibit genomic instability and an increased mutation rate due to underlying defects in DNA repair. Cancer cells are often defective in one of six major DNA repair pathways, namely: mismatch repair, base excision repair, nucleotide excision repair, homologous recombination, nonhomologous endjoining and translesion synthesis. The specific DNA repair pathway affected is predictive of the kinds of mutations, the tumor drug sensitivity, and the treatment outcome. The study of rare inherited DNA repair disorders, such as Fanconi anemia, has yielded new insights to drug sensitivity and…
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
A naturally cholera toxin gene negative Vibrio cholerae (O1, El Tor, Ogawa) strain, named IEM101, was isolated in China. The human volunteer tests showed that this strain was safe, able to colonize the intestinal mucosa, and able to induce a strong immune response. Also other studies indicated that it was an efficient live vector to deliver heterologous antigens. In this article, a thymidylate synthase gene (thyA)-defined mutant was constructed using homologous recombination. Except for the morphological changes in minimal medium and slightly reduced colonization capacity, mutant strain IEM101…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The latent TGF-beta binding protein (LTBP)-3 is an extracellular matrix (ECM) protein that binds the small latent complex (SLC) of TGF-beta. Disruption of the Ltbp-3 gene by homologous recombination in mice yields mutant animals that display multiple skeletal abnormalities. In addition, these mice have retarded growth. On an inbred 129 SvEv background, half of the Ltbp-3 mutant mice die between 3 and 4 weeks after birth. These mice show severe involution of the thymus and spleen and a sharp reduction in the numbers of CD4/CD8 double positive T-cells in the thymus. The thymus and spleen defect …
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоддержка службы здравоохранения СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
There are two major pathways for methionine biosynthesis: the enterobacterial type transsulfuration pathway and the sulfhydrylation pathway as previously identified in the spirochete Leptospira meyeri. Sequence analysis of the L. meyeri metYX locus allows the identification of a third gene, called metW, which encodes a protein exhibiting similarities with homologs in many organisms belonging to the alpha-, beta-, and gamma-subdivisions of proteobacteria. The metW, metX and metY genes of L. meyeri were disrupted by a resistance cassette by homologous recombination. While the L. meyeri metX muta…
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
For members of the CD1 family of beta(2)-microglobulin-associated lipid-presenting molecules, tyrosine-based motifs in the cytoplasmic tail … antigenic systems. By introducing a deletion of the tyrosine motif into the germ line, and through homologous recombination in embryonic stem cells, we now describe knock-in mice with the CD1d cytoplasmic tail deleted. Despite adequate surface CD1d expression and the presence of Ii, these mutant mice showed multiple and selective abnormalities in intracellular traffickin …
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоддержка службы здравоохранения СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Human replication protein (RPA) functions in DNA replication, homologous recombination and nucleotide excision repair. This multisubunit single-stranded DNA-binding protein may be required to make unique protein-protein contacts because heterologous single-stranded binding proteins cannot substitute for RPA in these diverse DNA transactions. We report here that, by using affinity chromatography and immunoprecipitation, we found that human RPA bound specifically and directly to two excision repair proteins, the xeroderma pigmentosum damage-recognition protein XPA (refs 8, 9) and the endonucleas…
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоддержка службы здравоохранения СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Creatine kinase isoenzymes (CK; EC 2.7.3.2) play a pivotal role in high-energy phosphoryl metabolism through subcellular compartmentation of the creatine-phosphate < = > ATP conversion reaction. In mouse, protein subunits constituting the ubiquitous mitochondrial CK (UbCKmit) and cytosolic B-CK isoforms are co-expressed in various cells and tissues with high and fluctuating energy demands such as brain, retina, smooth muscle, uterus, placenta and spermatozoa. Using targeted mutagenesis via homologous recombination in embryonic stem cells, we have generated mice that are deficient in UbCKmit su…
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The amino acid sequence obtained by translating the nucleotide sequence of a 0.55 kb fragment, amplified from Azotobacter vinelandii chromosomal DNA by PCR, was 57% identical to part of the Escherichia coli cyoB gene, encoding subunit I of the cytochrome bo-type quinol oxidase. This fragment was mutated in vitro by insertion of a kanamycin-resistance cassette and introduced into the chromosome of A. vinelandii by homologous recombination. The mutant contained no spectrally detectable cytochrome o. However, in the stationary phase of growth, the level of the alternative oxidase (cytochrome bd) …
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Urate oxidase, or uricase (EC 1.7.3.3), is a purine metabolic enzyme that catalyzes the conversion of uric acid to allantoin in most mammals except humans and certain other primates. The loss of urate oxidase in the human during primate evolution predisposes man to hyperuricemia, a metabolic disturbance that can lead to gouty arthritis and renal stones. To create a mouse model for hyperuricemia and gout, and to address the question of whether urate oxidase is essential in lower mammalian species, we have disrupted the urate oxidase gene in the mouse by homologous recombination in embryonic ste…
Сравнительное исследованиеСтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоддержка службы здравоохранения СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования