CD8+ T cells in the tumor microenvironment suppress breast cancer (BRCA) progression. Although LYRM2 correlates with immune cell infiltration, its crosstalk mechanism with CD8+ T cells in BRCA remains unclear. We integrated bioinformatics, clinical samples, and cellular experiments to analyze the potential role of LYRM2 in BRCA and CD8+ T cell infiltration. In a co-culture system of BRCA cells and CD8+ T cells, lactate dehydrogenase release assay, carboxyfluorescein succinimidyl ester proliferation assay, and ELISA assessed CD8+ T cell cytotoxicity and proliferation. Colony formation, WB, and
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Periodontitis (PD) is a complex inflammatory condition driven by the interplay of microbial, genetic, epigenetic, and environmental factors. … igenetic mechanisms including DNA methylation, histone modifications, non-coding RNAs, and emerging RNA methylation pathways are explored in their roles in modulating inflammation, tissue destruction, bone metabolism, and interactions between the host and microbes. Advances in transcriptomic technologies, particularly RNA sequencing, have enhanced our ability to …
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The combination of the B-cell lymphoma 2 (BCL2) inhibitor venetoclax (VEN) and the hypomethylating agent decitabine (DEC; VEN/DEC) constitutes a primary therapeutic strategy for treating older adults with acute myeloid leukemia (AML). However, a notable subset of patients exhibits resistance to VEN/DEC, demonstrating either no disease response or relapse after initial remission. This study aimed to elucidate the molecular mechanisms underlying this resistance through analyses of gene expression and DNA methylation profiles. We conducted comprehensive RNA sequencing analysis and DNA methylation
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
SARS-CoV-2 infection has raised significant concerns regarding its impact on assisted reproductive technology. We found that oocyte retrieval during acute SARS-CoV-2 infection significantly reduced the rates of good-quality blastocyst formation, but the underlying molecular mechanisms remain poorly understood. To address this, we investigated the effects of maternal acute SARS-CoV-2 infection on preimplantation embryo development and the early offspring hematopoietic system. Using single-cell RNA sequencing (scRNA-seq), we identified developmental delays in morphologically normal blastocysts f
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: N6-methyladenosine (m6A) is one of the most extensive RNA methylation modifications in eukaryotes and participates in the pathogenesis of numerous diseases including ischemic stroke. Peripheral blood neutrophils are forerunners after ischemic brain injury and exert crucial functions. This study aims to explore the transcriptional profiles of m6A modification in neutrophils of patients with ischemic stroke.
RESULTS: We found that the expression levels of m6A regulators FTO and YTHDC1 were notably decreased in the neutrophils following ischemic stroke, and FTO expression was negativ…
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Sarcoidosis is a heterogeneous granulomatous disease with no accurate biomarkers of disease progression. Therefore, we profiled and integrated the DNA methylome, mRNAs, and microRNAs to identify molecular changes associated with sarcoidosis and disease progression that might illuminate underlying mechanisms of disease and potential biomarkers.
METHODS: Bronchoalveolar lavage cells from 64 sarcoidosis subjects and 16 healthy controls were used. DNA methylation was profiled on Illumina HumanMethylationEPIC arrays, mRNA by RNA-sequencing, and miRNAs by small RNA-sequencing. Linear mo
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Skin cutaneous melanoma (SKCM) poses a significant challenge in skin cancers. Recent immunotherapy breakthroughs have revolutionized melanoma treamtment, yet tumor heterogeneity persists as an obstacle. Epigenetic modifications orchestrated by DNA methylation contributed to tumorigenesis, thus potentially unveiling melanoma prognosis. Here, we identified an interferon-gamma (IFN-g) sensitive subtype, which possesses favorable outcomes, robust infiltration CD8+T cells, and IFN-g score in bulk RNA-seq profile. Subsequently, we established an IFN-g sensitivity signature based on machine learning.
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The regulation of mammalian early-embryonic development is a complex, coordinated process that involves widespread transcriptomic and epigenetic remodeling. The main cause of developmental failure in preimplantation embryos after in vitro fertilization is the irreversible arrested-at-cleavage stage. To deepen our understanding of this embryonic block, we profiled a single-cell multi-omics map of copy number variations (CNVs), the transcriptome, the DNA methylome, and the chromatin state of bovine eight-cell embryos with a two-cell fate that either arrested or developed into blastocysts. To do
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: In addition to genomic risk variants and environmental influences, increasing evidence suggests epigenetic modifications are important for orofacial development and their alterations can contribute to orofacial clefts. Ezh2 encodes a core catalytic component of the Polycomb repressive complex responsible for addition of methyl marks to Histone H3 as a mechanism of repressing target genes. The role of Ezh2 in orofacial clefts remains unknown.
AIMS: To investigate the epithelial role of Ezh2-dependent methylation in secondary palatogenesis.
METHODS: We used conditional gene-targeti
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоддержка NIH: внешняя программаПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Pediatric neoplasms in the central nervous system (CNS) show extensive clinical and molecular heterogeneity and are fundamentally different from those occurring in adults. Molecular genetic testing contributes to accurate diagnosis and enables an optimal clinical management of affected children. Here, we investigated a rare, molecularly distinct type of pediatric high-grade neuroepithelial tumor (n = 18), that was identified through unsupervised visualization of genome-wide DNA methylation array data, together with copy number profiling, targeted next-generation DNA sequencing, and RNA transcr
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Oculopharyngodistal myopathy (OPDM) is an adult-onset neuromuscular disease characterized by progressive ocular, facial, pharyngeal and distal limb muscle involvement. Trinucleotide repeat expansions in LRP12 or GIPC1 were recently reported to be associated with OPDM. However, a significant portion of OPDM patients have unknown genetic causes. In this study, long-read whole-genome sequencing and repeat-primed PCR were performed and we identified GGC repeat expansions in the NOTCH2NLC gene in 16.7% (4/24) of a cohort of Chinese OPDM patients, designated as OPDM type 3 (OPDM3). Methylation analy
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVE: This study aimed to identify candidate host epigenetic biomarkers predicting latency reversal agents (LRA) efficacy and HIV-1 rebound kinetics during analytical treatment interruption (ATI).
DESIGN: Retrospective longitudinal epigenetic profiling study from 13 people with HIV (PWH) on virologically suppressive antiretroviral therapy (ART) that participated in a LRA (HDAC inhibitor) clinical trial (NCT01680094) and a subsequent optional ATI to monitor for viral recrudescence after ART cessation.
METHODS: Genome-wide DNA methylation (DNAm) in purified CD4+ T cells was measured at si
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
As a key N6-methyladenosine (m6A)-binding protein, YT521-B Homology (YTH) Domain-Containing Protein 2 (YTHDC2) plays a central role in the epitranscriptomic regulatory network. This protein specifically recognizes and binds to m6A modification sites on RNA molecules through its highly conserved YTH domain. This recognition exhibits high selectivity and affinity, thereby enabling precise control over the fate of target RNAs. At the molecular level, YTHDC2 is widely involved in various stages of the RNA life cycle, including core biological processes such as RNA splicing and processing, nuclear-
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Thus far, there are more than known 150 modifications to RNA, in which common internal modifications of mRNA include N6-methyladenosine (m6A), N1-methyladenosine, and 5-methylcytosine. Among them, m6A RNA modification is one of the highest abundance modifications in eukaryotes, regulating mechanisms controlling gene expression at the post-transcription level. As an invertible and dynamic epigenetic marker, m6A base modification influences almost all vital biological processes, cellular components, and molecular functions. Once the m6A modification process is abnormal, a series of diseases-incl
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАОбзорПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Type 2 diabetes (T2D) is a metabolic disease characterized by the development of β-cell dysfunction with hepatic, muscular and adipose tissue insulin resistance. Although the molecular mechanisms leading to its development are not entirely known, investigations of its causes reveal a multifactorial contribution to its development and progression in most cases. In addition, regulatory interactions mediated by epigenetic modifications such as DNA methylation, histone tail modifications and regulatory RNAs have been found to play a significant role in the etiology of T2D. In this chapter, we disc
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Phosphoramidite building blocks of ribostamycin (3 and 4), that may be incorporated at any position of the oligonucleotide sequence, were synthesized. The building blocks, together with a previously described neomycin-modified solid support, were applied for the preparation of aminoglycoside-2'-O-methyl oligoribonucleotide fusions. The fusions were used to clamp a single strand DNA sequence (a purine-rich strand of c-Myc promoter 1) to form triple helical 2'-O-methyl RNA/DNA-hybrid constructs. The potential of the aminoglycoside moieties to stabilize the triple helical constructs were studied
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The methylation state of endogenous mouse mammary tumor virus (MuMTV) proviral DNA was examined in normal mouse tissues. DNAs from various tissues were cleaved with the methylation-sensitive enzymes HhaI and HpaII and analyzed by Southern blotting. Tissue-specific MuMTV proviral DNA methylation patterns were found in the BALB/c, C3H, C57BL, GR/A, and GR-Mtv-2- mouse strains. MuMTV proviral DNA was hypomethylated in DNAs from the spleens and testes of all strains examined. The GR/A mouse strain, which was most thoroughly studied, also showed hypomethylation of MuMTV proviral DNA in bone marrow
СтатьяПоддержка службы здравоохранения СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
N6-methyladenosine (m6A) is a dynamic RNA modification that regulates RNA stability, processing, and translation and is increasingly recognized as a key modulator of neuronal plasticity. However, how psychostimulant exposure reshapes m6A-dependent regulatory networks across coding and non-coding RNA species remains poorly understood. We investigated the impact of volatilized cocaine (vCOC) exposure on m6A RNA methylation, m6A pathway components, transcriptome, and cocaine-induced locomotor sensitization in Drosophila melanogaster. Acute vCOC administration significantly increased global m6A le…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The increasing global demand for sustainable and renewable energy has intensified interest in microbial lipases as efficient biocatalysts for biodiesel production. A lipase-producing bacterium isolated from waste-oil-contaminated environments was identified as Stenotrophomonas maltophilia strain HO5 through 16 S ribosomal RNA gene sequencing. The strain exhibited a maximum lipase production of 28 U mL⁻¹. The purified monomeric enzyme (approximately 55 kDa) showed a Michaelis constant (Km) of 1.728 mM and a maximum reaction velocity (Vmax) of 80 U mL⁻¹, indicating high catalytic efficiency. The
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Long noncoding RNA (lncRNA) CHROMR is closely associated with the development of diffuse large B-cell lymphoma (DLBCL) and drug resistance to rituximab. However, the mechanism underlying the upregulation of the lncRNA CHROMR in DLBCL cells remains unknown. N 6-methyladenosine (m 6A) modifications are involved in the tumorigenesis and progression of numerous human cancers. This study reveals that m 6A complexes are enriched on the lncRNA CHROMR in DLBCL cells, as determined by methylated RNA immunoprecipitation-quantitative polymerase chain reaction (MeRIP-qPCR) assay and bioinformatics analysi
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования