Loxosceles spider venoms cause dermonecrosis in mammalian tissues. The toxin sphingomyelinase D (SMaseD) is a sufficient causative agent in lesion formation and is only known in these spiders and a few pathogenic bacteria. Similarities between spider and bacterial SMaseD in molecular weights, pIs and N-terminal amino acid sequence suggest an evolutionary relationship between these molecules. We report three cDNA sequences from venom-expressed mRNAs, analyses of amino acid sequences, and partial characterization of gene structure of SMaseD homologs from Loxosceles arizonica with the goal of bet
Сравнительное исследованиеСтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПоддержка службы здравоохранения СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Very recently, heterozygous mutations in the genes encoding transforming growth factor beta receptors I (TGFBR1) and II (TGFBR2) have been reported in Loeys-Dietz aortic aneurysm syndrome (LDS). In addition, dominant TGFBR2 mutations have been identified in Marfan syndrome type 2 (MFS2) and familial thoracic aortic aneurysms and dissections (TAAD). In the past, mutations of these genes were associated with atherosclerosis and several human cancers. Here, we report a total of nine novel and one known heterozygous sequence variants in the TGFBR1 and TGFBR2 genes in nine of 70 unrelated individua
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Burkholderia pickettii PKO1 metabolizes toluene and benzene via a chromosomally encoded toluene-3-monooxygenase pathway. Expression of the toluene-3-monooxygenase operon (tbuA1UBVA2C) is activated by the regulator, TbuT, in the presence of toluene. We have identified the TbuT coding region downstream of the toluene-3-monooxygenase structural genes by nucleotide sequence analysis and have shown that although TbuT is similar to XylR and DmpR, two members of the NtrC family of transcriptional activators which control toluene-xylene and (methyl)phenol catabolism, respectively, it is significantly
СтатьяПоддержка службы здравоохранения СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Quince (Cydonia oblonga Mill.) is the sole member of the genus Cydonia in the Rosacea family and closely related to the major pome fruits, apple (Malus domestica Borkh.) and pear (Pyrus communis L.). In the present work, whole genome shotgun paired-end sequencing was employed in order to assemble the first draft genome of quince. A genome assembly that spans 488.4 Mb of sequence corresponding to 71.2% of the estimated genome size (686 Mb) was produced in the study. Gene predictions via ab initio and homology-based sequence annotation strategies resulted in the identification of 25,428 and 30,6
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
To study genome evolution and diversity in barley (Hordeum vulgare), we have sequenced and compared more than 300 kb of sequence spanning the Rph7 leaf rust disease resistance gene in two barley cultivars. Colinearity was restricted to five genic and two intergenic regions representing <35% of the two sequences. In each interval separating the seven conserved regions, the number and type of repetitive elements were completely different between the two homologous sequences, and a single gene was absent in one cultivar. In both cultivars, the nonconserved regions consisted of approximately 53% r
Сравнительное исследованиеСтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоддержка правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The ubiquitous availability of protein structures permits replacing sequence alignment with more accurate and sensitive structure alignment algorithms. LoL-align maximizes a local log-odds score for proteins to be homologous, given their intra-protein Cα - Cα distances. Here we show that LoL-align is markedly more sensitive in detecting remote homologs than TM-align and Dali on single- and multidomain benchmarks and achieves better alignment quality at 5-20 × their speed. LoL-align is fully integrated into Foldseek.
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
At least 90% of the sequences of purified, in vitro labeled, DNA from Epstein-Barr virus (prepared from HR-1, Burkitt's lymphoblastoid cells) are homologous to the DNA of the herpes virus contained in cell lines derived from patients with infectious mononucleosis. The thermal stability of the homologous and heterologous hybrid DNA molecules could not be differentiated, indicating at least 97% matching of base pairs between DNA of Epstein-Barr virus and the herpes viral DNA contained in the lymphoblasts from patients with infectious mononucleosis.
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The severe acute respiratory syndrome coronavirus 2, also known as SARS-CoV-2, is the causative agent of the COVID-19 global pandemic. SARS-CoV-2 has a highly conserved non-structural protein 12 (NSP-12) involved in RNA-dependent RNA polymerase (RdRp) activity. For the identification of potential inhibitors for NSP-12, computational approaches such as the identification of homologous proteins that have been previously targeted by FDA-approved antivirals can be employed. Herein, homologous proteins of NSP-12 were retrieved from Protein DataBank (PDB) and the evolutionary conserved sequence and
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
To study the bioactive polypeptides included in Bufo skin and its secretions the plasmid skin cDNA library of adult Japanese toad Bufo japonicus formosus was prepared. The pSD64TR has been used as the vector and the cloning sites are Xho I and EcoR I. To screen cDNAs encoding bioactive components, the plasmid cDNA library was transformed into E. coli DH5 competent cells, and positive colonies were screened by colony PCR (polymerase chain reaction). The suspension of a single colony in LB medium was used as the template, SP6 (the upstream primer of the plasmid cDNA library) and a primer with Xh
Аннотация на английскомСтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Two families of bacterial heat-labile enterotoxins (HLTs) have been described: the type I HLTs are comprised of cholera toxin (CT) of Vibrio cholerae, LT-I of Escherichia coli, and several related HLTs; the type II HLTs are comprised of LT-IIa and LT-IIb. Herein, we report LT-IIc, a new type II HLT encoded from an enterotoxigenic E. coli (ETEC) strain isolated from an avian host. Using a mouse Y1 adrenal cell bioassay, LT-IIc was shown to be less cytotoxic than CT, LT-IIa, or LT-IIb. Cytotoxicity of LT-IIc was partially neutralized by antisera recognizing LT-IIa or LT-IIb but not by anti-CT an
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Lynch syndrome (LS) is an autosomal dominant hereditary disorder because of germline mutations in DNA mismatch repair genes, such as MutL homolog 1 (MLH1), PMS1 homolog 2, MutS homolog 2, and MutS homolog 6. Gene mutations could make individuals and their families more susceptible to experiencing various malignant tumors. In Chinese, MLH1 germline mutation c.(453+1_454-1)_(545+1_546-1)del-related LS has been infrequently reported. Therefore, we report a rare LS patient with colorectal and endometrioid adenocarcinoma and describe her pedigree characteristics.
CASE SUMMARY: A 57-yea
Клинический случайСтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVE: In the present study, an attempt has been made for subtractive proteomic analysis approach for novel drug targets in Salmonella enterica subsp. enterica serover Typhi str.CT18 using computational tools.
METHODS: Paralogous, redundant and less than 100 amino acid protein sequences were removed by using CD-HIT. Further detection of bacterial proteins which are non-homologous to host and are essential for the survival of pathogens by using BLASTp against host proteome and DEG`s, respectively. Comparative Metabolic pathways analysis was performed to find unique and common metabolic pat
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Autosomal Dominant Polycystic Kidney Disease (ADPKD), a common inherited disease leading to progressive renal failure, can be caused by a mutation in either the PKD1 or PKD2 gene. Both genes encode for putative transmembrane proteins, polycystin-1 and polycystin-2, which show significant homology to each other and are believed to interact at their carboxy termini. To identify genes that code for related proteins we searched for homologous sequences in several databases and identified one partial cDNA and two genomic sequences with significant homology to both polycystin-1 and - 2. Further anal
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Homologous regions (hrs) are repetitive DNA sequences widely distributed in baculovirus genomes, and are known to function as transcriptional enhancers. In this study, we systematically characterized the seven hrs (hr1, hr2L, hr2R, hr3, hr4L, hr4R, and hr5) from a novel isolate of Bombyx mori nucleopolyhedrovirus (strain BmNPV-YT). The seven hrs range from 390 to 880 bp in length and consist of 1-7 repeat units of approximately 72 bp, each containing a 30 bp palindrome with an EcoRI site. Structural diversity among the hrs includes variable numbers of stem-loop motifs, major late transcription
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
In May 2003, Canada became the 22nd country outside of the United Kingdom to report a case of bovine spongiform encephalopathy (BSE) in an animal not known to be imported from a country with cattle previously affected by this fatal, transmissible prion disease. Despite extensive testing of thousands of other animals that may have been exposed to contaminated feed at the same time as the affected animal, no evidence has been found for other infections. This finding leaves room for conjectures that the single confirmed case arose spontaneously, perhaps (by analogy with human Creutzfeldt-Jakob di
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Crystal structures available for four metalloendopeptidases have revealed zinc ligands for these enzymes. New sequence information has made it possible to compare the primary structures of the zinc-binding site in metalloendopeptidases. A scheme based on the zinc-binding site is proposed to classify metalloendopeptidases into five distinct families: thermolysin, astacin, serratia, matrixin, and snake venom metalloproteinases. Two histidines and one glutamate are zinc-ligands in the thermolysin family. Three histidines and one tyrosine are zinc ligands in the other four families, which are furt
СтатьяПоддержка службы здравоохранения СШАОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
GABAA receptors are GABA (gamma-aminobutyric acid)-gated chloride channels, which are major mediators of neuronal inhibition in the brain and are modulated by benzodiazepines, barbiturates, alcohol, and other important centrally acting drugs. Although previous pharmacological and biochemical data had suggested a degree of heterogeneity, recent cloning of at least 15 different receptor subunits, thought to be combined in groups of five, indicates that the brain may contain a truly astonishing variety of GABAA receptor subtypes. This review describes the little that is known about these subtypes
СтатьяПоддержка службы здравоохранения СШАОбзорПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
HLA-DP genotyping of 800 unrelated donor-recipient pairs in phase 5 of a retrospective analysis of unrelated bone marrow transplantation, sponsored by the National Marrow Donor Program (NMDP), has identified two new DPB1 alleles (DPB1*8701 and DBP1*8801) and one new DPA1 (DPA1*0108) allele. Sequencing confirmed that all three of these new alleles represent novel combinations of previously described sequence motifs, reinforcing the notion that "gene conversion-like" events play an important role in generating HLA allelic diversity. The identification of these new alleles brings the total number
СтатьяПоддержка правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Recent findings suggest that the vitronectin receptor, a member of the integrin family, plays an important role in the attachment of osteoclasts to bone matrix. We report here the localization by in situ hybridization of the mRNA for the alpha and beta subunits of the vitronectin receptor in rat bone sections. To generate the rat-specific RNA probes used in this study, we cloned cDNA fragments of integrin chains alpha v, beta 3, and beta 5 by the polymerase chain reaction from rat cDNA. These fragments share 86-91% homology with the respective human sequences. In situ hybridization localized t
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
PURPOSE: Hallmarks of germline BRCA1/2-associated ovarian carcinomas include chemosensitivity and improved survival. The therapeutic impact of somatic BRCA1/2 mutations and mutations in other homologous recombination DNA repair genes is uncertain.
EXPERIMENTAL DESIGN: Using targeted capture and massively parallel genomic sequencing, we assessed 390 ovarian carcinomas for germline and somatic loss-of-function mutations in 30 genes, including BRCA1, BRCA2, and 11 other genes in the homologous recombination pathway.
RESULTS: Thirty-one percent of ovarian carcinomas had a deleterious germline (2
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПоддержка правительства СШАПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования